Food and clinical strains of Listeria Monocytogenes: The quest for distinction

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Spokes cluster: The search for the quiescent gas

Context. Understanding the role of fragmentation is one of the most important current questions of star formation. To better understand the process of star and cluster formation, we need to study in detail the physical structure and properties of the parental molecular cloud. The Spokes cluster, or NGC 2264 D, is a rich protostellar cluster where previous N2H+(1-0) observations of its dense cores presented linewidths consistent with supersonic turbulence. However, the fragmentation of the most massive of these cores appears to have a scale length consistent with that of the thermal Jeans length, suggesting that turbulence was not dominant. Aims. These two results probe different density regimes. Our aim is to determine if there is subsonic or less-turbulent gas (than previously reported) in the Spokes cluster at higher densities. Methods. We present APEX N2H+(3-2) and N2D+(3-2) observations of the NGC2264-D region to measure the linewidths and the deuteration fraction of the higher density gas. The critical densities of the selected transitions are more than an order of magnitude higher than that of N2H+(1-0). Results. We find that the N2H+(3-2) and N2D+(3-2) emission present significantly narrower linewidths than the emission from N2H+(1-0) for most cores. In two of the spectra, the nonthermal component is close (within 1-sigma) to the sound speed. In addition, we find that the three spatially segregated cores, for which no protostar had been confirmed show the highest levels of deuteration. Conclusions. These results show that the higher density gas, probed with N2H+ and N2D+(3-2), reveals more quiescent gas in the Spokes cluster than previously reported. More high-angular resolution interferometric observations using high-density tracers are needed to truly assess the kinematics and substructure within NGC2264-D. (Abridged)Comment: 8 pages, 4 figures. Accepted in A&

O hábito alimentar dos morcegos (Mammalia, Chiroptera) e sua relação com a diversidade viral

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia, 2016.Os morcegos são reconhecidos como hospedeiros de uma grande variedade de vírus. No entanto, a relação entre a presença dos vírus e o hábito de vida dos morcegos quase não é explorada. O presente trabalho teve como objetivo entender um pouco melhor esta relação. Para tanto foi realizado um levantamento bibliográfico, apresentado no primeiro capítulo, sobre em quais morcegos já foram identificados vírus e quais são esses vírus, em um panorama global. Foi possível constatar que existe um maior número de estudos nos continentes do Velho Mundo e que a maioria dos trabalhos sobre vírus em morcegos nas Américas e no Brasil é sobre o vírus da raiva. Vírus pertencentes a 16 famílias já haviam sido identificados em morcegos no continente americano, sendo que destas famílias, apenas oito haviam sido identificadas no Brasil. Foi possível constatar que a família de morcegos Phyllostomidae é a que possui mais dados sobre vírus tanto no Brasil como nas Américas, seguida da família Molossidae, no Brasil. Sabendo que a ordem Chiroptera possui uma das dietas mais diversificadas entre todos os mamíferos, elaborei um estudo no capítulo 2 a fim de verificar a hipótese de que o hábito alimentar de quatro espécies de morcegos exerce influencia sobre a sua diversidade viral, bem como a hipótese de que quanto mais especializada a dieta dos morcegos, menor será a diversidade de vírus presentes em seus intestinos. Para tanto foram capturados 15 indivíduos de cada uma das seguintes espécies: Artibeus lituratus (Phyllostomidae) - frugívoro, Glossophaga soricina (Phyllostomidae) - nectarívoro, Desmodus rotundus (Phyllostomidae) – hematófago e, Nyctinomops laticaudatus (Molossidae) – insetívoro, em pontos aleatórios do Distrito Federal, no domínio Cerrado do Planalto Central, nos anos de 2014 e 2015. Os animais foram eutanasiados e tiveram seus intestinos armazenados a -80 ˚C para posterior análise. As amostras passaram por um processo de enriquecimento viral e os ácidos nucleicos foram extraídos utilizando-se o Kit de extração Zymo ZR Virus DNA/RNA. O DNA foi a seguir amplificado com polimerase phi29 e sequenciado usando o Kit de preparação Nextera DNA Library na plataforma Illumina MiSeq. As sequencias obtidas (reads) foram processadas e montadas usando CLC Genomics Workbench v.6.0.3. Os contigs resultantes foram comparados com o banco de dados Viral RefSeq, utilizando o programa BLASTX. A hipótese de que a diversidade viral varia de acordo com o hábito alimentar dos morcegos foi confirmad, porém a hipótese de que quanto mais especializada a dieta, dos morcegos, menor a diversidade viral encontrada no intestino, foi refutada. A espécie N. laticaudatus apresentou a maior diversidade viral, provavelmente porque os vírus encontrados no intestino dos espécimes, derivam da maior diversidade de insetos predados. As espécies G. soricina e A. lituratus apresentaram a mesma diversidade, o que pode ser explicado pelo fato de as duas espécies eventualmente utilizarem como alimentos plantas e esporadicamente insetos. D. rotundus foi a espécie com a menor diversidade viral, devido a dieta ser bastante restrita, apenas sangue. Porém, nesta espécie foi encontrado o vírus da Anemia Infecciosa das Galinhas – CAV, aqui encontrado pela primeira vez em D. rotundus, indicando que a espécie está predando além de mamíferos, aves. No todo 54 novos vírus foram detectados nas quatro espécies de morcegos, reforçando que pouco se conhece sobre os vírus presentes em morcegos.Bats have been identified as a reservoir host of many viruses. However, the relationship between the presence of virus and bats trophic guild has been underexplored. The present study aimed to know this relationship better. To do this, I did a literature compilation in Chapter 1, showing which bats have already been identified as hosts of viruses and which viruses are these at a global scale. I found that most studies have been made in the Old World countries and that most of the studies on viruses in bats in the Americas and Brazil are about rabies virus. Viruses belonging to 16 families have already been identified in bats on the American continent, but only eight of these have been identified in Brazil. The bat family Phyllostomidae is the one with most data about viruses, followed by the Molossidae family, in Brazil. Knowing that the Chiroptera order has one of the most diversified diets of all mammals, I proposed a study, presented in Chapter 2, to verify the hypothesis that viral diversity is guided by the feeding habits of four bat species and the hypothesis that the more specialized the diet of the bats, the lower the viral diversity presente in their intestines. I captured 15 individuals of each of the following species: Artibeus lituratus (Phyllostomidae) - frugivorous, Glossophaga soricina (Phyllostomidae) - nectarivorous, Desmodus rotundus (Phyllostomidae) – sanguivorous e, Nyctinomops laticaudatus (Molossidae) – insectivorous, during the years of 2014 and 2015, in the Brazilian Cerrado (a savanna-like vegetation) areas in the Federal District. The captured bats were euthanized, and their intestines were stored at -80 ˚C until processing. After viral enrichment, nucleic acids were extracted using the Zymo ZR Virus DNA/RNA Extraction kit. The resulting DNA was amplified with a phi29 polymerase and sequenced using Nextera DNA Library Preparation Kit and Illumina MiSeq platform. The paired-ends readings (881,946) were quality-filtered, re-assembled using CLC Genomics Workbench v.6.0.3, and the resulting contigs were compared to the Viral RefSeq database using BLASTX. The hypothesis that viral diversity varies according to the eating habits of the bats was confirmed, but the hypothesis that the more specialized the diet of the bats, the lower the viral diversity present in their intestines, was disproved. N. laticaudatus species had the highest viral diversity, probably because the viruses found in the intestines of specimens reflect the diversity of insects predated by them. The species G. soricina and A. lituratus showed the same viral diversity, which can be explained by the fact that this two species feed on plants and sporadically in insects. D. rotundus was the species with the lowest viral diversity due to its restricted blood feeding habits. However, Chicken Anemia Virus – CAV was reported for the first time in D. rotundus, indicating that D. rotundus bats are preying on avian hosts, despite preying on mammals too. Finally, altogether, 54 new viruses have been detected in the four bat species on this study, stressing that little is known about viruses in bats

Graphic calculators in the classroom: Students’ viewpoints

This paper presents the results of a study about the views and attitudes of students of a low achieving 11th grade class who were involved in an innovative experience with graphic calculators for all academic year. Contrasting the results obtained from a questionnaire and from interviews, it concludes that students tended to point some improvements in the mathematics class, but attributed their origin more to their teacher’ style and personality than to the use of this technology

Práticas de ensino da matemática : duas professoras, dois currículos

Tese de doutoramento em Educação (Didáctica da Matemática), apresentada à Universidade de Lisboa através da Faculdade de Ciências, 2004Este estudo inscreve-se na área de investigação sobre o professor de Matemática e tem como objectivo compreender as suas práticas curriculares, perspectivadas do seu ponto de vista, integrando pensamento e acção. Trata-se de uma investigação interpretativa, concretizada através da realização de estudos de caso de duas professoras. Para cada uma, procura responder às seguintes questões: Como se relaciona com o currículo oficial? Qual é o seu protagonismo curricular? Como legitima as suas práticas curriculares? Quais são as principais influências nas suas práticas curriculares? Francisca é professora de Matemática de 2º ciclo numa escola básica que aderiu ao projecto de gestão flexível do currículo. Margarida é professora numa escola secundária, onde lecciona o programa ajustado de Matemática. A escolha das professoras teve em conta o facto de serem profissionais experientes, reconhecidas como competentes no seu meio profissional, e de trabalharem em contextos curriculares distintos. Os estudos de caso apresentam as professoras, traçam o seu percurso biográfico, caracterizam o seu eu profissional e o seu conhecimento didáctico, descrevem o seu contexto profissional, analisam o seu modo de fazer a gestão curricular e de pôr o currículo em acção com os alunos. Apresentam também a sua reflexão pessoal sobre a forma como sentem as práticas curriculares. A estrutura dos casos resultou da combinação entre o processo analítico sobre os dados recolhidos e as assunções teóricas assumidas. O professor é visto como um profissional que possui um conhecimento próprio e específico para ensinar Matemática, que trabalha em contexto, mediado pelo seu eu profissional. A sua identidade e conhecimento profissionais desenvolvem-se continuamente, marcados pelo seu percurso, no qual a experiência lectiva representa uma importante fonte de aprendizagem. O currículo é encarado como envolvendo diversos níveis de configuração até chegar à sala de aula, para os quais concorrem as decisões de diferentes actores curriculares, nomeadamente no âmbito político--administrativo, de gestão da escola e de realização da sala de aula; não se esgota, portanto, num texto escrito. O professor é considerado um protagonista curricular privilegiado, que exerce um papel decisivo na gestão curricular e na definição do currículo em acção. O estudo ilustra a pluralidade de significados que as professoras atribuem ao conceito de currículo — desde programa-conteúdos, para Margarida, a conjunto de aprendizagens dos alunos, para Francisca. Estas diferentes interpretações estão em estreita relação com as componentes programáticas que mais valorizam — os conhecimentos matemáticos, para Margarida; as finalidades e objectivos, para Francisca. A adesão das professoras aos programas é mediada pela sintonia que sentem em relação à abordagem proposta da Matemática. O papel normativo do programa é entendido de forma diferente pelas duas professoras, que o perspectivam em função dos objectivos que gostariam que servisse — para Margarida, de definição completa e inequívoca dos conhecimentos matemáticos que todos os alunos devem saber, visando a uniformização da sua preparação para o exame de 12º ano; para Francisca, de orientação sobre as finalidades que a educação matemática deve visar. Não obstante, ambas as professoras manifestam empenho em cumprir o programa, que interpretam como concretizar aquilo que valorizam, reconhecendo que a retórica do cumprimento do programa mascara realidades muito distintas. As professoras revelam um significativo protagonismo curricular. Para ambas se identifica claramente um currículo pessoal de Matemática: as finalidades e objectivos reflectem a percepção que têm da sua responsabilidade profissional; os conteúdos resultam da sua valorização dos conhecimentos matemáticos indicados pelo programa; a sua abordagem, bem como as metodologias de trabalho, são reflexo do seu conhecimento didáctico, em especial, da visão da Matemática e do conhecimento do processo instrucional. A avaliação das aprendizagens dos alunos está solidamente apoiada por um corpo de saber-fazer que transmite segurança às professoras. O seu protagonismo curricular exerce-se em todas as fases do desenvolvimento curricular, desde a interpretação do texto programático à sala de aula. Por um lado, é uma forma de dar resposta à necessidade de adaptação do programa às turmas, numa lógica de diferenciação curricular. Por outro lado, acomoda a experimentação progressiva das novas orientações programáticas, que fazem por aproximações sucessivas e em harmonia com o seu conhecimento didáctico, avaliando o respectivo sucesso pela interpretação das reacções dos alunos. A legitimação das práticas curriculares joga-se entre o trabalho colectivo e o individual, que se complementam de forma interactiva. No contexto colectivo, assume especial importância o grupo disciplinar, cujo papel na definição do programa-conteúdos acaba por se sobrepor ao do texto oficial — no caso de Margarida, reforçado ainda pelo programa-de-exame. Ambas as professoras realizam trabalho de preparação lectiva em grupos de colegas, no seio dos quais encontram um apoio substantivo, nomeadamente para lidar com a insegurança originada pela introdução de novos programas. O pressuposto de homogeneização presente nos grupos não se estende ao “como” das aulas, sobre o qual as professoras exercem a sua individualidade, numa perspectiva de adaptação das decisões colectivas aos seus alunos — e a si próprias. Mas é na sala de aula que o currículo acaba por tomar forma definitiva, sendo as decisões interactivas legitimadas pela necessidade de resposta à complexidade que ali se vive, desempenhando as reacções dos alunos um forte papel na sua regulação. As professoras identificam as mesmas influências principais nas suas práticas curriculares: a ancoragem no programa oficial, os limites do calendário escolar, a inspiração dos recursos consultados, o apoio dos colegas, as características dos alunos — e Margarida, o condicionamento do exame nacional do ensino secundário. Mas, acima de tudo, valorizam a experiência que adquiriram, sublinhando a importância da sala de aula, que lhes permitiu desenvolver um conhecimento didáctico sólido, que lhes confere segurança e lhes permite agir de acordo com o respectivo eu profissional, exercendo as suas preferências e prioridades. Esta experiência constitui o capital adquirido pelas professoras ao longo do seu percurso, marcado por factores diversos da história pessoal e profissional, e tem um papel decisivo no significado que hoje em dia dão à profissão.This study is included in the area of research about the mathematics teacher and aims to understand his/her curriculum practices, from his/her point of view, integrating thinking and action. It is an interpretative research, undertaken through the case studies of two teachers, regarding whom it is sought to answer the following questions: How does the teacher relates with the official curriculum? How far does he/she act as an agent? How does he/she legitimate his/her curriculum practices? What are the main influences in the curriculum practices? Francisca is a mathematics teacher of the second cycle (grades 5-6) in a basic school that joined the project of flexible curriculum management. Margarida is a teacher in a secondary school, where she teach the adjusted mathematics program. The choice of the teachers was based on the fact that both are experienced professionals, recognized as competent in their professional circle, and work in distinct curriculum contexts. The case studies present the teachers, show their biographical journeys, characterize their professional self and didactic knowledge, describe their professional context, analyse their ways of carrying out curriculum management and putting the curriculum in action for their pupils; furthermore, the case studies present teachers’ personal reflection about the way they feel their curriculum practices. The structure of the cases resulted from the combination between the analytical process regarding the data collected and the theoretical framework regarding the teacher and the curriculum. The teacher is viewed as a professional, who has his/her own specific knowledge to teach mathematics, working in context, mediated by his/her professional self. The teacher’s identity and professional knowledge develop continuously, marked by his/her journeys, where the teaching experience represents a fundamental source of learning. The curriculum involves several levels of configuration before getting into the classroom, under the influence of the decisions of several curriculum agents, notably in the politic-administrative level, school management, and classroom action; it is much more than just a written text. The teacher is seen as a key curriculum agent, with a fundamental role in curriculum management and in the definition of the curriculum in action. The study illustrates the plurality of meanings that the teachers ascribe to the concept of curriculum — from program-contents, for Margarida, to a collection of learning outcomes, for Francisca. These different interpretations are closely related to the most valued curriculum components — mathematics knowledge, for Margarida; goals and objectives, for Francisca. Acceptance of the programs by the teachers is mediated by the syntony that they feel regarding the proposed approach to mathematics. The normative role of the program is viewed in different ways by the two teachers, who regard it according to the aims they would like it to support — complete and unambiguous definition of the mathematics knowledge that all pupils must have, aimed at the uniformization of the preparation of pupils for the grade 12 exam, for Margarida; of guidance about the general goals that that mathematics education must seek, for Francisca. Nevertheless, both teachers refer that they aspire to complete the program, what they interpret as carrying into practice what they value, recognizing that the rhetoric of completing the program masks very distinct realities. The teachers show a significant curriculum agency. For both, it is possible to identify a personal mathematics curriculum: The aims and goals reflect their perception of their professional responsibility; the contents emerge from their valuing of the mathematics knowledge indicated by the program; their approach, as well as their teaching methodologies, reflect their didactic knowledge, specially their perspective about mathematics and knowledge of the instructional process. Assessing pupils’ learning is firmly supported by a body of know-how that brings security to the teachers. Their curriculum agency is carried out in all phases of curriculum development, from the interpretation of the text of the program to the classroom. On one hand, it is a way of answering the need to adapt the program to the classes, through curriculum differentiation. On another hand, it accommodates the progressive experimentation of new programmatic orientations, what they do progressively and in harmony with pre-existing didactical knowledge, assessing their success by interpreting pupils’ reactions. The legitimisation of curriculum practices is carried out between collective and individual work, which complement each other in an interactive way. In the collective context, the subject matter group assumes special importance, as its role in the definition of the program-contents ends up superimposing the official text — in the case of Margarida, this is even reinforced by the program-for-exam. Both teachers undertake teaching preparation work within collegial groups, where they find substantial support, notably to deal with the insecurity associated to the introduction of new programs. The assumption of homogeneity of the groups does not follow to the “how” of classroom work regarding which the teachers exert their individuality, trying to adjust the collective decisions to their pupils — and to themselves. But it is in the classroom that the curriculum ends up assuming a definitive form, with the interactive decisions legitimated by the need to answer its complexity, dominated by unforeseen events, where pupils’ reactions assume a strong regulating role. The teachers identified the same main influences in their curriculum practices: the grounding in the official program, the limits of the school calendar, the inspiration of the resources used, the support from colleagues, the characteristics of pupils — and, for Margarida, the constraint of the national secondary school exam. But, above all, they value the experience that they acquired, underlying the importance of the classroom, what allowed them to develop a solid didactical knowledge, bringing them security that enables them to act according to their professional self, assuming their preferences and priorities. This experience constitutes the capital acquired by the teachers during their journeys, marked by different factors of personal and professional story, and has a decisive role in the meaning that nowadays they ascribe to the profession