Fenótipos de resistência antimicrobiana epidemiologicamente importantes em culturas de vigilância de um serviço terciário de saúde em Aracaju-SE

Introduction: The constant emergence and spread of bacterial phenotypes of resistance to multiple drugs has become a public health problem worldwide. Objective: To investigate the occurrence of critical antimicrobial resistance phenotypes in bacteria isolated from surveillance cultures. Method: Microbiological data were collected from surveillance cultures performed between January and December 2015 at a tertiary health service. 1,590 surveillance cultures using the VITEK 2 system for phenotypic identification and susceptibility to antimicrobials of the isolates were analyzed. The detection of extended-spectrum β-lactamases (ESBL) was performed using the approach disc and carbapenem resistance method and methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) using diffusion disc methods. The detection of bacteria carrying the blaKPC, blaNDM and blaOXA-48 genes was carried out through the polymerase chain reaction in house  Results: The analysis identified 201 (12.64%) ESBL phenotypes, 173 (11.87%) resistant to carbapenems and 3 (0.18%) MRSA. 34 strains carrying genes encoding carbapenemases were detected, where 23 (67.64%) carried the blaKPC gene, 8 (23.53%) blaNDM and 3 (8.82%) both genes. Conclusions: It is a challenge to control the spread of critical resistance bacterial phenotypes. The predominance of ESBL in the referent hospital, as well as  the occurrence of genes that have not been reported for carbapenemases until then, confirm the importance of epidemiological surveillance and the encouragement of subsequent research.Introdução: O constante surgimento e a disseminação de fenótipos bacterianos de resistência a múltiplas drogas têm se tornado problemas de saúde pública em todo o mundo. Objetivo: Investigar a ocorrência de fenótipos críticos de resistência aos antimicrobianos em bactérias isoladas de culturas de vigilância. Método: Os dados microbiológicos foram coletados a partir de culturas de vigilância realizadas entre janeiro e dezembro de 2015 em um serviço terciário de saúde. Foram analisadas 1.590 culturas de vigilância utilizando o sistema VITEK 2 para identificação fenotípica e suscetibilidade aos antimicrobianos dos isolados. A detecção de β-lactamases de espectro estendido (ESBL) foi realizada por método de disco aproximação e a resistência aos carbapenêmicos e Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) por métodos de disco difusão. A detecção de bactérias portadoras dos genes blaKPC, blaNDM e blaOXA-48 foi realizada através da reação em cadeia da polimerase in house. Resultados: Foram identificadas 201 (12,64%) fenótipos de ESBL, 173 (11,87%) de resistência aos carbapenêmicos e 3 (0,18%) de MRSA. Foram detectadas 34 cepas portadoras de genes codificadores de carbapenemases, onde 23 (67,64%) carreavam o gene blaKPC, oito (23,53%) o blaNDM e três (8,82%) ambos os genes. Conclusões: É um desafio controlar a disseminação de fenótipos críticos de resistência bacterianos. O predomínio de ESBL no referente hospital, assim como a ocorrência de genes codificadores de carbapenemases até então não relatados, ratificam a importância da vigilância epidemiológica e do incentivo a pesquisas subsequentes

Development of herbicide-tolerant irrigated rice cultivars

O objetivo deste trabalho foi desenvolver novas linhagens de arroz irrigado tolerantes ao herbicida imidazolinona. O método de retrocruzamento foi usado para transferir o alelo de tolerância à imidazolinona do mutante 93AS3510 para os genitores recorrentes 'BRS 7 Taim' e 'BRS Pelota'. Indivíduos tolerantes ao herbicida foram selecionados em cada geração, por três gerações de retrocruzamento (RC1 a RC3), seguidas por três gerações de autofecundação (RC3F1 a RC3F3). As quatro melhores linhagens RC3F3 quanto às características agronômicas foram genotipadas com 44 marcadores microssatélites. O índice de conversão observado nas novas linhagens tolerantes à imidazolinona variou de 91,86 a 97,67%. A análise de distância genética par-a-par, entre estas linhagens e 22 acessos do banco de germoplasma de arroz da Embrapa, agrupou-as com os seus respectivos genitores recorrentes, mas não com 'IRGA 417', que foi originalmente usada como genitor para derivar a IRGA 422 CL, única cultivar tolerante ao herbicida imidazolinona recomendada para cultivo no Brasil. Portanto, estas linhagens representam novas opções de acessos geneticamente diversos de arroz irrigado com tolerância ao herbicida imidazolinona. As linhagens CNA10756 ('BRS Sinuelo' CL) e CNA10757 serão lançadas para cultivo no sistema de produção "Clearfield" no Rio Grande do Sul, Brasil.The objective of this work was to develop new irrigated rice lines tolerant to imidazolinone herbicides. The backcross breeding procedure was used to transfer the imidazolinone tolerance allele from mutant 93AS3510 to the recurrent parents 'BRS 7 Taim' and 'BRS Pelota'. Individual herbicide-tolerant plants were selected in each generation, for three backcrossings (RC1 to RC3), followed by three selfing generations (RC3F1 to RC3F3). The best four RC3F3 lines for agronomic traits were genotyped with 44 microsatellite markers. The observed conversion index of the new imidazolinone-tolerant lines varied from 91.86 to 97.67%. Pairwise genetic distance analysis between these lines and 22 accessions from the Embrapa's Rice Germplasm Bank clustered the new lines with their respective recurrent parents, but not with 'IRGA 417', which was originally used as recurrent parent to derive IRGA 422 CL, the only imidazolinone-tolerant irrigated rice cultivar recommended for cultivation in Brazil. Therefore, these lines represent new options of genetically diverse imidazolinone-tolerant rice accessions. Lines CNA10756 ('BRS Sinuelo CL') and CNA10757 will be released for cultivation in the Clearfield irrigated rice production system in Rio Grande do Sul, Brazil

Estudo comparativo entre metodologias para o diagnóstico da leishmaniose visceral humana: uma revisão integrativa / Comparative study methodologies for the diagnosis of human visceral leishmaniasis: an integrative review

Objetivo: Discutir e comparar os testes utilizados no diagnóstico da Leishmaniose Visceral (LV). Métodos: O presente estudo trata-se de uma revisão integrativa de literatura. Para a seleção dos artigos utilizou-se a base de dados Pubmed e a amostra desta revisão constituiu-se de sete artigos. Resultados: Existem várias metodologias, destacando-se os testes rápidos, ELISA (Enzimaimunoensaio), DAT (teste de aglutinação direta), RIFI (ensaio de imunofluorescência indireta), aspiração esplênica, teste de aglutinação em látex (KAtex), PCR (Reação em cadeia da polimerase) convencional e PCR. Em maioria apresentam uma diferença se sensibilidade e especificidade a depender do fabricante, todavia os métodos de biologia molecular mostraram-se mais efetivos em relação aos demais e os testes rápidos apresentaram um grande diferencial quanto a praticidade. Considerações finais: os testes convencionalmente usados para o diagnóstico da LV apresentaram variações significativas em relação à sua sensibilidade e existe a necessidade de mais de uma metodologia diferente para a confirmação do resultado

Adubação orgânica e mineral no crescimento inicial de mudas de Cedrela Fissilis Vellozo / Organic and mineral fertilization in the initial growth Cedrela Fissilis Vellozo seedlings

O cedro rosa (Cedrela fissilis Vellozo) uma espécie florestal, indicada para ações como reflorestamento, preservação ambiental, arborização urbana, paisagismo, porém, de difícil manejo devido à dificuldade na produção de mudas devido a incidência de doenças destacando-se a morte do ponteiro, dificultando assim a produção de suas mudas como o plantio comercial ou não da espécie, apresenta elevado valor econômico devida as características da sua madeira. Este estudo tem como objetivo avaliar o crescimento e a qualidade das mudas de Cedro Rosa a partir da incorporação do substrato cama aviaria e NPK (9-28-20). O experimento foi conduzido, durante o período de julho de 2019 a fevereiro de 2020, na Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA), Campus Capitão Poço-PA. O delineamento experimental utilizado foi em blocos casualizados (DBC) com 8 (oitro) tratamentos e 6 (seis) repetições, totalizando 48 unidades experimentais obedecendo ao princípio da casualidade. Os tratamentos consistiram na testemunha, somente solo; e somente solo + NPK; diferentes níveis de cama aviária (10%, 20% e 40%) e a combinação de cama aviária + NPK (10%, 20% e 40%). As avaliações foram divididas em análises quantitativas: altura das mudas (AM); diâmetro do coleto (DC); número de folhas (NF); massas secas de folhas (MSF), caule (MSC) e raízes (MSR) e o índice de qualidade de Dickson (IQD), mensuradas ao final do experimento, aos 138 dias após o plantio. Os dados foram submetidos aos pressupostos de normalidade e homoscedasticidade, quando atendidos, foram submetidos à análise de variância com a aplicação do teste F (p < 0,05) e, posteriormente ao teste de médias Tukey (p < 0,05). Observa-se que a utilização de cama aviária 10% + NPK destacou-se apresentando as maiores medias, apesar do substrato cama aviária 10% apresentar resultados semelhantes. Com base nas informações, recomenda-se a utilização de cama aviária 10% do volume total ou cama aviária 10% + NPK incorporadas ao solo. 

Causas, consequências e métodos atribuídos para prevenir a desertificação na caatinga / Causes, consequences and methods attributed to prevent desertification in caatinga

A desertificação é um fenômeno que resulta da combinação de fatores naturais, principalmente as episódicas secas; e de fatores antrópicos, como sobrepastoreio, desmatamento e remoção da cobertura vegetal, juntamente com as atividades agrícolas que ocorrem acima da capacidade de suporte do ambiente. No Brasil o bioma Caatinga é o mais atingido, perdendo apenas para a Floresta Atlântica e o Cerrado. Estima-se que 80% da vegetação encontre-se completamente modificada, devido ao extrativismo e a agropecuária, apresentando-se a maioria dessas áreas em estádios iniciais ou intermediários de sucessão ecológica. Entretanto, o objetivo da presente pesquisa bibliográfica foi mostrar as causas e as consequências da desertificação da Caatinga e os métodos que são atribuídos para prevenção. É preciso ressaltar que as restrições físicas e químicas dos solos, a escassez de água no Semiárido nordestino, bem como a exploração intensiva dos recursos naturais e o super pastoreio tornam a Caatinga vulnerável à desertificação e à ameaça de extinção de espécies da fauna e da flora nativa da região, entretanto, esse processo pode ser controlado, evitado, e até mesmo revertido, desde que haja o envolvimento da população e que os órgãos governamentais proponham soluções, junto com as comunidades e as escolas e toda a sociedade para resolver, ou ao menos, buscar alternativas sustentáveis, oferecendo auxílio técnico para o manejo dessas áreas e incentivando a preservação ambiental de maneira que não ocorra uma sobrecarga de problemas nas áreas de risco. Nos locais onde o processo de desertificação já se instalou são necessários investimentos para sua contenção; porém, o custo é da ordem de bilhões de dólares

Geographic patterns of tree dispersal modes in Amazonia and their ecological correlates

Aim: To investigate the geographic patterns and ecological correlates in the geographic distribution of the most common tree dispersal modes in Amazonia (endozoochory, synzoochory, anemochory and hydrochory). We examined if the proportional abundance of these dispersal modes could be explained by the availability of dispersal agents (disperser-availability hypothesis) and/or the availability of resources for constructing zoochorous fruits (resource-availability hypothesis). Time period: Tree-inventory plots established between 1934 and 2019. Major taxa studied: Trees with a diameter at breast height (DBH) ≥ 9.55 cm. Location: Amazonia, here defined as the lowland rain forests of the Amazon River basin and the Guiana Shield. Methods: We assigned dispersal modes to a total of 5433 species and morphospecies within 1877 tree-inventory plots across terra-firme, seasonally flooded, and permanently flooded forests. We investigated geographic patterns in the proportional abundance of dispersal modes. We performed an abundance-weighted mean pairwise distance (MPD) test and fit generalized linear models (GLMs) to explain the geographic distribution of dispersal modes. Results: Anemochory was significantly, positively associated with mean annual wind speed, and hydrochory was significantly higher in flooded forests. Dispersal modes did not consistently show significant associations with the availability of resources for constructing zoochorous fruits. A lower dissimilarity in dispersal modes, resulting from a higher dominance of endozoochory, occurred in terra-firme forests (excluding podzols) compared to flooded forests. Main conclusions: The disperser-availability hypothesis was well supported for abiotic dispersal modes (anemochory and hydrochory). The availability of resources for constructing zoochorous fruits seems an unlikely explanation for the distribution of dispersal modes in Amazonia. The association between frugivores and the proportional abundance of zoochory requires further research, as tree recruitment not only depends on dispersal vectors but also on conditions that favour or limit seedling recruitment across forest types

Geography and ecology shape the phylogenetic composition of Amazonian tree communities

AimAmazonia hosts more tree species from numerous evolutionary lineages, both young and ancient, than any other biogeographic region. Previous studies have shown that tree lineages colonized multiple edaphic environments and dispersed widely across Amazonia, leading to a hypothesis, which we test, that lineages should not be strongly associated with either geographic regions or edaphic forest types.LocationAmazonia.TaxonAngiosperms (Magnoliids; Monocots; Eudicots).MethodsData for the abundance of 5082 tree species in 1989 plots were combined with a mega-phylogeny. We applied evolutionary ordination to assess how phylogenetic composition varies across Amazonia. We used variation partitioning and Moran's eigenvector maps (MEM) to test and quantify the separate and joint contributions of spatial and environmental variables to explain the phylogenetic composition of plots. We tested the indicator value of lineages for geographic regions and edaphic forest types and mapped associations onto the phylogeny.ResultsIn the terra firme and várzea forest types, the phylogenetic composition varies by geographic region, but the igapó and white-sand forest types retain a unique evolutionary signature regardless of region. Overall, we find that soil chemistry, climate and topography explain 24% of the variation in phylogenetic composition, with 79% of that variation being spatially structured (R2 = 19% overall for combined spatial/environmental effects). The phylogenetic composition also shows substantial spatial patterns not related to the environmental variables we quantified (R2 = 28%). A greater number of lineages were significant indicators of geographic regions than forest types.Main ConclusionNumerous tree lineages, including some ancient ones (>66 Ma), show strong associations with geographic regions and edaphic forest types of Amazonia. This shows that specialization in specific edaphic environments has played a long-standing role in the evolutionary assembly of Amazonian forests. Furthermore, many lineages, even those that have dispersed across Amazonia, dominate within a specific region, likely because of phylogenetically conserved niches for environmental conditions that are prevalent within regions

Geography and ecology shape the phylogenetic composition of Amazonian tree communities

Aim: Amazonia hosts more tree species from numerous evolutionary lineages, both young and ancient, than any other biogeographic region. Previous studies have shown that tree lineages colonized multiple edaphic environments and dispersed widely across Amazonia, leading to a hypothesis, which we test, that lineages should not be strongly associated with either geographic regions or edaphic forest types. Location: Amazonia. Taxon: Angiosperms (Magnoliids; Monocots; Eudicots). Methods: Data for the abundance of 5082 tree species in 1989 plots were combined with a mega-phylogeny. We applied evolutionary ordination to assess how phylogenetic composition varies across Amazonia. We used variation partitioning and Moran\u27s eigenvector maps (MEM) to test and quantify the separate and joint contributions of spatial and environmental variables to explain the phylogenetic composition of plots. We tested the indicator value of lineages for geographic regions and edaphic forest types and mapped associations onto the phylogeny. Results: In the terra firme and várzea forest types, the phylogenetic composition varies by geographic region, but the igapó and white-sand forest types retain a unique evolutionary signature regardless of region. Overall, we find that soil chemistry, climate and topography explain 24% of the variation in phylogenetic composition, with 79% of that variation being spatially structured (R$^{2}$ = 19% overall for combined spatial/environmental effects). The phylogenetic composition also shows substantial spatial patterns not related to the environmental variables we quantified (R$^{2}$ = 28%). A greater number of lineages were significant indicators of geographic regions than forest types. Main Conclusion: Numerous tree lineages, including some ancient ones (>66 Ma), show strong associations with geographic regions and edaphic forest types of Amazonia. This shows that specialization in specific edaphic environments has played a long-standing role in the evolutionary assembly of Amazonian forests. Furthermore, many lineages, even those that have dispersed across Amazonia, dominate within a specific region, likely because of phylogenetically conserved niches for environmental conditions that are prevalent within regions

Pervasive gaps in Amazonian ecological research

Biodiversity loss is one of the main challenges of our time,1,2 and attempts to address it require a clear un derstanding of how ecological communities respond to environmental change across time and space.3,4 While the increasing availability of global databases on ecological communities has advanced our knowledge of biodiversity sensitivity to environmental changes,5–7 vast areas of the tropics remain understudied.8–11 In the American tropics, Amazonia stands out as the world’s most diverse rainforest and the primary source of Neotropical biodiversity,12 but it remains among the least known forests in America and is often underrepre sented in biodiversity databases.13–15 To worsen this situation, human-induced modifications16,17 may elim inate pieces of the Amazon’s biodiversity puzzle before we can use them to understand how ecological com munities are responding. To increase generalization and applicability of biodiversity knowledge,18,19 it is thus crucial to reduce biases in ecological research, particularly in regions projected to face the most pronounced environmental changes. We integrate ecological community metadata of 7,694 sampling sites for multiple or ganism groups in a machine learning model framework to map the research probability across the Brazilian Amazonia, while identifying the region’s vulnerability to environmental change. 15%–18% of the most ne glected areas in ecological research are expected to experience severe climate or land use changes by 2050. This means that unless we take immediate action, we will not be able to establish their current status, much less monitor how it is changing and what is being lostinfo:eu-repo/semantics/publishedVersio