Parabolic reaction-diffusion systems with nonlocal coupled diffusivity terms

In this work we study a system of parabolic reaction-diffusion equations which are coupled not only through the reaction terms but also by way of nonlocal diffusivity functions. For the associated initial problem, endowed with homogeneous Dirichlet or Neumann boundary conditions, we prove the existence of global solutions. We also prove the existence of local solutions but with less assumptions on the boundedness of the nonlocal terms. The uniqueness result is established next and then we find the conditions under which the existence of strong solutions is assured. We establish several bow-up results for the strong solutions to our problem and we give a criterium for the convergence of these solutions towards a homogeneous state.CAPES [BEX 2478-12-8]; MEC/MCTI/CAPES/CNPq/FAPs, Brazil [71/2013, 88881.030388/2013-01]; Fundacao para a Ciencia e a Tecnologia, Portugal [UID/MAT/04561/2013-2015]info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Aggregation index and chemical properties of soil aggregates under no-tillage and conventional tillage systems of onion in Ituporanga, Santa Catarina State

TCC (graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Agrárias. Curso de Agronomia.Objetivou-se avaliar a agregação e os atributos químicos dos agregados do solo sob sistemas plantio direto (SPD) e preparo convencional (SPC) de cebola em Ituporanga, SC. O experimento foi implantado em abril/2007, e estabelecido oito tratamentos: T1-sucessão de milho e cebola, T2- rotação comercial e cebola bienal, T3- milho e cebola bienal, T4- milho-mucuna e cebola bienal, T5- gramíneas de cobertura e cebola anual, T6- leguminosas de cobertura e cebola anual, T7- rotação de coberturas e cebola anual, T8- consórcio de cobertura e cebola anual. A partir de 2011 o T7 passou a ser manejado em SPC do solo e os demais sempre em SPD. Em 2014, coletaram-se amostras de solo nas profundidades de 0-5, 5-10 e 10-20 cm. Os agregados foram separados e nestes quantificados o diâmetro médio ponderado (DMP), carbono orgânico total (COT), nitrogênio total (NT), relação C/N, pH, Ca+2, Mg+2, Al+3, K+, H++Al+3 e P. O SPD de cebola em comparação ao SPC aumenta os teores de COT e NT (0-5 cm) e DMP (5-10 cm). O T6 incrementa os teores de NT (0-5 e 10-20 cm) e diminui a relação C/N do solo (0-5 cm) e o DMP (5-10 cm) em comparação aos demais tratamentos. Porém, o T5 aumenta os teores de COT (0-5 cm) e NT (10-20 cm). Os tratamentos com maior diversidade vegetal, seja com plantas de coberturas em rotação ou consorciação, favorecem o aumento dos teores de Ca, Mg, K, P, em comparação ao tratamento com sucessão de milho-cebola.Aimed to evaluate the aggregation and chemical properties of soil aggregates under notillage (NT) and conventional tillage (CT) of onion in Ituporanga, Santa Catarina State, Brazil. The experiment was established in April/2007, and established eight treatments: T1- succession corn and onion, T2- commercial rotation and biennial onion, T3- corn and biennial onion, T4- corn-mucuna and biennial onion, T5- coverage grasses and annual onion, T6- coverage legumes and annual onion, T7- rotation covers plants and annual onion, T8- consortium of cover plants and annual onion. The T7, from 2011, is now handled in CT and the others were always in NT. In 2014, they collected up soil samples at 0-5, 5-10 and 10-20 cm of depths. Aggregates were separated and these quantified the mean weight diameter (MWD), total organic carbon (TOC), total nitrogen (TN), C/N ratio, pH, Ca+2, Mg+2, Al+3, K+, H+Al and P. The NT of onion compared to the CT, increases TOC and TN (0-5 cm) and MWD (5-10 cm). The T6 increases the TN levels (0-5 and 1020 cm) and decreases the C/N ratio of soil (0-5 cm) and MWD (5-10 cm) in comparison to the other treatments. However, the T5 increases TOC (0-5 cm) and TN (10-20 cm). The treatments with higher plant diversity, either with cover plants in rotation and intercropping favor the increases Ca, Mg, K, P, compared to treatment with succession corn-onion

Evaluation of Quaternary Ammonium Surfactants as prophylactic options for Streptococcus agalactiae infections

Streptococcus agalactiae is a leading cause of morbidity and mortality in neonates. Vertical trans mission during labor and delivery, is currently prevented by intrapartum antibiotic prophylaxis (IAP). However, resistance to the antibiotics used in IAP has been emerging and increasing. With no vaccine available, it is important to find new alternatives. Previous studies have showed that the cationic surfac tant dodecyl-pyridinium bromide (C12PB) is bactericide against S. agalactiae at concentrations that do not affect the commensal flora and epithelial cells of the vaginal mucosa. To get a step further in vali dating C12PB as a good prophylactic compound, this work aimed to evaluate its ability to induce anti microbial resistance against S. agalactiae. Isogenic clones were continuously propagated without and under C12PB sub-inhibitory concentrations. Phenotypic tests coupled with Whole Genome Sequencing of the populations exposed to such conditions were used to identify the emergence and putative mech anisms of resistance. As a proof-of-concept, the same procedure was performed with erythromycin, an antibiotic used in S. agalactiae intrapartum prophylaxis. In addition, the toxicity and pro-inflammatory potential of C12PB towards epithelial cells were also evaluated by the MTT assay and ELISA, respec tively. Contrarily to erythromycin, where the Minimum Inhibitory Concentration (0.125 µg/ml) doubled after 7 passages and increased up to >2000-times after 56 passages (end point), the appearance of re sistance to C12PB was not observed during the assay, which was also confirmed at the genome level. On the other hand, for erythromycin, genome comparison against the original clone revealed multiple mu tations on ribosome-associated genes (including the 23S rRNA m5U1939 methyltransferase, ribosomal protein L22 and 23S rRNA) associated with resistance acquisition. Additionally, overall toxicity and inflammation were low. In conclusion, together with the previous results, these findings highlight C12PB as a promising candidate for the prevention of S. agalactiae vertical transmitted infections.O Streptococcus agalactiae é uma das principais causas de morbilidade e mortalidade em recém-nasci dos. A transmissão vertical no parto é prevenida pela administração intraparto de antibióticos. No entanto, a resistência aos antibióticos utilizados tem vindo a surgir e aumentar. Com a ausência de uma vacina, é importante encontrar alternativas. Estudos anteriores revelaram que o surfactante catiónico brometo de dodecil-piridínio (C12PB) é bactericida contra S. agalactiae em concentrações que não afe tam a flora comensal e as células epiteliais da mucosa vaginal. Para estudar o C12PB como um bom composto profilático, este trabalho visou avaliar a sua capacidade de induzir resistência antimicrobiana contra S. agalactiae. Para este fim, clones isogénicos foram continuamente propagados na presença e ausência de concentrações sub-inibitórias de C12PB. Para identificar a emergência e os mecanismos putativos de resistência, foram utilizados testes fenotípicos e sequenciação do genoma inteiro das popu lações expostas a estas condições. Como prova de conceito, o mesmo procedimento foi realizado com a eritromicina, um antibiótico utilizado na profilaxia intraparto de S. agalactiae. A toxicidade e o po tencial pró-inflamatório do C12PB para células epiteliais foram também avaliados através do ensaio do MTT e ELISA, respetivamente. Contrariamente à eritromicina, onde a Concentração Mínima Inibitória (0,125 µg/ml) duplicou após 7 passagens e aumentou até >2000 vezes após 56 passagens (final do en saio), o aparecimento da resistência ao C12PB não foi observado, o que foi confirmado a nível genómico. Por outro lado, para a eritromicina, a comparação de genomas contra o clone original revelou mutações no rRNA 23S, metiltransferase m5U1939 do rRNA 23S e proteína ribossómica L22, alvos associados à aquisição de resistência. Além disso, os níveis de toxicidade e inflamação foram baixos na generalidade. Concluindo, juntamente com os resultados anteriores, estas descobertas destacam o C12PB como uma opção promissora para a prevenção de infeções neonatais causadas por S. agalactiae

Using a Spreadsheet SAM for GAMS CGE Modeling

This technical document provides in a single document a template to follow when using spreadsheet Social Accounting Matrix data to drive a GAMS-based Computable General Equilibrium model

Three Essays on the Economics of Public Libraries

This dissertation explores empirical issues concerning public libraries in the United States. In particular, it analyzes the direct and indirect effects to and from public libraries, on different issues such as charitable donations, labor market outcomes, institutions and technical efficiency. Chapter 1 discusses the economics of public libraries and its relevance. In addition, it provides an outline of the dissertation and its main contribution to the literature. Chapter 2, analyzes the determinants of donations to public libraries testing the crowding effect from government funding of public libraries. I find suggestive results of a crowd in effect with an inverted U shape in all levels of government. In other words, additional government dollars increase private donations to public libraries at a decreasing rate. Chapter 3 investigates the effect of public library programs and participation on unemployment and labor force participation in Appalachia. Using an instrumental variable approach, I show that neither adult nor children’s programs and participation affect local labor market outcomes. These results are robust across different specifications. Chapter 4 explores the institutional determinants of public library technical efficiency in West Virginia. The analysis is carried out in two steps. First, I document considerable cross-district variation in library efficiency. Then, I estimate the effect of institutional characteristics on the technical efficiency measures. I find consistent evidence that urban libraries are more inefficient than county and multi-jurisdictional libraries. In addition, I find revenue from local sources is associated with reduced efficiency, contrary to what would be predicted by local public goods producer theory. Chapter 5 concludes the dissertation by summarizing its main findings and discussing possible implications

Selection of an antimicrobial culture to be used in the prevention of neonatal listeriosis

The capacity of lactic acid bacteria to produce acidic products and/or secrete antimicrobial compounds is important in the impairment of vaginal colonization by pathogens. Vaginal pH is normally acidic, varying between 3.5-4.5; an increase in vaginal pH (5.0 to 6.5) can be associated with colonization by pathogenic microorganisms. The main goal of this study was to select an antimicrobial culture to be used in the prevention of vaginal colonization of Listeria monocytogenes during pregnancy, and consequently, prevent neonatal listeriosis. The survival and biofilm formation of 20 isolates of L. monocytogenes in simulated vaginal fluid at normal vaginal pH (4.2) and at higher pH values (5.5 and 6.5) was investigated. This pathogen was inhibited by the normal vaginal pH but survives when pH increases. All isolates tested were biofilm producers at different pH values. Streptococcus agalactiae is an important cause of neonatal infection and maternal colonization. Therefore, its behavior in simulated vaginal fluid was also analyzed. As with L. monocytogenes, S. agalactiae (n=10) survived longer at higher pH values than at normal vaginal pH. All S. agalactiae isolates were also biofilm producers. Therefore, since L. monocytogenes and S. agalactiae can survive at higher vaginal pHs, fetuses/neonates from women having increased vaginal pH values during pregnancy, may be at higher risk of neonatal infection. Biofilm production increases the probability of occurrence of neonatal infection. The application of vaginal probiotics could have the potential for preventing vaginal Listeria colonization in pregnant women and consequently reduce neonatal infections. Thirty-five isolates of Pediococcus spp. showed antimicrobial activity against L. monocytogenes, by production of a bacteriocin, but did not inhibit S. agalactiae isolates. Pediococcus spp. isolates demonstrated the ability to survive in simulated vaginal fluid at pH 4.2. Based on the higher bacteriocinogenic activity and survival in simulated vaginal fluid, one isolate of Pediococcus spp. was selected and characterized to evaluate its safety before use as vaginal probiotic. Pediococcus pentosaceus SB83 did not show the presence of virulence factors such as the production of gelatinase, lipase and DNase, hemolytic activity, nor the presence of virulence genes (i.e. surface adhesin, aggregation protein, cytolysin and extracellular metallo-endopeptidase). No relevant antibiotic resistance traits were detected. Pediococcus pentosaceus SB83 produced biofilms at different pH values (4.2, 5.5 and 6.5) in simulated vaginal fluid, which could also serve as a protective layer against colonization by pathogenic bacteria. The bacteriocin produced by P. pentosaceus SB83, designated as bacteriocin SB83, also showed inhibitory activity against Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium, but did not inhibit vaginal lactic acid bacteria. Bacteriocin SB83 is resistant to several conditions, including conditions in the vaginal tract (pH and components of vaginal fluid). The bacteriocinogenic activity of P. pentosaceus SB83 against L. monocytogenes was evaluated in simulated vaginal fluid at pH 6.5, since this is the ideal pH to the L. monocytogenes survival and proliferation. There the inhibitory effect of the bacteriocinogenic culture was assessed in suspension, as lyophilized powder and in tablets. Suspensions of P. pentosaceus SB83 (1010 CFU/mL) reduced the pathogen (10 CFU/mL) 5after only 2 h of exposure to below the detection limit; the lyophilized bacteria after 24 h of contact and in tablet form, P. pentosaceus SB83 lost the antimicrobial activity. The pH of simulated vaginal fluid decreased in all the tested conditions. Since P. pentosaceus SB83 lose its antimicrobial activity in tablet form, it could be therefore used in the form of lyophilized powder, which may be administered intra-vaginally, for instance as a washing solution. This formulation was selected to evaluate the anti-listerial activity during 12 months of storage. During storage at room temperature, lyophilized bacteria totally inhibited the pathogen (below the detection limit) only during one month; after this time, there was a decrease in the cell counts of P.pentosaceus SB83 and, consequently, in antimicrobial potential. During storage at 4 ºC, P. pentosaceus SB83 showed antimicrobial activity throughout the time of storage investigated. The bacteriocin produced by P. pentosaceus SB83 after storage at 4 ºC, remained active at least during 12 months, however a slight decrease in antimicrobial activity occurred between 9 to 12 months. Therefore, the best formulation of P. pentosaceus SB83 is as a lyophilized powder stored at 4 ºC. These in vitro results prove a concept for the use of P. pentosaceus SB83 as a vaginal probiotic, to prevent vaginal colonization by L. monocytogenes in pregnant women.Os compostos antimicrobianos produzidos pelas bactérias do ácido láctico são importantes para a diminuição da colonização vaginal por agentes patogénicos. O pH vaginal é normalmente acídico, variando entre 3,5-4,5; um aumento do pH vaginal (5,0 a 6,5) pode ser associado à colonização por microrganismos patogénicos. O objetivo principal deste estudo foi selecionar uma cultura com propriedades antimicrobianas com potencial para utilização na prevenção da colonização vaginal por Listeria monocytogenes durante a gravidez e, consequentemente, evitar a listeriose neonatal. Foi investigada a sobrevivência e a capacidade de formação de biofilmes para 20 isolados de L. monocytogenes em fluido vaginal simulado a pH vaginal normal (4,2) e a valores de pH elevados (5,5 e 6,5). Este patogénico foi inibido em condições de pH vaginal normal, mas sobreviveu quando este aumentou. Todos os isolados testados formaram biofilme aos diferentes valores de pH. Streptococcus agalactiae, é um importante agente de colonização maternal e causa de infeção neonatal. Por este motivo, foi também analisado o seu comportamento em condições de simulação de fluido vaginal. Tal como L. monocytogenes, os isolados de S. agalactiae (n=10) sobreviveram melhor a valores de pH elevados comparativamente ao pH vaginal normal. Todos os isolados foram também produtores de biofilme. O facto de L. monocytogenes e S. agalactiae sobreviverem a valores de pH vaginal elevados, sugere que as mulheres grávidas que tenham um aumento do pH vaginal, podem ter um maior risco de infeção neonatal. A produção de biofilmes aumenta a probabilidade de ocorrência destas infeções. A aplicação vaginal de probióticos apresenta potencial para a prevenção de colonização vaginal por L. monocytogenes em mulheres grávidas e, consequentemente, reduzir as infeções neonatais. Trinta e cinco isolados de Pediococcus spp., demonstraram atividade antimicrobiana contra L. monocytogenes, pela produção de uma bacteriocina, no entanto, não apresentou atividade contra os isolados de S. agalactiae. Estes isolados de Pediococcus spp. sobreviveram no fluido vaginal simulado a pH 4,2. Com base nos resultados da avaliação da atividade bacteriocinogénica e sobrevivência em fluido vaginal simulado, Pediococcus pentosaceus SB83 foi selecionado para futura aplicação como probiótico vaginal. Pediococcus pentosaceus SB83 não demonstrou possuir fatores de virulência tais como produção de gelatinase, lipase e DNase, atividade hemolítica, nem possuiu os genes de virulência estudados (adesina de superfície, proteína de agregação, citolisina e metalo-endopeptidase extracelular). Não foram detetadas resistências a antibióticos. Pediococcus pentosaceus SB83 demonstrou ser produtor de biofilme em fluido vaginal simulado a diferentes valores de pH (4,2, 5,5 e 6,5), que também pode atuar como camada protetora contra a colonização por bactérias patogénicas. A bacteriocina produzida por P. pentosaceus SB83, designada por bacteriocina SB83, também demonstrou atividade inibitória contra Enterococcus faecalis e Enterococcus faecium, mas não apresentou efeito inibitório para bactérias do ácido láctico autóctones do trato vaginal. A bacteriocina SB83 demonstrou ser resistente a vários parâmetros, incluindo as condições do trato vaginal (pH e componentes do fluido vaginal). A atividade bacteriocinogénica de P. pentosaceus SB83 contra L. monocytogenes foi avaliada em fluido vaginal simulado a pH 6,5, pois este demonstrou ser o pH ideal para a sobrevivência e proliferação de L. monocytogenes. Foi testado o efeito inibitório da cultura bacteriocinogénica em suspensão, na forma liofilizada e em comprimidos. A suspensão bacteriana de P. pentosaceus SB83 (1010 UFC/mL) reduziu o patogénico (10 UFC/mL) em5 apenas 2 h (abaixo do limite de deteção), a bactéria liofilizada após 24 h de contacto e em comprimidos o P. pentosaceus SB83 perdeu a atividade antimicrobiana. O pH do fluido vaginal simulado diminuiu para todas as condições testadas. Como P. pentosaceus SB83 perdeu a atividade antimicrobiana quando na forma de comprimido, poderá ser utilizado na forma liofilizada, a qual pode ser administrada intravaginalmente, por exemplo como uma solução de lavagem. Esta formulação foi a selecionada para avaliar a atividade anti-listerial durante 12 meses de armazenamento. Durante o armazenamento à temperatura ambiente, a bactéria liofilizada inibiu totalmente o patogénico (abaixo do limite de detecção) apenas durante um mês; após este período de tempo, houve uma diminuição SB83 e, consequentemente, o potencial antimicrobiano. Durante o armazenamento a 4 ºC, P. pentosaceus SB83 apresentou atividade antimicrobiana durante todo o tempo de armazenamento investigado. A bacteriocina produzida por P. pentosaceus SB83 após o armazenamento a 4 ºC, manteve-se ativa pelo menos durante 12 meses, no entanto, uma ligeira diminuição na atividade antimicrobiana ocorreu entre os 9 e 12 meses. Portanto, a melhor formulação de P. pentosaceus SB83 é como liofilizado armazenado a 4 ºC. Estes resultados in vitro provam o conceito para a utilização de P. pentosaceus SB83 como probiótico vaginal, para prevenir a colonização vaginal por L. monocytogenes em mulheres grávidas

Setting up a SAM in Excel using VBA

This technical document describes how to set up a full Social Accounting Matrix from its own partition in a spreadsheet file. This is done using VBA code