Adverse reactions to oncologic drugs: spontaneous reporting and signal detection

Oncology is one of the areas of medicine with the most active research being conducted on new drugs. New pharmacological entities frequently enter the clinical arena, and therefore, the safety profile of anticancer products deserves continuous monitoring. However, only very severe and (unusual) suspected adverse drug reactions (ADRs) are usually reported, since cancer patients develop ADRs very frequently and some practical selectivity must be used. Notably, a recent study was able to identify 76 serious ADRs reported in updated drug labels of oncologic drugs and 50% of them (n = 38) were potentially fatal. Of these, 49 and 58%, respectively, were not described in initial drug labels. The aims of this article are to provide an overview about spontaneous reporting of ADRs of oncologic drugs and to discuss the available methods to analyze the safety of anticancer drugs using databases of spontaneous ADR reporting

Data Mining Techniques in Pharmacovigilance: Analysis of the Publicly Accessible FDA Adverse Event Reporting System (AERS)

Pharmacovigilance is a clinically oriented discipline, which may guide appropriate drug use through a balanced assessment of drug safety. Although much has been done in recent years, efforts are needed to expand the border of pharmacovigilance. We have provided insight into the FDA_Adverse Events Reporting Systems (FDA_AERS), a worldwide publicly available pharmacovigilance archive, to exemplify how to address major methodological issues. We believe that fostering discussion among researchers will increase transparency and facilitate definition of the most reliable approaches. By virtue of its large population coverage and free availability, the FDA_AERS has the potential to pave the way to a new way of looking to signal detection in PhV. Our key messages are: (1) before applying statistical tools (i.e., Data Mining Approaches - DMAs) to pharmacovigilance database for signal detection, all aspects related to data quality should be considered (e.g., drug mapping, missing data and duplicates); (2) at present, the choice of a given DMA mostly relies on local habits, expertise and attitude and there is room for improvement in this area; (3) DMA performance may be highly situation dependent; (4) over-reliance on these methods may have deleterious consequences, especially with the so-called "designated medical events", for which a case-by-case analysis is mandatory and complements disproportionality; and (5) the most appropriate selection of pharmacovigilance tools needs to be tailored to each situation, being mindful of the numerous biases and confounders that may influence performance and incremental utility of DMAs

Adverse Drug Event Detection, Causality Inference, Patient Communication and Translational Research

Adverse drug events (ADEs) are injuries resulting from a medical intervention related to a drug. ADEs are responsible for nearly 20% of all the adverse events that occur in hospitalized patients. ADEs have been shown to increase the cost of health care and the length of stays in hospital. Therefore, detecting and preventing ADEs for pharmacovigilance is an important task that can improve the quality of health care and reduce the cost in a hospital setting. In this dissertation, we focus on the development of ADEtector, a system that identifies ADEs and medication information from electronic medical records and the FDA Adverse Event Reporting System reports. The ADEtector system employs novel natural language processing approaches for ADE detection and provides a user interface to display ADE information. The ADEtector employs machine learning techniques to automatically processes the narrative text and identify the adverse event (AE) and medication entities that appear in that narrative text. The system will analyze the entities recognized to infer the causal relation that exists between AEs and medications by automating the elements of Naranjo score using knowledge and rule based approaches. The Naranjo Adverse Drug Reaction Probability Scale is a validated tool for finding the causality of a drug induced adverse event or ADE. The scale calculates the likelihood of an adverse event related to drugs based on a list of weighted questions. The ADEtector also presents the user with evidence for ADEs by extracting figures that contain ADE related information from biomedical literature. A brief summary is generated for each of the figures that are extracted to help users better comprehend the figure. This will further enhance the user experience in understanding the ADE information better. The ADEtector also helps patients better understand the narrative text by recognizing complex medical jargon and abbreviations that appear in the text and providing definitions and explanations for them from external knowledge resources. This system could help clinicians and researchers in discovering novel ADEs and drug relations and also hypothesize new research questions within the ADE domain

Immunization Safety Monitoring and Vaccine Safety Assessment in China

The development of vaccines is one of the most important public health achievements. The goal of immunization is to protect individuals and the population from vaccine-preventable diseases (VPD). Although modern vaccines generally are safe, there is always a risk of adverse events, as is the case with any medical technology. Vaccines licensed by the National Regulatory Authorities are considered safe, but rare adverse reactions cannot be detected in pre-licensure clinical trials because of their limited size and duration. Once vaccines are licensed and used widely in the population, the main way to evaluate their safety is by conducting postlicensure surveillance and related observational epidemiology studies. An adverse event following immunization (AEFI) is defined as a reaction or an event occurring after vaccine administration that is suspected to be related to the vaccination. All detected AEFIs do not have a causal relationship with vaccines, but the public may perceive them to be related to vaccination, which may raise concern, influence public confidence and hamper the implementation of immunization programs. As more vaccines are being introduced worldwide, high quality safety surveillance is becoming even more important to maintain public confidence in vaccines and vaccine programs. Many developed countries have established well-functioning AEFI surveillance systems, such as the Vaccine Adverse Event Reporting System (VAERS) in the U.S. However, it may be difficult to compare the safety profiles of vaccines used in developed countries to those in low and middle-income countries because the vaccines used and the types of serious AEFIs may be different due to local programmatic, health care system, environmental and genetic differences. China has a total population of over 1.3 billion people and an annual birth cohort of 16 million. With the increasing demand for vaccines and the development of vaccine manufacturing, China now ranks among the world’s largest vaccine manufacturers producing more than one billion vaccine doses annually. In 2010, the Chinese Food and Drug Administration’s (CFDA) website listed 46 registered Chinese vaccine manufacturers of public or private status, collectively manufacturing 24 licensed vaccines. In mainland China, vaccine safety surveillance began first in provinces with enough economic resources, such as Shanghai and Jiangsu, in the 1980s. However, varying guidelines and definitions made comparing the collected data between provinces difficult. Based on National AEFI guideline issued by CFDA and the Ministry of Health (MoH) in 2010, the National Immunization Program (NIP) of the Chinese Center for Disease Control and Prevention (CDC) implemented the National AEFI Surveillance System (CNAEFIS) to establish a uniform nation-wide monitoring system which covers all NIP vaccines as well as those administered in private practices. The CNAEFIS is currently the only data source available for postlicensure safety monitoring for vaccines manufactured and used in mainland China. The studies in this dissertation focus on evaluating the performance of the CNAEFIS and on using the collected data to assess vaccine safety issues. The four studies (I to IV) describe and evaluate the national AEFI surveillance system and assess the safety of selected vaccines used in mainland China. Study I described the CNAEFIS and its performance attributes to understand its overall functioning and to identify areas needing strengthening. Studies II to IV are case studies that evaluate vaccine safety in the following topics: recipient vaccine-associated paralytic poliomyelitis (VAPP), AEFI-associated deaths and, the AEFIs associated with the Japanese Encephalitis (JE) vaccines manufactured and used in China. The findings from these studies helped to identify vaccine-related safety concerns, assess whether these concerns were associated with vaccines and find ways to strengthen surveillance and investigation capacity for the immunization services in China. The CNAEFIS is a passive surveillance system that can collect timely national AEFI data and detect rare and severe events. With cumulating experience and data since its implementation in 2005, the CNAEFIS provides baseline data on AEFIs in the world’s largest population. By using different sources of denominator data, the CNAEFIS may also have the unique ability and statistical power to detect changes in reporting rates of known adverse events to help determine whether potential changes in observed rates may reflect uneven reporting. With the end game in progress for global eradication of polio, the schedule of polio vaccine administration in China was changed in 2016: one dose of inactivated polio vaccine (IPV) was introduced as the first polio vaccine dose and the subsequent three doses of trivalent Oral Poliovirus Vaccine (OPV) were replaced with bivalent OPV. The evaluation of VAPP cases reported in CNAEFIS provided information on the safety of trivalent OPV and will serve as reference data for VAPP occurrence after bivalent OPV in future evaluations. In Study II, the epidemiological characteristics of recipient VAPP cases, such as age distribution, were comparable v to those in previous studies from other countries. The risk of recipient VAPP, using either estimated births or vaccination doses as the denominator, was comparable to that observed in the U.S. and Japan. To further decrease the number of recipients VAPP cases in China, use of IPV was recommended. Study III was initiated because of media reports of deaths following administration of hepatitis B vaccine in Hunan province in December 2013. These reports had raised concerns about safety of vaccines among parents and the public and had resulted in marked decline in parental and public confidence in vaccines in the province. Childhood deaths are very rare and concerning events, but vaccinations in childhood are common. Therefore, a temporal association of reported fatalities with hepatitis B vaccination may have occurred by chance, without a causal link to vaccination. Our analysis provided reassuring information about the small risk of death following immunization. The reporting peak of AEFI-associated deaths in late 2013 to early 2014 illustrated the sensitivity of passive reporting systems to public information. It also highlighted the caution that should be exercised in interpreting peaks in reports of serious AEFIs. Although the analysis was limited by small number of cases, our review of the characteristics of AEFIs and causes of death identified no vaccine safety concerns. This finding addressed the public’s concerns and should bolster confidence in the vaccine program. JE vaccines were introduced in the national immunization schedule in the mainland of China at the end of 2007. In 2013, the Japanese Encephalitis Vaccine Live (JEV-L) was the first Chinese-produced vaccine to be prequalified by the World Health Organization (WHO). Limited data were available on the safety of JE vaccines after their inclusion in the national immunization schedule and, consequently, on its large-scale use in China. In Study IV, the majority of AEFIs following JE vaccines were minor and comprised common adverse reactions. There were no significant differences between the estimated reported rates of serious AEFIs following JE Inactivated (JEV-I) and JEV-L. Most patients with serious AEFIs recovered fully. We recommended further studies to differentiate the effects of concurrent vaccination of other vaccines from those of JE vaccines and adoption of more sensitive methods to detect safety signals. This dissertation illustrates the progress made with vaccine safety monitoring during recent years in China. In these studies, we found that national AEFI surveillance was functional and able to provide useful data to evaluate safety of vaccines in the world’s largest population. The assessment of recipient VAPP, AEFIassociated deaths, and the safety of JE vaccines suggested acceptable vaccine safety profiles. However, we also identified several challenges, such as lack of standard international diseases and symptoms coding system and case definitions, which should be introduced to reduce misclassification and strengthen the system. In addition, the causality assessment procedures should be standardized and made more rigorous. Finally, new statistical methods should be introduced for safety signal detection and hypothesis generation in future studies. These scientific improvements in the world’ largest vaccine safety data source would continue building public confidence in vaccine programs in China, and perhaps serve as a model to surveillance system development in other countries.Rokotukset ovat yksi tärkeimmistä kansanterveyden saavutuksista. Rokotusohjelmien tavoitteena on suojata yksilöä ja väestöä vakavilta, rokotuksilla estettävissä olevilta taudeilta. Vaikka nykyiset rokotteet ovat yleisesti ottaen turvallisia, niihin voi liittyä haittavaikutuksia, kuten mihin tahansa lääketieteen teknologian käyttöön. Kansallisten viranomaisten hyväksymät rokotteet on todettu turvallisiksi ja tehokkaiksi ennen myyntiluvan myöntämistä tehdyissä kliinisissä tutkimuksissa. Harvinaisia haittavaikutuksia ei näissä tutkimuksissa kuitenkaan voida havaita niiden rajoitetun koon ja keston vuoksi. Rokotusten väestövaikutusten arviointi sekä harvinaisten haittavaikutusten havaitseminen on mahdollista vain, kun rokotteita on käytetty väestössä laajasti ja tarpeeksi pitkän aikaa. Kehittyneet seurantajärjestelmät ja niihin perustuvat epidemiologiset tutkimukset ovat tärkein tapa arvioida ja varmistaa rokotteiden turvallisuus. Rokotusten haittavaikutus määritellään reaktioksi tai tapahtumaksi, jonka epäillään liittyvän rokotukseen. Kaikilla rokotteilla voi olla haittavaikutuksia, mutta niitä esiintyy vain pienellä osalla rokotetuista. Kaikilla havaituilla haittavaikutuksilla ei myöskään ole syy-yhteyttä rokotteisiin. Koska rokotukset ovat yleisiä, niiden saatetaan kuitenkin olettaa liittyvän rokotuksiin ajallisen yhteyden perusteella. Tämä voi aiheuttaa huolta, vaikuttaa yleiseen luottamukseen rokotusohjelmaa kohtaan sekä haitata sen toteuttamista. Maailmanlaajuisesti otetaan jatkuvasti käyttöön uusia rokotteita. Tällöin korkealaatuisen turvallisuus seurannan rooli tulee entistä tärkeämmäksi, jotta väestön luottamus rokotteisiin ja rokoteohjelmiin säilyy. Useimmissa kehittyneissä maissa on hyvin toimivat, pitkäaikaiset rokotusten haittavaikutusten seurantajärjestelmät. Kehittyneissä maissa käytettyjen rokotteiden turvallisuuden seurannan tietoja on kuitenkin vaikea verrata ja soveltaa pieni- ja keskituloisiin maihin: Käytetyt rokotteet ja vakavat haittavaikutukset voivat poiketa toisistaan muun muassa rokotusohjelman, terveydenhuoltojärjestelmän, ympäristön ja väestön geneettisten erojen takia. Kiinassa on yli 1,3 miljardia ihmistä ja sen vuotuinen syntymäkohortti on 16 miljoonaa lasta. Rokotteiden kasvavan kysynnän ja rokotevalmistuksen menetelmien kehittymisen myötä Kiina on nykyään yksi maailman suurimmista rokotevalmistajista, joka valmistaa yli miljardi rokoteannosta vuodessa. Vuonna 2010 Kiinan elintarvike- ja lääkehallinnon verkkosivusto listasi 46 rekisteröityä kiinalaista rokotevalmistajaa, jotka valmistivat yhteensä 24:ttä eri rokotetta. Manner-Kiinan rokoteturvallisuuden seuranta aloitettiin 1980-luvulla provinsseissa, joilla oli riittävästi taloudellisia resursseja, kuten Shanghaissa ja Jiangsussa. Ohjeistuksen, tapausmääritelmien ja protokollien eroavaisuudet kuitenkin hankaloittivat tietojen vertailua maakuntien välillä. Kansallinen rokotusten haittavaikutusten seurantajärjestelmä (CNAEFIS) perustettiin vuonna 2010 Kiinan tautikeskuksen (Chinese Center for Disease Control and Prevention, CDC), kansallisen rokotusohjelman (National Immunization Program, NIP) ja terveysministeriön yhteistyössä kehittämän kansallisen ohjeistuksen perusteella. Yhdenmukainen, valtakunnallinen seurantajärjestelmä kattaa kansallisen rokotusohjelman rokotteiden lisäksi myös yksityisellä puolella annetut rokotteet. Tämä maailman suurimman väestön rokotteiden turvallisuustietokanta on ainoa kattava tietolähde, jonka avulla Manner-Kiinassa valmistettujen ja käytettyjen rokotteiden turvallisuutta voidaan seurata. Tämän väitöskirjan tutkimukset keskittyvät Kansallisen rokotusten turvallisuuden seurantajärjestelmän toiminnan arviointiin sekä kerätyn tiedon hyödyntämiseen tieteellisessä tutkimuksessa vastaamaan rokotusten turvallisuuteen liittyviin tieteellisiin kysymyksiin. Neljä tutkimusta (I – IV) kuvaavat ja arvioivat kansallisen seurantajärjestelmän toimintaa ja sekä kahta tautia vastaan kehitettyjen rokotteiden turvallisuutta. Nämä taudit ovat Japanin aivotulehdus, joka on vakava hyttysten levittämä virusinfektio sekä poliovirus infektio, joka aiheuttaa poliomyeliittiä eli lapsihalvausta. Ensimmäisessä tutkimuksessa kuvataan seurantajärjestelmän toiminta ja tunnistetaan vahvistettavia alueita. Tutkimukset II – IV ovat tapaustutkimuksia, joissa arvioidaan a) elävään poliorokotteeseen liittyvän halvausoireen yleisyyttä (Recipient Vaccine Associated Paralytic Polio); b) haittavaikutusilmoituksia, joihin oli liittynyt kuolema sekä Kiinassa valmistettuihin, Japanin aivotulehdusta vastaan kehitettyihin rokotteisiin liittyviä haittavaikutuksia. Nämä tutkimukset tunnistivat rokotteisiin liittyviä turvallisuuskysymyksiä, arvioivat tieteellistä näyttöä siitä oliko haittavaikutuksilla yhteys rokotteisiin sekä tunnistivat kohtia joissa Kiinan kansallisen rokotusohjelman seurannan- ja tutkimuksen kapasiteettia voidaan vahvistaa. Kiinan kansallinen rokotusten haittavaikutusten seurantajärjestelmä on passiivinen järjestelmä, joka on ollut toiminnassa vuodesta 2005 lähtien. Se kerää ajantasaisia tietoja ja kykenee havaitsemaan harvinaisia tai vakavia tapahtumia maailman suurimmassa väestössä. Hyödyntämällä useita nimittäjätietojen lähteitä, järjestelmällä on riittävästi tilastollista voimaa verrata ilmoitettujen haittavaikutusten havaittua määrää niiden odotettuun määrään. Tämän perusteella voidaan muun muassa arvioida heijastelevatko havaitut muutokset haittavaikutusilmoitusten määrässä muutoksia raportointiaktiivisuudessa todellisten haittavaikutusten sijaan. Polion maailmanlaajuiset hävittämistalkoot alkoivat Maailman terveysjärjestön (WHO) johdolla vuonna 1988. Laajamittaisten, elävää virusta sisältävien poliorokotusten ansiosta villi poliovirus ja sen aiheuttama halvausoireinen tauti on hävinnyt melkein kaikista maista ja maanosista, myös Kiinasta. Vuonna 2016 poliorokotteiden aikataulua muutettiin Kiinassa siten, että ensimmäiseksi annokseksi otettiin käyttöön inaktivoitu, pistettävä poliorokote. Seuraavat kolme annosta kolmevalenttista suun kautta otettavaa elävää poliovirusrokotetta korvattiin kaksivalenttisiella rokotteella. Seurantajärjestelmä on kerännyt tietoa kolmivalenttisen rokotteen turvallisuudesta jo vuodesta 2010 lähtien. Tutkimuksessa II suun kautta otettavaan poliorokotteeseen liittyneiden halvausoire-tapausten epidemiologiset ominaisuudet, esim. ikäjakauma, eivät poikenneet muiden maiden tuloksista. Halvausoireen riski, käytettäessä nimittäjänä joko arvioitua syntymien määrää tai annettuja rokotusannoksia, oli samaa luokkaa kuin aiemmin Yhdysvalloissa ja Japanissa tehdyissä tutkimuksissa. Harvinaisen halvausoireen (n. 4 tapausta per miljoona) ilmaantuvuutta uuden, kaksivalenttisen rokotteen käyttöönoton jälkeen verrattaan jatkossa aiempaan rokotteeseen. Tulokset tukevat pistettävän poliorokotteen käyttöä Kiinassa haittavaikutusten riskin edelleen vähentämiseksi. Tutkimus III aloitettiin koska joulukuussa 2013 tiedotusvälineissä raportoitiin kuolemantapauksista, joiden oletettiin liittyvän hepatiitti B -rokotuksiin Hunanin maakunnassa. Nämä uutisjutut herättivät runsaasti huolta rokotteiden turvallisuudesta vanhempien ja kansalaisten keskuudessa ja väestön luottamus rokotteisiin heikkeni selvästi. Lapsen kuolema on erittäin harvinainen ja traaginen tapahtuma – rokotukset taas ovat lapsuudessa hyvin yleisiä. Tämän takia ilmoitettujen kuolemantapausten ajallinen yhteys hepatiitti B -rokotuksiin on voinut olla sattuma, jolla ei ollut syy-yhteyttä rokotukseen. Tutkimus tuotti rauhoittavaa tietoa rokotusten jälkeisestä kuoleman riskistä, joka oli äärimmäisen pieni. Haittavaikutusten ilmoitushuippu vuosien 2013-2014 vaihteessa havainnollisti kuinka herkkä passiivinen seurantajärjestelmä saattaa olla median raportoimille tiedoille, jotka eivät perustuneet tieteelliseen tutkimukseen. Tulokset myös korostivat, että on noudatettava erityistä varovaisuutta tulkittaessa nopeita muutoksia vakavien haittailmoitusten määrässä. Vaikka pieni tapausmäärä rajoitti mahdollisuuksia tehdä tuloksista varmoja johtopäätöksiä, rokoteturvallisuuteen liittyviä ongelmia ei havaittu. Näiden tulosten arvioitiin lievittäneen yleisön huolenaiheita ja palauttaneen luottamusta rokoteohjelmaan. Rokotukset Japanin aivotulehdusta vastaan aloitettiin Kiinan kansallisessa rokotusohjelmassa vuoden 2007 lopulla. Elävä Japanin aivotulehdusrokote oli ensimmäinen Maailman terveysjärjestön (WHO) hyväksymä Kiinassa valmistettu rokote (2013). Tietoa Japanin aivotulehdusrokotteiden turvallisuudesta laajamittaisessa käytössä Kiinassa oli ennen tutkimustamme rajoitetusti. Tutkimuksessa IV suurin osa havaituista haittavaikutuksista oli vähäisiä, tiedossa olevia yleisiä haittavaikutuksia (esim. kuume, pistoskohdan kipu). Ilmoitettujen vakavien haittavaikutusten ilmaantuvuudessa ei ollut merkittäviä eroja elävän ja inaktivoidun rokotteen välillä. Useimmat potilaat toipuivat täysin myös vakavista haittavaikutuksista. Lisätutkimuksia tarvitaan erottelemaan muiden, samanaikaisesti annettujen rokotteiden vaikutukset Japanin aivotulehdusrokotteen vaikutuksista. On myös kehitettävä herkempiä menetelmiä turvallisuussignaalien havaitsemiseksi. Tämä väitöskirja tarjoaa kokonaiskuvan rokoteturvallisuuden seurannan ja tieteellisen arvioinnin viimeaikaisesta kehityksestä Kiinassa. Tutkimuksissa osoitettiin, että kansallinen haittavaikutusten seurantajärjestelmä on toimiva ja tuottaa tärkeää tietoa rokotteiden turvallisuudesta maailman suurimmassa väestössä. Tutkimukset vahvistivat, että rokotusten jälkeiset tapahtumat tai havaitut oireet eivät välttämättä johtuneet rokotuksesta. Tutkimukset tunnistivat kuitenkin myös useita haasteita, kuten yhdenmukaisen, kansainvälisen sairauksien ja oireiden luokittelujärjestelmän sekä tapausmäärittelyjen puuttuminen. Nämä tulisi ottaa käyttöön virheellisten luokittelujen vähentämiseksi ja järjestelmän vahvistamiseksi. Lisäksi syy-yhteyden arviointimenettely olisi yhtenäistettävä ja ohjeistusta tarkennettava. Tulevissa tutkimuksissa tulisi ottaa käyttöön uusia tilastollisia menetelmiä signaalien havaitsemiseksi sekä niiden erottamiseksi datan taustakohinasta uusien tutkimuskysymysten ja -hypoteesien luomiseksi. Nämä kokemukset maailman suurimmasta rokoteturvallisuuden tietolähteestä voivat edesauttaa luottamuksen säilymistä rokotusohjelmiin. Ne voivat myös toimia mallina seurantajärjestelmien kehittämiselle muissa pieni- ja keskituloisissa maissa

Rhabdomyolysis reported for children and adolescents treated with antipsychotic medicines: a case series analysis

published_or_final_versio

Rhabdomyolysis reported for children and adolescents treated with antipsychotic medicines: a case series analysis

published_or_final_versio