Conserved principles of mammalian transcriptional regulation revealed by RNA half-life

RNA levels in a cell are regulated by the relative rates of RNA synthesis and decay. We recently developed a new approach for measuring both RNA synthesis and decay in a single experimental setting by biosynthetic labeling of newly transcribed RNA. Here, we show that this provides measurements of RNA half-lives from microarray data with a so far unreached accuracy. Based on such measurements of RNA half-lives for human B-cells and mouse fibroblasts, we identified conserved regulatory principles for a large number of biological processes. We show that different regulatory patterns between functionally similar proteins are characterized by differences in the half-life of the corresponding transcripts and can be identified by measuring RNA half-life. We identify more than 100 protein families which show such differential regulatory patterns in both species. Additionally, we provide strong evidence that the activity of protein complexes consisting of subunits with overall long transcript half-lives can be regulated by transcriptional regulation of individual key subunits with short-lived transcripts. Based on this observation, we predict more than 100 key regulatory subunits for human complexes of which 28% could be confirmed in mice (P < 10−9). Therefore, this atlas of transcript half-lives provides new fundamental insights into many cellular processes

SISTEM INFERENSI FUZZY MAMDANI UNTUK SISTEM PENDUKUNG KEPUTUSAN PEMILIHAN KARYAWAN BERPRESTASI (STUDI KASUS PT.KREASI KODE)

Pemilihan karyawan berprestasi sebagai alat yang berguna untuk memotivasi kinerja karyawan, untuk itu perlu dibangun sebuah sistem yang bisa membantu mempermudah pengambilan keputusan yang terbaik berdasarkan kriteria yang ada sehingga bisa terpilih karyawan berprestasi secara cepat dan akurat. Objek penelitian berada di PT. Kreasi Kode yang berlokasi di daerah Condongcatur, Kabupaten Sleman, Yogyakarta. Untuk menyelesaikan masalah tersebut maka dibuat sistem pendukung keputusan yang menerapkan metode fuzzy. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menerapkan metode Mamdani dalam pengambilan keputusan pemilihan karyawan berprestasi. Pada penelitian ini digunakan metode Mamdani atau yang biasa disebut metode Min-Max. Untuk mendapatkan keluaran atau output dari metode ini diperlukan 4 tahapan yakni; Pembentukan himpunan fuzzy, fungsi implikasi, komposisi aturan, dan defuzzifikasi. Variabel input yang digunakan untuk perhitungan metode ini adalah disiplin, tanggungjawab, planningskill. Sedangkan untuk variabel outputnya adalah prestasi. Penelitian ini menghasilkan sistem yang mampu menerapkan salah satu dari Fuzzy Inference System menggunakan metode Mamdani untuk membantu Kepala Kantor PT. Kreasi Kode dalam menentukan karyawan berprestasi