Evaluation of de novo RNA-Seq assemblers in a differentially expressed transcripts analysis

Orientadores: Zanoni Dias, Felipe Rodrigues da SilvaDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de ComputaçãoResumo: RNA-Seq é uma tecnologia desenvolvida a partir de dados de sequenciamento de nova geração (NGS) para estudos de transcriptomas. Um pesquisador pode reconstruir isoformas a partir de dados de RNA-Seq sem utilizar um genoma de referência (montagem de novo). Uma das diversas análises possíveis utilizando dados de RNA-Seq é encontrar genes ou transcritos diferencialmente expressos. O objetivo deste trabalho é avaliar metodologias de análises em larga escala aplicadas na área da transcriptômica para encontrar transcritos diferencialmente expressos, propondo um critério de classificação que maximize a chance da escolha de algum transcrito montado por um montador de novo ser diferencialmente expresso. Esse critério pode auxiliar a eliminar transcritos falsos positivos a serem analisados posteriormente em bancada por metodologias, como PCR Real Time (Polimerase Chain Reaction Real Time). Dados reais foram testados para validar as montagens de novo na procura de transcritos diferencialmente expressos e resultados mostram que na alteração do volume de dados, a quantidade de verdadeiros positivos (transcritos realmente diferencialmente expressos) se altera. Concluímos que o melhor montador de novo foi o TrinityAbstract: RNA-Seq is a next-generation sequencing data (NGS) technology developed for transcriptome studies. For an organism, a researcher can perform isoform reconstructions from RNA-Seq data without the reference genome (de novo assembly). One of the several possible analyses using RNA-Seq data is finding differentially expressed genes or transcripts. This study evaluates analytic methods used in large-scale transcriptome studies for finding differentially expressed transcripts, proposing a data classification criterium that maximizes the chance of choosing a differentially expressed transcript in a de novo assembly. This criterium helps eliminate false positives that hinder posterior methods, such as Real-Time PCR (Polymerase Chain Reaction Real Time). Real data were tested to evaluate de novo assemblies, searching for differentially expressed transcripts, and the results show that the amount of true positives (truly differentially expressed transcripts) varies with the data volume, favoring libraries with more data. We concluded that the best de novo assembler is TrinityMestradoCiência da ComputaçãoMestre em Ciência da Computação134480/9-2013CNP

Characterization of the knee joint phenotype in the Portuguese population

Background: Neutral constitutional alignment and neutral joint line obliquity has been the standard alignment strategy for total knee arthroplasty. This one-for-all measure may negatively impact gait pattern and knee biomechanics. Novel alignment strategies surged, considering the variability in phenotypes found across the literature, as different populations may present different phenotype distributions. The Portuguese population has a distinct genetic origin, with no phenotype distribution data. Our objective was to characterise the population’s knee morphology, searching and analysing adjacent joint osteoarthrosis, and calculating the pre-disease coronal alignment. Methods: A retrospective cohort study was conducted. Full-length X-rays performed between 2016-2023 were analysed. Five alignment parameters were measured (LDFA, MPTA, JLCA, TJLA, HKA), and two parameters were calculated (aHKA, JLO). Knees were classified according to the CPAK classification. Results: For the arthritic cohort, CPAK-I (23%) II (20%) were most common, aHKA increases as KL increases (r=0.8352; p<0.001). For the healthy, Type-II (42%) and Type-I (15%) were most common. For paediatric, Type-II (43%) and Type-V (21%) were most common. CPAK Types-VII/VIII/IX were rare. Differences between genders for healthy and arthritic cohorts were statistically significant. The arthritic had higher prevalence of adjacent joint osteoarthritis. Conclusions: The Portuguese population presents a similar knee phenotype comparing with other populations, some differences have been found regarding the Asian continent. The most common phenotype was a neutral alignment if either healthy or paediatric, or a varus alignment if knee OA. Coronal alignment may not have a major impact in the prevalence of ankle and hip osteoarthritis; however, higher prevalence is observed in patients with knee OA

PERFIL E DESFECHOS CLÍNICOS DE PACIENTES INTERNADOS POR COVID-19 EM UM HOSPITAL DO SUL DO BRASIL

Objetivo: descrever perfil e desfechos clínicos de pacientes diagnosticados com COVID-19 admitidos em hospital privado na região Sul do Brasil. Método: estudo descritivo, realizado com 110 pacientes com COVID-19 que necessitaram de internação hospitalar entre março e maio de 2020. Foram coletados dados sociodemográficos, perfil clínico, sinais e sintomas e desfechos clínicos. Adotou-se análise descritiva para interpretação dos dados. Resultados: predominou sexo masculino (64,5%). Comorbidade prevalente: Hipertensão Arterial Sistêmica (45,5%). Sinais e sintomas com maior destaque: tosse (53,6%) e dispneia (48,2%). Desfechos clínicos evidenciados: tomografia de tórax com opacidades em vidro fosco (98,2%), suplementação com oxigenoterapia (86,4%), encaminhamento para Unidade de Internação (90,9%). Intercorrências observadas: arritmias cardíacas (18,2%) e hipoxemia (18,2%). Desfecho final predominante foi alta melhorada (90%). Conclusão: a descrição de perfil e desfecho clínico de pacientes com COVID-19 proporcionará o direcionamento de cuidados com fluxos e protocolos assistenciais que garantam qualidade da assistência e segurança na prática clínica.Descritores: COVID-19. Pacientes. Hospitalização. Pandemias. Enfermagem

Análise dos casos de Hanseníase da região norte em relação ao Brasil no período de 2011 a 2021: Analysis of Hansen’s disease cases in the northern region in relation to Brazil from 2011 to 2021

A Hanseníase, também chamada lepra, é uma doença infectocontagiosa causada pelo agente Mycobacterium leprae, apresenta dados epidemiológicos relevantes para o cenário regional e nacional, uma vez que registrou mais de 375 mil casos na última década. As anormalidades causadas pelo contágio afetam, principalmente, o sistema nervoso, responsável por controlar ações voluntárias e involuntárias do corpo que estão relacionadas com a perda de sensibilidade nos membros superiores e inferiores, por exemplo, além da presença de manchas tegumentares. Tais alterações prejudicam a qualidade de vida dos acometidos. Ademais, embora tenha cura, apresenta dados significativos de mortalidade no cenário regional e nacional. Tal pesquisa tem como objetivo analisar a quantidade e variáveis dos pacientes com diagnósticos, nos centros de atendimento, como hospitais e unidades básicas de saúde na região norte, no período de 2011 a 2021, em comparação às mesmas variáveis de âmbito nacional.Trata-se de um estudo epidemiológico, quantitativo e retrospectivo com coleta de dados do Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde - DATASUS. A pesquisa foi realizada mediante informações epidemiológicas e morbidade no grupo de Morbidade Hospitalar do SUS (SIH/SUS). Foram analisados os dados disponíveis pelo CID 10 de ambos os sexos, faixas etárias, raças e números de óbitos na região norte e no Brasil.Constatou-se 383.631 casos no Brasil, dos quais 42,44% na região norte. Sendo 61% dos casos do sexo masculino e 38,98% do sexo feminino, no Brasil esses percentuais são de 56,94% e 43,05% respectivamente. Das faixas etárias da região norte, a maior prevalência se dá entre 30 a 39 anos com 19,70% dos casos e em relação aos dados nacionais, tal faixa de idade representa 17,46%. Quanto às raças, observa-se que 69,94% dos acometidos são pardos, 14,37% são brancos, 11,58% são pretos e 4,10% outros, em esfera nacional destaca-se 57,20% do índice em pardos. Depreende-se, portanto, que essa patologia é mais prevalente em pessoas do sexo masculino, além do maior acometimento com aumento da idade e presença marcante em indivíduos da raça parda

A aplicação da análise envoltória de dados para avaliação de eficiência de cursos de graduação: uma revisão sistemática/ The application of data envelopment analysis to evaluate the efficiency of undergraduate courses: a systematic review

A avaliação de desempenho nas Instituições de Federais de Ensino Superior (IFES) está cada vez mais importante para sua manutenção e funcionamento, seja para manter a qualidade de Ensino, Pesquisa e Extensão por estas oferecidas, ou até mesmo para o aumento de vagas e o atendimento da demanda da comunidade, tendo em vista os atuais cortes de orçamento pelas instituições governamentais. Como avaliar a eficiência institucional, com as mais variadas especificidades de cursos de determinada IFES? O objetivo desta pesquisa consiste em identificar por meio da revisão sistemática do tema e como associar os múltiplos indicadores das IFES. A Análise Envoltória de Dados (DEA) é a metodologia que melhor se adequa à análise da eficiência da IFES a partir de multicritérios de insumos e resultados. Foi realizada uma revisa?o sistemática, descritiva e explorato?ria da aplicação da DEA em ambientes das IFES. A busca de artigos foi realizada atrave?s das bases de dados do Periódicos CAPES, utilizando os seguintes descritores: “Data Envelopment Analysis” e “educational institutions”. Foram selecionados 143 artigos nos idiomas Ingle?s e Portugue?s. Pore?m, apo?s a aplicac?a?o dos crite?rios de inclusa?o e exclusa?o, apenas 15 artigos foram incluídos na amostra final. Os artigos selecionados foram publicados entre os anos de 2016 e 2021. Analisando o conjunto de pesquisas, verifica-se que a DEA apresenta uma boa avaliação de eficiência ao possibilitar a criação de modelos combinando os múltiplos indicadores selecionados, conforme a necessidade de cada tomador de decisão da instituição

PERFIL DOS ÓBITOS POR INFARTO AGUDO DO MIOCÁRDIO DO BRASIL NO PERÍODO DE 2011 A 202

Acute Myocardial Infarction (AMI) corresponds to myocardial necrosis resulting from acute obstruction of a coronary artery. It mainly results from atherosclerosis, where fatty plaques are attached to the blood vessels and with the rupture, clots form and blood flow interruption, leading to ischemia of the heart muscle. It is associated with risk factors from an unhealthy lifestyle, associated with predispositions. As a result, there is a growth of more than 1 million hospitalizations in Brazil per year. This research aims to analyze the quantity and variables of mortality rates from acute myocardial infarction in Brazil through a quantitative and retrospective study with data collection from the Department of Informatics of the Unified Health System - DATASUS. Data available from the CID 10 for both sexes, age groups and races were analyzed. During the study period, 129,962 cases of deaths from AMI were identified. Regarding gender, 55.94% of the cases are male and 44.06% are female. Of the age groups, deaths are more prevalent between 60 and 79 years of age, with 56.06% of the total cases of death. As for races, it is observed that 55.56% of deaths are of white people, 38.26% are brown, 4.54% black and 1.64% others. It appears, therefore, that the number of deaths from AMI is more prevalent in males, especially in the age group from 60 to 79 years of age, with a marked emphasis on white people.     El infarto agudo de miocardio (IAM) corresponde a la necrosis miocárdica resultante de la obstrucción aguda de una arteria coronaria. Es principalmente el resultado de la aterosclerosis, donde las placas de grasa se adhieren a los vasos sanguíneos y con la ruptura, se forman coágulos y se interrumpe el flujo sanguíneo, lo que lleva a la isquemia del músculo cardíaco. Se asocia a factores de riesgo provenientes de un estilo de vida poco saludable, asociado a predisposiciones. Como resultado, hay un crecimiento de más de 1 millón de hospitalizaciones en Brasil por año. Esta investigación tiene como objetivo analizar la cantidad y las variables de las tasas de mortalidad por infarto agudo de miocardio en Brasil a través de un estudio cuantitativo y retrospectivo con recolección de datos del Departamento de Informática del Sistema Único de Salud - DATASUS. Se analizaron los datos disponibles del CID 10 para ambos sexos, grupos de edad y razas. Durante el período de estudio se identificaron 129.962 casos de muertes por IAM. En cuanto al género, el 55,94% de los casos son hombres y el 44,06% son mujeres. De los grupos de edad, las defunciones son más prevalentes entre los 60 y los 79 años, con el 56,06% del total de casos de defunción. En cuanto a las razas, se observa que el 55,56% de las muertes son de personas blancas, el 38,26% son pardas, el 4,54% negras y el 1,64% otras.O Infarto Agudo do Miocárdio (IAM) corresponde a uma necrose miocárdica resultante de obstrução aguda de uma artéria coronária. Decorre, principalmente, de aterosclerose, onde placas de gordura se fixam nos vasos sanguíneos e com o rompimento formam-se coágulos e interrupção do fluxo sanguíneo, levando à isquemia do músculo cardíaco. Possui associação a fatores de risco provenientes do estilo de vida não saudável, associado a predisposições. Com isso, observa-se crescimento de mais de 1 milhão de internações no Brasil por ano. Tal pesquisa tem por objetivo analisar a quantidade e as variáveis dos índices de mortalidade por infarto agudo do miocárdio no Brasil, por um estudo quantitativo e retrospectivo, com coleta de dados do Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde - DATASUS. Foram analisados os dados disponíveis pelo CID 10 de ambos os sexos, faixas etárias e raças. Identificou no período estudado, 129.962 casos de óbitos por IAM. Quanto ao sexo, 55,94% dos casos são do sexo masculino e 44,06% do sexo feminino. Das faixas etárias, os óbitos estão mais prevalentes entre 60 e 79 anos de idade, com 56,06% dos casos totais de morte. Quanto às raças, observa-se que 55,56% das mortes são de pessoas da raça branca, 38,26% são pardos, 4,54% pretos e 1,64% outros. Depreende-se, portanto, que o número de óbitos por IAM são mais prevalentes no sexo masculino, sobretudo na faixa etária dos 60 aos 79 anos de idade, com destaque marcante em pessoas da raça branca.  O Infarto Agudo do Miocárdio (IAM) corresponde a uma necrose miocárdica resultante de obstrução aguda de uma artéria coronária. Decorre, principalmente, de aterosclerose, onde placas de gordura se fixam nos vasos sanguíneos e com o rompimento formam-se coágulos e interrupção do fluxo sanguíneo, levando à isquemia do músculo cardíaco. Possui associação a fatores de risco provenientes do estilo de vida não saudável, associado a predisposições. Com isso, observa-se crescimento de mais de 1 milhão de internações no Brasil por ano. Tal pesquisa tem por objetivo analisar a quantidade e as variáveis dos índices de mortalidade por infarto agudo do miocárdio no Brasil, por um estudo quantitativo e retrospectivo, com coleta de dados do Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde - DATASUS. Foram analisados os dados disponíveis pelo CID 10 de ambos os sexos, faixas etárias e raças. Identificou no período estudado, 129.962 casos de óbitos por IAM. Quanto ao sexo, 55,94% dos casos são do sexo masculino e 44,06% do sexo feminino. Das faixas etárias, os óbitos estão mais prevalentes entre 60 e 79 anos de idade, com 56,06% dos casos totais de morte. Quanto às raças, observa-se que 55,56% das mortes são de pessoas da raça branca, 38,26% são pardos, 4,54% pretos e 1,64% outros. Depreende-se, portanto, que o número de óbitos por IAM são mais prevalentes no sexo masculino, sobretudo na faixa etária dos 60 aos 79 anos de idade, com destaque marcante em pessoas da raça branca.

PERFIL DOS ÓBITOS POR INFARTO AGUDO DO MIOCÁRDIO DO BRASIL NO PERÍODO DE 2011 A 202

Acute Myocardial Infarction (AMI) corresponds to myocardial necrosis resulting from acute obstruction of a coronary artery. It mainly results from atherosclerosis, where fatty plaques are attached to the blood vessels and with the rupture, clots form and blood flow interruption, leading to ischemia of the heart muscle. It is associated with risk factors from an unhealthy lifestyle, associated with predispositions. As a result, there is a growth of more than 1 million hospitalizations in Brazil per year. This research aims to analyze the quantity and variables of mortality rates from acute myocardial infarction in Brazil through a quantitative and retrospective study with data collection from the Department of Informatics of the Unified Health System - DATASUS. Data available from the CID 10 for both sexes, age groups and races were analyzed. During the study period, 129,962 cases of deaths from AMI were identified. Regarding gender, 55.94% of the cases are male and 44.06% are female. Of the age groups, deaths are more prevalent between 60 and 79 years of age, with 56.06% of the total cases of death. As for races, it is observed that 55.56% of deaths are of white people, 38.26% are brown, 4.54% black and 1.64% others. It appears, therefore, that the number of deaths from AMI is more prevalent in males, especially in the age group from 60 to 79 years of age, with a marked emphasis on white people.     El infarto agudo de miocardio (IAM) corresponde a la necrosis miocárdica resultante de la obstrucción aguda de una arteria coronaria. Es principalmente el resultado de la aterosclerosis, donde las placas de grasa se adhieren a los vasos sanguíneos y con la ruptura, se forman coágulos y se interrumpe el flujo sanguíneo, lo que lleva a la isquemia del músculo cardíaco. Se asocia a factores de riesgo provenientes de un estilo de vida poco saludable, asociado a predisposiciones. Como resultado, hay un crecimiento de más de 1 millón de hospitalizaciones en Brasil por año. Esta investigación tiene como objetivo analizar la cantidad y las variables de las tasas de mortalidad por infarto agudo de miocardio en Brasil a través de un estudio cuantitativo y retrospectivo con recolección de datos del Departamento de Informática del Sistema Único de Salud - DATASUS. Se analizaron los datos disponibles del CID 10 para ambos sexos, grupos de edad y razas. Durante el período de estudio se identificaron 129.962 casos de muertes por IAM. En cuanto al género, el 55,94% de los casos son hombres y el 44,06% son mujeres. De los grupos de edad, las defunciones son más prevalentes entre los 60 y los 79 años, con el 56,06% del total de casos de defunción. En cuanto a las razas, se observa que el 55,56% de las muertes son de personas blancas, el 38,26% son pardas, el 4,54% negras y el 1,64% otras.O Infarto Agudo do Miocárdio (IAM) corresponde a uma necrose miocárdica resultante de obstrução aguda de uma artéria coronária. Decorre, principalmente, de aterosclerose, onde placas de gordura se fixam nos vasos sanguíneos e com o rompimento formam-se coágulos e interrupção do fluxo sanguíneo, levando à isquemia do músculo cardíaco. Possui associação a fatores de risco provenientes do estilo de vida não saudável, associado a predisposições. Com isso, observa-se crescimento de mais de 1 milhão de internações no Brasil por ano. Tal pesquisa tem por objetivo analisar a quantidade e as variáveis dos índices de mortalidade por infarto agudo do miocárdio no Brasil, por um estudo quantitativo e retrospectivo, com coleta de dados do Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde - DATASUS. Foram analisados os dados disponíveis pelo CID 10 de ambos os sexos, faixas etárias e raças. Identificou no período estudado, 129.962 casos de óbitos por IAM. Quanto ao sexo, 55,94% dos casos são do sexo masculino e 44,06% do sexo feminino. Das faixas etárias, os óbitos estão mais prevalentes entre 60 e 79 anos de idade, com 56,06% dos casos totais de morte. Quanto às raças, observa-se que 55,56% das mortes são de pessoas da raça branca, 38,26% são pardos, 4,54% pretos e 1,64% outros. Depreende-se, portanto, que o número de óbitos por IAM são mais prevalentes no sexo masculino, sobretudo na faixa etária dos 60 aos 79 anos de idade, com destaque marcante em pessoas da raça branca.  O Infarto Agudo do Miocárdio (IAM) corresponde a uma necrose miocárdica resultante de obstrução aguda de uma artéria coronária. Decorre, principalmente, de aterosclerose, onde placas de gordura se fixam nos vasos sanguíneos e com o rompimento formam-se coágulos e interrupção do fluxo sanguíneo, levando à isquemia do músculo cardíaco. Possui associação a fatores de risco provenientes do estilo de vida não saudável, associado a predisposições. Com isso, observa-se crescimento de mais de 1 milhão de internações no Brasil por ano. Tal pesquisa tem por objetivo analisar a quantidade e as variáveis dos índices de mortalidade por infarto agudo do miocárdio no Brasil, por um estudo quantitativo e retrospectivo, com coleta de dados do Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde - DATASUS. Foram analisados os dados disponíveis pelo CID 10 de ambos os sexos, faixas etárias e raças. Identificou no período estudado, 129.962 casos de óbitos por IAM. Quanto ao sexo, 55,94% dos casos são do sexo masculino e 44,06% do sexo feminino. Das faixas etárias, os óbitos estão mais prevalentes entre 60 e 79 anos de idade, com 56,06% dos casos totais de morte. Quanto às raças, observa-se que 55,56% das mortes são de pessoas da raça branca, 38,26% são pardos, 4,54% pretos e 1,64% outros. Depreende-se, portanto, que o número de óbitos por IAM são mais prevalentes no sexo masculino, sobretudo na faixa etária dos 60 aos 79 anos de idade, com destaque marcante em pessoas da raça branca.

Estudo epidemiológico avaliativo da manutenção dos casos de Sífilis adquirida no período de 2017 a 2021 no Brasil / Epidemiological study evaluating the maintenance of acquired syphilis cases from 2017 to 2021 in Brazil

A Sífilis adquirida é uma Infecção Sexualmente Transmissível (IST) causada pelo patógeno Treponema pallidum que apresenta dados epidemiológicos relevantes para o âmbito nacional, considerando os mais de 619 mil casos diagnosticados nos últimos 5 anos. As manifestações clínicas são variáveis conforme o estágio de evolução da doença, podendo se manifestar de forma primária, secundária, latente e terciária. Por conseguinte, o acometimento sistêmico do organismo pode evoluir com complicações graves, a exemplo, a sífilis cardiovascular e a neurossífilis. Ademais, embora tenha tratamento simples com medicamentos à base de penicilina, há dados significativos de complicações pela doença no cenário nacional. Logo, o atual estudo objetiva analisar dados quantitativos e as variáveis dos pacientes com diagnóstico de Sífilis nos centros de atendimento, sendo eles hospitais e unidades básicas de saúde do Brasil, no período de 2017 a 2021. Trata-se de uma pesquisa epidemiológica, quantitativa e retrospectiva com coleta de dados do Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde - DATASUS. Tal análise de dados foi realizada mediante informações epidemiológicas e morbidade no grupo de Morbidade Hospitalar do SUS (SIH/SUS). Foram analisados os dados disponíveis pelo CID 10 de ambos os sexos, faixas etárias, raças e números de casos por região do Brasil. Foram constatados no período estudado, 619.819 casos de sífilis adquirida no Brasil. No tocante ao sexo, 60,47% dos casos é do sexo masculino, 39,53% do sexo feminino. Das faixas etárias, as maiores prevalências se dão entre 15 e 39 anos de idade com 68,11% dos casos totais de sífilis adquirida. Quanto às raças, observa-se que 43,80% dos acometidos são pardos, 42,36% são brancos, 12,08% são pretos e 1,76% outros ou não informado. Além disso, a região sudeste destaca-se com 47,59% dos casos e a região sul com 23,38% dos casos totais de Sífilis Adquirida. Depreende-se, portanto, que essa patologia é mais prevalente em pessoas do sexo masculino com destaque na região sudeste do Brasil, principalmente na faixa etária de 15 até 39 anos de idade e presença marcante em indivíduos da raça parda. Dessa forma, percebe-se como o estudo da epidemiologia da Sífilis Adquirida se faz importante para a compreensão do número de casos e riscos em cada especificidade descrita, a fim de mostrar e alertar a seriedade da doença no âmbito nacional

A review of the genus Semele (Ruscaceae) systematics in Madeira

The present study attempts to review the systematics of Semele (Ruscaceae) in Madeira, based on phenotypic diversity. The variation in some vegetative (climbing shoot, second-order branches or ‘phylloclades’) and sexual (inflorescence and flowers) characters was analysed in 115 plant specimens from 30 field populations, herbaria of the Costa collection and Madeira Botanical Garden (MADJ) and certain gardens. Thirty-one quantitative and qualitative characters have been utilized in the analysis. Kaiser–Meyer–Olkin (KMO) analysis indicates adequate sampling. Principal component analysis (PCA) reveals that the spatial distribution of individuals has a discontinuous behaviour. Principal coordinate analysis (PCO) utilizing the Gower coefficient on standardized data revealed a significantly discontinuous distribution of individuals, such that two different clusters can be defined. The Student’s t-test and Tukey test on separate characters, when individuals were classified according to the Costa classification, confirms the significant differences between grouping accessions. This leads to the recognition of two species within the genus in Madeira. Literature and herbarium studies show that these two taxa are conspecific with Semele androgyna (L.) Kunth sensu stricto (s.s.) and Semele menezesi Costa sensu lato (s.l.). A separated statistical analysis of the S. androgyna cluster shows the possible existence of additional subgroups. Based on field population distribution, ecological behaviour and variation in features, we propose the recognition of two species, S. androgyna (L.) Kunth and S. menezesi (Costa) Pinheiro de Carvalho, and two subspecies S. androgyna (L.) Kunth androgyna Pinheiro de Carvalho and S. androgyna (L.) Kunth pterygophora Pinheiro de Carvalho.The authors are grateful to Mr Francisco Fernandes, Madeira Botanical Garden, Priest Nóbrega and Mr Rogério Correia for help in the monitoring of plant populations and fieldwork and to Dr Grahm Queen curator of MADM herbarium for access to the Costa herbarium collection. This work has been financially supported by FCT (Portuguese Foundation for Science and Technology) and PRAXIS XXI, through the CEM (Centre for Macaronesian Studies) and CRUP (Dean Council of Portuguese University)/British Council.info:eu-repo/semantics/publishedVersio