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Germination and sporophytic development of Regnellidium diphyllum Lindm. (Marsileaceae) in the presence of a glyphosate-based herbicide
Regnellidium diphyllum is a vulnerable heterosporous fern which occurs in the State of Rio Grande do Sul, Brazil, and in some neighboring localities in the State of Santa Catarina, in Uruguay and Argentina. The species grows in areas subjected to flooding and humid soils which frequently are alterated by agricultural activities. Agricultural fields are commonly treated with herbicides such as glyphosate. The effects of glyphosate on in vitro germination of megaspores and initial sporophytic development of R. diphyllum under aqueous conditions were investigated. Six glyphosate concentrations (0.32, 0.64, 1.92, 4.80, 9.60 and 19.20 mg/L) and the control (0.00 mg/L) were tested using Meyer’s medium. Cultures were maintained in vitro in a growth chamber at 24±1oC and 16 hours photoperiod for five weeks. Megaspore germination was significantly reduced (67% and lower) in concentrations of 4.80 mg/L onwards compared with the control (81%), while the sporophyte formation was negatively influenced even at the lowest concentration tested (0.32 mg/L). The length of the primary root and primary and secondary leaves was significantly reduced at glyphosate concentrations of 4.80 mg/L onwards. Low concentrations of the herbicide did not affect the percentage of germination, although significantly interfered in the initial development of R. diphyllum. Concentrations of 9.60 and 19.20 mg/L inhibited the establishment of new plants. These results indicate that application of glyphosate to agricultural areas may have negative impacts on the vulnerable fern R. diphyllum.Regnellidium diphyllum é uma pteridófita heterosporada vulnerável, ocorrente no estado do Rio Grande do Sul, Brasil e em algumas localidades vizinhas no estado de Santa Catarina, no Uruguai e na Argentina. A espécie cresce em áreas alagáveis e solos úmidos que freqüentemente são alterados para atividades agrícolas. Campos de agricultura são comumente tratados com herbicidas como o glifosato. Os efeitos do glifosato sobre a germinação de megásporos e o desenvolvimento esporofítico inicial de R. diphyllum foram investigados. Seis concentrações de glifosato (0,32; 0,64; 1,92; 4,80; 9,60 e 19,20 mg/L) e o controle (0,00 mg/L), foram testados utilizando meio de Meyer. As culturas foram mantidas in vitro, em câmara de germinação a 24±1oC e fotoperíodo de 16 horas, por cinco semanas. A germinação de megásporos foi significantemente reduzida (67% e inferior) em concentrações de glifosato a partir de 4,80 mg/L, comparada ao controle (81%), enquanto que a formação de esporófitos foi negativamente influenciada mesmo na menor concentração testada (0,32 mg/L). Os comprimentos da raiz primária e das folhas primária e secundária foram significantemente reduzidos em concentrações de glifosato a partir de 4,80 mg/L. Baixas concentrações do herbicida não afetaram a porcentagen de germinação, embora tenham interferido significantemente no desenvolvimento inicial de R. diphyllum. Concentrações de 9,60 e 19,20 mg/L inibiram o estabelecimento de plantas novas. Esses resultados indicam que a aplicação de glifosato em áreas de agricultura pode ter impactos negativos sobre a pteridófita vulnerável R. diphyllum
The genus Thelypteris (Thelypteridaceae, Polypodiopsida) in the state of Mato Grosso, Brazil, II. Subgenera Amauropelta (Kunze) A.R. Sm., Cyclosorus (Link) C.V. Morton and Steiropteris (C. Chr.) K. Iwats.
The family Thelypteridaceae presents considerable species richness throughout the hillside forests and coastal plains of Brazil, as well as in the forests of its southern plateau. This study was based on material collected in 24 trips to various regions within the state of Mato Grosso, as well as material deposited in the principal Brazilian herbaria and in other herbaria. The genus Thelypteris, represented in this study by the subgenera Amauropelta (Kunze) A.R. Sm., Cyclosorus (Link) Morton and Steiropteris (C. Chr.) K. Iwats., comprises 11 species in Mato Grosso and surrounding regions. Keys for identification, descriptions and references to illustrations of diagnostic characters are presented.Fil: Ponce, Marta Monica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica Darwinion (i); Argentina;Fil: Kieling-Rubio, Maria Angélica. Universidade FEEVALE; Brasil;Fil: Windisch, Paulo Günter. Universidade Federal Do Rio Grande Do Sul. Programa de Pós-Graduação em Botânica; Brasil
Diversity of ferns and lycophytes in Brazil
This compilation of ferns and lycophytes in Brazil is an update of the one published in 2010 in Catálogo de Plantas e Fungos do Brasil. The methodology consisted in collecting data from regional checklists, taxonomic revisions, and selected databases. Invited specialists improved the list accessing a website housed at the Jardim Botânico do Rio de Janeiro. The results show 1,253 species: 1,111 of ferns and 142 of lycophytes. This number is 6.5% higher than the previous one (1,176 spp.). The percentage of endemic species decreased from 38.2% to 36.7%. We recognized 36 families and 133 genera (vs. 33 families, 121 genera in 2010). The 10 most diverse families are Pteridaceae (196 spp.), Dryopteridaceae (179), Polypodiaceae (164), Hymenophyllaceae (90), Thelypteridaceae (86), Aspleniaceae (78), Lycopodiaceae (64), Selaginellaceae (55), Anemiaceae (51), and Cyatheaceae (45). The three most diverse genera are still Elaphoglossum (87 spp.), Thelypteris (85), and Asplenium (74). The richest phytogeographic domain continues to be in the Atlantic Rainforest with 883 species which also has the largest number of endemic and threatened species, followed by the Amazon Rainforest (503), Cerrado (269), Pantanal (30), Caatinga (26), and Pampa (eight). Minas Gerais remains as the richest state (657 spp. vs. 580 in 2010).Esta compilação de samambaias e licófitas do Brasil é uma atualização daquela de 2010, no Catálogo de Plantas e Fungos do Brasil. A metodologia consistiu na reunião de dados de listas regionais, revisões de grupos e bancos de dados selecionados. Especialistas convidados melhoraram a lista através do acesso a um sítio da web do Jardim Botânico do Rio Janeiro. Os resultados apontam uma diversidade de 1.253 espécies, sendo 1.111 samambaias e 142 licófitas. Este número é 6,5% maior que o anterior (1.176 espécies). As espécies endêmicas decresceram de 38,2% para 36,7%. Foram reconhecidas 36 famílias e 133 gêneros (vs. 33 famílias, 121 gêneros em 2010). As dez famílias mais diversas são: Pteridaceae (196 espécies), Dryopteridaceae (179), Polypodiaceae (164), Hymenophyllaceae (90), Thelypteridaceae (86), Aspleniaceae (78), Lycopodiaceae (64), Selaginellaceae (55), Anemiaceae (51) e Cyatheaceae (45). Os três gêneros mais diversos continuam sendo Elaphoglossum (87 espécies), Thelypteris (85) e Asplenium (74). O Domínio Fitogeográfico mais rico continua sendo a Mata Atlântica (883 espécies) e também com mais espécies endêmicas e ameaçadas, seguido pela Amazônia (503 espécies), Cerrado (269), Pantanal (30), Caatinga (26) e Pampa (oito). Minas Gerais permanece como o estado com maior riqueza (657 espécies vs. 580 em 2010)
AI is a viable alternative to high throughput screening: a 318-target study
: High throughput screening (HTS) is routinely used to identify bioactive small molecules. This requires physical compounds, which limits coverage of accessible chemical space. Computational approaches combined with vast on-demand chemical libraries can access far greater chemical space, provided that the predictive accuracy is sufficient to identify useful molecules. Through the largest and most diverse virtual HTS campaign reported to date, comprising 318 individual projects, we demonstrate that our AtomNet® convolutional neural network successfully finds novel hits across every major therapeutic area and protein class. We address historical limitations of computational screening by demonstrating success for target proteins without known binders, high-quality X-ray crystal structures, or manual cherry-picking of compounds. We show that the molecules selected by the AtomNet® model are novel drug-like scaffolds rather than minor modifications to known bioactive compounds. Our empirical results suggest that computational methods can substantially replace HTS as the first step of small-molecule drug discovery
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