Omentina-1 e diabetes mellitus pós-transplante : polimorfismo rs2274907 no gene ITLN1 e níveis plasmáticos de omentina-1 em pacientes transplantados renais

O diabetes mellitus pós-transplante (DMPT) é uma complicação metabólica comum nos pacientes após o transplante renal. Possui fatores de risco heterogêneos, sendo alguns deles específicos do período pós-transplante relacionados ao uso de imunossupressores, e outros similares aos observados no diabetes mellitus tipo 2 (DM2), como síndrome metabólica, obesidade e idade avançada. O caráter inflamatório desta complicação metabólica vem sendo descrito e associado a uma maior ocorrência de morbimortalidade nesta população. O tecido adiposo desempenha papel fundamental na fisiopatogênese da inflamação sistêmica subclínica, secretando proteínas com atividades inflamatórias e anti-inflamatórias. Omentina-1 é uma adipocina anti-inflamatória associada a parâmetros metabólicos, incluindo resistência periférica à ação da insulina e obesidade. Neste sentido desenvolvemos este estudo, com o objetivo de: 1) avaliar a associação dos níveis plasmáticos de omentina-1 com DMPT e; 2) avaliar a associação de um polimorfismo no gene da omentina-1 com DMPT. No nosso primeiro estudo, alocamos pacientes provenientes de uma coorte de pacientes transplantados renais da região sul do Brasil, para um estudo de caso-controle (54 casos e 53 controles). Os pacientes foram selecionados pelas variáveis idade, sexo, tempo de transplante, índice de massa corporal (IMC) e taxa de filtração glomerular. Como principal resultado, observamos que os níveis plasmáticos de omentina-1 foram significativamente reduzidos no grupo DMPT (3.83 [1.67– 6.52] ng/mL) comparado ao grupo controle (5.62 [2.70 – 9.47] ng/mL, p = 0.036). Avaliando o valor incremental de omentina-1 para predição de risco de DMPT, verificamos que para cada 1ng/mL de aumento nos níveis plasmáticos de omentina-1, as chances de desenvolver DMPT reduziram em 8% (OR=0.92 [0.854 – 0.997], p=0.041). No segundo estudo, avaliamos a associação do polimorfismo rs2274907 no gene da omentina-1 em pacientes com DMPT e sem DMPT, num desenho de caso-controle aninhado a uma coorte retrospectiva (105 casos e 211 controles). Verificamos que o alelo A foi associado com risco para DMPT nos modelos de herança recessivo e aditivo (ambos p < 0,0001) na população estudada. Após ajuste para idade, etnia, tipo de doador e IMC pré-transplante, o genótipo A/A permaneceu associado ao risco nestes mesmos modelos (recessivo: OR = 3.711, 95% CI 1.659 – 8.302; aditivo: OR = 4.799, 95% CI 1.896 – 12.143; p=0,001). 9 Este projeto é o primeiro, de nosso conhecimento, a avaliar a associação da omentina-1 com DMPT. Nossos resultados apontam para um significativo papel protetor da omentina-1 no risco de desenvolvimento de DMPT. Mais estudos são necessários para confirmar esse achado. Contudo, acreditamos que nossos resultados possam contribuir para um melhor entendimento da fisiopatologia do DMPT bem como instigar a realização de estudos objetivando estratégias terapêuticas que possam prevenir ou reduzir a ocorrência desta complicação.Posttransplant diabetes mellitus (PTDM) is a common metabolic complication after kidney transplantation. The risk factors are heterogeneous and related to both the transplant process itself, such as the immunosuppressive drugs use and to other factors commonly found in type 2 diabetes mellitus (T2DM) patients, such as metabolic syndrome, obesity, and age. An inflammatory profile has been associated with PTDM and may lead to increase morbimortality in this population. The adipose tissue has a significant role in chronic lowgrade inflammation by secreting inflammatory and anti-inflammatory proteins. Omentin- 1 is an anti-inflammatory adipokine associated with metabolic factors, including insulin resistance and obesity. Therefore, this study aimed to 1) evaluate the association of plasma omentin-1 levels with PTDM and, 2) evaluate the association of rs2274907 polymorphism in the omentin-1 gene with PTDM. For the first aim, we performed a case-control study (54 cases and 53 controls) of a cohort of kidney transplant recipients from southern Brazil. Patients were matched by age, gender, time after transplantation, body mass index (BMI), and glomerular filtration rate. As a main result, we observed that the plasma omentin-1 levels were significantly reduced in the PTDM group (3.83 [1.67– 6.52] ng/mL) compared to the control group (5.62 [2.70 – 9.47] ng/mL, P = 0.036). Evaluating the incremental value of plasma omentin-1 to predict risk of PTDM, we found that for each increased 1ng/mL the odds to develop PTDM decreased by 8% (OR=0.92 [0.854 – 0.997], P=0.041). For the second aim, we evaluated the association of the rs2274907 polymorphism in the omentin-1 gene in patients with and without PTDM, in a nested case-control study within a retrospective cohort of kidney transplant recipients (105 cases and 211 controls). We observed that the A allele was associated with risk for PTDM under recessive and additive inheritance models (both P < 0.0001). After adjustment for age, ethnicity, type of donor, and BMI pre-transplant, the A/A genotype remained independently associated with risk for PTDM under recessive model: OR = 3.711, 95% CI 1.659 – 8.302 and under additive model: OR = 4.799, 95% CI 1.896 – 12.143; P=0.001. This is the first study, of our knowledge, to evaluate the association between omentin-1 and PTDM. Our results showed a significant protector pattern of the omentin11 1 in PTDM risk. Further studies are needed to confirm these findings. However, we believe our results can contribute to a better understanding of the PTDM physiopathology, and may also instigate further studies aiming therapeutic strategies to prevent or reduce the occurrence of this complication

Population wide testing pooling strategy for SARS-CoV-2 detection using saliva

SARS-CoV-2 pandemic has forced frequent testing of populations. It is necessary to identify the most cost-effective strategies for the detection of COVID-19 outbreaks. Nasopharyngeal samples have been used for SARS-CoV-2 detection but require a healthcare professional to collect the sample and cause discomfort and pain to the individual. Saliva has been suggested as an appropriate fluid for the diagnosis of COVID-19. We have investigated the possibility of using pools of saliva samples to detect SARS-CoV-2 in symptomatic and asymptomatic patients. Two hundred and seventy-nine saliva samples were analyzed through RT-PCR of Envelope, Nucleocapsid and Open Reading Frame 1ab genes. Reproducibility assays showed an almost perfect agreement as well as high sensitivity (96.6%), specificity (96.8%), positive predicted value (96.6%), and negative predicted value (96.8%). The average Cycle Threshold of the genes detected was 29.7. No significant differences (p > 0.05) were detected when comparing the cycle threshold average of two consecutive reactions on the same positive saliva samples. Saliva samples have a higher median viral load (32.6) than in nasopharyngeal samples (28.9), although no significant differences were detected (p > 0.05). Saliva-pool samples allowed effective SARS-CoV-2 screening, with a higher sensibility (96.9%) on 10-sample pools than in 20-sample pools (87.5%). Regardless of pools size specificity was high (99.9%) and an almost perfect agreement was observed. Our strategy was successfully applied in population wide testing of more than 2000 individuals, showing that it is possible to use pooled saliva as diagnostic fluid for SARS-CoV-2 infection.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

MAMMALS IN PORTUGAL : A data set of terrestrial, volant, and marine mammal occurrences in P ortugal

Mammals are threatened worldwide, with 26% of all species being includedin the IUCN threatened categories. This overall pattern is primarily associatedwith habitat loss or degradation, and human persecution for terrestrial mam-mals, and pollution, open net fishing, climate change, and prey depletion formarine mammals. Mammals play a key role in maintaining ecosystems func-tionality and resilience, and therefore information on their distribution is cru-cial to delineate and support conservation actions. MAMMALS INPORTUGAL is a publicly available data set compiling unpublishedgeoreferenced occurrence records of 92 terrestrial, volant, and marine mam-mals in mainland Portugal and archipelagos of the Azores and Madeira thatincludes 105,026 data entries between 1873 and 2021 (72% of the data occur-ring in 2000 and 2021). The methods used to collect the data were: live obser-vations/captures (43%), sign surveys (35%), camera trapping (16%),bioacoustics surveys (4%) and radiotracking, and inquiries that represent lessthan 1% of the records. The data set includes 13 types of records: (1) burrowsjsoil moundsjtunnel, (2) capture, (3) colony, (4) dead animaljhairjskullsjjaws, (5) genetic confirmation, (6) inquiries, (7) observation of live animal (8),observation in shelters, (9) photo trappingjvideo, (10) predators dietjpelletsjpine cones/nuts, (11) scatjtrackjditch, (12) telemetry and (13) vocalizationjecholocation. The spatial uncertainty of most records ranges between 0 and100 m (76%). Rodentia (n=31,573) has the highest number of records followedby Chiroptera (n=18,857), Carnivora (n=18,594), Lagomorpha (n=17,496),Cetartiodactyla (n=11,568) and Eulipotyphla (n=7008). The data setincludes records of species classified by the IUCN as threatened(e.g.,Oryctolagus cuniculus[n=12,159],Monachus monachus[n=1,512],andLynx pardinus[n=197]). We believe that this data set may stimulate thepublication of other European countries data sets that would certainly contrib-ute to ecology and conservation-related research, and therefore assisting onthe development of more accurate and tailored conservation managementstrategies for each species. There are no copyright restrictions; please cite thisdata paper when the data are used in publications.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Mammals in Portugal: a data set of terrestrial, volant, and marine mammal occurrences in Portugal

Mammals are threatened worldwide, with ~26% of all species being included in the IUCN threatened categories. This overall pattern is primarily associated with habitat loss or degradation, and human persecution for terrestrial mammals, and pollution, open net fishing, climate change, and prey depletion for marine mammals. Mammals play a key role in maintaining ecosystems functionality and resilience, and therefore information on their distribution is crucial to delineate and support conservation actions. MAMMALS IN PORTUGAL is a publicly available data set compiling unpublished georeferenced occurrence records of 92 terrestrial, volant, and marine mammals in mainland Portugal and archipelagos of the Azores and Madeira that includes 105,026 data entries between 1873 and 2021 (72% of the data occurring in 2000 and 2021). The methods used to collect the data were: live observations/captures (43%), sign surveys (35%), camera trapping (16%), bioacoustics surveys (4%) and radiotracking, and inquiries that represent less than 1% of the records. The data set includes 13 types of records: (1) burrows | soil mounds | tunnel, (2) capture, (3) colony, (4) dead animal | hair | skulls | jaws, (5) genetic confirmation, (6) inquiries, (7) observation of live animal (8), observation in shelters, (9) photo trapping | video, (10) predators diet | pellets | pine cones/nuts, (11) scat | track | ditch, (12) telemetry and (13) vocalization | echolocation. The spatial uncertainty of most records ranges between 0 and 100 m (76%). Rodentia (n =31,573) has the highest number of records followed by Chiroptera (n = 18,857), Carnivora (n = 18,594), Lagomorpha (n = 17,496), Cetartiodactyla (n = 11,568) and Eulipotyphla (n = 7008). The data set includes records of species classified by the IUCN as threatened (e.g., Oryctolagus cuniculus [n = 12,159], Monachus monachus [n = 1,512], and Lynx pardinus [n = 197]). We believe that this data set may stimulate the publication of other European countries data sets that would certainly contribute to ecology and conservation-related research, and therefore assisting on the development of more accurate and tailored conservation management strategies for each species. There are no copyright restrictions; please cite this data paper when the data are used in publications

Efeito da suplementação de óleo de linhaça na redução de proteína c-reativa em pacientes em hemodiálise crônica

INTRODUÇÃO: Uma elevada proporção dos pacientes em hemodiálise crônica (HD) apresentam estado inflamatório representado pela elevação da proteína C-reativa (PCR) a qual é um marcador prognóstico de aumento de mortalidade. Os ácidos graxos w3 possuem atividade anti-inflamatória que ocorre pela inibição de eicosanóides inflamatórios. O óleo de linhaça é o único óleo vegetal composto em 60% pelo precursor α-linolênico. Neste estudo avaliamos a ação do óleo de linhaça no estado inflamatório de pacientes em HD. METODOLOGIA: Ensaio clínico randomizado, duplo-cego e multicêntrico realizado no estado do Rio Grande do Sul. Participaram 114 indivíduos alocados em 2 grupos: placebo, óleo mineral (OM) e óleo de linhaça (OL), sendo incluídos os maiores de 18 anos, em HD há mais de 90 dias, que não apreentassem infecção ou inflamação, doença auto-imune, cateteres endovenosos, infecção por HIV, doença maligna conhecida, e transplante renal prévio. O grupo OL recebeu 2 cápsulas de 1g de óleo de linhaça com α-tocoferol (3,5mg) por 120 dias. O grupo OM recebeu cápsulas de placebo. Foram coletados dados bioquímicos de proteína C reativa e perfil lipídico no início, em 60 e 120 dias de suplementação. Foram aplicados os testes estatísticos ANOVA, t-Student, chi-quadrado e Wilcoxon Mann Whitney (SPSS). O valor de p<0,05 foi considerado estatisticamente significativos e a correlação foi calculada através do teste de Pearson ou Sperman. RESULTADOS: Os grupos foram homogêneos para idade, sexo, etnia, tempo em HD e IMC. Inflamação foi definida por PCR ≥5,1mg/dL e prevaleceu em 60% dos pacientes na primeira análise. Homens obtiveram maior mediana de PCR (11,8mg/dL x 8,6mg/dL nas mulheres; p=0,03). Houve correlação entre PCR e IMC (Rs=0,22; p=0,022) e HDL-c (Rs = -0,23; p= 0,032). A variação de PCR do OL foi maior que a do OM no tempo (pinteração <0,001), mas sem diferença entre grupos. Analisando a transição dos pacientes de inflamados à não inflamados, no grupo OL 33,3% mudaram de categoria entre a primeira e a última análise, contra 16,9% no grupo OM (p=0,04). Colesterol e frações não apresentaram mudança significativa. No grupo OL, 88,8% (n=48) referiram melhora da função intestinal comparados com 25% (n=15) do grupo OM (p<0,001). CONCLUSÃO: A inflamação nos pacientes em HD parece estar correlacionada ao IMC e a diminuição de HDL-c. A função intestinal do pacientes foi melhor no grupo OL. O óleo de linhaça possibilitou redução do número de pacientes inflamados. Estudos mais prolongados e com maior número de pacientes devem ser feitos para comprovar estes achados

Omentina-1 e diabetes mellitus pós-transplante : polimorfismo rs2274907 no gene ITLN1 e níveis plasmáticos de omentina-1 em pacientes transplantados renais

O diabetes mellitus pós-transplante (DMPT) é uma complicação metabólica comum nos pacientes após o transplante renal. Possui fatores de risco heterogêneos, sendo alguns deles específicos do período pós-transplante relacionados ao uso de imunossupressores, e outros similares aos observados no diabetes mellitus tipo 2 (DM2), como síndrome metabólica, obesidade e idade avançada. O caráter inflamatório desta complicação metabólica vem sendo descrito e associado a uma maior ocorrência de morbimortalidade nesta população. O tecido adiposo desempenha papel fundamental na fisiopatogênese da inflamação sistêmica subclínica, secretando proteínas com atividades inflamatórias e anti-inflamatórias. Omentina-1 é uma adipocina anti-inflamatória associada a parâmetros metabólicos, incluindo resistência periférica à ação da insulina e obesidade. Neste sentido desenvolvemos este estudo, com o objetivo de: 1) avaliar a associação dos níveis plasmáticos de omentina-1 com DMPT e; 2) avaliar a associação de um polimorfismo no gene da omentina-1 com DMPT. No nosso primeiro estudo, alocamos pacientes provenientes de uma coorte de pacientes transplantados renais da região sul do Brasil, para um estudo de caso-controle (54 casos e 53 controles). Os pacientes foram selecionados pelas variáveis idade, sexo, tempo de transplante, índice de massa corporal (IMC) e taxa de filtração glomerular. Como principal resultado, observamos que os níveis plasmáticos de omentina-1 foram significativamente reduzidos no grupo DMPT (3.83 [1.67– 6.52] ng/mL) comparado ao grupo controle (5.62 [2.70 – 9.47] ng/mL, p = 0.036). Avaliando o valor incremental de omentina-1 para predição de risco de DMPT, verificamos que para cada 1ng/mL de aumento nos níveis plasmáticos de omentina-1, as chances de desenvolver DMPT reduziram em 8% (OR=0.92 [0.854 – 0.997], p=0.041). No segundo estudo, avaliamos a associação do polimorfismo rs2274907 no gene da omentina-1 em pacientes com DMPT e sem DMPT, num desenho de caso-controle aninhado a uma coorte retrospectiva (105 casos e 211 controles). Verificamos que o alelo A foi associado com risco para DMPT nos modelos de herança recessivo e aditivo (ambos p < 0,0001) na população estudada. Após ajuste para idade, etnia, tipo de doador e IMC pré-transplante, o genótipo A/A permaneceu associado ao risco nestes mesmos modelos (recessivo: OR = 3.711, 95% CI 1.659 – 8.302; aditivo: OR = 4.799, 95% CI 1.896 – 12.143; p=0,001). 9 Este projeto é o primeiro, de nosso conhecimento, a avaliar a associação da omentina-1 com DMPT. Nossos resultados apontam para um significativo papel protetor da omentina-1 no risco de desenvolvimento de DMPT. Mais estudos são necessários para confirmar esse achado. Contudo, acreditamos que nossos resultados possam contribuir para um melhor entendimento da fisiopatologia do DMPT bem como instigar a realização de estudos objetivando estratégias terapêuticas que possam prevenir ou reduzir a ocorrência desta complicação.Posttransplant diabetes mellitus (PTDM) is a common metabolic complication after kidney transplantation. The risk factors are heterogeneous and related to both the transplant process itself, such as the immunosuppressive drugs use and to other factors commonly found in type 2 diabetes mellitus (T2DM) patients, such as metabolic syndrome, obesity, and age. An inflammatory profile has been associated with PTDM and may lead to increase morbimortality in this population. The adipose tissue has a significant role in chronic lowgrade inflammation by secreting inflammatory and anti-inflammatory proteins. Omentin- 1 is an anti-inflammatory adipokine associated with metabolic factors, including insulin resistance and obesity. Therefore, this study aimed to 1) evaluate the association of plasma omentin-1 levels with PTDM and, 2) evaluate the association of rs2274907 polymorphism in the omentin-1 gene with PTDM. For the first aim, we performed a case-control study (54 cases and 53 controls) of a cohort of kidney transplant recipients from southern Brazil. Patients were matched by age, gender, time after transplantation, body mass index (BMI), and glomerular filtration rate. As a main result, we observed that the plasma omentin-1 levels were significantly reduced in the PTDM group (3.83 [1.67– 6.52] ng/mL) compared to the control group (5.62 [2.70 – 9.47] ng/mL, P = 0.036). Evaluating the incremental value of plasma omentin-1 to predict risk of PTDM, we found that for each increased 1ng/mL the odds to develop PTDM decreased by 8% (OR=0.92 [0.854 – 0.997], P=0.041). For the second aim, we evaluated the association of the rs2274907 polymorphism in the omentin-1 gene in patients with and without PTDM, in a nested case-control study within a retrospective cohort of kidney transplant recipients (105 cases and 211 controls). We observed that the A allele was associated with risk for PTDM under recessive and additive inheritance models (both P < 0.0001). After adjustment for age, ethnicity, type of donor, and BMI pre-transplant, the A/A genotype remained independently associated with risk for PTDM under recessive model: OR = 3.711, 95% CI 1.659 – 8.302 and under additive model: OR = 4.799, 95% CI 1.896 – 12.143; P=0.001. This is the first study, of our knowledge, to evaluate the association between omentin-1 and PTDM. Our results showed a significant protector pattern of the omentin11 1 in PTDM risk. Further studies are needed to confirm these findings. However, we believe our results can contribute to a better understanding of the PTDM physiopathology, and may also instigate further studies aiming therapeutic strategies to prevent or reduce the occurrence of this complication