211 research outputs found

    Evolutionary history of the Galápagos Rail Revealed by ancient mitogenomes and modern samples

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    The biotas of the Galápagos Islands are one of the best studied island systems and have provided a broad model for insular species’ origins and evolution. Nevertheless, some locally endemic taxa, such as the Galápagos Rail Laterallus spilonota, remain poorly characterized. Owing to its elusive behavior, cryptic plumage, and restricted distribution, the Galápagos Rail is one of the least studied endemic vertebrates of the Galapagos Islands. To date, there is no genetic data for this species, leaving its origins, relationships to other taxa, and levels of genetic diversity uncharacterized. This lack of information is critical given the adverse fate of island rail species around the world in the recent past. Here, we examine the genetics of Galápagos Rails using a combination of mitogenome de novo assembly with multilocus nuclear and mitochondrial sequencing from both modern and historical samples. We show that the Galápagos Rail is part of the “American black rail clade”, sister to the Black Rail L. jamaicensis, with a colonization of Galápagos dated to 1.2 million years ago. A separate analysis of one nuclear and two mitochondrial markers in the larger population samples demonstrates a shallow population structure across the islands, possibly due to elevated island connectivity. Additionally, birds from the island Pinta possessed the lowest levels of genetic diversity, possibly reflecting past population bottlenecks associated with overgrazing of their habitat by invasive goats. The modern and historical data presented here highlight the low genetic diversity in this endemic rail species and provide useful information to guide conservation efforts.Fil: Chaves, Jaime A.. San Francisco State University; Estados Unidos. Universidad San Francisco de Quito; EcuadorFil: Martinez Torres, Pedro J.. Universidad San Francisco de Quito; EcuadorFil: Depino, Emiliano Agustín. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Bio y Geociencias del NOA. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Museo de Ciencias Naturales. Instituto de Bio y Geociencias del NOA; ArgentinaFil: Espinoza Ulloa, Sebastian. University of Saskatchewan; Canadá. Pontificia Universidad Católica del Ecuador; EcuadorFil: García Loor, Jefferson. Universidad San Francisco de Quito; EcuadorFil: Beichman, Annabel C.. University of Washington; Estados UnidosFil: Stervander, Martin. Natural History Museum; Reino Unid

    Métodos para el control e inhibición de la acumulación de depósitos parafínicos

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    Paraffin deposition is one of the biggest issues in crude oil production, transport and storage. Inhibition by magnetic treatment is a choice that improves rheological properties of the treated crude oil, without modifying its chemical properties. This study presents a revision of works carried out in national and international oil fields, where different paraffin inhibition methods have been applied, and to standing out the advantages of using the magnetic method: paraffin removal processes reduction in the treated wells, low maintenance costs, paraffin inhibition without production process interruptions or formation damage to utilizing only reservoir energy. Those facts make the magnetic treatment and interesting choice for reducing significantly the lift cost of the barrel of petroleum produced and to keep paraffin crude oil with high mobility.La acumulación de parafina es uno de los mayores inconvenientes en la producción, transporte y almacenamiento de crudo. La inhibición por medio del método magnético es una alternativa que mejora las propiedades reológicas del crudo tratado sin alterar sus propiedades químicas. Este estudio presenta una revisión de los trabajos hechos en campos petrolíferos a nivel nacional e internacional, donde se han aplicado distintos métodos para la inhibición de precipitación de parafinas y exaltado las ventajas del uso del método magnético: reducción de los trabajos de limpieza en los pozos tratados, bajos costos de mantenimiento, la inhibición de depósitos de parafina sin interrupción de la producción o daños a la formación utilizando únicamente la energía del yacimiento. Lo anteriormente expuesto hace del tratamiento magnético una interesante opción para reducir sustancialmente los costos del barril producido y mantener con una alta movilidad el crudo parafínico

    Métodos para el control e inhibición de la acumulación de depósitos parafínicos

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    Paraffin deposition is one of the biggest issues in crude oil production, transport and storage. Inhibition by magnetic treatment is a choice that improves rheological properties of the treated crude oil, without modifying its chemical properties. This study presents a revision of works carried out in national and international oil fields, where different paraffin inhibition methods have been applied, and to standing out the advantages of using the magnetic method: paraffin removal processes reduction in the treated wells, low maintenance costs, paraffin inhibition without production process interruptions or formation damage to utilizing only reservoir energy. Those facts make the magnetic treatment and interesting choice for reducing significantly the lift cost of the barrel of petroleum produced and to keep paraffin crude oil with high mobility.La acumulación de parafina es uno de los mayores inconvenientes en la producción, transporte y almacenamiento de crudo. La inhibición por medio del método magnético es una alternativa que mejora las propiedades reológicas del crudo tratado sin alterar sus propiedades químicas. Este estudio presenta una revisión de los trabajos hechos en campos petrolíferos a nivel nacional e internacional, donde se han aplicado distintos métodos para la inhibición de precipitación de parafinas y exaltado las ventajas del uso del método magnético: reducción de los trabajos de limpieza en los pozos tratados, bajos costos de mantenimiento, la inhibición de depósitos de parafina sin interrupción de la producción o daños a la formación utilizando únicamente la energía del yacimiento. Lo anteriormente expuesto hace del tratamiento magnético una interesante opción para reducir sustancialmente los costos del barril producido y mantener con una alta movilidad el crudo parafínico

    Modelo DBI con argumentación y planificación aplicado a juegos con agentes inteligentes autónomos

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    Este artículo presenta el diseño y los resultados del sistema multi-agente d3lp0r, desarrollado por un grupo de estudiantes del Laboratorio de Investigación y Desarrollo en Inteligencia Artificial (LIDIA) para el Multi-Agent Programming Contest 2011 (MAPC). Los agentes diseñados para el sistema utilizan una arquitectura BDI extendida con planning y argumentación (utilizando Programación Lógica Rebatible) para modelar un equipo que opera de manera cooperativa en un entorno din amico de competencia. En particular, el principal objetivo de este artículo es describir la arquitectura elegida, el esquema de comunicación, y el uso dado a la argumentación en el proceso de razonamiento de los agentes.Eje: Agentes y Sistemas InteligentesRed de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI

    Chronological and biological aging of the human left ventricular myocardium: Analysis of microRNAs contribution

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    Aging is the main risk factor for cardiovascular diseases. In humans, cardiac aging remains poorly characterized. Most studies are based on chronological age (CA) and disregard biological age (BA), the actual physiological age (result of the aging rate on the organ structure and function), thus yielding potentially imperfect outcomes. Deciphering the molecular basis of ventricular aging, especially by BA, could lead to major progresses in cardiac research. We aim to describe the transcriptome dynamics of the aging left ventricle (LV) in humans according to both CA and BA and characterize the contribution of microRNAs, key transcriptional regulators. BA is measured using two CA-associated transcriptional markers: CDKN2A expression, a cell senescence marker, and apparent age (AppAge), a highly complex transcriptional index. Bioinformatics analysis of 132 LV samples shows that CDKN2A expression and AppAge represent transcriptomic changes better than CA. Both BA markers are biologically validated in relation to an aging phenotype associated with heart dysfunction, the amount of cardiac fibrosis. BA-based analyses uncover depleted cardiac-specific processes, among other relevant functions, that are undetected by CA. Twenty BA-related microRNAs are identified, and two of them highly heart-enriched that are present in plasma. We describe a microRNA-gene regulatory network related to cardiac processes that are partially validated in vitro and in LV samples from living donors. We prove the higher sensitivity of BA over CA to explain transcriptomic changes in the aging myocardium and report novel molecular insights into human LV biological aging. Our results can find application in future therapeutic and biomarker research

    Nondisjunction of a Single Chromosome Leads to Breakage and Activation of DNA Damage Checkpoint in G2

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    The resolution of chromosomes during anaphase is a key step in mitosis. Failure to disjoin chromatids compromises the fidelity of chromosome inheritance and generates aneuploidy and chromosome rearrangements, conditions linked to cancer development. Inactivation of topoisomerase II, condensin, or separase leads to gross chromosome nondisjunction. However, the fate of cells when one or a few chromosomes fail to separate has not been determined. Here, we describe a genetic system to induce mitotic progression in the presence of nondisjunction in yeast chromosome XII right arm (cXIIr), which allows the characterisation of the cellular fate of the progeny. Surprisingly, we find that the execution of karyokinesis and cytokinesis is timely and produces severing of cXIIr on or near the repetitive ribosomal gene array. Consequently, one end of the broken chromatid finishes up in each of the new daughter cells, generating a novel type of one-ended double-strand break. Importantly, both daughter cells enter a new cycle and the damage is not detected until the next G2, when cells arrest in a Rad9-dependent manner. Cytologically, we observed the accumulation of damage foci containing RPA/Rad52 proteins but failed to detect Mre11, indicating that cells attempt to repair both chromosome arms through a MRX-independent recombinational pathway. Finally, we analysed several surviving colonies arising after just one cell cycle with cXIIr nondisjunction. We found that aberrant forms of the chromosome were recovered, especially when RAD52 was deleted. Our results demonstrate that, in yeast cells, the Rad9-DNA damage checkpoint plays an important role responding to compromised genome integrity caused by mitotic nondisjunction

    Jardins per a la salut

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    Facultat de Farmàcia, Universitat de Barcelona. Ensenyament: Grau de Farmàcia. Assignatura: Botànica farmacèutica. Curs: 2014-2015. Coordinadors: Joan Simon, Cèsar Blanché i Maria Bosch.Els materials que aquí es presenten són el recull de les fitxes botàniques de 128 espècies presents en el Jardí Ferran Soldevila de l’Edifici Històric de la UB. Els treballs han estat realitzats manera individual per part dels estudiants dels grups M-3 i T-1 de l’assignatura Botànica Farmacèutica durant els mesos de febrer a maig del curs 2014-15 com a resultat final del Projecte d’Innovació Docent «Jardins per a la salut: aprenentatge servei a Botànica farmacèutica» (codi 2014PID-UB/054). Tots els treballs s’han dut a terme a través de la plataforma de GoogleDocs i han estat tutoritzats pels professors de l’assignatura. L’objectiu principal de l’activitat ha estat fomentar l’aprenentatge autònom i col·laboratiu en Botànica farmacèutica. També s’ha pretès motivar els estudiants a través del retorn de part del seu esforç a la societat a través d’una experiència d’Aprenentatge-Servei, deixant disponible finalment el treball dels estudiants per a poder ser consultable a través d’una Web pública amb la possibilitat de poder-ho fer in-situ en el propi jardí mitjançant codis QR amb un smartphone

    Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2

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    The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality

    Reformulando el tratamiento procesal de las víctimas de violencia sexual en procesos penales

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    Esta obra presenta las investigaciones desarrolladas a lo largo del proyecto europeo de investigación, financiado por el Programa de Justicia de la Union Europea (2014-2020): “RE-TREAT: Reshaping treatment approaches towards victims of sexual crimes within criminal proceedings”. Los objetivos perseguidos por este proyecto de investigación son, entre otros, el análisis de las barreras, recursos y prácticas nocivas en el tratamiento de las víctimas de delitos sexuales a lo largo de las diversas fases del proceso penal, identificación de mejores prácticas en este ámbito que pueden ser aplicadas por los operadores jurídicos, o bien, la sensibilización de los actores que abordan este fenómeno. Se presentan en el primer Capítulo los obstáculos que enfrentan las víctimas de delitos sexuales en las diversas etapas del proceso penal español, se describen los estándares prácticos para profesionales del sistema de justicia que trabajan con víctimas de violencia sexual en el Capítulo II de la obra. En el Capítulo III se incluyen recomendaciones políticas que permiten garantizar un mejor tratamiento hacia las víctimas de violencia sexual por parte del sistema de justicia en España y en el Capítulo IV el informe comparativo de la situación con Grecia e Italia.Esta obra presenta las investigaciones desarrolladas a lo largo del proyecto europeo de investigación, financiado por el Programa de Justicia de la Union Europea (2014-2020): “RE-TREAT: Reshaping treatment approaches towards victims of sexual crimes within criminal proceedings”Financed by The European Union Justice Program (2014-2020). RE-TREAT: Reshaping treatment approaches towards victims of sexual violence within criminal proceedings. JUST-JACC-AG-2019 - 878566 - RETREATObstáculos que enfrentan las víctimas de delito sexual en las etapas del proceso penal / Helena Soleto, Sabela Oubiña Barbolla, Jessica Jullien de Asís, Aurea Grané Chávez, Margarita Diges Junco, Candela Galán González, Nieves Pérez-Mata, Anna Fiodorova, Federico González Barrera, Iván Navarro Papic, Rosa Gómez de Liaño, Raquel López Jiménez, Daniel Rodríguez Horcajo, Soledad Torrecuadrada García Lozano, Ignacio de Torres Guajardo, Belén Hernández Moura, Emiliano Carretero Morales, Irene de Lamo Velado, Rocío Zafra Espinosa de los Monteros, Cristina Ruiz López, Miriam Peláez Devesa (pp. 7-92). -- Guía para profesionales de la justicia que trabajan con mujeres víctimas de violencia sexual / Monique Anderson, Evelien Claes (pp. 93-116). -- Recomendaciones políticas / Monique Anderson, Evelien Claes, Anna Fiodorova, Helena Soleto (p. 117-165). -- Estudio comparativo sobre tratamiento procesal a víctimas de violencia sexual en España, Grecia e Italia / Sabela Oubiña Barbolla, Helena Soleto Muñoz, Nieves Pérez-Mata, Daniel Rodríguez Horcajo, Margarita Diges Junco, Miriam Peláez Devesa, Jessica Jullien de Asís, Aurea Grané, Candela Galán González, Manuel Cancio Meliá, Jose Alberto Revilla González (pp. 166-229

    Les droits disciplinaires des fonctions publiques : « unification », « harmonisation » ou « distanciation ». A propos de la loi du 26 avril 2016 relative à la déontologie et aux droits et obligations des fonctionnaires

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    The production of tt‾ , W+bb‾ and W+cc‾ is studied in the forward region of proton–proton collisions collected at a centre-of-mass energy of 8 TeV by the LHCb experiment, corresponding to an integrated luminosity of 1.98±0.02 fb−1 . The W bosons are reconstructed in the decays W→ℓν , where ℓ denotes muon or electron, while the b and c quarks are reconstructed as jets. All measured cross-sections are in agreement with next-to-leading-order Standard Model predictions.The production of ttt\overline{t}, W+bbW+b\overline{b} and W+ccW+c\overline{c} is studied in the forward region of proton-proton collisions collected at a centre-of-mass energy of 8 TeV by the LHCb experiment, corresponding to an integrated luminosity of 1.98 ±\pm 0.02 \mbox{fb}^{-1}. The WW bosons are reconstructed in the decays WνW\rightarrow\ell\nu, where \ell denotes muon or electron, while the bb and cc quarks are reconstructed as jets. All measured cross-sections are in agreement with next-to-leading-order Standard Model predictions
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