Proceedings. 27. Workshop Computational Intelligence, Dortmund, 23. - 24. November 2017

Dieser Tagungsband enthält die Beiträge des 27. Workshops Computational Intelligence. Die Schwerpunkte sind Methoden, Anwendungen und Tools für Fuzzy-Systeme, Künstliche Neuronale Netze, Evolutionäre Algorithmen und Data-Mining-Verfahren sowie der Methodenvergleich anhand von industriellen und Benchmark-Problemen

Bioinformatics Applications Based On Machine Learning

The great advances in information technology (IT) have implications for many sectors, such as bioinformatics, and has considerably increased their possibilities. This book presents a collection of 11 original research papers, all of them related to the application of IT-related techniques within the bioinformatics sector: from new applications created from the adaptation and application of existing techniques to the creation of new methodologies to solve existing problems

Algorithms and representations for supporting online music creation with large-scale audio databases

The rapid adoption of Internet and web technologies has created an opportunity for making music collaboratively by sharing information online. However, current applications for online music making do not take advantage of the potential of shared information. The goal of this dissertation is to provide and evaluate algorithms and representations for interacting with large audio databases that facilitate music creation by online communities. This work has been developed in the context of Freesound, a large-scale, community-driven database of audio recordings shared under Creative Commons (CC) licenses. The diversity of sounds available through this kind of platform is unprecedented. At the same time, the unstructured nature of community-driven processes poses new challenges for indexing and retrieving information to support musical creativity. In this dissertation we propose and evaluate algorithms and representations for dealing with the main elements required by online music making applications based on large-scale audio databases: sound files, including time-varying and aggregate representations, taxonomies for retrieving sounds, music representations and community models. As a generic low-level representation for audio signals, we analyze the framework of cepstral coefficients, evaluating their performance with example classification tasks. We found that switching to more recent auditory filter such as gammatone filters improves, at large scales, on traditional representations based on the mel scale. We then consider common types of sounds for obtaining aggregated representations. We show that several time series analysis features computed from the cepstral coefficients complement traditional statistics for improved performance. For interacting with large databases of sounds, we propose a novel unsupervised algorithm that automatically generates taxonomical organizations based on the low-level signal representations. Based on user studies, we show that our approach can be used in place of traditional supervised classification approaches for providing a lexicon of acoustic categories suitable for creative applications. Next, a computational representation is described for music based on audio samples. We demonstrate through a user experiment that it facilitates collaborative creation and supports computational analysis using the lexicons generated by sound taxonomies. Finally, we deal with representation and analysis of user communities. We propose a method for measuring collective creativity in audio sharing. By analyzing the activity of the Freesound community over a period of more than 5 years, we show that the proposed creativity measures can be significantly related to social structure characterized by network analysis.La ràpida adopció dInternet i de les tecnologies web ha creat una oportunitat per fer música col•laborativa mitjançant l'intercanvi d'informació en línia. No obstant això, les aplicacions actuals per fer música en línia no aprofiten el potencial de la informació compartida. L'objectiu d'aquesta tesi és proporcionar i avaluar algorismes i representacions per a interactuar amb grans bases de dades d'àudio que facilitin la creació de música per part de comunitats virtuals. Aquest treball ha estat desenvolupat en el context de Freesound, una base de dades d'enregistraments sonors compartits sota llicència Creative Commons (CC) a gran escala, impulsada per la comunitat d'usuaris. La diversitat de sons disponibles a través d'aquest tipus de plataforma no té precedents. Alhora, la naturalesa desestructurada dels processos impulsats per comunitats planteja nous reptes per a la indexació i recuperació d'informació que dona suport a la creativitat musical. En aquesta tesi proposem i avaluem algorismes i representacions per tractar amb els principals elements requerits per les aplicacions de creació musical en línia basades en bases de dades d'àudio a gran escala: els arxius de so, incloent representacions temporals i agregades, taxonomies per a cercar sons, representacions musicals i models de comunitat. Com a representació de baix nivell genèrica per a senyals d'àudio, s'analitza el marc dels coeficients cepstrum, avaluant el seu rendiment en tasques de classificació d'exemple. Hem trobat que el canvi a un filtre auditiu més recent com els filtres de gammatons millora, a gran escala, respecte de les representacions tradicionals basades en l'escala mel. Després considerem tres tipus comuns de sons per a l'obtenció de representacions agregades. Es demostra que diverses funcions d'anàlisi de sèries temporals calculades a partir dels coeficients cepstrum complementen les estadístiques tradicionals per a un millor rendiment. Per interactuar amb grans bases de dades de sons, es proposa un nou algorisme no supervisat que genera automàticament organitzacions taxonòmiques basades en les representacions de senyal de baix nivell. Em base a estudis amb usuaris, mostrem que el sistema proposat es pot utilitzar en lloc dels sistemes tradicionals de classificació supervisada per proporcionar un lèxic de categories acústiques adequades per a aplicacions creatives. A continuació, es descriu una representació computacional per a música creada a partir de mostres d'àudio. Demostrem a través d'un experiment amb usuaris que facilita la creació col•laborativa i dóna suport l'anàlisi computacional usant els lèxics generats per les taxonomies de so. Finalment, ens centrem en la representació i anàlisi de comunitats d'usuaris. Proposem un mètode per mesurar la creativitat col•lectiva en l'intercanvi d'àudio. Mitjançant l'anàlisi de l'activitat de la comunitat Freesound durant un període de més de 5 anys, es mostra que les mesures proposades de creativitat es poden relacionar significativament amb l'estructura social descrita mitjançant l'anàlisi de xarxes.La rápida adopción de Internet y de las tecnologías web ha creado una oportunidad para hacer música colaborativa mediante el intercambio de información en línea. Sin embargo, las aplicaciones actuales para hacer música en línea no aprovechan el potencial de la información compartida. El objetivo de esta tesis es proporcionar y evaluar algoritmos y representaciones para interactuar con grandes bases de datos de audio que faciliten la creación de música por parte de comunidades virtuales. Este trabajo ha sido desarrollado en el contexto de Freesound, una base de datos de grabaciones sonoras compartidos bajo licencia Creative Commons (CC) a gran escala, impulsada por la comunidad de usuarios. La diversidad de sonidos disponibles a través de este tipo de plataforma no tiene precedentes. Al mismo tiempo, la naturaleza desestructurada de los procesos impulsados por comunidades plantea nuevos retos para la indexación y recuperación de información en apoyo de la creatividad musical. En esta tesis proponemos y evaluamos algoritmos y representaciones para tratar con los principales elementos requeridos por las aplicaciones de creación musical en línea basadas en bases de datos de audio a gran escala: archivos de sonido, incluyendo representaciones temporales y agregadas, taxonomías para buscar sonidos, representaciones musicales y modelos de comunidad. Como representación de bajo nivel genérica para señales de audio, se analiza el marco de los coeficientes cepstrum, evaluando su rendimiento en tareas de clasificación. Encontramos que el cambio a un filtro auditivo más reciente como los filtros de gammatonos mejora, a gran escala, respecto de las representaciones tradicionales basadas en la escala mel. Después consideramos tres tipos comunes de sonidos para la obtención de representaciones agregadas. Se demuestra que varias funciones de análisis de series temporales calculadas a partir de los coeficientes cepstrum complementan las estadísticas tradicionales para un mejor rendimiento. Para interactuar con grandes bases de datos de sonidos, se propone un nuevo algoritmo no supervisado que genera automáticamente organizaciones taxonómicas basadas en las representaciones de señal de bajo nivel. En base a estudios con usuarios, mostramos que nuestro enfoque se puede utilizar en lugar de los sistemas tradicionales de clasificación supervisada para proporcionar un léxico de categorías acústicas adecuadas para aplicaciones creativas. A continuación, se describe una representación computacional para música creada a partir de muestras de audio. Demostramos, a través de un experimento con usuarios, que facilita la creación colaborativa y posibilita el análisis computacional usando los léxicos generados por las taxonomías de sonido. Finalmente, nos centramos en la representación y análisis de comunidades de usuarios. Proponemos un método para medir la creatividad colectiva en el intercambio de audio. Mediante un análisis de la actividad de la comunidad Freesound durante un periodo de más de 5 años, se muestra que las medidas propuestas de creatividad se pueden relacionar significativamente con la estructura social descrita mediante análisis de redes

Análisis de datos etnográficos, antropológicos y arqueológicos: una aproximación desde las humanidades digitales y los sistemas complejos

La llegada de las Ciencias de la Computación, el Big Data, el Análisis de Datos, el Aprendizaje Automático y la Minería de Datos ha modificado la manera en que se hace ciencia en todos los campos científicos, dando lugar, a su vez, a la aparición de nuevas disciplinas tales como la Mecánica Computacional, la Bioinformática, la Ingeniería de la Salud, las Ciencias Sociales Computacionales, la Economía Computacional, la Arqueología Computacional y las Humanidades Digitales –entre otras. Cabe destacar que todas estas nuevas disciplinas son todavía muy jóvenes y están en continuo crecimiento, por lo que contribuir a su avance y consolidación tiene un gran valor científico. En esta tesis doctoral contribuimos al desarrollo de una nueva línea de investigación dedicada al uso de modelos formales, métodos analíticos y enfoques computacionales para el estudio de las sociedades humanas tanto actuales como del pasado.El Ministerio de Ciencia e Innovación • Proyecto SimulPast – “Transiciones sociales y ambientales: simulando el pasado para entender el comportamiento humano” (CSD2010-00034 CONSOLIDER-INGENIO 2010). • Proyecto CULM – “Modelado del cultivo en la prehistoria” (HAR2016-77672-P). • Red de Excelencia SimPastNet – “Simular el pasado para entender el comportamiento humano” (HAR2017-90883-REDC). • Red de Excelencia SocioComplex – “Sistemas Complejos Socio-Tecnológicos” (RED2018-102518-T). La Consejería de Educación de la Junta de Castilla y León • Subvención a la línea de investigación “Entendiendo el comportamiento humano, una aproximación desde los sistemas complejos y las humanidades digitales” dentro del programa de apoyo a los grupos de investigación reconocidos (GIR) de las universidades públicas de Castilla y León (BDNS 425389

Multivariate Statistical Machine Learning Methods for Genomic Prediction

This book is open access under a CC BY 4.0 license This open access book brings together the latest genome base prediction models currently being used by statisticians, breeders and data scientists. It provides an accessible way to understand the theory behind each statistical learning tool, the required pre-processing, the basics of model building, how to train statistical learning methods, the basic R scripts needed to implement each statistical learning tool, and the output of each tool. To do so, for each tool the book provides background theory, some elements of the R statistical software for its implementation, the conceptual underpinnings, and at least two illustrative examples with data from real-world genomic selection experiments. Lastly, worked-out examples help readers check their own comprehension. The book will greatly appeal to readers in plant (and animal) breeding, geneticists and statisticians, as it provides in a very accessible way the necessary theory, the appropriate R code, and illustrative examples for a complete understanding of each statistical learning tool. In addition, it weighs the advantages and disadvantages of each tool

Multivariate Statistical Machine Learning Methods for Genomic Prediction

This book is open access under a CC BY 4.0 license This open access book brings together the latest genome base prediction models currently being used by statisticians, breeders and data scientists. It provides an accessible way to understand the theory behind each statistical learning tool, the required pre-processing, the basics of model building, how to train statistical learning methods, the basic R scripts needed to implement each statistical learning tool, and the output of each tool. To do so, for each tool the book provides background theory, some elements of the R statistical software for its implementation, the conceptual underpinnings, and at least two illustrative examples with data from real-world genomic selection experiments. Lastly, worked-out examples help readers check their own comprehension. The book will greatly appeal to readers in plant (and animal) breeding, geneticists and statisticians, as it provides in a very accessible way the necessary theory, the appropriate R code, and illustrative examples for a complete understanding of each statistical learning tool. In addition, it weighs the advantages and disadvantages of each tool

Social Network Dynamics

This thesis focuses on the analysis of structural and topological network problems. In particular, in this work the privileged subjects of investigation will be both static and dynamic social networks. Nowadays, the constantly growing availability of Big Data describing human behaviors (i.e., the ones provided by online social networks, telco companies, insurances, airline companies. . . ) offers the chance to evaluate and validate, on large scale realities, the performances of algorithmic approaches and the soundness of sociological theories. In this scenario, exploiting data-driven methodologies enables for a more careful modeling and thorough understanding of observed phenomena. In the last decade, graph theory has lived a second youth: the scientific community has extensively adopted, and sharpened, its tools to shape the so called Network Science. Within this highly active field of research, it is recently emerged the need to extend classic network analytical methodologies in order to cope with a very important, previously underestimated, semantic information: time. Such awareness has been the linchpin for recent works that have started to redefine form scratch well known network problems in order to better understand the evolving nature of human interactions. Indeed, social networks are highly dynamic realities: nodes and edges appear and disappear as time goes by describing the natural lives of social ties: for this reason. it is mandatory to assess the impact that time-aware approaches have on the solution of network problems. Moving from the analysis of the strength of social ties, passing through node ranking and link prediction till reaching community discovery, this thesis aims to discuss data-driven methodologies specifically tailored to approach social network issues in semantic enriched scenarios. To this end, both static and dynamic analytical processes will be introduced and tested on real world data