Estudo computacional de peptídeos ativos da Nitroforina-2 visando o planejamento de fármacos anticoagulantes

Nitroforina 2 (NP-2), uma proteína anticoagulante presente na saliva inseto hematófago Rhodniusprolixus, foi caracterizada como um inibidor específico do complexo tenase (fXase). Em estudo prévio, foiobservado que um peptídeo sintético correspondendo a região entre os resíduos 90 a 110 de NP-2 apresentouatividade anticoagulante. O presente trabalho tem por objetivo o emprego de ferramentas de modelagemmolecular no estudo da interação de NP-2 e de seu fragmento ativo com o fator IXa. Os resultadosobtidos mostram as diferenças e as semelhanças conformacionais entre as estruturas simuladas. As informaçõesobtidas serão empregadas para o planejamento de moléculas pequenas (peptide-like) com potencialanticoagulante.Palavras-chave: fator IXa, nitroforina-2, fármacos anticoagulantes, modelagem molecular

Análise computacional de domínios tóxicos de fosfolipases A2 secretadas de veneno

Fosfolipases A2 (FLA2) compõem uma família de enzimas que, apesar de compartilharem grandesemelhança quanto à seqüência de aminoácidos e estrutura 3D, apresentam distintos efeitos biológicos.Com o objetivo de tentar contribuir para a elucidação dos fatores determinantes da especificidade destasproteínas, programas de modelagem molecular e alinhamento de seqüências foram utilizados na análisecomputacional de dois grupos de FLA2: miotóxicas e neurotóxicas. A partir dos dados obtidos é possívelconcluir que a ação miotóxica ou neurotóxica de FLA2 é determinada por mudanças topológicas e dopotencial eletrostático na superfície destas proteínas, as quais estão correlacionadas com a seqüênciaprimária de aminoácidos de cada motivo funcional.Palavras-chave: fosfolipase A2, FLA2, miotoxicidade, neurotoxicidade, bioinformática, modelagemmolecular

Reação de esterificação de ácido graxos, empregando-se glicerol como agente de alcóolise: estudo comparativo entre diferentes catalisadores

Neste trabalho foi avaliada a síntese de acilglicerídeos a partir de ácidos graxos, empregando-se glicerole seis diferentes catalisadores. Empregou-se ácido caprílico, ácido linolêico e ácido olêico e os catalisadoresforam ácido sulfúrico, ácido p-toluenossulfônico, dibutil-estanho, enzima lipozyme RM IM , enzima lipozymeTL IM e o metóxido de sódio. Realizou-se um estudo das condições de reação, como temperatura, tempo,atmosfera, concentração dos reagentes e dos catalisadores. Os acilglicerídeos obtidos foram caracterizadospor absorção atômica, cromatografia gasosa, índice de iodo, índice de acidez, infravermelho e DSC.Através do delineamento experimental confirmou-se que a temperatura é o fator determinante para aobtenção dos ésteres de glicerol.Palavras-chave: ácidos graxos, glicerol, acilglicerídeos, catálise química e enzimática

O emprego de lipases como agentes de resolução cinética de enantiômeros em síntese orgânica: aspectos gerais sobre a influência do solvente

In organic synthesis, lipases are the most frequently used biocatalysts. They are efficient stereoselective catalysts in the kinetic resolution of a wide variety of chiral compounds. The discovery that enzymes possess catalytic activity in organic solvents has made it possible to address the question of reaction medium influence on enzymatic specificity. Perhaps the most exciting and significant development in this emerging area is the discovery that enzyme specificity, in particular enantioselectivity, can be affected by changing from one organic solvent to another. This article discusses the scope and possible mechanistic models of this phenomenon in hydrolases, specially lipases, as well as directions of future research in the area

Sequence and structural characterization of tbnat gene in isoniazid-resistant Mycobacterium tuberculosis: identification of new mutations

The present study was carried out to investigate the presence of polymorphism in the N-acetyltransferase gene of 41 clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis, that were resistant to isoniazid (INH) with no mutations in the hot spots of the genes previously described to be involved in INH resistance (katG, inhA and ahpC). We observed single nucleotide polymorphisms (SNPs) in ten of these, including the G619A SNP in five isolates and an additional four so far un-described mutations in another five isolates. Among the latter SNPs, two were synonymous (C276T, n = 1 and C375G, n = 3), while two more non-synonymous SNPs were composed of C373A (Leu→Met) and T503G (Met→Arg) were observed in respectively one and two isolates. Molecular modeling and structural analysis based in a constructed full length 3D models of wild type TBNAT (TBNAT H37Rv) and the isoforms (TBNAT L125M and TBNAT M168R) were also performed. The refined models show that, just as observed in human NATs, the carboxyl terminus extends deep within the folded enzyme, into close proximity to the buried catalytic triad. Analysis of tbnat that present non-synonymous mutations indicates that both substitutions are plausible to affect enzyme specificity or acetyl-CoA binding capacity. The results contribute to a better understanding of structure–function relationships of NATs. However, further investigation including INH-sensitive strains as a control group is needed to get better understanding of the possible role of these new mutations on tuberculosis control