Mass spectrometry based protein profiling : taking the steps towards clinical application

  In this thesis mass spectrometry based protein profiling was applied as a new biomarker screening modality and it was evaluated whether or not this could be translated into early detection of breast cancer and pancreatic cancer. The status of breast cancer screening by proteomic profiling is discussed. Which steps have already been made? What is essential to implement this techniques in a clinical setting? Furthermore, the new protein profiling screening methods for pancreatic cancers are evaluated. Future studies will be suggested that are needed to translate this promising biomarker into a clinical application.  Abbie; Fagron; Chipsoft; GaldermaLUMC / Geneeskund

Hoe gevoelig is de Nederlandse natuur voor verzilting

Door klimaatverandering, zeespiegelstijging, bodemdaling en veranderingen in het waterbeleid zal verzilting van grond- en oppervlaktewater toenemen. Vormt zilt water een bedreiging of biedt het mogelijkheden voor hoogwaardige natuur? Dit artikel geeft de resultaten weer van een verkennende studie naar de gevoeligheid voor verzilting van natuur in laag-Nederland. Gegevens over zouttolerantie van soorten en levensgemeenschappen blijken schaars. Vaak gaat het om (kwalitatief) deskundigenoordeel. Een robuuste normering voor het water- en natuurbeheer, die rekening houdt met de gevoeligheid van levensgemeenschappen voor verzilting, is wenselijk. Het systeem van zoutgetallen volgens Ellenberg biedt een basis om de gevoeligheid van vegetatietypen voor verzilting te kwantificeren en chloridenormen voor natuurdoeltypen af te leide

GO-FRESH: Valorisatie kansrijke oplossingen voor een robuuste zoetwatervoorziening

Een consortium onderzoekt in hoeverre lokale maatregelen de zoetwaterbeschikbaarheid voor de landbouw kunnen vergroten in gebieden die onafhankelijk zijn van het hoofdwatersysteem. Hierbij wordt de ondergrond gebruikt voor opslag van zoet water in periodes van wateroverschot, om het water vervolgens te gebruiken in droge tijden. Het betreft een Kennis voor Klimaat project in de Zuidwestelijke Delta

Proteomic Serum Biomarkers and Their Potential Application in Cancer Screening Programs

Early diagnosis of cancer is of pivotal importance to reduce disease-related mortality. There is great need for non-invasive screening methods, yet current screening protocols have limited sensitivity and specificity. The use of serum biomarkers to discriminate cancer patients from healthy persons might be a tool to improve screening programs. Mass spectrometry based proteomics is widely applied as a technology for mapping and identifying peptides and proteins in body fluids. One commonly used approach in proteomics is peptide and protein profiling. Here, we present an overview of profiling methods that have the potential for implementation in a clinical setting and in national screening programs

Methode voor het bepalen van de potentie voor het toepassen van lokale zoetwateroplossingen : Fresh Water Options Optimizer - fase 1

Binnen Kennis voor Klimaat worden kleinschalige maatregelen ontwikkeld om de zoetwatervoorziening te verbeteren. In deze studie zijn methoden ontwikkeld waarmee de potentie van dergelijke maatregelen op het schaalniveau van een groter gebied, voor hoog en laag Nederland, kan worden verkend. In deze studie zijn de opschalingsmogelijkheden bekeken voor de volgende lokale zoetwateroplossingen: (1) drains2buffer, (2) regelbare en klimaatadaptieve drainage, (3) kreekruginfiltratie, (4) Freshmaker, (5) verticale ASR, (6) waterconservering door stuwen en (7) waterconservering door slootbodemverhoging

Mogelijke effecten van actualisatie van zoutschadefuncties van grondgebonden, beregende landbouwgewassen

De derving van de fysieke opbrengst van grondgebonden teelten die kunnen worden beregend wordt deels bepaald door het zoutgehalte van het beregeningswater. De kennis op grond waarvan deze opbrengstderving wordt berekend is gebaseerd op veelal buitenlands onderzoek uit de jaren vijftig van de vorige eeuw in andere klimaatzones. Deze methodiek blijkt op basis van recente resultaten van veldproeven en praktijkervaringen niet toepasbaar op de Nederlandse situatie, maar dat gebeurt desondanks nog wel. Recente resultaten van Nederlandse veldproeven en praktijkervaringen tonen aan dat de zouttolerantie van gewassen als aardappelen, suikerbieten en gras aanzienlijk groter is dan gedacht op basis van buitenlands onderzoek. Dit zou moeten leiden tot bijgestelde zouttolerantiefuncties voor deze - en wellicht ook andere - gewassen. Om een indruk te geven wat de effecten van een bijstelling van de zouttolerantie-functies op de berekende opbrengst zouden kunnen zijn heeft een consortium, bestaande uit Alterra, De Bakelse Stroom, Deltares, Acacia Water, LEI en het Zilt Proefbedrijf Texel hiernaar een ruimtelijke verkenning uitgevoerd. Gewasopbrengten zijn per waterschap/regio in laag Nederland berekend met de anno 2013 gehanteerde, en met bijgestelde (lees: ‘tolerantere’) zouttolerantiefuncties. In de analyse is de berekende derving van de gewasopbrengst alleen bepaald door zout in beregeningswater. Voor laag Nederland werd het 10% droge jaar 1989 doorgetrokken naar ‘warm’ 2050 (W+). Op basis hiervan is een eerste schatting gemaakt van de verandering van de modelmatige opbrengst (i.c. een toename) van €60 miljoen/jaar. Dit resultaat geeft aan dat er sprake is van handelingsruimte in het (toekomstige) zoetwaterbeheer. Geadviseerd wordt om de zouttolerantiefuncties van landbouwgewassen te actualiseren, en om te kijken naar mogelijke consequenties voor de inrichting en het beheer van onze zoetwateraanvoersystemen

Reliability of Wearable-Sensor-Derived Measures of Physical Activity in Wheelchair-Dependent Spinal Cord Injured Patients

Physical activity (PA) has been shown to have a positive influence on functional recovery in patients after a spinal cord injury (SCI). Hence, it can act as a confounder in clinical intervention studies. Wearable sensors are used to quantify PA in various neurological conditions. However, there is a lack of knowledge about the inter-day reliability of PA measures. The objective of this study was to investigate the single-day reliability of various PA measures in patients with a SCI and to propose recommendations on how many days of PA measurements are required to obtain reliable results. For this, PA of 63 wheelchair-dependent patients with a SCI were measured using wearable sensors. Patients of all age ranges (49.3 ± 16.6 years) and levels of injury (from C1 to L2, ASIA A-D) were included for this study and assessed at three to four different time periods during inpatient rehabilitation (2 weeks, 1 month, 3 months, and if applicable 6 months after injury) and after in-patient rehabilitation in their home-environment (at least 6 months after injury). The metrics of interest were total activity counts, PA intensity levels, metrics of wheeling quantity and metrics of movement quality. Activity counts showed consistently high single-day reliabilities, while measures of PA intensity levels considerably varied depending on the rehabilitation progress. Single-day reliabilities of metrics of movement quantity decreased with rehabilitation progress, while metrics of movement quality increased. To achieve a mean reliability of 0.8, we found that three continuous recording days are required for out-patients, and 2 days for in-patients. Furthermore, the results show similar weekday and weekend wheeling activity for in- and out-patients. To our knowledge, this is the first study to investigate the reliability of an extended set of sensor-based measures of PA in both acute and chronic wheelchair-dependent SCI patients. The results provide recommendations for sensor-based assessments of PA in clinical SCI studies

Methode voor het selecteren van lokale zoetwateroplossingen en het afwegen van hun effecten "Fresh Water Options Optimizer"

Binnen Kennis voor Klimaat worden kleinschalige oplossingen ontwikkeld om de zoetwatervoorziening te verbeteren. In deze studie zijn de mogelijkheden voor opschaling onderzocht. Het gaat om de oplossingen (1) drains2buffer (D2B), (2) regelbare en klimaatadaptieve drainage (RD/KAD), (3) kreekruginfiltratie (KRI), (4) freshmaker (FM), (5) verticale ASR (VASR), (6) waterconservering door stuwen (WCST) en (7) waterconservering door slootbodemverhoging (WCSB)

Is it possible to assess the effects of dynamic arm supports on upper extremity range of motion during activities of daily living in the domestic setting using a portable motion capturing device? - A pilot study

BACKGROUND: Understanding how dynamic arm supports affect the ability to perform activities of daily living (ADL) in daily life situations is essential for improved prescription. OBJECTIVE: To determine whether the newly developed MMAAS is a useful tool to assess the RoM at home. Secondly, to investigate differences in RoM and ADL performance with and without dynamic arm support. METHODS: Five dynamic arm support users performed nine activities with and without dynamic arm support at home. A reference group of five participants was included. Shoulder and elbow RoM were assessed for the three most difficult tasks. RESULTS: The measurement of the elbow joint RoM appeared unreliable. In most participants shoulder RoM increased with dynamic arm support, but the magnitude of change differed. Variation was also found regarding whether people could perform ADL with and without support. CONCLUSIONS: In its current state the MMAAS is not regarded a useful tool for assessing the RoM in the domestic setting. The ability to perform ADL and RoM seem influenced by the environment, users' needs and abilities. Future studies investigating effects and benefits of dynamic arm supports should be conducted in a broader daily life context

Serum peptide signatures for pancreatic cancer based on mass spectrometry: a comparison to CA19-9 levels and routine imaging techniques

Cellular mechanisms in basic and clinical gastroenterology and hepatolog