Understanding the cross-talk between microbiota, host fitness, and the environment using Egyptian mongoose (Herpestes ichneumon) as a model

Tese de mestrado, Microbiologia Aplicada, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2017Gut microbiota is the complex and diverse community of bacteria, archaea, fungi, protozoa, and viruses present in the gastrointestinal tract of animals. Once established, this ecosystem is relatively stable, but responsive to a variety of effects, namely host diet, health, genetics, sex, and reproductive status, and also the habitat. Increasing importance has been attributed to host gut-microbe interactions due to implications in the immune system and ecological features, such as behavior, however, the microbiota of many carnivores remains unknown. In this work, the gut microbiota of Egyptian mongoose, a medium-size mammalian carnivore, with opportunistic feeding behavior, ranging in distribution throughout the African continent, but also in Mediterranean Middle East, southern Turkey, and the Iberian Peninsula, was thoroughly investigated using a wide range culture-based approach. The aims of this work were: [1] the characterization of the core gut microbiota of Egyptian mongoose population; [2] the investigation of sex- and age class-related differences of gut microbiota; and [3] the analysis of the relationship between bio-environmental features and gut microbiota of these specimens. Fecal samples from ten males and ten females sampled in mainland Portugal were enriched in Buffered Peptone Water, in both aerobic and anaerobic conditions. Part of the enriched samples was pasteurized and inoculated into YCFA P solid medium, under both aerobic and anaerobic conditions. The remaining part was inoculated into YCFA under anaerobic conditions and into YCFA, MacConkey, PDA supplemented with chloramphenicol solid media, ESBL chromogenic medium, with and without antibiotic supplement, and Brilliance ESBL solid medium. Selected isolates were grouped into different morpho-physiological types (MT) based on Gram character, catalase and oxidase activities, and endospore formation. A bacterial isolate belonging to each MT, in each media, for each mammal host, was selected for molecular fingerprinting using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) with M13 and PH primers. Strain relationships were analyzed by hierarchical numerical methods with Pearson correlation coefficient and Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean (UPGMA) clustering. One isolate from each cluster was randomly selected for 16S rDNA gene sequencing. Fungi isolates with different morphology were selected for genomic identification through Internal Transcribed Spacer (ITS) region sequencing. In this study, we generated for the first-time extended baseline information on the microbiome of mongoose, enabling the exploitation of microbial community differences between sexes and exploring the influence exerted by the biological and environmental context of each host in its microbiota signature. Looking at each individual host as a habitat with its own community, the MT-II, MT-VI, MTVII, MT-IX and MT-XI types may be considered the core gut microbiota community and the remaining morpho-physiological types can be considered part of the intra-specific individual microbiota community. Additionally, we perceived that the majority of individuals possess MT-II ESBL-producing bacteria. Higher microbial load was present in fecal samples from female hosts in rich medium under anaerobic conditions, both for total and sporobiota bacterial community. The bacterial microbiota of both males and females was dominated by Gram-positive bacteria, mainly of the phylum Firmicutes, with bacilli isolates prevailing, in particular, Enterococcus spp. and Bacillus spp. The growth of putative Escherichia coli was only registered in female host samples. The specimens analyzed in this study revealed high Proteobacteria/Bacteroidetes ratio, a feature that may be related to a carnivorous or scavenger dietary regime and with highly efficient energy harvest. Filamentous fungi were exclusively detected in fecal samples from male hosts and their genus identified as Pseudozyma and Naganishia (Basidiomycota phylum), Penicillium (Ascomycota phylum) and Mucor (Mucoromycota phylum). Although the number of surveyed specimens is limited, considerable similarity between adult and juvenile microbiota was found, which contrasted with sub-adult’s, probably due to higher proximity and interaction between the first two groups, since this species social behavior includes protection of the cubs and juveniles, leading to similar diet and easier host-to-host transmission of microbiota. This work sets the ground for more comprehensive studies on the microbiota of Mediterranean wild carnivores, including sympatric threatened species. Future studies using culture-independent methods will improve our knowledge of this species microbiome and lead to a better understanding of its bioecology

On the role of RNA binding proteins in polyglutamine diseases: from pathogenesis to therapeutics

Polyglutamine (polyQ) diseases are a group of different neurodegenerative disorders characterized by an abnormal expansion of the trinucleotide cytosine-adenine-guanine (CAG) within coding regions of each disease-associated gene. The abnormal expansion translates into a protein bearing an abnormally long tract of glutamines. The expanded proteins are prone to aggregate, promote aberrant interaction with other proteins and mRNAs and contribute to cellular pathway disruption (Matos et al., 2019). To date, nine different polyQ diseases are described, including among others, Huntington’s disease, and six different spinocerebellar ataxias (SCA). Patients affected by polyQ diseases, suffer a myriad of motor symptoms that include ataxia, dysphagia, tremors, dysarthria, and even dementia. Unfortunately, there is no cure nor treatment able to delay the disease and patients rely only on symptomatic and supportive treatments culminating in premature death (Takahashi et al., 2010).info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Acerca de uma tigela de terra sigillata clara da necrópole do Sol Avesso, Porto Salvo (Oeiras)

Em 1964, no decurso da construção de uma moradia na rua de São Sebastião, no chamado Bairro de Auto-Construção de Porto-Salvo, em Sol Avesso, foram ocasionalmente postas a descoberto três sepulturas estruturadas, de planta rectangular, parcialmente escavadas nas margens do Cenomaniano (Cretácio Inferior) que afloram no local. Correspondem à estação arqueológica nº 45 da Carta Arqueológica do concelho de Oeiras (CARDOSO & CARDOSO, 1992). As circunstâncias da descoberta e ulteriores vicissitudes, prejudicaram a realização, como se impunha, de trabalhos aturados; as limitadas investigações então efectuadas por um grupo de alunos da Faculdade de Letras da Universidade de Lisboa, depararam com dificuldades, em detrimento não só da adequada exploração das três sepulturas referidas, mas também das muitas outras que, após aquela intervenção de emergência, foram totalmente destruídas, em consequência do prosseguimento das obras. Na curta notícia dedicada aos trabalhos arqueológicos então efectuados, publica-se apenas uma lucerna atribuída ao século II d.C. (MATOS, 1969; CARDOSO & CARDOSO, 1993). A taça de terra sigillata clara objecto deste estudo, foi recolhida, provavelmente, em outra sepultura, das muitas que, entretanto, foram destruídas. Conserva-se no Centro de Estudos Arqueológicos do Concelho de Oeiras (Câmara Municipal de Oeiras); dela, foi anteriormente publicada apenas desenho, sem mais comentários (CARDOSO & CARDOSO, 1992). porém, a importância arqueológica desta peça intacta justificava estudo mais desenvolvido, o qual agora é concretizado. Com efeito, é excepcional a ocorrência de exemplares inteiros comparáveis: um dos raros casos compulsados é o de tigela proveniente de Bello, Cádiz, conservada no Museu Arqueológico nacional, em Madrid (ZOREDA, 1971, Est. III)

Um cometa na Pré-história portuguesa : a taça do povoado calcolítico do Outeiro de S. Mamede (Bombarral) e o imaginário colectivo ligado a tais corpos celestes

Os autores dão a conhecer a representação de um cometa esgrafitada na face externa de pequena taça cerâmica datável do Calcolítico pleno recolhida no povoado do Outeiro de S. Mamede (Bombarral). Tecem também algumas considerações sobre o papel desempenhado por estes corpos celestes no imaginrió das comunidades humanas que os observaram.The authors show a sgraffito decoratian representing a comet on the extemal face of a small pottery cup dated from me Full Chalcolithic and gathered in the settlement of Outeiro de S. Mamede (Bombarral). They also make some remarques on the role of such celestial bodies in the imagination of the human communities that observed them

Falemos de casas: heterogenia e habitar - o bairro sustentável

O tema principal incide sobre a proposta de reabilitação do Bairro do Alto da Cova da Moura, que representa um dos muitos casos de bairros de génese ilegal considerados críticos, que se desenvolveram principalmente nos anos 50 e 60 do séc. XX devido às consequências do planeamento e crescimento urbano da capital e da Área Metropolitana de Lisboa. A sua proliferação estendeu-se assim na periferia da Cidade de Lisboa, onde alguns bairros como o caso da Cova da Moura já se encontram consolidados embora não integrados no tecido urbano como seria desejável. O desafio que se coloca, para além das questões que dizem respeito à sua legalização, é a intervenção numa realidade urbana sui generis onde os parâmetros legais são demasiado restritivos, procurando regenerar a sua estrutura de forma sustentável para uma melhor relação com todos os intervenientes urbanos. Assim, sugere-se um projecto de intervenção cujo modelo poderá ser aplicável a casos semelhantes, com vista à integração definitiva destes espaços urbanos.The main subject relies on a proposal for the reabilitation of Bairro do Alto da Cova da Moura, representing one of many cases of illegal neighborhoods considered critical, which developed mainly in the 50’s and 60’s of the 20th century by the consequences of urban growth and planning of the capital and Metropolitan Area of Lisbon. Its proliferation extended to the suburbs of Lisbon where some neighborhoods like Cova da Moura already have consolidated although they are not integrated in the urban tissue like it would be desirable. The challenge, beyond the legal matters, is the intervention on a particular urban reality where the urbans regulations are too restrictive, trying to regenerate its structure on a sustainable way to a better relation with all the urban intervenients. Therefore, an intervention project is suggested and witch its model can be applied to similar cases to achieve definite integration of these urban spaces

Aprendizagens do “tornar-se”, das experiências formadoras e da visibilidade: aproximações entre autobiografias e educação

Ainda que a educação seja um empreendimento coletivo, histórico e circunstanciado, a dinâmica do sujeito da aprendizagem é perpassada por sua existencialidade e por sua singularidade. Nosso objetivo, neste artigo, é analisar aprendizagens biográficas significativas na construção do tornar-se escritor, nas autobiografias literárias de Manuel Bandeira (1886-1968), Lêdo Ivo (1924-2012) e Ferreira Gullar (1930-2016). O critério de variabilidade foi decisivo para a escolha desses autores, posto que suas obras são marcadas por diferentes gerações e escolas literárias. Nosso olhar tem como base abordagens (auto)biográficas em educação, que interrogam a experiência da formação na temporalidade do sujeito, partindo de um enfoque epistemológico no qual a subjetividade é crucial. Para tanto, consideramos, inicialmente, a discussão entre autobiografia e educação; posteriormente, avaliamos como as aprendizagens biográficas se apresentam nas trajetórias dos autores estudados. Os resultados das análises consideram três dinâmicas de aprendizagem em suas vidas: a) tornar-se si mesmo; b) as experiências formadoras constitutivas da escrita autobiográfica; c) a visibilidade ética e estética do mundo. Concluímos discutindo a importância dessas aprendizagens na proposição de uma educação para a singularidade que recupere esses elementos da aprendizagem biográfica de forma dinâmica e agregadora

FILOSOFIA DA CULTURA E EDUCAÇÃO: AS IMPLICAÇÕES SIMBÓLICAS E CULTURAIS REGIONAIS/LOCAIS NA PRÁTICA PEDAGÓGICA ESCOLAR NO CONTEXTO DE UMA ESCOLA EM FEIRA DE SANTANA/BA.

A Filosofia é um campo do conhecimento humano preliminar para outros tipos de conhecimentos. A cultura é um aglomerado de sentidos, símbolos e práticas que se evidenciam nas pessoas e nos povos, nas individualidades e nas coletividades. A cultura e a filosofia são imprescindíveis ao próprio existir humano. O ser humano existe culturalmente em sua coexistência com o outro. As investigações filosóficas sobre a cultura estabelecem reflexões que contribuem para um entendimento mais aprofundado desse aglomerado de sentidos humanos. A filosofia em diálogo com a cultura, estabelece, em sua compreensão, a delimitação do conceito de cultura constituindo um modo específico de pensar a cultura. A cultura enquanto ação humana é a capacidade simbólica do ser humano que o permite atribuir sentidos a sua existência. É tudo aquilo que ele elabora através de sua subjetividade e traz significação aos fenômenos e a sua existência. Por fim, nas inferências advindas dessa experiência de criar e recriar a sua própria existência, este mesmo ser humanose vê mergulhado numa coexistência de sentidos e símbolos.A escola é, sem dúvida, uma instituição cultural. Deste modo, as correlações entre escola e cultura não podem ser entendidas como dois campos independentes do fazer humano, mas sim como campos fenomênicos entrecruzados. Assim, partindo dessas afirmações e acentuando a íntima associação entre educação e cultura, filosofia e cultura, ao observar suas relações como intrinsecamente constitutivas do campo fenomênico educacional, cabe questionar por que hoje essa compreensão ainda se apresenta como uma prática e reflexão desafiadora para as ações educativas. A escola, enquanto instituição cultural e lugar da intersubjetividade precisa ser o lugar em que a pluralidade de culturas e os saberes culturais possam encontrar espaços fecundos. A problemática das relações entre educação e cultura, cultura e filosofia é intrínseco a todo fazer educativo no contexto escolar. Toda forma de educação está inserida,na cultura da humanidade.Partindo destes pressupostos, a questão que orienta esta pesquisa está em identificar as implicações simbólicas e culturais regionais/locais na prática pedagógica escolar. Deste modo o objetivo deste trabalho é investigar a relevância, bem como, a presença (ou ausência) dos saberes culturais que revelam os sentidos e os valores da vida dos sujeitos em suas comunidades, no cotidiano da prática escolar, identificando o modo como essa experiência acontece no contexto de duas escolas em Feira de Santana e como estas expressões culturais contribuem na formação do pensamento crítico, dosvalores humanos. Para a elaboração desta pesquisa entrevistamos 10 estudantes e 5professores para construção dos dados da pesquisa

EFICIÊNCIA TÉCNICA, ECONOMIAS DE ESCALA, ESTRUTURA DA PROPRIEDADE E TIPO DE GESTÃO NO SISTEMA HOSPITALAR BRASILEIRO

We estimate DEA (Data Envelopment Analysis) technical efficiency scores for 1170 Brazilian hospitals included in the SUS (Central Health System) using a recently proposed method that combines bootstrap and jackknife resampling to eliminate the influence of outliers and possible measurement and recording errors in the data. We use the variable returns to scale variants of the DEA method. After computing the efficiency scores, we use econometric methods, especially quantile regression, to investigate the determinants of those scores. Our results confirm the importance of the scale effect (measured by the total number of services) over the technical efficiency of this sector, controlled by the average permanence in the hospital, its average costs and human capital variables. Regarded to hospital's management, we highlight the negative effects of non-profit organizations over the efficiency, which differs from the empirical literature due the usage of quantile regression in this paper. Excessive specialization also has a negative effect over the efficiency scores, pointing out the existence of an optimal mix between specialization and generalization hospitals' characteristics. As for property, private hospitals have its performance negatively affected for those units over the 30th efficiency quantile, suggesting that market failure effects are important in this sector.

O povoado do Carrascal (Oeiras): estudo das ocupações do Neolítico Final e do Calcolítico

In this article we present the Late Neolithic occupation of Carrascal’s settlement and discuss its functional feature. We conclude that it is a settlement with mixed carachteristics, corresponding to a specialized lithic workshop, located nearby the raw material resources, simultaneously with important evidence of semi-permanent, or even permanent, human occupation evidenced by the ceramics and polished stone industry.info:eu-repo/semantics/publishedVersio