In-vitro testing of stent retrievers for cerebral thrombi removal

International audienceRecent articles appeared in literature demonstrated that early mechanical thrombectomy offered to patients presenting with acute ischemic stroke is related to improved functional outcome. Stent retrievers (STR) are recognized as the most effective devices for intracranial thrombectomy. In the present study we experimentally analyzed devices mechanical properties, behavior during retrieval and their interaction with clots of different features. The aim of this study was to identify any device feature that was functional to the thrombus removal

Analyzing the Evolution of Semantic Correspondences between SNOMED CT and ICT-9-CM

International audienceThe combined use of Knowledge Organizations Systems (KOS) including ontologies, terminologies or codification schemas has widespread in e-health systems over the past decades due to semantic interoperability reasons. However, the dynamic aspect of KOS forces knowledge engineers to maintain KOS elements, as well as semantic correspondences between KOS up-to-date. This is crucial to keep the underlying systems exploiting these KOS consistent over time. In this paper we provide a pragmatic analysis of the evolution of mappings between SNOMED CT and ICD-9-CM affected by the evolution of these two KOS

Requirements for Implementing Mappings Adaptation Systems

International audienceOntologies, or more generally speaking, Knowledge Organization Systems (KOS) have been developed to support the correct interpretation of shared data in collaborative applications. The quantity and the heterogeneity of domain knowledge often require several KOS to describe their content. In order to assure unambiguous interpretation, overlapped concepts of different, but domain-related KOS are semantically connected via mappings. However, in various domains, KOS periodically evolve creating the necessity of reviewing the validity of associated mappings. The size of KOS remains a barrier for a manual review of mappings, and rather requires the support of (semi-) automatic solutions. This article describes our experiences in understanding how KOS evolution affects mappings. We present our lessons learned from various empirical experiments, and we derive primary elements and requirements for improving the automation of mapping maintenance

Cenozoic tectonics of the Western Approaches Channel basins and its control of local drainage systems

International audienceLe domaine des Approches occidentales de la Manche constitue une zone clé pour caractériser l'évolution post-rift des marges continentales NW européennes associées à la collision Afrique/Europe. Malgré les divers témoins des inversions cénozoïques jalonnant le pourtour de la Manche, la structuration et l'amplitude des mouvements demeurent néanmoins incertaines au sein de la partie méridionale française des Approches occidentales. Il en est de même sur le rôle de l'inversion de la mer du Nord dans la mise en place du Fleuve Manche qui drainait un bassin versant bien supérieur à la Manche actuelle durant les grandes régressions plio-quaternaires et alimentait les éventails sous-marins Celtique et Armoricain en bas de pente. La réalisation des campagnes de sismique-réflexion haute résolution GEOMOC et GEOBREST03 dont les résultats font l'objet de cet article permettent de répondre à ces questions en complétant la connaissance géologique de la Manche. Les nouvelles observations soulignent le diachronisme et le contraste de l'amplitude des mouvements du système de failles associées à l'inversion du bassin d'Iroise. Celle-ci se fait en deux épisodes: un épisode paroxysmal paléogène décomposé en deux phases, éocène (Yprésien probable) et oligocène, et un épisode néogène plus modéré réactivant partiellement les structures impliquées antérieurement. Les déformations se concentrent le long de l'accident nord Iroise (NIF) situé dans le prolongement de la faille Médio-Manche et entraîne localement des plissements de la couverture sédimentaire à l'aplomb des accidents profonds. L'inversion induit ainsi un soulèvement de près de 700 m du plateau médian situé au sud de l'accident nord Iroise. La cartographie isochrone des séquences sismiques identifiées démontre également le contrôle majeur des structures tectoniques sur la mise en place des dépôts néogènes. Le soulèvement de la partie orientale du bassin favorise ainsi la mise en place de vastes prismes progradants d'âge miocène supérieur, et contrôle le développement postérieur du réseau des paléo-vallées constituant l'extrémité occidentale du fleuve Manche. Ce réseau présente une géométrie en baïonnette marquée par de brutaux changements de directions variant de N040 à N070, cette dernière direction caractérisant la plus grande partie des failles néogènes associées au bassin d'Iroise. Les paléo-vallées se seraient développées lors d'une chute du niveau marin au-delà du rebord de plate-forme et la stratigraphie établie à travers cette étude amène à placer le début des incisions au Pliocène (Reurévien ou pré-Tiglien). La chute amplifiée par l'inversion du bassin d'Iroise serait suivie d'un basculement tardif de la plate-forme externe à l'instar des observations réalisées sur de nombreuses marges du pourtour nord atlantique

Multi-Platform Next-Generation Sequencing of the Domestic Turkey (Meleagris gallopavo): Genome Assembly and Analysis

The combined application of next-generation sequencing platforms has provided an economical approach to unlocking the potential of the turkey genome

Modélisation logique et générique des systèmes d'hypermédias adaptatifs

Les hypermédias adaptatifs, comme tous les systèmes à base de connaissances, peuvent être divisés en deux parties : une partie statique, permettant la représentation de données relatives aux domaines à traiter, et une partie dynamique, consacrée au traitement des données par différents procédés.Les modèles de données existants sont souvent difficiles à réutiliser car ils sont soit très spécifiques à une application particulière, soit très généraux et, dans ce cas, il est rarement possible de les rendre plus spécifiques pour un domaine d application particulier. Les modèles d adaptation existants se limitent souvent à des langages de règles, qui ne font pas de distinction entre les différentes sortes de données.Cette thèse propose des modèles génériques de données, décrits sous forme de diagrammes de classe UML, permettant par spécialisation la création de modèles spécifiques à un domaine d application. Elle présente également un modèle d adaptation entièrement décrit en calcul des prédicats du premier ordre, basé sur la logique situationnelle, et muni d un langage de règles constitué de plusieurs niveaux, prenant en compte les différents types de données à des niveaux différents du langage. Ce langage introduit, en outre, une forme de méta-adaptation, par sélection de stratégies de parcours du domaine. Cette thèse introduit la notion de parcours par tronçons, qui offre une solution intermédiaire, entre le parcours libre et le parcours guidé. L ensemble des modèles est utilisé pour proposer une application dans le domaine du e-learning.Adaptive hypermedia systems can be split in two parts, as any knowledge-based systems: a static part, in charge of representing the data related to the application, and a dynamic part, in charge of computing the data.The existing data models are difficult to reuse, since they are either dedicated to a specific application, or very general, in which case they can rarely be specified to fit a domain in particular. The adaptation models are often limited to a rule language, which makes no distinction between the different kinds of data it deals with.This thesis describes generic data models, which allow the creation data models specific for a given domain. These models are provided as UML class diagrams, which can be specialized to provide specific models. This thesis also describes an adaptation model. This model is based on first order logic. It reuses the situation calculus, and introduces a rule language working altogether with the calculus. This rule language is made of different layers, which take into account the different kinds of data. It also allows the description of meta-adaptation, by selection of adaptation strategies. Finally, this thesis introduces the notion of semi-guidance, an intermediary between full guidance and free navigation. All the models described above have been used to provide an e-learning application.ORSAY-PARIS 11-BU Sciences (914712101) / SudocSudocFranceF

Une architecture pour la reconnaissance-identification de cibles terrestres à partir d'images SAR et infrarouges haute résolution

Cette thèse concerne l'élaboration d'un système pour la reconnaissance - identification de cibles terrestres à partir d'images infrarouge et SAR haute résolution. Nous proposons tout d'abord une revue de travaux dans le domaine de la reconnaissance- identification d'objets, en l'orientant sur des démarches utilisant des images optronique et SAR. Cette présentation s'appuie d'une part sur la description des objets puis d'autre part sur les processus de reconnaissance. Ensuite, nous étendons notre approche à la conception d'un système de fusion. Cette conception s'appuie sur une décomposition en différentes fonctionnalités et elle est orientée interaction entre les différents modules. Une phase de dimensionnement permet d'intégrer dans l'élaboration du système les spécifications et les contraintes imposées par le cadre applicatif (composition des images, information sur les cibles, nombre des données disponibles, charge calculatoire, etc...). A l'issue de cette phase, nous proposons une approche de type prédiction vérification. La première étape est la constitution d'un ensemble d'enveloppes convexes à partir des images. Une enveloppe est construite à partir de points chauds et de points brillants. Leur extraction s'effectue selon un jeu de seuil. Ainsi sont générés différents ensembles de points qui conduisent à plusieurs enveloppes convexes puis à plusieurs hypothèses de modèles. La seconde étape permet de vérifier les modèles retenus par comparaison de l'image infrarouge et d'une image de synthèse. L'évaluation du système proposé est réalisée sur un ensemble d'images réelles issues des capteurs RAMSES (radar) et TIMBRE POSTE (optronique et infrarouge) de l'ONERA.The purpose of this work is to build a recognition system. Our application deals with SAR and infrared aerial images. First, we review object recognition approaches and more specifically SAR and infrared processing methods. This review is composed on one hand of object description and recognition process on the other hand. Then, we extend our approach to fusion system conception. This conception is based on a functional decomposition and is interacting processes oriented. A design step integrates requirements and constraints imposed by our application (image composition, target information, volume of data, computational load, etc...). After this step, we propose a prediction verification approach. The first module builds a set of convex hull from images. A convex hull is computed from hot and scattering points. These points are extracted with different thresholds, generating different sets of points. Then several convex hull are constructed which lead to several model hypotheses. The second module verifies models chosen by comparing the infrared image and a synthetic silhouette image. The evaluation of the proposed system is performed on real images acquired with two ONERA sensors: RAMSES (SAR) and TIMBRE POSTE (optronic and infrared).ORSAY-PARIS 11-BU Sciences (914712101) / SudocSudocFranceF

Une approche adaptative pour la recherche d'information sur le Web

Nous nous sommes interesses a la prise en compte de l'evolution des donnees du web dans le but d'ameliorer, en terme de pertinence, la recherche documentaire sur le web. La solution proposee s appuie sur les ontologies, fondement du web semantique, pour representer les connaissances du domaine de recherche vise par des requetes ainsi que les vues des utilisateurs sur ce domaine. Dans la solution preconisee, les ontologies sont vues comme des connaissances evoluant au cours du temps. Ainsi, l'evolution des ontologies est envisagee sous deux aspects: de maniere generale par rapport au domaine vise par la requete et de maniere particuliere par rapport aux connaissances des utilisateurs. Nous proposons d abord, base sur des idees emises en psychologie, un modele d'ontologies adaptatives ainsi qu'un processus permettant aux ontologies de s'adapter aux evolutions des connaissances du domaine. Ensuite, nous proposons une exploitation de ces ontologies pour ameliorer la recherche de donnees sur le web. Nous introduisons, les wpgraphs et w3graphs pour la representation du contenu du web, puis le langage de requete ask adapte a ces structures pour l'extraction des donnees pertinentes. Nous proposons egalement un ensemble de regles d'enrichissement des requetes ask base sur les relations ontologiques et les elements des ontologies adaptatives des ontologies representant le domaine vise et celle des vues des utilisateurs sur le domaine. Enfin nous proposons un outil pour la gestion de ces ontologies et la recherche documentaire sur le web et une validation experimentale des concepts introduits basee sur un cas d'etude realiste pour la recherche d'articles scientifiques.In this work, we address the problem of knowledge evolution for improving web search in the sense of relevance of the returned results. The advocated solution implements ontologies, cornerstone of the semantic web, for representing both the domain targeted by the query and the profile of the user who entered the query. Ontologies are considered as knowledge that is evolving over time. Hence, the ontology evolution problem is tackled as regard the evolution of the targeted domain but also with respect to the evolution of users' profile. First, based on the adaptation of ideas developed in psychology to the knowledge engineering field, we introduce a new paradigm: adaptive ontology and a process for making adaptive ontologies smoothly follow the evolution of a domain. Then, we propose an approach exploiting adaptive ontologies for improving web information retrieval. To this end, we first introduce data structures, wpgraphs and w3graphs, for representing web data. We then introduce the ask query language tailored to the extraction of relevant information from these structures. We also propose a set of query enrichment rules based on the exploitation of ontological relations as well as adaptive ontologies elements of the ontology representing the domain targeted by the query and the one representing the view of the user on the domain. Lastly, we present a tool for managing adaptive ontologies and for searching relevant information on the web as well as an experimental validation of the introduced concepts. We based our validation on the definition of a realistic case study devoted to the retrieval of scientific articles published at the www series of conference.ORSAY-PARIS 11-BU Sciences (914712101) / SudocSudocFranceF

Experimental Assessment of the TARGET Adaptive Ontology-based Web Search Framework

International audienceFinding relevant information on the Web can be a complex task for most of the users. Although Web search applications are improving, they still need to be more intelligent to adapt to the search domain targeted by users, the evolution of this domain and users' characteristics. In this paper, we present an experimental assessment of the TARGET framework for improving the relevance of the documents when users are searching the Web by using adaptive ontologies. This is done first by introducing the TARGET approach. We will briefly present the used ontologies and their ability to adapt the domain evolution. Then, we detail the TARGET tool used in our experimentations. This includes its architecture, its ability to carry out the ontology adaptation process as well as the way it searches the Web and ranks the returned results. Finally, we discuss the results obtained using the tool through the presentation of our case study devoted to the retrieval of scientific articles