Spark deployment and performance evaluation on the MareNostrum supercomputer

In this paper we present a framework to enable data-intensive Spark workloads on MareNostrum, a petascale supercomputer designed mainly for compute-intensive applications. As far as we know, this is the first attempt to investigate optimized deployment configurations of Spark on a petascale HPC setup. We detail the design of the framework and present some benchmark data to provide insights into the scalability of the system. We examine the impact of different configurations including parallelism, storage and networking alternatives, and we discuss several aspects in executing Big Data workloads on a computing system that is based on the compute-centric paradigm. Further, we derive conclusions aiming to pave the way towards systematic and optimized methodologies for fine-tuning data-intensive application on large clusters emphasizing on parallelism configurations.Peer ReviewedPostprint (author's final draft

Listado de la artropodofauna del macizo de Sierra Nevada (Almería y Granada, España)

Descripción de los datos El presente artículo describe la versión 2.7 del conjunto de datos titulado “Checklist of the arthropod fauna of the Sierra Nevada Mountain range (Almería and Granada, Spain)” (Tinaut et al. 2022), el cual recoge las especies y subespecies de artrópodos citadas para el macizo de Sierra Nevada y otros taxones que, aún siendo minoría, han sido citados solamente hasta nivel de familia o género. Además, se aporta toda su información taxonómica correspondiente, en formato Darwin Core. Incluye 3953 registros representados como 6 clases, 33 órdenes, 268 familias, 1884 géneros y 3940 especies (de las cuales 169 son endemismos). Se han incluido además algunas especies cuya presencia no está totalmente confirmada (86) detallando esta información en el campo “taxon- Remarks”. Este y el resto de los campos utilizados del formato Darwin Core se detallan en la Tabla 1. Para su elaboración se ha utilizado como fuente primaria la obra “Los Insectos de Sierra Nevada. 200 años de historia” (Ruano et al. 2013) y ha sido completada con aquellos taxones citados en la bibliografía científica, con posterioridad a la edición de esta obra, o no incluidos en ella. Este listado está publicado en GBIF (https://doi.org/10.15470/nt5nsx) bajo licencia de Creative Commons Atribución No Comercial (CCBY- NC) 4.0. Parte de este material está presente en las colecciones del Departamento de Zoología de la Universidad de Granada y se puede consultar en https://ccz.ugr.es/.Presentamos un listado de la artropodofauna de Sierra Nevada (latitud 36.927 y 37.23; longitud -3.571 y -2.646) en el que se incluyen 3953 registros representados como 6 clases, 33 órdenes, 268 familias, 1884 géneros y 3940 especies (de las cuales 169 son endemismos), indicando la referencia bibliográfica de la cita y la información taxonómica correspondiente. La elaboración de este listado, y sus futuras actualizaciones, intentan paliar el desconocimiento que todavía existe sobre los artrópodos presentes en Sierra Nevada ofreciendo un recurso imprescindible para generar conocimiento sobre la biodiversidad entomológica de este macizo, así como para plantear estrategias de conservación adecuadas. La obra "Los Insectos de Sierra Nevada. 200 años de historia" (Ruano et al. 2013) ha sido la fuente primaria de citas y la hemos completado con aquellos taxones no incluidos en ella o aparecidos en la bibliografía científica con posterioridad. Los nombres científicos han sido validados en base a diferentes catálogos taxonómicos y el conocimiento de expertos y bajo criterios de coherencia, relevancia y actualidad. El listado está disponible en GBIF en formato Darwin Core (https://doi.org/10.15470/nt5nsx) y parte del material citado se encuentra depositado en las colecciones del Departamento de Zoología de la Universidad de Granada (https://ccz.ugr.es).We present a list of the arthropod fauna of Sierra Nevada (latitude 36.927 and 37.23; longitude -3.571 and -2.646) which includes 3953 records represented as 6 classes, 33 orders, 268 families, 1884 genera and 3940 species (of which 169 are endemic), indicating the bibliographic reference of the citation and the corresponding taxonomic information. The elaboration of this list, and its future updates, attempts to alleviate the lack of knowledge that still exists about the arthropods present in Sierra Nevada; offering an essential resource to generate knowledge about the entomological biodiversity of this massif, as well as to propose adequate conservation strategies. The work "Los Insectos de Sierra Nevada. 200 years of history" (Ruano et al. 2013) has been the primary source of citations and we have completed it with those taxa not included in it or appearing in the scientific literature later. The scientific names have been validated based on different taxonomic catalogues and the knowledge of experts and under criteria of coherence, relevance and timeliness. The list is available in GBIF in Darwin Core format (https://doi.org/10.15470/nt5nsx) and part of the material cited is deposited in the collections of the Zoology Department of the University of Granada (https://ccz.ugr.es/).Proyecto Smart Ecomountains (Ref. LifeWatch-2019-10-UGR-01_WP-1), subvencionado por el Ministerio de Ciencia e Innovación y fondos FEDE

Adaptación al bilingüismo del material docente de prácticas de Zoología

El objetivo principal de este proyecto de innovación docente es la adaptación al bilingüismo, concretamente al inglés, del material de prácticas (presenciales y virtuales) de la asignatura de Zoología del grado de Biología. Este objetivo se enmarca dentro del actual proceso de internacionalización de la UGR, que en el caso concreto del grado de Biología se ha iniciado el curso académico 2021/2022 con algunas asignaturas impartidas en inglés. Aunque el bilingüismo en la asignatura de Zoología se ha retrasado hasta el curso 2022/2023.Universidad de Granad

Strategies to improve the catalytic activity and stability of bioinspired Cu molecular catalysts for the ORR

The oxygen reduction reaction (ORR) is essential for energy conversion devices such as fuel cells and metal-air batteries. The use of expensive and scarce noble metal materials to catalyze the ORR is a limitation for the massification of these energy conversion technologies. Copper molecular catalysts that mimic the active sites of metalloenzymes such as laccase are under continuous development. In this minireview, we present the strategies to increase the activity and stability of the copper catalysts for the ORR. The flexibility, lability, and electronic character of the ligands are crucial to promote the ORR. In addition, the use of polymers as backbone for multicopper catalysts and the synthesis of copper carbon-based pyrolyzed catalysts present remarkable results with promissory applicationsThis work has been supported by FONDECYT 11221073, FONDECYT 1221798, FONDECYT Postdoctoral Project 3170330 and Anillo Project ACT-19217

Prefeasibility implementation of photovoltaic generation systems companies industrial zone in Puente Aranda Bogotá City

El proyecto se formula con el propósito de conocer qué tan rentable pueden ser para las empresas que se encuentran ubicadas en la zona de Puente Aranda, implementar los sistemas de generación fotovoltaica dentro de la organización para el consumo de energía eléctrica desde un punto de vista económico, ambiental, social y a uso futuro. Para la realización del estudio de pre factibilidad se levantó información primaria y secundaria para determinar el número de empresas interesadas en la implementación de energías alternativas, con posibilidad económica de adquisición y cumpliendo con las condiciones técnicas, permitiendo el diseño de un posible sistema que se acomodaría con las necesidades identificadas. Se plantea el uso dispositivos electrónicos que cumplen con las especificaciones de consumo de energía identificada en el estudio de mercado y demás aspectos que son relevantes para las empresas del sector; y a partir del uso de estos dispositivos se genera una propuesta económica con el valor del sistema para las empresas Teniendo en cuenta los datos y valores identificados en el estudio de mercado para identificar la cantidad de energía necesaria a generar, almacenar y regular. La propuesta económica contiene las proyecciones a cinco años de las posibles ganancias en las empresas por motivo de ahorro y generación de energía eléctrica a partir del sistema fotovoltaico diseñado. Además, esta propuesta se construye teniendo en cuenta los beneficios que pudiese obtener una empresa al implementar este tipo de tecnologías. Por último se cuenta con una serie de recomendaciones de usos y mejoras al sistema para las empresas, teniendo en cuenta aspectos importantes con el fin de que el servicio de energía eléctrica en cada una de ella sea continuo y de calidad.The project is formulated for the purpose of knowing how profitable can be for companies that are located in the area of Puente Aranda, implement photovoltaic generation systems within the organization for electric power consumption from an economic point of view , environmental, social and future use. To carry out the pre-feasibility study primary and secondary information rose to determine the number of companies interested in implementing alternative energy, with economic potential acquisition and complying with the technical conditions, enabling the design of a possible system that would accommodate with the identified needs. The use of electronic devices that meet the specifications of energy identified in the market study and other aspects that are relevant to the sector companies arises; and from the use of these devices an economic proposal is generated with the system value for the companies Given data and values identified in the market study to identify the amount of energy needed to generate, store and regulate. The economic proposal contains the five-year projections of the potential gains in companies because of savings and generation of electricity from photovoltaic system designed. In addition, this proposal is built taking into account the benefits that could get a company to implement these technologies. Finally there are a number of recommendations of applications and system improvements for businesses, taking into account important aspects so that the electric power service in each of them is continuous and quality

Adaptación de un modelo de simulación hidrológica a la cuenca del río Laja, Guanajuato, México

Se desarrolló, calibró, validó y aplicó el modelo de simulación hidrológica SWAT (Soil and Water Assessment Tool) en la cuenca del río Laja ubicada en Guanajuato, México. La metodología básicamente consistió en: a) calibración del modelo, para lograr un ajuste satisfactorio entre los escurrimientos medidos y los simulados, mediante un análisis de sensibilidad en los parámetros del modelo, con un periodo de calibración de cinco años de observación (1993 a 1997); b) validación del modelo, para evaluar su capacidad predictiva mediante la comparación de los escurrimientos medidos y los simulados para un periodo de cinco años de observación (1998 a 2002). La capacidad predictiva del modelo se analizó mediante regresión lineal. Los resultados muestran que la pendiente de la línea de regresión y el coeficiente de determinación (R2) entre escurrimientos simulados y medidos, fueron 0.99 y 0.97, en tanto que para la validación éstos fueron 0.73 y 0.95. De lo anterior se concluye que el modelo SWAT es una herramienta valiosa para la simulación del impacto del manejo del suelo y la vegetación en la producción de agua y sedimentos en la cuenca del Río Laja, la cual experimenta una variación en sus suelos, uso de suelo y condiciones de manejo en largos periodos

Sepsis neonatal: aspectos fisiopatológicos y biomarcadores

Neonatal sepsis is a major cause of morbidity and mortality in newborns worldwide. Its diagnosis remains a challenge due to the nonspecific clinical findings and the lack of efficient diagnostic tools. In the physiopathology of neonatal sepsis, an excessive or suppressed immune response has been described, which can lead to potentially fatal conditions. The prognostic, diagnostic, and follow-up value of several soluble factors altered in neonatal sepsis has been studied. These have been grouped under the term neonatal sepsis biomarkers. Here, aspects of the physiopathology in neonatal sepsis and the characteristics of the most studied biomarkers used for neonatal sepsis diagnosis are described, also, details about other recently studied markers are mentioned. Currently, the use of an early-warning biomarker together with a late-warning biomarker is recommended to get higher diagnostic accuracy. However, a single ideal biomarker for neonatal sepsis has not been found yet. MÉD.UIS.2019;32(3):35-47 La sepsis neonatal es una causa importante de morbilidad y mortalidad en recién nacidos a nivel mundial. Su diagnóstico es difícil por sus manifestaciones clínicas inespecíficas y la poca disponibilidad de métodos diagnósticos eficientes. En la fisiopatología de la sepsis se ha descrito una respuesta inmune excesiva o suprimida que puede conducir a desenlaces potencialmente fatales. Se ha estudiado la utilidad pronóstica, diagnóstica y de seguimiento de factores solubles que se alteran en la sepsis neonatal y se han agrupado bajo el término biomarcadores de sepsis neonatal. Aquí se describen los principios fisiopatológicos de la sepsis neonatal y las características de los biomarcadores más usados para su diagnóstico, además, se mencionan detalles de otros marcadores que también han sido estudiados recientemente. Actualmente, se recomienda el uso de un biomarcador temprano en combinación con uno tardío para lograr un mejor rendimiento, sin embargo, aún no se ha identificado un biomarcador ideal para la sepsis neonatal. MÉD.UIS.2019;32(3):35-47

Recomendaciones de vitamina D para la población general

Objective: To provide recommendations based on evidence on the management of vitamin D deficiency in the general population. Participants: Members of the Bone Metabolism Working Group of the Spanish Society of Endocrinology. Methods: Recommendations were formulated using the GRADE system (Grading of Recommendations, Assessment, Development, and Evaluation) to describe both the strength of recommendations and the quality of evidence. A systematic search was made in MEDLINE (Pubmed) using the term Vitamin D and the name of each issue. Papers in English and Spanish with publication date before 17 March 2016 were included. Recommendations were jointly discussed by the Working Group. Conclusions: This document summarizes the data about vitamin D deficiency in terms of prevalence, etiology, screening indications, adequate levels and effects of supplementation on bone and non-skeletal health outcomes.Objetivo: Proporcionar recomendaciones basadas en la evidencia sobre el manejo del déficit de vitamina D en población general. Participantes: Miembros del Grupo de Trabajo de Osteoporosis y Metabolismo Mineral de la SEEN. Métodos: Se empleó el sistema Grading of Recommendations, Assessment, Development, and Evaluation (GRADE) para establecer tanto la fuerza de las recomendaciones como el grado de evidencia. Se realizó una búsqueda sistemática en Medline de la evidencia disponible para vitamina D y el título de cada capítulo. Se revisaron artículos escritos en inglés con fecha de inclusión hasta 17 de marzo del 2016. Tras la formulación de las recomendaciones, estas se discutieron de manera conjunta en el grupo de trabajo. Conclusiones: Este documento resume los datos acerca del déficit de vitamina D en lo que respecta a su prevalencia, etiología, indicaciones de cribado, niveles adecuados y efectos de la suplementación a nivel óseo y extraóseo.Sin financiación0.346 SJR (2017) Q3, 150/232 Endocrinology, Diabetes and Metabolism, 73/124 Nutrition and Dietetics; Q4, 102/135 EndocrinologyUE

Weldability and hydrogen relationships in super duplex stainless steel

SIGLEAvailable from British Library Document Supply Centre- DSC:DX185443 / BLDSC - British Library Document Supply CentreGBUnited Kingdo