Diversificación evolutiva de los genes de catepsinas en vertebrados

Paralogous genes are a clear example of duplications and source of diversification in the evolution of the genomes of living beings. Here we addressed CTS genes that give rise to the proteolytic enzymes called cathepsins. After a thorough search in bibliographic databases and molecular sequences we found information about these genes is confusing. In order to identify the processes involved in their evolutionary diversification since the origin of terrestrial vertebrates to the present we analysed the phylogenetic relationships between the amino acid sequences of cathepsins. The species included in this study belong mainly to some specific taxa such as Mammals (Primates, Rodents, Ungulates, Carnivora and Marsupials), Birds and Bony Fishes. In general terms, among the 32 genes found in vertebrates, at least 4 of them have arisen due to duplications subsequent to the colonization of the terrestrial environment and 2 of them seem  to have been  lost in  the lineage of the Birds. Other modifications observed are mainly due to mutations such as amino acid substitutions or insertions/deletions (indels).Los genes parálogos son un claro ejemplo de duplicaciones y fuente de diversificación en la evolución de los genomas de los seres vivos. Como muestra de ello, se ha llevado a cabo un estudio de los genes CTS, que dan lugar a las enzimas proteolíticas llamadas catepsinas. Tras la búsqueda en bases de datos bibliográficas y de secuencias moleculares, se ha intentado clarificar la confusa información sobre estos genes y analizar las relaciones filogenéticas entre las secuencias aminoacídicas de estas proteínas con el fin de identificar los procesos que han podido intervenir en su diversificación evolutiva desde el origen de los vertebrados terrestres hasta la actualidad. Las especies incluidas en este estudio pertenecen principalmente a algunos taxones concretos como mamíferos (Primates, Rodentia, Ungulata, Carnivora y Marsupialia), aves y peces óseos. En términos generales, puede decirse que, de los 32 genes encontrados en vertebrados, al menos 4 de ellos han surgido por duplicaciones posteriores a la colonización del medio terrestre y 2 de ellos parecen haberse perdido en el linaje de las aves. Otras modificaciones observadas son debidas principalmente a mutaciones como las sustituciones de aminoácidos o las inserciones/deleciones (indels)

Phylogenetic triangulation: Using predator-prey-parasite interactions to infer population history from partial genetic information

Phylogeographic studies, which infer population history and dispersal movements from intra-specific spatial genetic variation, require expensive and time-consuming analyses that are not always feasible, especially in the case of rare or endangered species. On the other hand, comparative phylogeography of species involved in close biotic interactions may show congruent patterns depending on the specificity of the relationship. Consequently, the phylogeography of a parasite that needs two hosts to complete its life cycle should reflect population history traits of both hosts. Population movements evidenced by the parasite's phylogeography that are not reflected in the phylogeography of one of these hosts may thus be attributed to the other host. Using the wild rabbit (Oryctolagus cuniculus) and a parasitic tapeworm (Taenia pisiformis) as an example, we propose comparing the phylogeography of easily available organisms such as game species and their specific heteroxenous parasites to infer population movements of definitive host/predator species, independently of performing genetic analyses on the latter. This may be an interesting approach for indirectly studying the history of species whose phylogeography is difficult to analyse directly

Uso de virtualización como apoyo social para el alumno de informática del Grado de Biología

El presente trabajo muestra el diseño curricular desarrollado para la implantación efectiva de la asignatura de Informática dentro de la titulación del Grado de Biología en la Universidad de Málaga. Esta asignatura se enmarca en el contexto del Espacio Europeo de Educación Superior. Se trata de una asignatura de carácter interdisciplinar impartida por 3 áreas de conocimiento. Con el objetivo de que el alumno perciba la asignatura como una única entidad se plantea la incorporación de técnicas de educación virtual en un entorno común. Adicionalmente, esto permitirá que el alumno pueda seguirla usando los recursos suministrados, que realice las prácticas y pruebas de conocimiento programadas, y que pueda conocer el estado de su progresión en la asignatura mediante el libro de calificaciones actualizado en tiempo real. Todo esto supone un refuerzo y un apoyo social al trabajo realizado por el alumno y a la organización del mismo por parte de dicho alumno.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Experiencias de una red docente: aprendizaje significativo en ciencias y tecnología mediante gamificación

En el aprendizaje de los contenidos de materias científico-técnicas es especialmente importante la motivación del estudiante mediante referencias y ejercicios de casos reales donde se trata de reducir la memorización de muchos conceptos reforzando el aprendizaje significativo. De este modo, el método de aprendizaje significativo basado en gamificación se lleva a cabo mediante el uso de técnicas, elementos y dinámicas propias de los juegos y el ocio en actividades docentes con el fin de potenciar la motivación, así como de reforzar la conducta para solucionar problemas, mejorar la productividad, obtener objetivos, activar el aprendizaje y evaluar a los alumnos. En esta comunicación se explicará el proceso de puesta en común, diseño, desarrollo y evaluación de las experiencias de una Red Docente que ha empleado la gamificación como metodología para conseguir el aprendizaje significativo de los alumnos. La acción se ha llevado a cabo en las asignaturas de segundo cuatrimestre en los Estudios de Grado de Química, Biología, Ciencias Ambientales, Ingeniería de la salud, Bioquímica e Ingeniería de Telecomunicación de la Universidad de Málaga que imparten los profesores que componen la Red Docente. Para llevarla a cabo los profesores han conseguido una ayuda para fomentar la creación e implantación de redes docentes de excelencia gracias al Plan Propio Integral de Docencia de la Universidad de Málaga.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Revista de Vertebrados de la Estación Biológica de Doñana

Página 298 con error de impresiónEstudio cariológico en dos especies de Serránidos del Mediterráneo (Peces: PerciformesRelaciones morfométricas de Atherina boyeri Risso (Pisces: Atherinidae) de la laguna de Zoñar (Córdoba, España)Contribución al conocimiento de la biometríay osteología de Barbus barbus bocagei, Steindachner, 1866 (Pisces: CyprinidaeLa actividad de la salamandra, Salamandra salamandra (L.), en Galicia.Estudios sobre el sapo corredor (Bufo calamita) en el Sur de España.1. BiometríaEstudios sobre el sapo corredor (Bufo calamita) en el Sur de España. II. AlimentaciónBiología de la reproducción de Rana iberica Boulenger 1879 en zonas simpátridas con Rana temporaria Linneo, 1758Nuevos datos sobre la distribución geográfica de Lacerta monticola cantabrica Mertens, 1929. (Sauria, lacertidae).Datos sobre Lacerta monticola Boulenger, 1905 (Saurio: lacertidae)en el oeste del Sistema Central.Nueva especie de Anolis (lacertilia, Iguanidae) para CubaEtograma cuantificado del cortejo en Falco naumannOntogénesis del comportamiento predador en Falco naumanniContaminación xenobiótica del Parque Nacional de Doñana. 1. Residuos de insecticidas organoclorados, bifenilos policlorados y mercurio en anseriformes y gruiformesReproducción del críalo (Clamator glandarius) en Sierra Morena CentraNidificación de Picus viridis en taludes de arcilla en Ramblas de Guadix (Granada)Comportamiento del calamón Porphyrio porphyrio (Linnaeus, 1758) en Doñana, Marismas del GuadalquiviBiología y ecología de la malvasía (Oxyura leucocephala) en Andalucía.On the differential diet of Carnivora in islands:a method for analysing it and a particular case.Notas sobre la distribución pasada y actual del meloncillo Herpestes ichneumon (L.) en la Península IbéricaEstructuración de las interacciones en una camada de lobos (Canís lupus)Nuevos datos sobre la distribución del Cottus gobio L. (pisces, cottidae) en EspañaSobre la alimentación de Callopistes maculatus (Reptilia,teiidaeObservación de Lacerta lepida depredando un nido de Alectoris rufaNueva cita del galápago leproso Mauremys leprosa (Scheigger, 1812) en los pirineosPrimera cita de Psammodromus hispanicus (Fitzinger) para GaliciaSobre la presencia de Gallotia (=Lacerta) atlantica (Peters y Doria, 1882) en Gran CanariaNota sobre las Lacerta monticola Boulenger, 1905 de las zonas del norte de GaliciaPrimeras notas herpetológicas de la provincia de Soria.Datos sobre selección de hábitat y ecología alimenticia del porrón pardo (Aythya nyroca)Probable nueva área de cría del pechiazul (Luscinia svecica cyanecula) en el sistema central. PerisPredación de Falco peregrinus y Falco subbuteo sobre quirópterosResultados de la producción de Oxyura leucocephala en el año 1981 en las lagunas de Zóñar y el rincónAnálisis de la dieta de Tyto alba en un medio árido antropógeno de los alrededores de Almería¿Son Eudocimus ruber y E. albus distintas especies?EL Estornino pinto (Sturnus vulgaris) en Canarias: nueva especie nidifiante en el archipiélagoDatos sobre la alimentación otoñal del cárabo (Strix aluco) en la sierra de CádizObservación primaveral de rapaces y otras aves en el páramo del estado de Mérida (Venezuela).Murciélago hematófago (Desmodus rotundus) parasitando a un chigüire (Hidrochoerus hydrochaeris)Observaciones sobre la reproducción del zacatuche o teporinho Romerolagus diazi (Mammalia: lagomorpha)Estudio electroforético de hemoglobinas y esterasas sanguíneas en Rhinolophus ferrumequinum (Chiroptera: rhinolophidae) y de hemoglobinas en Tadaria taeniotis (chiroptera: molossidae)Peer reviewe

Chromosome complement, C-banding, Ag-NOR and replication banding in the zebrafishDanio reio

The chromosome complement ofDanio rerio was investigated by Giemsa staining and C-banding, Ag-NORs and replication banding. The diploid number of this species is 2n=50 and the arm number (NF)=100. Constitutive heterochromatin was located at the centromeric position of all chromosome pairs. Nucleolus organizer regions appeared in the terminal position of the long arms of chromosomes 1, 2 and 8. Replication banding pattern allowed the identification of each chromosome pair.Peer reviewe

Phylogeographic triangulation: using predator-prey-parasite interactions to infer population history from partial genetic information.

Phylogeographic studies, which infer population history and dispersal movements from intra-specific spatial genetic variation, require expensive and time-consuming analyses that are not always feasible, especially in the case of rare or endangered species. On the other hand, comparative phylogeography of species involved in close biotic interactions may show congruent patterns depending on the specificity of the relationship. Consequently, the phylogeography of a parasite that needs two hosts to complete its life cycle should reflect population history traits of both hosts. Population movements evidenced by the parasite's phylogeography that are not reflected in the phylogeography of one of these hosts may thus be attributed to the other host. Using the wild rabbit (Oryctolagus cuniculus) and a parasitic tapeworm (Taenia pisiformis) as an example, we propose comparing the phylogeography of easily available organisms such as game species and their specific heteroxenous parasites to infer population movements of definitive host/predator species, independently of performing genetic analyses on the latter. This may be an interesting approach for indirectly studying the history of species whose phylogeography is difficult to analyse directly

Poly(A) site choice during mRNA 3′-end formation in the Schizosaccharomyces pombe wos2 gene

In the fission yeast Schizosaccharomyces pombe, the wos2 gene encodes p23, a highly conserved protein which functions as a co-chaperone for the heat shock protein Hsp90. This p23 protein binds to Hsp90, but its activities and regulatory mechanisms are still unclear. Northern analysis has shown that the wos2 gene produces three transcripts of about 1.1, 0.9 and 0.8 kb, which are expressed differentially depending on the growth temperature. The largest and the smallest transcripts were most abundant at 25 degrees C, whereas the 0.9-kb transcript predominated at 37 degrees C. A time-course analysis indicated that this 0.9-kb species rapidly increased in abundance after a shift from 25 degrees C to 37 degrees C, reaching a maximum after 15 min. A shift back to 25 degrees C resulted in a decline in the amount of this transcript, albeit at a slower rate. Expression analysis of wos2:ura4 and nmt1:wos2 constructs showed that the 3' untranslated region of wos2 alone directs the formation of these multiple, discrete wos2 mRNAs. Sequence analysis of cDNAs derived from these mRNAs showed that the use of different polyadenylation sites results in the production of the three differently sized wos2 transcripts. In the case of the 0.9- and 0.8-kb mRNA species, these sites lie in a predicted hairpin loop in the mRNA, suggesting that polyadenylation signals in wos2 transcripts may be mediated by RNA secondary structure. The possibility that differential thermal stability of these hairpin structures could influence polyadenylation site choice during formation of the 3'-ends of the mRNAs is discussed.This work was supported by grants from the Spanish MEC (BMC2000-0124) and the Junta de Andalucía (CVI-146).Peer reviewe

Phylogenetic triangulation: Using predator-prey-parasite interactions to infer population history from partial genetic information

Phylogeographic studies, which infer population history and dispersal movements from intra-specific spatial genetic variation, require expensive and time-consuming analyses that are not always feasible, especially in the case of rare or endangered species. On the other hand, comparative phylogeography of species involved in close biotic interactions may show congruent patterns depending on the specificity of the relationship. Consequently, the phylogeography of a parasite that needs two hosts to complete its life cycle should reflect population history traits of both hosts. Population movements evidenced by the parasite's phylogeography that are not reflected in the phylogeography of one of these hosts may thus be attributed to the other host. Using the wild rabbit (Oryctolagus cuniculus) and a parasitic tapeworm (Taenia pisiformis) as an example, we propose comparing the phylogeography of easily available organisms such as game species and their specific heteroxenous parasites to infer population movements of definitive host/predator species, independently of performing genetic analyses on the latter. This may be an interesting approach for indirectly studying the history of species whose phylogeography is difficult to analyse directly

Geographic distribution of the analysed <i>Taenia pisiformis</i> individuals.

<p>Iberian Peninsula, the Azores archipelago and (shaded in grey) the regions of origin of the analysed sequences. Province initials correspond with those in <a href="http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0050877#pone-0050877-t001" target="_blank">Table 1</a>. The dashed line is the putative limit between the north-eastern and south-western Iberian rabbit (intermediate host) lineages <a href="http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0050877#pone.0050877-Branco2" target="_blank">[13]</a>.</p