Estudio de polimorfismos genéticos en SDF1, CCR5, CCR2; y su relación a progresión en un grupo de sujetos infectados con VIH-1

Las mutaciones en las quimiocinas y sus receptores; SDF1, CCR2 Y CCR5 han sido identificados y asociados con resistencia a la infección del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1) y retardo de la progresión al síndrome de inmunodeficiencia (SIDA) o muerte. Los sujetos infectados perinatalmente que presentaron el polimorfismo CCR5-59029G mostraron una progresión lenta a muerte y una mejor recuperación de los niveles de linfocitos T CD4. Los sujetos con el polimorfismo SDF-1-3’A entre las edades de 5 a 12 años mostraron una progresión lenta a muerte y una disminución estadísticamente significativa de la carga viral del VIH-1 después del tratamiento con TARV. Los análisis estadísticos no mostraron ninguna asociación con la progresión a SIDA o muerte. Este es el primer estudio que se realiza en Centroamérica en busca de asociación entre factores genéticos del hospedero y progresión a SIDA y muerte en sujetos infectados con VIH-1 perinatalmente. Muestras de sangre de 74 sujetos infectados perinatalmente con VIH-1 y 223 adultos infectados con VIH-1 fueron obtenidas y evaluadas para las mutaciones CCR5 delta (Δ) 32 en el gen de CCR5, CCR5-59029 en la región del promotor de CCR5, CCR2-V641, y en el gen SDF1-3'A utilizando PCR y PCR-RFLP. Los sujetos infectados perinatalmente que presentaron el polimorfismo CCR5-59029G mostraron una progresión lenta a muerte y una mejor recuperación de los niveles de linfocitos TCD4. Los sujetos con el polimorfismo SDF1-3'A entre las edades de 5 a 12 años mostraron una progresión lenta a muerte y una disminución estadísticamente significativa de la carga viral del VIH-1 después del tratamiento con TARV. Los análisis estadísticos no mostraron ninguna asociación con la progresión a SIDA o muerte. Este es el primer estudio que se realiza en Centroamérica en busca de asociación entre factores genéticos del hospedero y progresión a SIDA y muerte en sujetos infectados con VIH-1 perinatalmente. Como se esperaba, la frecuencia del alelo Δ32 entre nuestra población de estudio fue marcadamente bajo comparado a frecuencias reportadas en caucásicos. El polimorfismo CCR5-59029G fue relacionado a progresión lenta a SIDA y muerte en individuos infectados perinatalmente con VIH-1, su detección puede aportar información en la evolución clínica en estos sujetos y apoyar en las decisiones terapéuticas

Detección de Rickettsia spp. en ectoparásitos de animales domésticos y silvestres de la Reserva Natural Privada Cerro Chucantí y comunidades aledañas, Panamá, 2007-2010

Introduction. Ectoparasites are the main vectors of rickettsiosis. In Panama, have limited data on the arthropods that may be considered vectors or reservoirs.Objectives. The aim is to present data on the presence of Rickettsia in ectoparasites of wildlife and domestic animals in the Private Natural Reserve Cerro Chucantí and neighboring villages.Materials and methods. We evaluated 9 humans, 95 domestic mammals and 48 wild. From these, were 21 species of ectoparasites, including fleas, lice, ticks and mites, which were preserved in 95% ethanol. Genetic material was extracted from ticks and fleas to be analyzed by molecular techniques in the detection of Rickettsia.Results. A total of 425 were carried out PCR reactions, of which 270 were positive and 155 negative. The positive, 86 PCR amplified for the gltA gene (55% of positives) of these also amplified 41 (26%) for ompA. DNA of Rickettsia amblyommii was found in horses ticks (Amblyomma cajennense, Dermacentor nitens), dogs ticks (Rhipicephalus sanguineus) and free living nymph in forest. Adicionally, DNA of R. felis was found in dogs fleas Ctenocephalides felis.Conclusions. Detected the presence of R. amblyommii and R. felis in ticks and fleas of domestic animals of the villages near Cerro Chucanti, even if they were unable to find genetic material from Rickettsia in ectoparasites of wildlife.Introducción. Los ectoparásitos son los principales vectores de rickettsiosis. En Panamá se tienen escasos datos sobre los artrópodos que pudieran considerarse vectores o reservorios.Objetivos. Presentar datos sobre la presencia de Rickettsia spp. en ectoparásitos de fauna silvestre y animales domésticos en la Reserva Natural Privada Cerro Chucantí y poblados vecinos.Materiales y métodos. Se revisaron 9 personas, 95 mamíferos domésticos y 48 silvestres. Los animales domésticos se examinaron con anuencia del propietario, mientras que la fauna silvestre se capturó con trampas Sherman y Tomahawk. Se extrajeron 21 especies de ectoparásitos: pulgas, piojos, garrapatas y otros ácaros, los cuales se preservaron en etanol al 95 %. Se extrajo material genético de garrapatas y pulgas para ser analizado por técnicas moleculares en la detección de Rickettsia spp.Resultados. Se practicaron 425 reacciones de PCR, de las cuales, 270 resultaron negativas y 155 positivas. De las positivas, 86 amplificaron para el gen gltA (55 % de las positivas); de estos también amplificaron 41 (26 %) para ompA. Se encontró material genético de Rickettsia amblyommii, en garrapatas de caballos (Amblyomma cajennense, Dermacentor nitens), de perros (Rhipicephalus sanguineus) y ninfas de Amblyomma recolectadas en el bosque. Además, se detectó ADN de R. felis en pulgas Ctenocephalides felis de perros.Conclusiones. Se pudo detectar la presencia de R. amblyommii y R. felis en garrapatas y pulgas de animales domésticos de los poblados cercanos a Cerro Chucantí, aun cuando no se pudo encontrar material genético de Rickettsia en ectoparásitos de la fauna silvestre. doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v32i2.390

Evidencia serológica de infecciones de Rickettsia en humanos provenientes de tres localidades de Panamá

Introduction: Since the middle of last century, cases of rickettsiosis have been found in Panamá when outbreaks of murine typhus and spotted fever were reported. Since then, little information exists about its prevalence in this country, since it is most often is misdiagnosed as another disease.Objectives: The aim of this paper is to demonstrate the presence of Rickettsia infections in humans in three locations in Panamá. These locations are agricultural areas, near forested areas or those whowork in zoo.Materials and methods: Three locations where chosen for this study: Tortí, El Valle de Antón and workers in the Summit Municipal Park in Panamá City. All volunteers signed an informed consent and answered a questionnaire. The samples were analyzed for the detection of rickettsial spotted fever and typhus group by the indirect immunofluorescence (using commercial kits) and antigens of Rickettsia rickettsii and R. amblyommii.Results: Blood samples were taken from 97 volunteers in Tortí (25), El Valle de Anton (37) and Summit Municipal Park (35). Of these, a total of 38 (39%) samples reacted to one of the two methods: eight (32%) in Tortí, 18 (48%) in El valle and 12 (34%) in Summit Municipal Park.Conclusion: The results show a high prevalence of antibodies to Rickettsia belonging to the spotted fever group in each of the three study areas, in addition to presenting evidence of the typhus group Rickettsia in El Valle de Anton. These areas could be considered endemic for rickettsiosis as there are conditions for maintaining them. doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v33i0.831 Introducción. Desde mediados del siglo pasado, se conocen en Panamá casos de rickettsiosis, cuando fueron reportados brotes de tifus en ratones y de fiebres manchadas. A partir de entonces, poca información se tiene sobre su prevalencia en este país, lo cual se debe principalmente a que son confundidos con otras enfermedades.Objetivos. El objetivo de este trabajo fue demostrar la presencia de rickettsiosis en humanos provenientes de tres localidades de Panamá, que corresponden a zonas agropecuarias, cercanas a bosques, o que trabajaban en zoológicos.Materiales y métodos. Se escogieron tres localidades para este estudio: Tortí (provincia de Panamá), El Valle de Antón (provincia de Coclé) y el Parque Municipal Summit en Ciudad de Panamá. Los voluntarios firmaron un consentimiento informado, además de responder un cuestionario. De cada voluntario se extrajo sangre venosa, la que fue analizada por medio de inmunoflorescencia indirecta, utilizando kits comerciales y láminas sensibilizadas con antígenos cultivados de Rickettsia rickettsii y Rickettsia amblyommii.Resultados. Se tomaron muestras de 97 voluntarios, 25 en Tortí, 37 en El Valle de Antón y 35 en el Parque Municipal Summit. De estos, 38 (39 %) de las muestras fueron positivas en algunas de las dos técnicas practicadas: 8 (32 %) en Tortí, 18 (48 %) en El Valle y 12 (34 %) en el Parque Municipal Summit.Conclusión. Se demuestra una alta prevalencia de anticuerpos contra Rickettsia del grupo de las fiebres manchadas en las tres áreas de estudio, además de presentarse evidencia de títulos para Rickettsia del grupo tifus en El Valle de Antón. Estas zonas podrían considerarse como endémicas por rickettsiosis, ya que existen condiciones que permiten el mantenimiento de las mismas.doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v33i0.831

Description of human infestations by ticks in Panama and Costa Rica

Tick bites in humans are associated with the transmission of pathogens, anaphylactic shock, paralysis, and secondary infections. In this work we described six cases of tick bites in patients from Panama and Costa Rica. These bites were provoked for adults of Ornithodoros puertoricensis, Amblyomma cf. oblongoguttatum, Amblyomma ovale, and Ixodes cf. boliviensis, and a nymph of Amblyomma mixtum. The relationships of these species of ticks with the environment are explained. Among the reactions observed in the patients there are blisters, maculo-papular rash, granuloma, lymphadenopathy, and erythema migrans-like rash, but none referred symptoms compatible with an infectious disease. In the collected ticks a PCR battery was developed to rule out Borrelia, Rickettsia, Anaplasmataceae, and Coxiella diseases to the ticks from the cases 1, 2, 3 and 4, with negative results. Although no pathogen infections were evidenced, these finding indicate that the tick bites constitute a public health problem what goes unnoticed in many countries

Phylogenetic Analysis of Hepatitis B Virus Genotypes Circulating in Different Risk Groups of Panama, Evidence of the Introduction of Genotype A2 in the Country

<div><p>The Hepatitis B Virus (HBV) can cause acute or chronic infection it is also associated with the development of liver cancer, thousands of new infections occur on a yearly basis, and many of these cases are located in certain areas of the Caribbean and Latin America. In these areas, the HBV prevalence is still high which makes this virus a serious public health concern to the entire region. Studies performed in Panama suggest a complex pattern in the distribution of HBV among the country’s different risk groups. We use phylogenetic analysis in order to determine which HBV genotypes were circulating in these specific groups; for this we used a fragment of the PreS2/2 region of the HBV genome. Subsequently whole HBV genome sequences were used for Bayesian analysis of phylodynamics and phylogeography. Two main genotypes were found: genotype A (54.5%) and genotype F (45.5%). There was a difference in the distribution of genotypes according to risk groups: 72.9% of high risk groups were associated to genotype A, and 55.0% of samples of genotype F were associated to the low risk group (p<0.002). The Bayesian analysis of phylogeny-traits association revealed a statistically significant geographical association (p<0.0001) with both genotypes and different regions of the country. The Bayesian time of most recent common ancestor analysis (tMRCA) revealed a recent tMRCA for genotype A2 circulating in Panama (1997, 95% HPD: 1986—2005), when it is compared with Panamanian genotype F1c sequences (1930, 95% HPD: 1810 – 2005). These results suggest a possible change in the distribution of HBV genotypes in Panama and Latin America as a whole. They also serve to encourage the implementation of vaccination programs in high-risk groups, in order to prevent an increase in the number of new HBV cases in Latin America and worldwide.</p></div

Bayesian phylogeny-traits association results, according to risk behavior group and geographic location.

<p>Abbreviations: Association index (AI), parsimony score (PS), and monophyletic clade (MC), Highest posterior density (HPD), confidence interval (CI). For the MC statistic the corresponding trait is indicated between parentheses, for p value calculation the desired level of significance was ≤0.05.</p><p>Bayesian phylogeny-traits association results, according to risk behavior group and geographic location.</p

Map of Panama indicating the origin of the HBV sequences analyzed in this study.

<p>The number of sequences according to the genotype is indicated in the top left pie chart, the middle bar plot indicates the number of genotypes according to geographic area. Pie charts within the map are sized by the proportion of sub-genotype found in the corresponding region.</p

Genotype distribution of the HBV sequences evaluated according to risk behavior group, geographic location and the mutations found in BCP, X/PreC and Polymerase.

<p>Data are: Number (%)</p><p>* This number represent the total of samples successfully amplified.</p><p>^&Chiriqui, Bocas del toro, Ngobe Bugle.</p><p>^$$Los Santos, Cocle.</p><p>°Commercial sex workers</p><p>°°Men that have sex with Men.</p><p>^&Exact-Fisher test statistic.</p><p>**Double mutation 1762T/1764.</p><p>*** Any combination of mutations: 1613A, 1653T, 1846T, 1896, 1899A as suggested by Park et al (49).</p><p>****All the subjects with resistance mutation were HIV positive.</p><p>Genotype distribution of the HBV sequences evaluated according to risk behavior group, geographic location and the mutations found in BCP, X/PreC and Polymerase.</p

Estimated of tMRCA and substitution rate for Genotype A and F, with the HBV Whole genome of the Panamanian samples.

<p>Abbreviations: tMRCA, mean time to the most recent common ancestor; 95% HPD, 95% highest posterior density; subs/site/year, substitutions per site year.</p><p>Estimated of tMRCA and substitution rate for Genotype A and F, with the HBV Whole genome of the Panamanian samples.</p

Spatial dissemination of HBV genotypes across the world.

<p>Lines between countries represent sequences in which transition location occurs, and were supported by a significant non-zero rate (Bayes Factor >3). Map (a) is for genotype F (a), and map (b) for genotype A. Lines were colored according to the sub-genotype involved in the migration.</p