A Comprehensive Pan-Cancer Molecular Study of Gynecologic and Breast Cancers

We analyzed molecular data on 2,579 tumors from The Cancer Genome Atlas (TCGA) of four gynecological types plus breast. Our aims were to identify shared and unique molecular features, clinically significant subtypes, and potential therapeutic targets. We found 61 somatic copy-number alterations (SCNAs) and 46 significantly mutated genes (SMGs). Eleven SCNAs and 11 SMGs had not been identified in previous TCGA studies of the individual tumor types. We found functionally significant estrogen receptor-regulated long non-coding RNAs (lncRNAs) and gene/lncRNA interaction networks. Pathway analysis identified subtypes with high leukocyte infiltration, raising potential implications for immunotherapy. Using 16 key molecular features, we identified five prognostic subtypes and developed a decision tree that classified patients into the subtypes based on just six features that are assessable in clinical laboratories. By performing molecular analyses of 2,579 TCGA gynecological (OV, UCEC, CESC, and UCS) and breast tumors, Berger et al. identify five prognostic subtypes using 16 key molecular features and propose a decision tree based on six clinically assessable features that classifies patients into the subtypes

РЕКОМЕНДАЦИИ ПО ВЕДЕНИЮ ПЕРВИЧНЫХ ПАЦИЕНТОВ С СИМПТОМАМИ ДИСПЕПСИИ

Aim: To develop evidence-based recommendations for primary care physicians and general practitioners (GP) on choosing the proper management tactics and making valuable & quick diagnostic decisions at outpatient phase for patients with symptoms of dyspepsia, and also reveal possible oncology on time. Summary of recommendations: Approximately 40% of the patients in Russia presenting to primary care with symptoms of dyspepsia. A doctor has to focus on the warning signs, which may require an urgent additional examination & the consultation with a surgeon/onco-surgeon or other specialists if required. With regard to a risk of cancer, a doctor should be more cautious in patients over 45 years of age. Early diagnosis of oncology depends mainly on cautiousness of GP, primary care physicians and their knowledge, future tactics with regard to the patients. From the mandatory diagnostic tests during the first visit, esophagogastroduodenoscopy and H. pylori diagnostics helps to exclude any organic esophagus and stomach pathology, possible oncology. While waiting for endoscopy results, a physician should use the preliminary diagnoses “Uninvestigated Dyspepsia” (ICD-10 К 31.9) (disease of stomach and duodenum, unspecified). After exclusion of all warning signs, therapy of dyspepsia should be in accordance to the order of the Ministry of Health No 248 which gives an option to use proton pump inhibitors (omeprazole or rabeprazole 20 mg daily) in combination with prokinetic (domperidone 30 mg daily). Fixed drug combination of omeprazole 20 mg and modified-release domperidone 30 mg/daily (Omez® DSR) is medically reasonable. Conclusion: The introduction of this recommendation into clinical practice will help clinicians to prevent diagnostic mistakes, unreasonable use of expensive diagnostic examinations and inappropriate treatment leads to improvement in the overall prognosis and quality of life for the patients.Цель. Представить рекомендации диагностики и лечения пациентов с симптомами диспепсии на этапе амбулаторно-поликлинической помощи, обобщающие зарубежный и отечественный опыт ведения данной категории больных. Основная цель рекомендаций - помочь терапевту и врачу общей практики (ВОП) на амбулаторном этапе принять правильное решение о тактике ведения больного, и в максимально короткий срок поставить правильный диагноз, а также вовремя выявить у пациента наличие онкологической патологии. Основные положения. Около 40% обращений пациентов на амбулаторно-поликлиническом приеме в России связано с симптомами диспепсии. Врач, в первую очередь, должен исключить наличие «тревожных признаков», которые требуют незамедлительного дополнительного обследования пациента, привлечения хирурга и/или других специалистов и госпитализации больного. Доктор должен иметь онкологическую настороженность, особенно, при обращении пациентов в возрасте 45 лет и старше, так как ранняя диагностика злокачественных новообразований (ЗНО) зависит главным образом от онкологической настороженности терапевтов, врачей общей практики и их знаний, дальнейшей тактики в отношении больного. Эзофагогастродуоденоскопия и тесты на H. pylori являются обязательными методами исследования на этапе диагностического поиска и позволяют исключить органические заболевания пищевода и желудка, наличие онкологии. До получения результатов эндоскопического исследования следует выставлять предварительный диагноз «Диспепсия Неуточненная» и шифровать под рубрикой МКБ-10 К 31.9 (болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки неуточненная). После исключения «тревожных признаков» терапия диспепсии проводится согласно Приказу МЗ РФ № 248 и включает назначение ингибиторов протонной помпы (омепразол или рабепразол 20 мг/сут) в комбинации с прокинетиком (домперидон 30 мг/сут). Оправдано применение фиксированной комбинации омепразола 20 мг с домперидоном модифицированного высвобождения 30 мг/сут (Омез® ДСР). Заключение. Внедрение рекомендаций в клиническую практику поможет врачу избежать ошибок при постановке диагноза, применения необоснованных и нередко дорогостоящих методов обследования, нерационального лечения, что позволит улучшить прогноз и качество жизни пациентов

Metabolism and biomass vertical distribution of zooplankton in the Bransfield Strait (Antarctic Peninsula) during summer

Publicado

РЕКОМЕНДАЦИИ ПО ВЕДЕНИЮ ПЕРВИЧНЫХ ПАЦИЕНТОВ С СИМПТОМАМИ ДИСПЕПСИИ

Aim: To develop evidence-based recommendations for primary care physicians and general practitioners (GP) on choosing the proper management tactics and making valuable & quick diagnostic decisions at outpatient phase for patients with symptoms of dyspepsia, and also reveal possible oncology on time. Summary of recommendations: Approximately 40% of the patients in Russia presenting to primary care with symptoms of dyspepsia. A doctor has to focus on the warning signs, which may require an urgent additional examination & the consultation with a surgeon/onco-surgeon or other specialists if required. With regard to a risk of cancer, a doctor should be more cautious in patients over 45 years of age. Early diagnosis of oncology depends mainly on cautiousness of GP, primary care physicians and their knowledge, future tactics with regard to the patients. From the mandatory diagnostic tests during the first visit, esophagogastroduodenoscopy and H. pylori diagnostics helps to exclude any organic esophagus and stomach pathology, possible oncology. While waiting for endoscopy results, a physician should use the preliminary diagnoses “Uninvestigated Dyspepsia” (ICD-10 К 31.9) (disease of stomach and duodenum, unspecified). After exclusion of all warning signs, therapy of dyspepsia should be in accordance to the order of the Ministry of Health No 248 which gives an option to use proton pump inhibitors (omeprazole or rabeprazole 20 mg daily) in combination with prokinetic (domperidone 30 mg daily). Fixed drug combination of omeprazole 20 mg and modified-release domperidone 30 mg/daily (Omez® DSR) is medically reasonable. Conclusion: The introduction of this recommendation into clinical practice will help clinicians to prevent diagnostic mistakes, unreasonable use of expensive diagnostic examinations and inappropriate treatment leads to improvement in the overall prognosis and quality of life for the patients.Цель. Представить рекомендации диагностики и лечения пациентов с симптомами диспепсии на этапе амбулаторно-поликлинической помощи, обобщающие зарубежный и отечественный опыт ведения данной категории больных. Основная цель рекомендаций - помочь терапевту и врачу общей практики (ВОП) на амбулаторном этапе принять правильное решение о тактике ведения больного, и в максимально короткий срок поставить правильный диагноз, а также вовремя выявить у пациента наличие онкологической патологии. Основные положения. Около 40% обращений пациентов на амбулаторно-поликлиническом приеме в России связано с симптомами диспепсии. Врач, в первую очередь, должен исключить наличие «тревожных признаков», которые требуют незамедлительного дополнительного обследования пациента, привлечения хирурга и/или других специалистов и госпитализации больного. Доктор должен иметь онкологическую настороженность, особенно, при обращении пациентов в возрасте 45 лет и старше, так как ранняя диагностика злокачественных новообразований (ЗНО) зависит главным образом от онкологической настороженности терапевтов, врачей общей практики и их знаний, дальнейшей тактики в отношении больного. Эзофагогастродуоденоскопия и тесты на H. pylori являются обязательными методами исследования на этапе диагностического поиска и позволяют исключить органические заболевания пищевода и желудка, наличие онкологии. До получения результатов эндоскопического исследования следует выставлять предварительный диагноз «Диспепсия Неуточненная» и шифровать под рубрикой МКБ-10 К 31.9 (болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки неуточненная). После исключения «тревожных признаков» терапия диспепсии проводится согласно Приказу МЗ РФ № 248 и включает назначение ингибиторов протонной помпы (омепразол или рабепразол 20 мг/сут) в комбинации с прокинетиком (домперидон 30 мг/сут). Оправдано применение фиксированной комбинации омепразола 20 мг с домперидоном модифицированного высвобождения 30 мг/сут (Омез® ДСР). Заключение. Внедрение рекомендаций в клиническую практику поможет врачу избежать ошибок при постановке диагноза, применения необоснованных и нередко дорогостоящих методов обследования, нерационального лечения, что позволит улучшить прогноз и качество жизни пациентов

A Comprehensive Pan-Cancer Molecular Study of Gynecologic and Breast Cancers

We analyzed molecular data on 2,579 tumors from The Cancer Genome Atlas (TCGA) of four gynecological types plus breast. Our aims were to identify shared and unique molecular features, clinically significant subtypes, and potential therapeutic targets. We found 61 somatic copy-number alterations (SCNAs) and 46 significantly mutated genes (SMGs). Eleven SCNAs and 11 SMGs had not been identified in previous TCGA studies of the individual tumor types. We found functionally significant estrogen receptor-regulated long non-coding RNAs (lncRNAs) and gene/lncRNA interaction networks. Pathway analysis identified subtypes with high leukocyte infiltration, raising potential implications for immunotherapy. Using 16 key molecular features, we identified five prognostic subtypes and developed a decision tree that classified patients into the subtypes based on just six features that are assessable in clinical laboratories. By performing molecular analyses of 2,579 TCGA gynecological (OV, UCEC, CESC, and UCS) and breast tumors, Berger et al. identify five prognostic subtypes using 16 key molecular features and propose a decision tree based on six clinically assessable features that classifies patients into the subtypes