Transcriptomic analysis of a near-isogenic line of melon with high fruit flesh firmness during ripening

BACKGROUND. A near-isogenic line (NIL) of melon (SC10-2) with introgression in linkage group X was studied from harvest (at firm-ripe stage of maturity) until day 18 of postharvest storage at 20.5 °C together with its parental control (‘Piel de Sapo’, PS). RESULTS. SC10-2 showed higher flesh firmness and whole fruit hardness but lower juiciness than its parental. SC10-2 showed a decrease in respiration rate accompanied by a decrease in ethylene production during ripening, both of which fell to a greater extent than in PS. The introgression affected 11 volatile organic compounds (VOCs), the levels of which during ripening were generally higher in SC10-2 than in PS. Transcriptomic analysis from RNA-Seq revealed differentially expressed genes (DEGs) associated with the effects studied. For example, 909 DEGs were exclusive to the introgression, and only 23 DEGs were exclusive to postharvest ripening time. Major functions of the DEGs associated with introgression or ripening time were identified by cluster analysis. About 37 genes directly and/or indirectly affected the delay in ripening of SC10-2 compared with PS in general and, more particularly, the physiological and quality traits measured and, probably, the differential non-climacteric response. Of the former genes, we studied in more detail at least five that mapped in the introgression in linkage group (LG) X, and 32 outside it. CONCLUSION. There is an apparent control of textural changes, VOCs and fruit ripening by an expression quantitative trait locus located in LG X together with a direct control on them due to genes presented in the introgression (CmTrpD, CmNADH1, CmTCP15, CmGDSL esterase/lipase, and CmHK4-like) and CmNAC18.This work was funded by grants 11784/PI/09 (Seneca Foundation, Region of Murcia) and Ministry of Economy and Innovation (AGL2010-20858)

Transcriptomic analysis of a near-isogenic line of melon with high fruit flesh firmness during ripening

This is the peer reviewed version of the following article: Zarid, M., García-Carpintero, V., Esteras, C., Esteva, J., Bueso, M.C., Cañizares, J., Picó, M.B., Monforte, A.J. and Fernández-Trujillo, J.P. (2021), Transcriptomic analysis of a near-isogenic line of melon with high fruit flesh firmness during ripening. J Sci Food Agric, 101: 754-777, which has been published in final form at https://doi.org/10.1002/jsfa.10688. This article may be used for non-commercial purposes in accordance with Wiley Terms and Conditions for Self-Archiving.[EN] BACKGROUND A near-isogenic line (NIL) of melon (SC10-2) with introgression in linkage group X was studied from harvest (at firm-ripe stage of maturity) until day 18 of postharvest storage at 20.5 degrees C together with its parental control ('Piel de Sapo', PS). RESULTS SC10-2 showed higher flesh firmness and whole fruit hardness but lower juiciness than its parental. SC10-2 showed a decrease in respiration rate accompanied by a decrease in ethylene production during ripening, both of which fell to a greater extent than in PS. The introgression affected 11 volatile organic compounds (VOCs), the levels of which during ripening were generally higher in SC10-2 than in PS. Transcriptomic analysis from RNA-Seq revealed differentially expressed genes (DEGs) associated with the effects studied. For example, 909 DEGs were exclusive to the introgression, and only 23 DEGs were exclusive to postharvest ripening time. Major functions of the DEGs associated with introgression or ripening time were identified by cluster analysis. About 37 genes directly and/or indirectly affected the delay in ripening of SC10-2 compared with PS in general and, more particularly, the physiological and quality traits measured and, probably, the differential non-climacteric response. Of the former genes, we studied in more detail at least five that mapped in the introgression in linkage group (LG) X, and 32 outside it. CONCLUSION There is an apparent control of textural changes, VOCs and fruit ripening by an expression quantitative trait locus located in LG X together with a direct control on them due to genes presented in the introgression (CmTrpD,CmNADH1,CmTCP15,CmGDSL esterase/lipase, andCmHK4-like) and CmNAC18.This work was funded by grants 11784/PI/09 (Seneca Foundation, Region of Murcia) and Ministry of Economy and Innovation (AGL2010-20858). M Zarid acknowledges an UE-Erasmus predoctoral fellowship, a program coordinated by the University of Murcia in the framework of CMN. Thanks are due to Semillas Fitó SA (Barcelona, Spain), for providing seeds of PS melons and IRTACRAG for the seeds of SC10-2. We acknowledge the assistance of P Varó and his team in CIFEA-Torre Pacheco for crop management, to N Dos-Santos, M Medina, M García-Gutiérrez, A Hakmaoui, E Cuadros, I Canales and AA Escudero (UPCT) for sampling and technical assistance, to SAIT-UPCT for GC-MS analysis, to AG Sifres (COMAV) for RNA extraction, and to CNAG (Barcelona) for professional assistance in RNA-Seq. The authors declare that the research was conducted in the absence of any commercial or financial relationships that could be construed as a potential conflict of interest.Zarid, M.; García-Carpintero, V.; Esteras Gómez, C.; Esteva, J.; Bueso, MC.; Cañizares Sales, J.; Picó Sirvent, MB.... (2021). Transcriptomic analysis of a near-isogenic line of melon with high fruit flesh firmness during ripening. Journal of the Science of Food and Agriculture. 101(2):754-777. https://doi.org/10.1002/jsfa.10688S7547771012Ríos, P., Argyris, J., Vegas, J., Leida, C., Kenigswald, M., Tzuri, G., … Garcia-Mas, J. (2017). 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Plant Physiology, 140(2), 761-770. doi:10.1104/pp.105.070995Nakamura, Y., Koizumi, R., Shui, G., Shimojima, M., Wenk, M. R., Ito, T., & Ohta, H. (2009). Arabidopsis lipins mediate eukaryotic pathway of lipid metabolism and cope critically with phosphate starvation. Proceedings of the National Academy of Sciences, 106(49), 20978-20983. doi:10.1073/pnas.0907173106Nakamura, Y., Awai, K., Masuda, T., Yoshioka, Y., Takamiya, K., & Ohta, H. (2005). A Novel Phosphatidylcholine-hydrolyzing Phospholipase C Induced by Phosphate Starvation in Arabidopsis. Journal of Biological Chemistry, 280(9), 7469-7476. doi:10.1074/jbc.m408799200Tang, Y., Zhang, C., Cao, S., Wang, X., & Qi, H. (2015). The Effect of CmLOXs on the Production of Volatile Organic Compounds in Four Aroma Types of Melon (Cucumis melo). PLOS ONE, 10(11), e0143567. doi:10.1371/journal.pone.0143567Zhang, C., Cao, S., Jin, Y., Ju, L., Chen, Q., Xing, Q., & Qi, H. (2017). Melon13-lipoxygenase CmLOX18 may be involved in C6 volatiles biosynthesis in fruit. Scientific Reports, 7(1). doi

NEWSHUB: Incubadora de contenidos formativos para la comunicación profesional de los resultados del Aprendizaje Basado en Proyectos (ABP)

El proyecto NEWSHUB pretende ser el punto de unión entre docentes y estudiantes a través de las asignaturas y proyectos que desarrollen ambos colectivos de la comunidad universitaria. En esta relación al mismo nivel entre profesor/alumno se proporciona apoyo, formación y asesoramiento para poder realizar proyectos de diversa índole y materializarlos para su uso y difusión tanto dentro del aula y el ámbito académico como fuera de ella en el terreno profesional. NEWSHUB es una incubadora de proyectos. Rediseñamos actividades y prácticas de clase para que se ajusten a una aplicación eficaz de la metodología de aprendizaje basado en proyectos. Ofrecemos asesoría y acompañamiento a docentes y estudiantes para que desarrollen su actividad académica integrando estrategias y procesos de calidad propios del ámbito profesional. NEWSHUB es una plataforma de formación. Ponemos contenidos formativos sobre comunicación eficiente a disposición de la comunidad educativa e investigadora y del sector de la orientación laboral y el fomento del emprendimiento. Ofrecemos recursos educativos abiertos a través de una plataforma web modular, interoperable y accesible, que alberga contenidos digitales de producción propia y un banco de buenas prácticas. NEWSHUB conecta asignaturas, docentes y estudiantes para que los resultados de los distintos procesos de enseñanza-aprendizaje se optimicen para el cumplimiento de los objetivos clave del proyecto: aplicar eficazmente metodologías abiertas en el aula; alimentar el porfolio y el currículum en la búsqueda de empleo y el fomento del emprendimiento; y generar recursos educativos y modelos de buenas prácticas para formar en una comunicación eficiente

NEWSHUB: Incubadora de contenidos formativos para la comunicación profesional de los resultados del Aprendizaje Basado en Proyectos (ABP)

NEWSHUB es un espacio de encuentro académico y profesional. Su principal función es cubrir necesidades específicas de formación tanto para el profesorado como para el alumnado en materia de comunicación. La finalidad es facilitar que se diseñen actividades de aprendizaje basado en proyectos orientadas a generar productos comunicativos de calidad profesional, que sirvan a un tiempo como herramienta eficiente de aprendizaje en el entorno académico además de recurso destacado en el porfolio del alumnado para la búsqueda de empleo o la formalización de proyectos emprendedores. NEWSHUB es una incubadora de proyectos. Rediseñamos actividades y prácticas de clase para que se ajusten a una aplicación eficaz de la metodología de aprendizaje basado en proyectos. Ofrecemos asesoría y acompañamiento a docentes y estudiantes para que desarrollen su actividad académica integrando estrategias y procesos de calidad propios del ámbito profesional. NEWSHUB es una plataforma de formación. Ponemos contenidos formativos sobre comunicación eficiente a disposición de la comunidad educativa e investigadora y del sector de la orientación laboral y el fomento del emprendimiento. Ofrecemos recursos educativos abiertos a través de una plataforma web modular, interoperable y accesible, que alberga contenidos digitales de producción propia y un banco de buenas prácticas. NEWSHUB es coaching digital. Con la nueva situación provocada por la pandemia tenemos que adaptar nuestra manera de enseñar y de aprender haciendo que el entorno virtual sea un espacio en el que tanto profesores como estudiantes se encuentren tan cómodos como en el aula. Para ello acompañaremos a los docentes en ese tránsito y contaremos con la opinión directa de los alumnos/as que participan en nuestro proyecto. NEWSHUB conecta asignaturas, docentes y estudiantes para que los resultados de los distintos procesos de enseñanza-aprendizaje se optimicen para el cumplimiento de los objetivos clave del proyecto: aplicar eficazmente metodologías abiertas en el aula; alimentar el porfolio y el currículum en la búsqueda de empleo y el fomento del emprendimiento; y generar recursos educativos y modelos de buenas prácticas para formar en una comunicación eficiente. NEWSHUB también permite crear un puente entre profesores/as, alumnos/as y materias de otras facultades e incluso de otros países. La virtualización permite deslocalizar y ponernos en contacto para intercambiar experiencias, programas y recursos educativos proporcionando una visión más rica y abierta en diferentes contextos culturales y de diversidad. Como principal novedad, en esta segunda parte del proyecto, NEWSHUB se vuelve más internacional incorporando a profesores y profesoras de facultades de Comunicación y Diseño que imparten materiales similares. El objetivo de esta internacionalización es comparar el proceso de enseñanza y aprendizaje basada en proyectos en diferentes contextos culturales

Scientific output on transsexuality in the Spanish biomedical literature: Bibliometric and content analysis (1973-2011)

Objetivo: Explorar la evolución del conocimiento científico sobre transexualidad durante los últimos 40 años, a través de un análisis bibliométrico y de contenido de la producción de la literatura biomédica española sobre la transexualidad entre los años 1973 y 2011. Método: Descriptivo y transversal. Universo: artículos biomédicos españoles sobre transexualidad publicados entre 1973 y 2011. Fuente: ÍndiceMédico Español e ISOC-Ciencias Sociales y Humanidades. Análisis: bibliométrico y de contenido de las publicaciones biomédicas. Resultados: 65 artículos biomédicos analizados. Entre 1973 y 1984, en España, el conocimiento sobre transexualidad se produce y circula en revistas médicas. En 1996 se inicia una década de gran productividad, y en los años siguientes el número de revistas que publican sobre transexualidad se multiplica. Hasta 2006, año de mayor productividad biomédica, los discursos biomédicos reproducen representaciones de la transexualidad ancladas en el determinismo biológico. En el período 2008-2011, los y las profesionales incorporan teorías feministas y perspectivas sociales en sus discursos. Conclusiones: En el último cuarto del siglo xx, el discurso médico dominante ha considerado las manifestaciones de las personas transexuales desde una perspectiva biologicista que concibe la transexualidad como un error de correspondencia sexo/género. En los últimos años, la aparición de nuevas categorías de identidad y la reflexión desde posturas no esencialistas y normativas del género favorece la gestión clínica de la transexualidad.Objective: To explore the scientific output on transsexuality in the Spanish biomedical literature between 1973 and 2011, through bibliometric and content analyses. Methods: We carried out a descriptive, cross-sectional study of Spanish biomedical articles on transsexuality published between 1973 and 2011. The data sources consisted of Índice Médico Español and ISOC-Ciencias Sociales y Humanidades. Bibliometric and content analyses were performed. Results: A total of 65 papers were analyzed. Knowledge on transsexuality in Spain began to appear in medical journals between 1973 and 1984. A decade of intense productivity began in 1996 and the number of journals publishing articles on transsexuality multiplied in the following years. Until 2006, the year with the most biomedical productivity, biomedical discourses reproduced representations of transsexuality anchored in biological determinism. From 2008-2011, professionals writing on the topic incorporated feminist theories and social perspectives in their discourses. Conclusions: In the last quarter of the twentieth century, the dominant medical discourse considered manifestations of transsexual people from a biologist perspective that conceives transsexuality as a configuration mismatch between sex and gender. The emergence of new identity categories and medical reflection from non-essentialist and non-normative gender perspectives has improved the clinical management of transsexuality

Ciencia y profesión : el farmacéutico en la historia

474 páginas. Versiones pdf / epubLas IV Jornadas Científicas de la Sociedad de Docentes Universitarios de Historia de la Farmacia (SDUHFE) se celebraron en la Sede de La Rábida en junio de 2016. Esta obra presenta diversas investigaciones y comunicaciones, con varias temáticas que pueden desglosarse en cuatro bloques: 1) En un primer grupo podemos considerar todos los capítulos que abordan la historia de los colegios farmacéuticos así como los avatares de la profesión. Se da cuenta en la provincia de Sevilla de las dificultades del Colegio de Farmacéuticos en el periodo de la Guerra Civil y la Posguerra (1936-1949), del proceso de colegiación obligatoria a partir de 1916, pinceladas históricas sobre los farmacéuticos cántabros del siglo XIX, del Colegio de Farmacéuticos de Filipinas a finales del XIX, de los conflictos de los farmacéuticos en las reuniones sanitarias de mitad del XX, y del papel de los farmacéuticos titulares en la potabilización de las aguas de consumo en Plentzia (Vizcaya). 2) Podemos destacar también todos los trabajos que giran en torno a diferentes medicamentos y productos farmacéuticos, entre ellos estudios históricos sobre piedras preciosas, medicamentos para tratar heridas, quina contra las tercianas, opio, alexifármacos, medicamentos homeopáticos, talidomida o curiosos productos como el Licor del Polo. 3) El papel de los laboratorios farmacéuticos como la Casa Nestlé durante la Guerra Civil española y el franquismo, diferentes laboratorios onubenses durante este mismo periodo, el papel del Instituto de Higiene Militar y la experimentación con insecticidas clorados sintéticos en la posguerra española, aglutinan el tercer cuerpo temático. 4) Finalmente, podemos destacar los trabajos que tienen una componente publicitaria, divulgadora y social entre los que cabe destacar el estudio del NO-DO y los diferentes noticieros y documentales sobre temas farmacéuticos que resultan muy ilustrativos. La propaganda farmacéutica desarrollada en la revista Matronas, el inventario del patrimonio farmacéutico catalán, junto a la percepción social de la farmacia a través de las fallas valencianas conforma este último grupo

Derecho, género e igualdad : cambios en las estructuras jurídicas androcéntricas. Vol I

Este libro es el resultado de trabajos seleccionados del I Congreso Internacional Derecho, Género e Igualdad, realizado en el año 2009 en la Universidad de Barcelona por el Grupo Antígona y el Grupo Dones i Drets

Efecto de los antimaláricos sobre los diferentes dominios del índice de daño SLICC en pacientes de la cohorte GLADEL

Objetivos: estimar el efecto de los antimaláricos (AM) sobre los diferentes dominios del índice de daño SLICC (SDI). Métodos: se estudiaron pacientes con diagnóstico clínico reciente (≤2 años) de lupus eritematoso sistémico (LES) de la cohorte GLADEL

Subvarieties of BL-algebras generated by single-component chains

In this paper we study and equationally characterize the subvarieties of BL, the variety of BL-algebras, which are generated by families of single-component BL-chains, i.e. MV-chains, Product-chain or Gödel-chains. Moreover, it is proved that they form a segment of the lattice of subvarieties of BL which is bounded by the Boolean variety and the variety generated by all single-component chains, called Å?âˆ?G.The authors thank Petr Hájek for useful remarks and suggestions. The authors have been partially supported by the bilateral Italian-Spanish cooperation project Integrated Action HI 1998-0090Peer Reviewe

COMPARACIÓN DE LOS COMPONENTES DEL RENDIMIENTO EN VARIEDADES DE FRIJOL EN CONDICIONES DE ACIDEZ Y HUMEDAD RESIDUAL DEL SUELO EN EL SUR DE VERACRUZ

El frijol negro (Phaseolus vulgaris L.) se cultiva en suelos ácidos (pH<5) con humedad residual en el sur del estado de Veracruz, México. El cultivo se realiza en unas 6600 ha al final de la temporada de lluvias a mediados de septiembre o principios de octubre. La humedad residual, aunado a la acidez del suelo frecuentemente afectan el periodo de formación de la semilla, reduciendo el rendimiento. El presente trabajo tuvo como objetivo caracterizar variedades de frijol de tipo III en cuanto a su rendimiento de semilla y sus componentes, cultivadas bajo restricciones de humedad residual y acidez del suelo, y altas temperaturas en el ciclo otoño-invierno 2012-2013, en el Municipio de Juan Rodríguez Clara, Veracruz. Se emplearon seis variedades de testa de color negro, seis del tipo ‘Flor de Mayo’ y una del tipo ‘Flor de Junio’. El diseño experimental fue de bloques completos al azar con cuatro repeticiones. La unidad experimental se constituyó de cinco surcos de 5 m de longitud y 0.8 m de separación. Se fertilizó con una dosis de 40-40-00. Las variedades “Negro Veracruz”, “San Andrés”, “Negro Cotaxtla” y “Flor de Junio Marcela”, exhibieron mayor rendimiento de semilla, vainas por m2 y peso de 200 semillas, altura de planta y menor biomasa aérea final que las demás. El mayor rango de variabilidad genética entre las variedades se observó para la biomasa aérea final y altura de planta. La respuesta en rendimiento y sus componentes sugiere que algunas variedades de testa negra han desarrollado mecanismos de tolerancia a la acidez, restricción de humedad residual del suelo y altas temperaturas durante la floración y formación de la semilla, que les permiten producir altos rendimientos a pesar de estar sometidas a estrés ambiental. La variedad de Valles Altos (“Flor de Junio Marcela”), también mostró que podría tener buena adaptación a estas condiciones