RNA interference and nucleolar dominance establishment in Arabidopsis suecica

Doutoramento em Biologia - Instituto Superior de AgronomiaThe discovery of small RNAs has added a new level to our understanding of gene regulation mechanisms. Small interfering RNAs (siRNAs) are involved in the establishment of repressive epigenetic marks in a variety of organisms by guiding RNA induced silencing complexes to homologous DNA sequences. Could the endogenous siRNA heterochromatic pathway be linked to the establishment of nucleolar dominance? The latter is a large scale manifestation of directed epigenetic gene silencing, resulting in the transcriptional inactivation of the entire rRNA gene cluster from one parent in a hybrid species. Inactivation of rRNA genes is linked to the establishment of heterochromatic marks, both at the DNA and histone levels, in the promoter region. We were able to identify 24nt siRNAs homologous to the rRNA gene promoter in Arabidopsis sp., whose biogenesis is dependent on nuclear RNA polymerase IV and other known proteins of the endogenous siRNA pathway in Arabidopsis. RNAi mediated knockdown of genes in this pathway in the natural allopolyploid hybrid A. suecica (A. thaliana x A. arenosa) disrupted nucleolar dominance, causing the production of rRNA transcripts from the underdominant A. thaliana rDNA genes. This observation implicates nuclear siRNAs in the establishment of nucleolar dominance in A. suecica

Via algaliada versus mudança de bitola dos eixos do material circulante

Trabalho Final de Mestrado para obtenção do grau de Mestre em Engenharia CivilA presente dissertação tem como objetivo a elaboração de um documento que compare duas das tecnologias que se encontram na vanguarda da resolução do problema da ligação entre vias-férreas existentes com diferentes valores de bitola, tornando-as interoperáveis. Será também importante que este documento possibilite a sua utilização como ferramenta de trabalho para quem exerça a sua atividade essencialmente dentro da área da ferrovia e que defina a sua atuação no âmbito da procura das melhores soluções e mais ajustadas à realidade portuguesa, tanto em termos económicos como técnicos, relativamente a um sistema que tem uma capacidade de responder às exigências dos interesses das populações, caraterizando-se também por uma vida útil considerável. Em síntese, o presente trabalho incide sobre o que cada uma das tecnologias descritas tem a oferecer, tendo em conta a problemática da compatibilização entre os três valores de bitola existentes da União Europeia, sendo especialmente focado no caso da Península Ibérica, e nas suas especificidades. Este documento está suportado na pesquisa, análise de soluções e deliberações já implementadas.Abstract: This dissertation aims to draw up a document that compares two of the technologies that are at the forefront of the resolution of the problem for the connection between railway lines with different values of gauge. It will be also important that this document allowsits use as a tool for anyone who carries on business mainly in the railway area and defines his role within the framework of the search for the best solutions and more adjusted to the Portuguese reality, both in economic and technical terms, related to a system that has an ability to respond to the demands of the population interests, as well as is characterized as having a considerable life span. Resuming, this work will focus on what each of the described technologies have to offer, taking into account the problem of compatibility between the three more important existing types of gauge on the European Union, more particularly in the Iberian Peninsula case and its specificities. This document is supported in the research, solutions analyses and resolutions already implemented

Análisis confirmatorio de la versión reducida del Cuestionario de Dimensiones y Estilos Parentales (PSDQ) en una muestra portuguesa

An important research field in family studies relates to the role parenting practices can have on several domains of children's development. Regarding to parenting styles, it was Baumrind's conceptualization that was responsible for a relevant research boost in this area. She proposed a model contemplating three different styles: authoritative, authoritarian, and permissive. The aim of our study was to examine the factor structure, internal consistency and others psychometric properties of the Portuguese version of the Parenting Styles and Dimensions Questionnaire (PSDQ). The participants were 424 parents (mainly mothers, 81.2%) from Algarve (South of Portugal), that answered to PSDQ and a sociodemographic questionnaire. The instrument comprises 32 items: 12 questions regarding the authoritative style, 15 questions regarding the authoritarian style, and 5 questions regarding the permissive style. Several competing models (i.e., one and three-factorial, and another where latent variables were organized in a 1st and 2nd order factors) were tested in regards to PSDQ factor structure using confirmatory factor analysis. A fourth model, contemplating inter-correlations between item 7 and 8 was also proposed, which showed adequate fit and internal consistency. These findings support the PSDQ original structure. Implications concerning the use and contributes to social and emotional child' adjustment are discussed.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

A nitrosilação de proteínas em Leishmania infantum

Tese de mestrado em Bioquímica, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2013O parasita Leishmania infantum, endémico nos países mediterrânicos, incluindo Portugal, é o causador da leishmaniose visceral, uma doença letal se não for tratada e para a qual não existem vacinas humanas. Tendo um ciclo de vida complexo, estes parasitas regulam a expressão e a função de proteínas através de modificações pós-traducionais (PTMs), extremamente importantes no seu desenvolvimento e infecção, nomeadamente a S-nitrosilação. Este trabalho teve dois objectivos principais. O primeiro foi a identificação do nitrosoproteoma da Leishmania infantum. Este objectivo foi conseguido utilizando duas abordagens proteómicas: a identificação por peptide mass fingerprint (PMF) por MALDI-FT-ICR e a análise por cromatografia líquida nano e espectrometria de massa (nanoLC-MS). O segundo objectivo foi a identificação dos processos metabólicos em que a nitrosilação pelo óxido nítrico poderá estar envolvida, de forma a perceber qual a importância desta modificação pós-traducional em L. infantum. No total foram identificadas 137 proteínas diferentes, 8 por MALDI-FT-ICR e 134 por nanoLC-MS. De salientar que apenas 3 proteínas identificadas por MALDI-FT-ICR não foram identificadas através de nanoLC-MS. De entre os vários processos celulares identificados, que contêm proteínas nitrosiladas, podemos destacar como mais relevantes os processos de folding proteíco, a resposta ao stress e o metabolismo dos glúcidos. No que diz respeito ao folding proteico, a S-nitrosilação das proteínas de choque térmico Hsp70 e Hsp83, bem como da proteína dissulfito isomerase, poderá modelar a sua função como chaperone. Em relação à resposta ao stress, é interessante a S-nitrosilação do triparedoxina peroxidase e do glioxalase I, enzimas envolvidos no stress oxidativo e carbonílico, respectivamente. A modificação destes enzimas pelo NO poderá inibir a sua actividade enzimática. Por fim, em relação ao metabolismo de glúcidos, a S-nitrosilação do GAPDH poderá exercer um papel fundamental no controlo do fluxo glicolítico o enolase poderá ter um papel importante no scavange do NO produzido pelo hospedeiro na fase de amastigota.The parasite Leishmania infantum, endemic from the Mediterranean region, including Portugal, it’s the leading cause of visceral leishmaniasis, a lethal condition if untreated and for which there are no human vaccines. Due to their complex life cycle, these parasites use posttranslational modifications (PTM), e.i. S-nitrosylation, to regulate the expression and function of proteins being these extremely important in the parasite’s development and infection capacity. One of the two main objectives of this project was the Leishmania infantum nitrosoproteome identification. This objective was accomplished using two proteomic approaches: identification by peptide mass fingerprint (PMF) through MALDI-FTICR and analysis through nanoscale liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (nanoLC-MS). The second objective was the identification of the metabolic processes in which nitric oxide nitrosylation might be involved to allow us to understand more about the importance of this posttranslational modification in L. infantum. Totally we identified 137 different proteins, 8 through MALDI-FT-ICR and 134 through nanoLC-MS. Among the celular processes identified as containing nitrosilated proteins, protein folding, stress response and carbohydrate metabolism are the most important ones. S-nitrosilation of heat shock proteins Hsp70 and Hsp83, as well as of disulfide isomerase may modelate chaperon function. Besides of that, it´s interesting that S-nitrosilation of Tryparedoxin peroxidase and glyoxalase I, enzymes involved in oxidative and carbonylic stress, respectively, may inhibit theirs enzymatic activity. Lastly, the S-nitrosilation of GAPDH may be relevant in glycolytic flux control and enolase may be important in the scavange of NO