Multi-TGDR: a regularization method for multi-class classification in microarray experiments

Background With microarray technology becoming mature and popular, the selection and use of a small number of relevant genes for accurate classification of samples is a hot topic in the circles of biostatistics and bioinformatics. However, most of the developed algorithms lack the ability to handle multiple classes, which arguably a common application. Here, we propose an extension to an existing regularization algorithm called Threshold Gradient Descent Regularization (TGDR) to specifically tackle multi-class classification of microarray data. When there are several microarray experiments addressing the same/similar objectives, one option is to use meta-analysis version of TGDR (Meta-TGDR), which considers the classification task as combination of classifiers with the same structure/model while allowing the parameters to vary across studies. However, the original Meta-TGDR extension did not offer a solution to the prediction on independent samples. Here, we propose an explicit method to estimate the overall coefficients of the biomarkers selected by Meta-TGDR. This extension permits broader applicability and allows a comparison between the predictive performance of Meta-TGDR and TGDR using an independent testing set. Results Using real-world applications, we demonstrated the proposed multi-TGDR framework works well and the number of selected genes is less than the sum of all individualized binary TGDRs. Additionally, Meta-TGDR and TGDR on the batch-effect adjusted pooled data approximately provided same results. By adding Bagging procedure in each application, the stability and good predictive performance are warranted. Conclusions Compared with Meta-TGDR, TGDR is less computing time intensive, and requires no samples of all classes in each study. On the adjusted data, it has approximate same predictive performance with Meta-TGDR. Thus, it is highly recommended

Seguridad del paciente en el Servicio de Urgencias

La Seguridad del Paciente, también llamada Seguridad Clínica es un elemento esencial en la gestión de los servicios sanitarios considerada como una dimensión básica para que un servicio pueda alcanzar un nivel de calidad óptimo. La OMS define como seguridad a la reducción del riesgo de daños innecesarios hasta un mínimo aceptable, siendo esta una asistencia sin riesgos de eventos no previstos. La preocupación sobre la seguridad, se remonta al Código de Hammurabi y a Hipócrates con la famosa “primum non nocere”.Grado en Enfermerí

Caos: Una breve revisión conceptual

La Teoría del Caos (TC) y la Geometría Fractal (GF) revolucionaron el pensamiento científico en la segunda mitad del pasado siglo XX. Y aún continúan haciéndolo, como indica la incesante repercusión mediática que mantienen. En cuanto que su aplicación, además de universal (desde la Física a la Ingeniería, Medicina, Economía, o el Arte), aporta novedosas perspectivas a problemas tan diversos como el origen de la vida o la evolución de la bolsa. En el presente artículo revisaremos algunas cuestiones conceptuales que nacen de la propia Naturaleza interdisciplinar de las misma

Un análisis del Caos: Evolución y ubicuidad

Una de las propiedades del Caos más inquietantes es su ubicuidad. La dinámica caótica y los entes que muestran comportamiento complejo son ubicuos en nuestro mundo. En este ensayo pretendemos explicar este hecho sobre una base evolutiva universal, que obliga a revisar sucintamente el estado actual de conocimiento sobre la generación de planetas similares a la Tierra, y el origen de la vida como fenómeno emergent

Vision of families on bilingual education and bicultural competence in early childhood education: A case study

El presente Trabajo de Fin de Máster tiene como objetivo principal analizar el grado de información que tienen las familias sobre la educación bilingüe y lo que esta implica. Además, se pretende determinar que actitudes tienen estas respecto al bilingüismo y el papel que le confieren a la competencia bicultural. Para llevar a cabo dicha investigación se empleó una metodología de carácter mixto que combina técnicas cualitativas y cuantitativas. También se hace un recorrido teórico por diversos aspectos relacionados con la educación bilingüe con el fin de clarificar conceptos y la importancia de esta en el desarrollo del alumnado.The main purpose of this Master's Dissertation is to analyse the degree of information that families have about bilingual education and what it implies. Furthermore, it is intended to determine what attitudes families have regarding bilingualism and the role that they give to bicultural competence. To carry out this research, a mixed methodology was used that combines qualitative and quantitative techniques. There is also a theoretical journey through various aspects related to bilingual education in order to clarify some concepts and the importance of this in the development of students and when it comes to achieving a higher quality education

Los registros de población y su uso para el análisis espacial de la salud

El proyecto LONGPOP que une los esfuerzos investigadores de España, Holanda, Suecia, Italia, Reino Unido, Bélgica y Suiza para formar una nueva generación de investigadores sociales en demografía y ciencias afinas y para el estudio de la evolución de la demografía y de la salud en Europa a través de metodología longitudinal y de análisis de BigData. LONGPOP es el acrónimo en inglés de Metodologías y técnicas de minería de datos para el análisis y explotación de grandes volúmenes de información basados en Registros Epidemiológicos y Longitudinales de Población. Las sociedades europeas se enfrentan a rápidos cambios sociales, que traen consigo retos y beneficios. Esta rápida transformación de la sociedad, afecta a los cambios en las formas de familia, la fecundidad, el declive de la mortalidad y el aumento de la longevidad, y los cambios son más rápidos en períodos de inestabilidad económica y social. Una de esas transformaciones, el envejecimiento de la población en toda Europa, está provocando que los países experimenten el impacto de estos cambios rápidos en la sostenibilidad de sus sistemas de bienestar. Al mismo tiempo, el uso del espacio y la movilidad residencial se ha convertido en un tema clave, convirtiéndose en el eje de la agenda política, con la migración dentro de los países de la UE y desde fuera de Europa como uno de los temas de mayor actualidad. Estos rápidos cambios sociales pueden ser estudiados con bases de datos y herramientas tradicionales de análisis, pero afrontando serias limitaciones de precisión y rapidez en la obtención de resultados. Durante la última década, equipos de investigación de toda Europa han estado involucrados en el desarrollo y construcción de registros longitudinales de población y grandes bases de datos de investigación, abriendo nuevas vías para establecer relaciones entre diferentes fuentes de datos (fundamentalmente registros de datos administrativos y epidemiológicos) con otras más heterogéneas y no estructuradas, haciendo posible conocer la causalidad de esa rápidas transformaciones sociales de forma menos costosa, con mayor precisión y prontitud. Sin embargo, el trabajo con ese tipo de conjuntos de datos requiere conocimientos avanzados, tanto en gestión de datos como en técnicas estadísticas. LONGPOP tiene como objetivo crear la red que reúne a estos diferentes equipos de investigación para compartir experiencias, construir investigación conjunta y crear una red de formación de especialistas en el campo y con ello aumentar el número de usuarios de estas grandes, y posiblemente infrautilizadas, bases de datos.N

La tensión del "pluralismo" desde la perspectiva filosófica intercultural

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