Systolic genetic search, a parallel metaheuristic for GPUs

La utilización de unidades de procesamiento gráfico (GPUs) para la resolución de problemas de propósito general ha experimentado un crecimiento vertiginoso en los últimos años, sustentado en su amplia disponibilidad, su bajo costo económico y en contar con una arquitectura inherentemente paralela, así como en la aparición de lenguajes de programación de propósito general que han facilitado el desarrollo de aplicaciones en estas plataformas. En este contexto, el diseño de nuevos algoritmos paralelos que puedan beneficiarse del uso de GPUs es una línea de investigación prometedora e interesante. Las metaheurísticas son algoritmos estocásticos capaces de encontrar soluciones muy precisas (muchas veces óptimas) a problemas de optimización en un tiempo razonable. Sin embargo, como muchos problemas de optimización involucran tareas que exigen grandes recursos computacionales y/o el tamaño de las instancias que se están abordando actualmente se están volviendo muy grandes, incluso las metaheurísticas pueden ser computacionalmente muy costosas. En este escenario, el paralelismo surge como una alternativa exitosa con el fin de acelerar la búsqueda de este tipo de algoritmos. Además de permitir reducir el tiempo de ejecución de los algoritmos, las metaheurísticas paralelas a menudo son capaces de mejorar la calidad de los resultados obtenidos por los algoritmos secuenciales tradicionales.Si bien el uso de GPUs ha representado un dominio inspirador también para la investigación en metaheurísticas paralelas, la mayoría de los trabajos previos tenían como objetivo portar una familia existente de algoritmos a este nuevo tipo de hardware. Como consecuencia, muchas publicaciones están dirigidas a mostrar el ahorro en tiempo de ejecución que se puede lograr al ejecutar los diferentes tipos paralelos de metaheurísticas existentes en GPU. En otras palabras, a pesar de que existe un volumen considerable de trabajo sobre este tópico, se han propuesto pocas ideas novedosas que busquen diseñar nuevos algoritmos y/o modelos de paralelismo que exploten explícitamente el alto grado de paralelismo disponible en las arquitecturas de las GPUs. Esta tesis aborda el diseño de una propuesta innovadora de algoritmo de optimización paralelo denominada Búsqueda Genética Sistólica (SGS), que combina ideas de los campos de metaheurísticas y computación sistólica. SGS, así como la computación sistólica, se inspiran en el mismo fenómeno biológico: la contracción sistólica del corazón que hace posible la circulación de la sangre. En SGS, las soluciones circulan de forma síncrona a través de una grilla (rejilla) de celdas. Cuando dos soluciones se encuentran en una celda se aplican operadores evolutivos adaptados para generar nuevas soluciones que continúan moviéndose a través de la grilla (rejilla). La implementación de esta nueva propuesta saca partido especialmente de las características específicas de las GPUs. Un extenso análisis experimental que considera varios problemas de benchmark clásicos y dos problemas del mundo real del área de Ingeniería de Software, muestra que el nuevo algoritmo propuesto es muy efectivo, encontrando soluciones óptimas o casi óptimas en tiempos de ejecución cortos. Además, los resultados numéricos obtenidos por SGS son competitivos con los resultados del estado del arte para los dos problemas del mundo real en cuestión. Por otro lado, la implementación paralela en GPU de SGS ha logrado un alto rendimiento, obteniendo grandes reducciones de tiempo de ejecución con respecto a la implementación secuencial y mostrando que escala adecuadamente cuando se consideran instancias de tamaño creciente. También se ha realizado un análisis teórico de las capacidades de búsqueda de SGS para comprender cómo algunos aspectos del diseño del algoritmo afectan a sus resultados numéricos. Este análisis arroja luz sobre algunos aspectos del funcionamiento de SGS que pueden utilizarse para mejorar el diseño del algoritmo en futuras variantes

Bioinformatics

This book is divided into different research areas relevant in Bioinformatics such as biological networks, next generation sequencing, high performance computing, molecular modeling, structural bioinformatics, molecular modeling and intelligent data analysis. Each book section introduces the basic concepts and then explains its application to problems of great relevance, so both novice and expert readers can benefit from the information and research works presented here

Mechanics of Phenotypic Aging Trajectories in C. elegans and Humans

Overall, my dissertation integrates longitudinal measurements of physiology to investigate the aging process. In the first half, I examine the surprising and largely unexplained degree of variation in lifespan within even homogeneous populations. I sought to understand how physiological aging differs between long- and short-lived individuals within a population of genetically identical C. elegans reared in a homogeneous environment. Using a novel culture apparatus, I longitudinally monitored aspects of aging physiology across a large population of isolated individuals. Aggregating several measures into an overall estimate of senescence, I find that long- and short-lived individuals start adulthood on an equal physiological footing. However, longer-lived individuals then experience slower declines in function, but spend a disproportionately large portion of life in poor physiological health. Indeed, the period of early-life good health is much less variable than the period of late-life advanced senescence, which I conclude to be a more plastic phase of life. In the second half, I show that simple physiological measurements have broader lifespan-predictive value than previously believed and that incorporating information from multiple time points can significantly increase that predictive capacity. Using longitudinal data from a cohort of 1349 human participants in the Framingham Heart Study, I show that as early as 28–38 years of age, almost 10% of variation in future lifespan can be predicted from simple clinical parameters. Further, different clinical measurements are predictive of lifespan in different age regimes. Moreover, I find that several blood glucose and blood pressure are best considered as measures of a rate of “damage accrual”, such that total historical exposure, rather than current measurement values, is the most relevant risk factor (as with pack-years of cigarette smoking). Together, this work has established the physiological basis of variation in longevity within an isogenic population of C. elegans and extended our ability to predict mortality from basic clinical measurements in humans

Green Parallel Metaheuristics: Design, Implementation, and Evaluation

Fecha de lectura de Tesis Doctoral 14 mayo 2020Green parallel metaheuristics (GPM) is a new concept we want to introduce in this thesis. It is an idea inspired by two facts: (i) parallel metaheuristics could help as unique tools to solve optimization problems in energy savings applications and sustainability, and (ii) these algorithms themselves run on multiprocessors, clusters, and grids of computers and then consume energy, so they need an energy analysis study for their different implementations over multiprocessors. The context for this thesis is to make a modern and competitive effort to extend the capability of present intelligent search optimization techniques. Analyzing the different sequential and parallel metaheuristics considering its energy consumption requires a deep investigation of the numerical performance, the execution time for efficient future designing to these algorithms. We present a study of the speed-up of the different parallel implementations over a different number of computing units. Moreover, we analyze and compare the energy consumption and numerical performance of the sequential/parallel algorithms and their components: a jump in the efficiency of the algorithms that would probably have a wide impact on the domains involved.El Instituto Egipcio en Madrid, dependiente del Gobierno de Egipto

Advanced Signal Processing in Wearable Sensors for Health Monitoring

Smart, wearables devices on a miniature scale are becoming increasingly widely available, typically in the form of smart watches and other connected devices. Consequently, devices to assist in measurements such as electroencephalography (EEG), electrocardiogram (ECG), electromyography (EMG), blood pressure (BP), photoplethysmography (PPG), heart rhythm, respiration rate, apnoea, and motion detection are becoming more available, and play a significant role in healthcare monitoring. The industry is placing great emphasis on making these devices and technologies available on smart devices such as phones and watches. Such measurements are clinically and scientifically useful for real-time monitoring, long-term care, and diagnosis and therapeutic techniques. However, a pertaining issue is that recorded data are usually noisy, contain many artefacts, and are affected by external factors such as movements and physical conditions. In order to obtain accurate and meaningful indicators, the signal has to be processed and conditioned such that the measurements are accurate and free from noise and disturbances. In this context, many researchers have utilized recent technological advances in wearable sensors and signal processing to develop smart and accurate wearable devices for clinical applications. The processing and analysis of physiological signals is a key issue for these smart wearable devices. Consequently, ongoing work in this field of study includes research on filtration, quality checking, signal transformation and decomposition, feature extraction and, most recently, machine learning-based methods

Aerospace Medicine and Biology: A continuing bibliography with indexes (supplement 141)

This special bibliography lists 267 reports, articles, and other documents introduced into the NASA scientific and technical information system in April 1975

Enumeration, conformation sampling and population of libraries of peptide macrocycles for the search of chemotherapeutic cardioprotection agents

Peptides are uniquely endowed with features that allow them to perturb previously difficult to drug biomolecular targets. Peptide macrocycles in particular have seen a flurry of recent interest due to their enhanced bioavailability, tunability and specificity. Although these properties make them attractive hit-candidates in early stage drug discovery, knowing which peptides to pursue is non‐trivial due to the magnitude of the peptide sequence space. Computational screening approaches show promise in their ability to address the size of this search space but suffer from their inability to accurately interrogate the conformational landscape of peptide macrocycles. We developed an in‐silico compound enumerator that was tasked with populating a conformationally laden peptide virtual library. This library was then used in the search for cardio‐protective agents (that may be administered, reducing tissue damage during reperfusion after ischemia (heart attacks)). Our enumerator successfully generated a library of 15.2 billion compounds, requiring the use of compression algorithms, conformational sampling protocols and management of aggregated compute resources in the context of a local cluster. In the absence of experimental biophysical data, we performed biased sampling during alchemical molecular dynamics simulations in order to observe cyclophilin‐D perturbation by cyclosporine A and its mitochondrial targeted analogue. Reliable intermediate state averaging through a WHAM analysis of the biased dynamic pulling simulations confirmed that the cardio‐protective activity of cyclosporine A was due to its mitochondrial targeting. Paralleltempered solution molecular dynamics in combination with efficient clustering isolated the essential dynamics of a cyclic peptide scaffold. The rapid enumeration of skeletons from these essential dynamics gave rise to a conformation laden virtual library of all the 15.2 Billion unique cyclic peptides (given the limits on peptide sequence imposed). Analysis of this library showed the exact extent of physicochemical properties covered, relative to the bare scaffold precursor. Molecular docking of a subset of the virtual library against cyclophilin‐D showed significant improvements in affinity to the target (relative to cyclosporine A). The conformation laden virtual library, accessed by our methodology, provided derivatives that were able to make many interactions per peptide with the cyclophilin‐D target. Machine learning methods showed promise in the training of Support Vector Machines for synthetic feasibility prediction for this library. The synergy between enumeration and conformational sampling greatly improves the performance of this library during virtual screening, even when only a subset is used

Analysis of the cardiovascular response to autonomic nervous system modulation in Brugada syndrome patients

Cotutela Universitat Politècnica de Catalunya i Université de Rennes 1Brugada syndrome (BS) is a genetic arrhythmogenic disease characterized by a distinctive electrocardiographic pattern, associated with a high risk for sudden cardiac death (SCD) due to ventricular fibrillation (VF) in absence of structural cardiopathies. Its complex and multifactorial nature turns risk stratification into a major challenge. Although variations in autonomic modulation are commonly related to arrhythmic events in this population, novel markers with higher predictive values are still needed so as to identify those patients at high risk. The autonomic function can be better characterized through the application of standardized maneuvers stimulating the autonomic nervous system (ANS), such as exercise testing or the head-up tilt (HUT) test. Therefore, in this PhD thesis a thorough evaluation of the cardiovascular response to ANS modulations overnight is proposed, as well as in response to exercise and HUT testing, on a clinical database composed of BS patients with different levels of risk (symptomatic and asymptomatic subjects). In this context, the autonomic function was assessed by three main approaches. First, through the characterization and comparison of previously described methods capturing heart rate complexity, baroreflex sensitivity, and non-stationary heart rate variability, never before studied in the context of BS patients; in order to identify new markers capable of distinguishing between symptomatic and asymptomatic patients. According to the results, a lower variability and complexity overnight, as well as a higher vagal tone and a lower sympathetic activity both during exercise and HUT testing, was observed in the symptomatic group. In a second analysis, in order to address the multifactorial nature of the disease, a multivariate approach based on a step-based machine learning method was introduced. By employing features extracted at signal-processing analysis, robust classifiers capable of identifying patients at high risk were proposed. The classifier based on autonomic features extracted during nighttime analysis presented the best performance (AUC=95%), improving previously reported predictive models of risk in BS based on non-invasive parameters. Finally, the third part of this work was focused on the implementation of novel mathematical models and the associated model analysis methods, so as to study the autonomic mechanisms regulating the mechanical and circulatory functions of the cardiovascular system in this population. First, by the integration and evaluation of a computational model capturing the cardiovascular system's dynamics and its autonomic regulation in response to HUT testing. Likewise, a second model-based approach based on a recursive identification of the sympathetic and parasympathetic contributions to ANS regulation was proposed in order to estimate the time-varying autonomic response to exertion and subsequent recovery. The results showed a reduced contractility function, as well as a significantly greater parasympathetic activity during exercise, in symptomatic patients. Finally, in order to combine characteristics extracted from model-based approaches, a prospective study introduced a multivariate classifier based on estimated model parameters. Overall, the obtained results indicate important trends of clinical relevance that provide new insights into the underlying autonomic mechanisms regulating the cardiovascular system in BS, improving physiopathology and prognosis interpretation, with a potential future impact on therapeutic strategies. The proposed approach is presented as a potential instrument for the identification of those asymptomatic patients at high risk who may benefit from a cardioverter defibrillator implantation.El síndrome de Brugada (SB) es una enfermedad genética asociada a un patrón electrocardiográfico característico y a un elevado riesgo de muerte súbita cardíaca (MSC), causada por fibrilación ventricular (FV) en ausencia de cardiopatías estructurales. Debido a su naturaleza compleja y multifactorial, la estratificación del riesgo supone, en la actualidad, uno de los aspectos más controvertidos. Ciertas alteraciones en la modulación del sistema nervioso autónomo (SNA) se han relacionado con eventos arrítmicos en esta población; no obstante, nuevos marcadores con valores predictivos más elevados que permitan identificar a aquellos pacientes con un alto riesgo de sufrir MSC son todavía necesarios. El uso de maniobras estandarizadas con el objetivo de estimular el SNA permiten mejorar la caracterización de la función autonómica. Por ello, en esta tesis doctoral se propone una evaluación exhaustiva de la respuesta cardiovascular a la modulación del SNA durante la noche, así como en respuesta al ejercicio y a la prueba de mesa inclinada, en una base de datos clínicos compuesta por sujetos con diferentes niveles de riesgo (pacientes sintomáticos y asintomáticos). En este contexto, la evaluación de la función autonómica se llevó a cabo mediante tres estrategias principales. En primer lugar, se caracterizaron y compararon la variabilidad y complejidad del ritmo cardíaco, así como la sensibilidad barorrefleja, en pacientes sintomáticos y asintomáticos, con el objetivo de identificar nuevos marcadores capaces de distinguir entre grupos de pacientes. Los resultados mostraron, en el grupo sintomático, una menor variabilidad y complejidad durante la noche, así como un mayor tono vagal y una menor actividad simpática tanto durante el ejercicio como en respuesta a la prueba de mesa inclinada. En un segundo análisis, se abordó la etiología multifactorial del síndrome mediante un enfoque multivariado basado en un método de aprendizaje automático por etapas. A partir de marcadores extraídos en la etapa anterior, se propusieron modelos predictivos capaces de clasificar pacientes diagnosticados con SB en función de su nivel de riesgo. El mejor clasificador (AUC = 95%) fue diseñado a partir de marcadores autonómicos obtenidos durante la noche, superando modelos predictivos previamente descritos para la estratificación del riesgo en el SB a partir de la combinación de parámetros no invasivos. Finalmente, se analizaron las interacciones entre las funciones mecánica, circulatoria y autonómica de estos pacientes a partir de modelos fisiológicos. En primer lugar, mediante la implementación y evaluación de un modelo computacional integrando la dinámica del sistema cardiovascular y su respuesta autonómica a la prueba de mesa inclinada. Asimismo, se propuso la identificación recursiva de un modelo implementado para el análisis de la evolución temporal de las contribuciones simpática y parasimpática del SNA durante una prueba de esfuerzo. Los resultados mostraron una menor contractilidad, así como una actividad parasimpática significativamente mayor durante el ejercicio, en pacientes sintomáticos. Con el objetivo de combinar características extraídas del modelado fisiológico, un último estudio prospectivo propuso el diseño de un clasificador multivariado integrando los parámetros estimados en esta última etapa. Los resultados obtenidos indican importantes tendencias de relevancia clínica que aportan nuevos conocimientos sobre los mecanismos autonómicos encargados de regular el sistema cardiovascular en el SB. Su interpretación permite mejorar la estratificación del riesgo en estos pacientes y, por tanto, optimizar las estrategias terapéuticas aplicadas. La metodología propuesta se presenta como un instrumento para la identificación de aquellos pacientes con alto riesgo de MSC que podrían beneficiarse de la implantación de desfibriladores automáticos.Le syndrome de Brugada (BS) est une maladie cardiaque caractérisée par la survenue d’une syncope ou mort subite, provoquées par une arythmie cardiaque, chez les patients avec un coeur structurellement normal, mais présentant des altérations électrocardiographiques spécifiques. Cependant, ces modifications sont intermittentes et varient avec la température ou les traitements appliqués, ce qui rend particulièrement difficile le diagnostic chez un patient donné. En outre, elles sont fortement modulées par le système nerveux autonome (SNA), partie du système nerveux périphérique responsable de la régulation des organes internes. Les défibrillateurs implantables (DI) sont le traitement principal pour les patients symptomatiques, c’est-à-dire les patients documentés d’arythmie ventriculaire, syncope ou ayant survécu à un épisode de mort subite. Cependant, la décision d’implanter un DI peut être très difficile pour des patients asymptomatiques sans antécédents familiaux de morte subite. Dans ce contexte, l’objectif de la thèse était d’améliorer la compréhension de l’influence du SNA chez les patients souffrant du BS. Une méthodologie globale fusionnant traitement du signal, machine learning et modélisation a été proposée durant la thèse. Cette chaine de traitement originale a pu être mise en oeuvre sur trois bases de données de patients BS symptomatiques et asymptomatiques. Les bases de données cliniques utilisées dans ce travail sont le résultat d’une étude prospective, multicentrique dont l’objectif était de provoquer des modifications de l’activité du SNA chez les patients BS. L’acquisition des données s’est déroulée entre 2009 et 2013 dans le service de cardiologie du CHU de Rennes et les participants provenaient de 8 hôpitaux français situés à La Rochelle, Angers, Bordeaux, Brest, Nantes, Rennes, Poitiers et Tours. Afin de caractériser les patients présentant différents niveaux de risque, les participants ont été classés en patients symptomatiques et asymptomatiques, selon leurs historiques cliniques. Les patients symptomatiques devaient présenter les symptômes documentés suivants : arrêt cardiaque dû à une fibrillation ventriculaire, syncopes, vertiges, palpitations et convulsions nocturnes. La base de données est constituée des ECG (12 dérivations) de 87 patients, collectés pendant 24 heures, incluant un test d’orthostatisme (tilt-test) et une épreuve d’effort. L’acquisition était réalisée à l’aide d’un moniteur Holter (ELA medical, Sorin Group, Le Plessis Robinsson, France) à une fréquence d’échantillonnage de 1000 Hz. Par ailleurs, des tilt-tests ont été réalisés sur 32 patients en mesurant de manière non-invasive la pression artérielle et l’ECG avec le moniteur Task Force (CN Systems, Graz, Autriche) à une fréquence d’échantillonnage de 100 Hz et 1000 Hz, respectivement. Des signaux ECG à 12 dérivations échantillonnés à 1000 Hz ont été acquis chez 36 autres patients BS lors d’un test d’exercice avec le moniteur ECG (Cardionics, Webster, Texas). Par conséquent, l’analyse de l’activité du système nerveux autonome est basée sur 3 périodes différentes : 1) une épreuve d’effort, 2) un test d’orthostatisme (tilt-test) et 3) un recueil de données pendant la nuit. La réponse du système nerveux autonome, à ces trois tests, a tout d’abord été évaluée avec des méthodes d’estimation du gain du baroréflexe, de variabilité et de complexité cardiaque. L’une des difficultés du traitement des signaux associés à l’épreuve d’effort et au test d’orthostatisme réside dans leurs natures non-stationnaires. L’analyse spectrale de ces signaux nécessite la mise en oeuvre d’outils spécifiques permettant de décrire une évolution temporelle des caractéristiques fréquentielles. Des analyses temps-fréquence, basées sur la transformée de Wigner-Ville, ont ainsi été utilisées afin d’étudier conjointement, le contenu spectral des signaux, et leurs évolutions temporelles. Cependant, ces méthodes classiques d’analyse de la variabilité cardiaque ne permettent pas de capturer la non-linéarité de la dynamique cardiovasculaire. Ainsi, des méthodes spécifiques d’analyse de la complexité des séries cardiaques ont pu être utilisées. La sensibilité du baroréflexe de ces patients a été évaluée à partir de différentes méthodes proposées dans la littérature. Une série d’indices a ainsi été déduite des signaux avant d’être analysée pour trouver des différences significatives entre les patients symptomatiques et asymptomatiques. Les résultats ont mis en évidence que les indices calculés chez les patients symptomatiques sont associés à une baisse de la variabilité et de la complexité cardiaque pendant la nuit. Par ailleurs, pendant le test d’exercice, les patients symptomatiques ont montré une activité vagale augmentée et un tonus sympathique réduit. Lors de la réponse au tilt-test, les patients symptomatiques ont présenté une augmentation du tonus parasympathique et une réduction de l’équilibre sympatho-vagal par rapport aux patients asymptomatiques. L’étiologie multifactorielle du BS nécessite l’utilisation d’approches complexes capables de capturer les multiples mécanismes sous-jacents à la maladie. Ainsi, une analyse multivariée a été réalisée à partir de la série d’indices calculés précédemment. L’approche globale, basée sur des méthodes de machine learning, permet de combiner de manière optimale les indices autonomiques extraits précédemment, afin de concevoir des classificateurs capables de différencier les patients BS, en fonction de leur symptomatologie. La sélection de ces indicateurs autonomiques, permettant une meilleure caractérisation du BS, peut être difficile surtout lorsque le nombre de sources dépasse la quantité d’observations et que les variabilités entre patients sont significatives. Ainsi, une approche robuste basée sur un processus de sélection de paramètres en deux étapes a été mise en oeuvre. La méthodologie proposée a été optimisée, évaluée et comparée sur les données extraites lors de différents tests autonomiques. Les résultats montrent que le meilleur classificateur (AUC = 95%) a été conçu à partir de marqueurs autonomiques obtenus pendant la nuit, améliorant des modèles prédictifs décrits précédemment pour la stratification du risque dans le BS à partir de la combinaison de paramètres non invasifs. Bien que l’analyse multivariée proposée montre une amélioration des performances de classification par rapport à la littérature, les méthodes utilisées n’intègrent pas de connaissance physiologique dans le traitement des données. Or le BS étant une pathologie complexe et multifactorielle, l’utilisation de modèles mathématiques de connaissance peut s’avérer pertinente car cela permet l’intégration d’information physiologique dans le traitement des données et l’analyse de mécanismes sous-jacents qui sont difficiles ou impossibles à observer en clinique avec des méthodes non-invasives, comme le tonus vagal ou sympathique. Une analyse à base de modèle a été proposée durant la thèse afin : 1) d’étudier la réponse autonomique et hémodynamique au test d’orthostatisme chez des sujets sains et des patients BS, 2) de simuler les réponses vagales et sympathiques durant l’épreuve d’effort chez les patients BS symptomatiques et asymptomatiques. Concernant l’étude de la réponse au test d’orthostatisme, un modèle a été proposé de manière à intégrer les représentations : i) de l’activité électrique cardiaque, ii) de la mécanique des ventricules et des oreillettes, iii) des circulations systémique et pulmonaire et iv) du baroréflexe incluant les voies vagale et sympathique. Le modèle complet permet de simuler les réponses hémodynamiques et autonomiques au test d’orthostatisme. Des analyses de sensibilité, basées sur des méthodes globales et de criblage, ont mis en évidence l’importance de certains paramètres du baroréflexe et en lien avec la description des propriétés diastoliques des ventricules. Ces paramètres ont pu être identifiés, à l’aide d’algorithmes évolutionnaires, afin de créer des modèles spécifiques-patients de 8 sujets sains et 12 patients BS. Les résultats ont montré des différences significatives concernant la réponse sympathique au tilt-test entre sujets sains et BS. Par ailleurs, les patients symptomatiques et asymptomatiques sont associés des modifications significatives des paramètres diastoliques ventriculaires. Concernant les simulations de la réponse autonomique durant l’épreuve d’effort, un algorithme d’identification récursif a pu être mis en oeuvre sur un modèle composé des cavités cardiaques, des circulations systémique et pulmonaire, couplées au baroréflexe. L’identification récursive réalisée sur le modèle a permis une estimation des activités vagale et sympathique durant l’effort chez 13 patients BS symptomatiques et 31 asymptomatiques. Les patients symptomatiques ont montré une élévation significative de l’activité vagale, spécialement à la fin de l’échauffement. Les analyses réalisées sur les modèles proposés, concernant le test d’orthostatisme et l’épreuve d’effort, ont permis une exploration de variables physiologiques, difficilement observables. Les résultats obtenus avec les modèles mettent en évidence des modifications de la réponse hémodynamique cardiaque et confirment des modifications de la balance sympatho-vagale entre les patients symptomatiques et asymptomatiques. En résumé, les résultats obtenus mettent en évidence un déséquilibre de la balance sympathovagale entre les patients symptomatiques et asymptomatiques et montrent l’utilité des indices de variabilité cardiaque pour la classification des patients en fonction de la symptomatologie. Les résultats obtenus sont cohérents avec la littérature, rapportant un tonus vagal plus élevé, ainsi qu’une activité sympathique, variabilité et complexité cardiaques plus faibles, chez les patients symptomatiques. Des études précédentes ont rapporté que la plupart des événements cardiaques majeurs se produisent au repos et pendant le sommeil, ainsi que l’apparition des altérations électrocardiographiques caractéristiques du BS augmente avec la stimulation vagale. Les résultats obtenus pendant la nuit, lorsque l’activité parasympathique est prédominante, ont montré des résultats particulièrement pertinents pour la différentiation des populations de patients. De plus, étant donnée qu’il existe une activité parasympathique significativement plus élevée chez les patients symptomatiques pendant les tests d’exercice et d’orthostatisme par rapport aux sujets asymptomatiques, les résultats soulignent le rôle de l’analyse du tonus vagal pour la stratification du risque dans cette population. Enfin, l’analyse basée sur un modèle du système cardiovasculaire a permis de mettre en évidence des différences concernant les propriétés diastoliques cardiaques et la réponse du baroréflexe pendant le test d’orthostatisme. L’ensemble des résultats de la thèse permet une meilleure caractérisation des profils autonomiques des patients atteints du syndrome de Brugada et laisse envisager une amélioration de la sélection des patients pour implantation d’un DI.Postprint (published version