Sandro Aguilar: não faço pitchings, não discuto o projecto, não faço castings, não planifico, não ensaio

O projecto “Principais tendências no cinema português contemporâneo” nasceu no Departamento de Cinema da ESTC, com o objectivo de desenvolver investigação especializada a partir de um núcleo formado por alunos da Licenciatura em Cinema e do Mestrado em Desenvolvimento de Projecto Cinematográfico, a que se juntaram professores-investigadores membros do CIAC e convidados. O que agora se divulga corresponde a dois anos e meio de trabalho desenvolvido pela equipa de investigação, entre Abril de 2009 e Novembro de 2011. Dada a forma que ele foi adquirindo, preferimos renomeá-lo, para efeitos de divulgação, “Novas & velhas tendências no cinema português contemporâneo”.QUAIS SÃO, hoje, as principais características do desenvolvimento de projectos para cinema em Portugal? O que pensam realizadores cinematográficos, produtores, distribuidores e exibidores sobre o cinema português? Que conclusões tirar das suas opiniões, relatos de experiências e análises da situação contemporânea? Que novas tendências surgiram no cinema português, nos primeiros anos do séc. XXI?Fundação para a Ciência e Tecnologia, Centro de Investigação em Artes e Comunicação, Instituto do Cinema e do Audiovisual, Ministério da Cultura, Escola Superior de Teatro e Cinema

Manipulação de interações entre proteínas com tratamentos enzimáticos e alta pressão para alterar as propriedades dos alimentos

The demand for proteins is rising and alternatives to animal-based proteins are necessary, either for nutritional or environmental reasons. Plant-based proteins appear as an alternative, however, their techno-functional properties need improvement. High-pressure processing (HPP) is a non-thermal technology that allows modifying proteins’ structure hence allowing to change several of their properties. Enzymes, such as microbial transglutaminase (MTG), can also modify the techno-functional properties of proteins, however, many globular proteins show low susceptibility to the action of this enzyme. HPP, being able to change protein conformation, may be a useful tool to increase the accessibility of proteins to the action of MTG. Nevertheless, HPP conditions need to be carefully optimized to avoid the expected decrease in enzymatic activity when subjected to pressure. Pressure inactivation of MTG under different HPP conditions (200 – 600 MPa; 20 – 40 °C; 10 – 30 min) was evaluated at different pH values. At least 20 % of MTG was inactivated when low pressures (< 300 MPa) were used at pH 4 and 5, whereas a higher pressure (above 400 MPa) was needed to obtain a similar inactivation at pH 6 or 7. MTG pressure-inactivation followed first-order kinetics under all tested conditions. Inactivation rate constants decreased with increasing pressure at constant temperature and pH 4, with a positive activation volume, while the opposite was verified for the other pH values. Both activation energy and volume were dependent on pH. Overall, MTG can be considered relatively resistant to pressure, particularly near its optimal pH. The influence of HPP (200 – 600 MPa; 5 – 15 min) was also evaluated, applied individually or in combination with MTG (up to 30 U·g-1 ), on selected properties of pea (PPI) and soy (SPI) protein isolates with concentrations between 1 and 9 % (w/v). For a protein concentration of 1 % (w/v), HPP increased the protein solubility of both isolates when applied individually. This effect was more pronounced for SPI, particularly at pH 7 and 8. Similarly, the protein surface hydrophobicity also increased with HPP for proteins from both sources, increasing, in general, with increasing pressure and holding time. On the contrary, the content of free sulfhydryl groups decreased with HPP for proteins from both sources. The effects of HPP on the emulsifying properties of the protein isolates, considering both the whole and soluble protein fractions, were dependent on pH and HPP conditions (pressure, holding time). HPP appeared to have minimal effects on the surface tension of both proteins and the general absence of negative effects on emulsifying activity results from HPPinduced protein aggregation effects. On the other hand, MTG individual treatments had no significant effects on the studied properties. For the other protein concentrations studied, HPP increased the solubility of proteins when there were at low initial concentrations, decreasing it when they were in the higher concentration range analysed. Regardless of the concentration, HPP decreased the content of free sulfhydryl groups for pea proteins, however, had the contrary effect on soy proteins. Comparably to the solubility, the surface hydrophobicity increased in low protein concentrations and the contrary was verified in high protein concentrations. MTG decreased solubility and increased the content of free sulfhydryl groups of both proteins. The enzyme decreased the surface hydrophobicity of soy proteins and of the pea proteins, but only when these were within the higher concentration range analysed. When combined, HPP and MTG appear to have antagonistic effects on the solubility and content of free sulfhydryl groups and synergistic effects on viscosity. The obtained results indicate that simultaneous HPP and MTG treatments can be used to modify the proteins’ structure and consequently tailor their techno-functional properties.Verifica-se um crescente aumento da procura por proteínas para satisfazer as necessidades nutricionais da população a nível global, em particular de proteínas vegetais devido a preocupações nutricionais e ambientais. As proteínas de origem vegetal aparecem assim como uma alternativa vantajosa às proteínas de origem animal, no entanto, as suas propriedades tecno-funcionais precisam ser melhor conhecidas e otimizadas. O processamento de alta pressão (AP) é uma tecnologia não térmica que permite modificar a estrutura das proteínas, permitindo alterar várias das suas propriedades. Enzimas, como a transglutaminase microbiana (MTG), também podem modificar as propriedades tecno-funcionais das proteínas, no entanto, muitas proteínas globulares mostram baixa suscetibilidade à ação desta enzima. A AP, capaz de alterar a conformação de proteínas, pode ser uma ferramenta útil para aumentar a acessibilidade das proteínas à ação da MTG. No entanto, as condições de processamento precisam ser adequadamente otimizadas para evitar a diminuição da atividade enzimática quando sujeita a pressão. A inativação da MTG sob diferentes condições de pressão (200 – 600 MPa; 20 – 40 °C; 10 – 30 min) foi avaliada em diferentes valores de pH. Pelo menos 20% da MTG foi inativada quando foram usadas baixas pressões (< 300 MPa) a pH 4 e 5, enquanto foi necessária uma pressão acima de 400 MPa para obter uma inativação semelhante a pH 6 ou 7. A inativação por pressão da MTG seguiu uma cinética de primeira ordem em todas as condições testadas. As constantes cinéticas de inativação diminuíram com o aumento da pressão a uma temperatura constante a pH 4, com um volume de ativação positivo, enquanto o contrário foi verificado para os demais valores de pH. Tanto a energia de ativação quanto o volume de ativação foram dependentes do pH. No geral, a MTG pode ser considerada relativamente resistente à pressão, particularmente próximo do seu pH óptimo. Foi avaliada a influência da pressão (200 – 600 MPa; 5 – 15 min), aplicada individualmente ou em combinação com MTG (até 30 U·g-1 ), sobre propriedades selecionadas de proteínas de ervilha e soja com concentrações entre 1 e 9% (m/v). Para uma concentração de proteína de 1 % (m/v), a AP aumentou a solubilidade da proteína de ambos os isolados quando aplicada individualmente. Da mesma forma, a hidrofobicidade de superfície também aumentou com a AP nas proteínas de ambas as fontes, aumentando, em geral, com o aumento da pressão e do tempo. Pelo contrário, o conteúdo de grupos sulfidrilo livres diminuiu com a pressão nas proteínas de ambas as fontes. O efeito da AP nas propriedades emulsificantes das proteínas, considerando quer a fração total de proteína no isolado, quer a fração solúvel, foi dependente do pH e das condições de AP (pressão, tempo). A AP parece ter efeitos mínimos na tensão superficial de ambas as proteínas e a ausência geral de efeitos negativos na atividade emulsificante resulta dos efeitos de agregação de proteínas induzidas pela AP. Por outro lado, os tratamentos individuais de MTG não produziram efeitos sobre as propriedades estudadas. Para as demais concentrações de proteínas utilizadas, a AP aumentou a solubilidade de dispersões de baixa concentração, diminuindo-a nas mais altas. Independentemente da concentração, a AP diminuiu o conteúdo de grupos sulfidrilo livres para as proteínas de ervilha, no entanto, teve o efeito contrário para as proteínas de soja. Comparativamente à solubilidade, a hidrofobicidade de superfície aumentou para concentrações baixas de proteína e o contrário foi verificado para concentrações altas. A MTG diminuiu a solubilidade e aumentou o conteúdo de grupos sulfidrilo livres de ambas as as proteinas. A enzima diminuiu a hidrofobicidade de superfície de ambas as proteínas quando estas se encontravam em concentração relativamente elevada. Quando combinados, AP e MTG parecem ter efeitos antagonisticos na solubilidade e no conteúdo de grupos sulfidrilo livres e efeitos sinergisticos na viscosidade. Os resultados obtidos indicam que tratamentos simultâneos de AP e MTG podem ser usados para modificar a estrutura das proteínas e consequentemente adaptar suas propriedades tecno-funcionais.Programa Doutoral em Ciência e Tecnologia Alimentar e Nutriçã

Monitorização da qualidade de serviço da rede portuguesa de investigação e ensino (RCTS)

Dissertaçao de mestrado integrado em Engenharia de ComunicaçõesNo âmbito do trabalho desta dissertação, intitulada “Monitorização da Qualidade de Serviço da Rede Portuguesa de Investigação e Ensino (RCTS)”, é proposta a especificação de uma nova sonda para a Rede Ciência Tecnologia e Sociedade, baseada em soluções open source. Esta sonda faz parte de uma rede de sondas, cujo objetivo é a medição da qualidade de serviço da Rede Ciência Tecnologia e Sociedade. Um sistema de gestão centralizado auxilia na manutenção da rede de sondas. Inicialmente é feita uma análise dos métodos e das ferramentas envolvidas na medição de parâmetros de qualidade de serviço. De seguida, avalia-se a possibilidade de canibalizar o hardware atualmente em uso para instalar uma nova solução de medição de parâmetros de qualidade de serviço. Após a apresentação de vários métodos de sincronização temporal, é tornado claro o propósito destes no contexto do trabalho desenvolvido nesta dissertação. Finalmente, é apresentada a arquitetura da solução final, assente no Performance focused Service Oriented Network monitoring ARchitecture e num sistema de gestão centralizado das sondas, baseado no Spacewalk. São também apresentados resultados de testes conduzidos para aferir a legitimidade do Performance focused Service Oriented Network monitoring ARchitecture, como ferramenta válida para a medição dos parâmetros de qualidade de serviço da Rede Ciência Tecnologia e Sociedade, bem como um plano de migração para a nova solução.Within the scope of this thesis, titled “Quality of Service monitoring of the Portuguese National Research and Education Network (RCTS)”, the specification of a new probe for the “Rede Ciência Tecnologia e Sociedade” network, based on open source solutions, is proposed. This probe is part of a network of probes, whose purpose is to measure the quality of service of the “Rede Ciência Tecnologia e Sociedade” network. A centralized management system assists in maintaining the network of probes. Initially, the methods and tools involved in the measurement of quality of service parameters are analyzed. Next, the possibility of salvaging the hardware currently in use to install a new solution for measuring the quality of service parameters is evaluated. After presenting several methods for time synchronization, the purpose of these in the context of the work undertaken in this thesis is explicited. Finally, the architecture of the final solution, based on Performance focused Service Oriented Network monitoring ARchitecture and on a centralized management system, based on Spacewalk, is presented. Results of tests conducted to assess the legitimacy of Performance focused Service Oriented Network monitoring ARchitecture as a valid tool for measuring the quality of service parameters of the “Rede Ciência Tecnologia e Sociedade” network, as well as a migration plan for the new solution, are also presented

Evolution of Hox 3'UTR regulation by alternative polyadenylation and microRNA regulation within twelve Drosophila genomes

Tese de mestrado. Biologia (Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2010O desenvolvimento é um processo biológico generativo que integra a informação genotípica e o seu contexto ambiental para originar um organismo adulto, com um fenótipo particular. Dado que o fenótipo de um ser vivo é a porção do mesmo que está exposta à acção da selecção natural e o mesmo é em grande parte o resultado dos processos de desenvolvimento, torna-se fulcral estudar a evolução das espécies no contexto das mudanças evolutivas que ocorrem nos mecanismos de desenvolvimento. A evolução dos processos de desenvolvimento dá-se por dois tipos gerais de mudança, de natureza distinta: criação de novos genes efectores (as proteínas) ou mudanças na regulação das mesmas. Vários estudos apontam para a predominância da mudança regulatória enquanto mecanismo para a evolução do desenvolvimento. Entre estes destacam-se os resultados da comparação do complemento proteico do chimpanzé (Pan troglodytes) e do humano (Homo sapiens), revelando que mais de 90% destas são semelhantes entre as duas espécies. Torna-se no entanto necessário entender de que natureza são estas mudanças regulatórias, para que se possa formular um modelo mecanístico de como o desenvolvimento evolui. O contexto da descoberta mencionada acima, pouco depois do início da era da biologia molecular pelas descobertas de Jacob e Monod, que demonstraram que as bactérias E.Coli controlam a expressão dos seus genes através de mudanças na transcrição dos mesmos, tornou o nível transcricional o mais estudado como o locus evolutivo por excelência. Nesta linha, surgiram vários estudos que demonstraram que mudanças espaciais e temporais na transcrição de genes específicos, nomeadamente nas sequências em cis que promovem a mesma, podem ser responsáveis por diferenças morfológicas entre espécies de vários grupos animais, dos insectos aos peixes. Quanto ao modelo apresentado para a predominância da mudança cisregulatória da transcrição na modificação evolutiva do desenvolvimento, este defente que estas sequências (baptizadas de sequências enhancer ou potenciadoras) têm um grande potencial evolutivo, pela sua estrutura compacta e modular (curtas sequências de nucleótidos) escapando assim às consequências deletérias da pleiotropia, assim como pela sua capacidade de recrutar diversos tipos de factores de transcrição (proteínas que promovem o início da transcrição dos genes) de modo combinatório, podendo assim diversificar facilmente o padrão de transcrição dos genes. No entanto, outros níveis menos explorados de regulação da expressão génica também possuem as mesmas características. O nível pós-transcricional, explorado por este trabalho, é um destes casos. Nos eucariotas, após transcrição de um dado gene codificante, o transcrito de ARN é processado de vários modos, por excisão de intrões não codificantes, assim como por modificações nas extremidades 5’ e 3’ da molécula (capping e poliadenilação) que sinalizam o início e o fim do transcrito, respectivamente. O transcrito processado (ARN mensageiro ou ARNm) é translocado do núcleo para o citoplasma, onde é reconhecido pelos ribossomas, dando-se o início do processo de tradução, que descodifica a mensagem contida no ARNm dando origem a uma proteína. Durante o seu ciclo-de-vida, a concentração de cada tipo de ARNm é também regulada, assim como a taxa da tradução do mesmo, para que a quantidade de proteína produzida seja controlada. Vários estudos independentes apoiam o modelo de que grande parte da informação que controla estes eventos está contida na 3’UTR (3’untranslated region ou região não-traduzida em 3’). Como o nome indica, esta sequência está presente nos ARNm dos eucariotas não com o propósito de codificar uma sequência proteica, mas sim porque contém a informação pós-transcricional necessária para a sua regulação. Um dos modos pelos quais a taxa de tradução, assim como a concentração de um dado mRNA são reguladas no citoplasma é a ligação a microARNs. Estes últimos são moléculas curtas de ARN, contendo em média 22 ribonucleótidos, que se associam a complexos proteicos no citoplasma para detectar ARNm específicos, por complementaridade de bases com determinadas sequências-alvo nas suas regiões 3’UTR. Após a sua a ligação às 3’UTRs, os microARNs promovem a deadenilação dos ARNm, assim como a paragem do processamento do mesmo pelo ribossoma, tendo assim um efeito negativo na procução de proteínas. As sequências-alvo dos micro-ARN partilham com os potenciadores da transcrição as características, anteriormente mencionadas, que tornaram os últimos nos principais candidatos a promover mudanças evolutivas na expressão génica. São modulares (8 ribonucleótidos), tendo também capacidade de promover eventos de regulação combinatória (cada 3’UTR tem sequências-alvo para microARNs distintos). Como tal, torna-se claro que a informação cis-regulatória pós-transcricional é também candidata a um factor potenciador da mudança evolutiva nos processos de desenvolvimento. O nosso estudo baseou-se em descobertas recentes referentes à regulação póstranscricional de genes Hox, efectuadas por outros membros do nosso laboratório, assim como por investigadores de outros grupos. Os genes Hox codificam uma família de factores de transcrição que operam durante o desenvolvimento dos animais com simetria bilateral, regulando vários genes-alvo ao nível da transcrição para dirigir programas de desenvolvimento que geram diferentes identidades segmentares ao longo do eixo antero-posterior. Para além desta função conservada, os genes Hox já foram implicados em vários eventos de diversificação evolutiva. Resultados recentes no modelo animal Drosophila melanogaster indicam que este grupo de genes é regulado no nível pós-transcricional, tanto por microARNs (do complexo iab4/iab8) como pela geração de diferentes transcritos codificando a mesma proteína, mas contendo isoformas de 3’UTR distintas (geradas por sinais em cis que medeiam eventos de poliadenilação alternativa). Em mais detalhe, os ARNm dos genes Hox antennapedia, abdominal-a, abdominal-b e ultrabithorax sofrem poliadenilação alternativa durante o desenvolvimento embrionário de Drosophila melanogaster, dando origem a transcritos codificando a mesma proteína mas contendo informações regulatórias distintas. Estas isoformas de 3’UTR são reguladas no espaço e no tempo, e medeiam regulação diferencial por microRNAs. Neste trabalho, recorremos a análises bioinformáticas para explorar a evolução destes eventos de regulação pós-transcricional dos genes Hox, com o intuito de entender quais as forças evolutivas que intervém na evolução das sequências 3’UTR dos genes Hox do género Drosophila. Esta informação, gerada in silico, será depois usada para guiar uma investigação in vitro mais informada, tendo em vista um conhecimento mais profundo da evolução da regulação génica pós-transcricional, e das suas consequências no fenótipo dos animais. A grande quantidade de ferramentas e dados já disponíveis desde o início da era genómica, permitiram-nos um estudo extenso desta questão. Recorremos primeiro a doze genomas de espécies do género Drosophila, isolando as sequências 3’UTR dos genes Hox referidos acima. Alinhámos depois estas mesmas sequências e observámos que existe uma extensa variação no posicionamento das sequências em cis que promovem a poliadenilação alternativa, havendo quase sempre, no entanto, dois sinais alternativos. Estes resultados indicam que a capacidade de gerar duas isoformas de 3’UTR é fulcral para a regulação dos genes Hox em Drosophila, segregando entre as duas informação regulatória diferencial, mas também que existe alguma plasticidade evolutiva no tipo de informação que cada isoforma contém. O tamanho relativo das isoformas também paree ter evoluído substancialmente, apoiando esta ideia. De seguida, examinámos a estrutura secundária dos ARNs das 3’UTRs dos genes Hox para as 12 espécies, e encontrámos um padrão conspícuo de conservação, ao contrário do que acontece ao nível da sequência primária. Isto indica que a realidade tridimentional em que as 3’UTRs destes genes se encontram, ao longo da vida do ARNm, exerce uma pressão selectiva forte para a manutenção de uma estrutura que seja reconhecida pelos reguladores em trans. A regulação por microARNs foi também abordada. Nesta secção, concentrámo-nos em ultrabithorax, usando um sofware desenvolvido para o efeito (PITA) assim como informação de expressão dos miARNs para gerar uma lista de candidatos a reguladores pós-transcricionais. Analisámos em seguida a evolução das sequências-alvo que medeiam a regulação pelos microARN-candidatos e encontrámos dinâmicas quantitativas, que sugerem que houve uma mudança significativa nas sequências 3’UTR no sentido de acomodar diferentes potenciais regulatórios. A dinâmica individual destas sequências-alvo sugere outros paralelos com o modelo de evolução transcricional: observámos que existe, tal como no caso dos enhancers, uma sequência-alvo predominante, responsável pela maioria da afinidade da 3’UTR para cada microARN, assim como sequências acessórias que intervêm pouco na regulação e têm uma evolução mais rápida. Na transcrição, os enhancers acessórios são funcionais apenas na ocorrência de stress ambiental. Dado que os miARNs já foram implicados na robustez do desenvolvimento ao stress ambiental, sugerimos que a existência de sequências-alvo acessórias faça parte do mecanismo pelo qual os microARNs exercem esta função. Finalmente, tentámos formular um modelo geral para a regulação póstranscricional dos genes Hox. Para isto, investigámos a estrutura secundária de todo o transcrito de ARNm de cada Hox, nos diferentes contextos gerados pela poliadenilação alternativa. As 3’UTRs parecem ter uma estrutura modular, estando segregadas tridimensionalmente do resto do transcrito. Este resultado apoia a ideia de que a estrutura secundária é fulcral para a regulação dos genes Hox e ajuda também a explicar os resultados da comparação evolutiva das estruturas secundárias. Para além disso, a região onde se encontra o primeiro sinal de poliadenilação parece sofrer uma remodelação na sua estrutura secundária, que afecta a probabilidade de interacção ARNm-microARN ao mudar a acessibilidade das sequências-alvo aí contidas. Assim, a poliadenilação alternativa parece estar conservada na linhagem Drosophila, apesar de ter diversificado a informação que é segregada para cada uma das isoformas. A evolução da regulação por microARNs parece ter mudado significativamente durante os 60 milhões de anos de evolução destas espécies, e a lista de candidatos que gerámos abre as portas para estudos in vivo de evolução do desenvolvimento por mudanças na regulação em cis do nível pós-transcricional. Adicionalmente, a estrutura secundária do ARN das 3’UTRs parece ser muito importante ao longo da evolução, dada a sua conservação, e é um factor que terá que ser tido em conta, aquando de outros estudos do género. Estamos neste momento a realizar testes in vivo, tendo em vista a validação destes resultados.The Hox genes encode a family of transcriptional regulators that operate differential developmental programs along the anteroposterior axis of animal bodies. Regulatory changes affecting Hox gene expression are believed to have been crucial for the evolution of animal body plans. In Drosophila melanogaster, Hox expression is posttranscriptionally regulated by microRNAs (miRNAs) acting on target sites located in Hox 3' untranslated regions (3’UTRs). Notably, recent work has shown that during development Hox genes produce mRNAs with variable 3'UTRs (short and long forms) in different tissues as a result of alternative polyadenylation; importantly, Hox short and long 3’UTRs contain very different target sites for miRNAs. Here we use a computational approach to explore the evolution of Hox 3'UTRs treated with especial regard to Hox miRNA regulation. Our work is focused on the twelve Drosophila species for which genomic sequences are available, and shows, first, that alternative polyadenylation of Hox transcripts is a feature shared by all Drosophilids tested in the study. Second, that the regulatory impact of miRNAs is evolving very fast within the Drosophila group, and, third, that in contrast to the low degree of conservation observed at the level of primary sequence Hox 3’UTR regions show very similar RNA topology indicating that RNA structure is under strong selective pressure. Finally, we also demonstrate that alternative polyadenylation leading to the formation of short and long Hox 3’UTRs can remodel the control regions seen by miRNAs by at least two mechanisms: by gradually adding target sites to a short 3’UTR form, as well as modifying the regulatory value of multiple miRNA target sites simultaneously through changes in RNA secondary structure

In situ real-time Zooplankton Detection and Classification

Zooplankton plays a key-role on Earth’s ecosystem, emerging in the oceans and rivers in great quantities and diversity, making it an important and rather common topic on scientific studies. It serves as prey for many large living beings, such as fish and whales, and helps to keep the food chain stabilized by acting not only as prey to other animals but also as a consumer of phytoplankton, the main producers of oxygen on the planet. Zooplankton are also good indicators of environmental changes, such as global warming or rapid fluctuations in carbon dioxide in the atmosphere, since their abundance and existence is dependent on many environmental factors that indicate such changes. Not only is it important to study the numbers of zooplankton in the water masses, but also to know of what different species these numbers are composed of, as different species can provide information of different environmental attributes. In this thesis a possible solution for the zooplankton in situ detection and classification problem in real-time is proposed using a portable deep learning approach based on CNNs (Convolutional Neural Networks) deployed on INESC TEC’s MarinEye system. The proposed solution makes use of two different CNNs, one for the detection problem and another for the classification problem, running in MarinEye’s plankton imaging system, and portability is guaranteed by the use of the Movidius™ Neural Compute Stick as the deep learning motor in the hardware side. The software was implemented as a ROS node, which guarantees not only portability but facilitates communication between the imaging system and other MarinEye’s modules.O zooplâncton representa um papel fundamental no ecossistema do planeta, surgindo nos oceanos e rios em grandes quantidades numa elevada diversidade de espécies, sendo um objecto de estudo comum em publicações e artigos produzidos pela comunidade científica. A sua importância vem de entre outros factores do facto de ser a principal fonte de alimento de uma grande parte da vida marinha, desde pequenos peixes a baleias, e de ser um grande consumidor de fitoplâncton, a principal fonte de oxigénio do planeta. O zooplâncton é também um bom indicador de alterações ambientais, como o aquecimento global ou variações rápidas na quantidade de dióxido de carbono na atmosfera, uma vez que a sua abundância depende de diversos factores ambientais relacionados com tais mudanças, sendo não só importante perceber em que quantidades existe nas massas de água do planeta, mas também por que diferentes espécies está distribuído. Nesta tese é apresentada uma possível solução para a deteção e classificação de zooplâncton in situ e em tempo real, recorrendo a uma abordagem facilmente portável de Deep Learning, baseada em Redes Neuronais Convolucionais implementado no sistema MarinEye do INESC TEC. A solução proposta faz uso de duas arquitecturas de redes diferentes, uma dedicada à tarefa de deteção do zooplâncton, e outra dedicada `a sua classificação, implementadas no módulo de aquisição de imagens de plâncton do sistema MarinEye. A portabilidade e flexibilidade do sistema foi garantida através do uso da Movidius™ Neural Compute Stick como motor de deep learning, assim como da implementação do software como um nó de ROS, que garante não só a portabilidade do sistema, como também permite uma facilidade de comunicação entre os diferentes módulos do MarinEye

Desenvolvimento de uma ferramenta de suporte à implementação prática de conceitos do lean manufacturing

A presente Dissertação de Mestrado surge no âmbito da Unidade Curricular de Projeto/Dissertação/Estágio, referente ao 2º ano do Mestrado em Engenharia e Gestão Industrial do Instituto Superior de Engenharia do Porto. O projeto de investigação, intitulado “Desenvolvimento de um manual de suporte à implementação prática de conceitos do Lean Manufacturing”, tem como principal objetivo desenvolver e validar um manual de auxílio à implementação prática de conceitos do LM. Na atualidade, o Lean Manufacturing (LM) é um dos modelos de gestão mais procurado pelas organizações para promover o seu crescimento e desenvolvimento, no entanto muitas delas têm dificuldade em implementar de forma correta os seus conceitos, principalmente, devido à falta de conhecimento, más práticas de aplicação e por não possuírem um suporte com as metodologias standard da sua aplicação nos momentos de implementação. Posto isto, o que se pretende neste projeto é desenvolver e testar um Manual de Instruções Lean (MIL) com a informação necessária para implementar alguns dos conceitos do LM. O objetivo é que o manual sirva de suporte aos utilizadores nos momentos em que implementam as ferramentas do LM. Para a realização deste projeto seguiu-se a metodologia investigação-ação, visto que é uma metodologia normalmente utilizada em projetos que pretendem resolver problemas práticos e sociais através da investigação, o que é o caso. Através desta metodologia, inicialmente, efetuouse a definição do problema e dos objetivos do trabalho. De seguida, realizou-se um planeamento de ações. Posteriormente, executou-se o plano, sendo de destacar as etapas de seleção das ferramentas do LM a incluir no MIL (Kaizen, Standard Work, 5´s, SMED, Kanban e VSM), desenvolvimento e validação do manual. Depois, observaram-se os resultados e efetuaram-se os ajustes necessários. Por fim, teceram-se as devidas conclusões e identificaram-se projetos futuros de melhoria. Na fase de validação, o MIL foi aprovado por duas peritas na área do LM, testado por três potenciais utilizadores, que aplicaram as ferramentas Kaizen, 5´s e VSM em ambientes industriais, e avaliado por vinte e nove pessoas através da realização de um questionário online. Além disto, para monitorizar os resultados do questionário desenvolveu-se uma dashboard em Power Bi e um fluxo em Power Automate para agilizar o processo. Os conteúdos do MIL foram aprovados com sucesso pelos experts Lean, as ferramentas testadas foram corretamente implementadas com o auxílio do manual e apresentaram resultados bastante significativos, como por exemplo, a redução de cerca de 62% do tempo de identificação de materiais e os incrementos de 55% e 57% das pontuações dos 5´s nos postos de trabalho e, por fim, as avaliações efetuadas ao MIL pelos questionados foram bastante positivas e, no geral, acima do objetivo definido. Assim, todos estes resultados, permitem concluir que o projeto foi desenvolvido com sucesso e que a utilização do Manual de Instruções Lean no processo de implementação de ferramentas do LM tem um efeito bastante positivo. Por fim, elaborou-se um artigo científico, o qual foi submetido na revista científica Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI).This Master's Dissertation is part of the Project/Dissertation/Internship Curricular Unit, referring to the second year of the Master's Degree in Industrial Engineering and Management at the Instituto Superior de Engenharia do Porto. This research project, entitled “Development of a support manual for the practical implementation of Lean Manufacturing concepts”, has as main objective to develop and validate a manual to aid the practical implementation of LM concepts. Currently, Lean Manufacturing (LM) is one of the management models most required by organizations to promote their growth and development, however many of them have difficulty implementing its concepts correctly, mainly due to lack of knowledge, bad application practices and for not having a support with the standard methodology of its application in the moments of implementation. That said, the aim of this project is to develop and test a Lean Instruction Manual with the necessary information to implement some of the LM concepts. The goal is for the manual to serve as a support for users when implementing the LM tools. To carry out this project, the research-action methodology was followed, since it is a methodology normally used in projects that intend to solve practical and social problems through research, which is the case. Through this methodology, initially, the problem and objectives of the work were defined. Then, action planning was carried out. Subsequently, the plan was executed, highlighting the steps of selecting the LM tools to include in the manual (Kaizen, Standard Work, 5's, SMED, Kanban and VSM), development and validation of the manual. Afterwards, the results were observed and the necessary adjustments were made. Finally, the appropriate conclusions and future improvement projects were identified. In the validation phase, the manual was approved by two experts in the field of LM, tested by three potential users, who applied the Kaizen, 5's and VSM tools in industrial environments, and evaluated by twenty-nine people through an online questionnaire. In addition, to monitor the results of the questionnaire, a Power Bi dashboard and a Power Automate flow were developed to streamline the process. The contents of the manual were successfully approved by Lean experts, the tested tools were correctly implemented with the help of the manual and presented very significant results, for example, a reduction of about 62% in material identification time and increases in 55% and 57% of the scores of the 5's in the workstations and, finally, the assessments made to the manual by the respondents were very positive and, in general, above the defined objective. Thus, all these results allow us to conclude that the project was successfully developed and that the use of the Lean Instruction Manual in the process of implementing LM tools has an extremely positive effect. Finally, a scientific article was elaborated, which was submitted in the scientific journal Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)

Os Hipogeus de Vale de Barrancas 1 (Berinjel, Beja) Práticas funerárias e análise antropológica dos restos ósseos humanos exumados

Dissertação de Mestrado em Evolução e Biologia Humanas, apresentada ao Departamento de Ciências da Vida da Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de CoimbraO presente trabalho propôe-se estudar os restos ósseos humanos exumados dos Hipogeus de Vale de Barrancas 1 (datados do Neolítico Final), localizado em Berinjel, Beja, contribuindo para um conhecimento mais completo da realidade funerária e das características antropológicas das comunidade pré-históricas que viveram nesta região. A elevada fragmentação óssea, provocada por diversos factores tafonómicos, como a fauna, a flora, e a acção humana, limitou o nosso estudo. Ainda assim, tentou-se traçar o perfil biológico e das patologias dos indivíduos exumados destas estruturas negativas. O material deste provém dos hipogeus datados do Neolítico Final (1, 2, 3, 4, 5, 7 e 8). Nestes túmulos o espólio ósseo humano foi recuperado em contexto colectivo e primário, não sendo possível, contudo, reconstituir todos os gestos funerários desta população. Detectou-se o uso generalizado de ocre, sobre os restos humanos. Identificaram-se indivíduos adultos e não adultos, onde se calculou um NMI entre 2 e 6 indivíduos no primeiro grupo, e entre 1 e 8 no segundo. Entre estes últimos, a faixa etária mais representada é a de entre 5-9 anos (N=11). Os dados da diagnose sexual, por sua vez, sugerem uma proporção semelhante de indivíduos de ambos os sexos. Morfologicamente, destaca-se a presença de caracteres discretos como a presença de fossa hipotrocanteriana nos fémures dos hipogeus 1 (N=1/5), 2 (N=3/9), 7 (N=1/4) e 8 (N=3/6); e de 3º trocânter (também nos fémures) do Hipogeu 3 (N=2/5). No âmbito paleopatológico destaca-se um caso de artrose de grau máximo nos ossos constituintes do braço esquerdo de um indivíduo do Hipogeu 3: extremidade distal do úmero, e extremidades proximais do rádio e cúbito. Constituem, portanto, a articulação do cotovelo esquerdo do indivíduo. Foram detectadas algumas diferenças pertinentes entre os estudos coevos de séries provenientes do interior e do litoral, nomeadamente a nível de patologia dentária.This paper proposes to study the human osteological remains buried in the Hypogea of Vale de Barrancas 1 (dated to the Late Neolithic), located in Berinjel, Beja, contributing to a more complete knowledge of the funeral reality of the prehistoric community that lived in this region, and its anthropological characteristics. The bone fragmentation observed, caused by multiple taphonomic factors, such as the fauna and flora, as well as the human intervention, limited our study. Still, we tried to trace the biological profile and the pathologies of the individual exhumed from these negative structures. The material of this study comes from human hypogea dated to the Late Neolithic (1, 2, 3, 4, 5, 7 and 8). In these graves the human bone spoils were recovered in primary and collective context, not being possible, however, to reconstruct all the funerary gestures of this population. It was detected the widespread use of ochre over the human osteological remains. It was identified adult and non-adult individuals, for whom it was calculated a MNI between 2 and 6 individuals in the first group, and between 1 and 8 in the second. Among the last, the most represented age group is the one between 5-9 years old (N=11). On the other hand, the sexual diagnosis data suggest a similar proportion between individuals of both sexes. Morphologically, stands out the presence of discrete characters such as the presence of hypotrocanteric fossa in the femurs of hypogea 1 (N=1/5), 2 (N=3/9), 7 (N=1/4) and 8 (N=3/6); as well as the 3rd trochanter in the femurs of Hypogeum 3 (N=2/5). In the paleopathological field, it stands out a case of osteoarthritis of maximum degree in the bones constituting the left arm of an individual from Hypogeum 3: distal end of the humerus and proximal ends of the radius and ulna. Therefore, they compose the individual’s left elbow joint. It were detected some pertinent differences between coeval studies of series from inland and coastal areas, namely at the level of dental pathology