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    Produção de proteínas quiméricas como bioferramentas no estudo da desintegrina e metaloprotease ADAM23

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    Orientador : Prof. Dr. Silvio Marques ZanataDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Defesa: Curitiba, 31/03/2015Inclui referências : f. 155-165Resumo: ADAM23 é uma proteína transmembrana, da família ADAM (A Disintegrin and Metalloprotease), altamente expressa em células neuronais, cujo papel biológico não está bem elucidado. Sabe-se que a ADAM23 está envolvida no processo de adesão celular em neuroblastomas através da interação com integrinas. Mecanismos de adesão celular envolvendo a ADAM23 humana, informações sobre o seu processamento intracelular e as propriedades do seu ectodomínio podem servir para a compreensão do papel estrutural e biológico dessa proteína. O presente estudo visou o desenvolvimento de vetores de expressão para a produção de quimeras protéicas constituídas pelo ectodomínio de ADAM23 e a região Fc de IgG humana (domínios CH2 e CH3). As quimeras serão utilizadas como bioferramentas no estudo do processamento de ADAM23 e da sua função na adesão e proliferação celular. Os fragmentos de nucleotídeos que codificam os resíduos 60-792 (ADAM23C1) e 287-792 (ADAM23C2) da ADAM23 humana foram clonados no vetor pINFUSE-hIgG1-Fc2 (secreção através do peptídeo sinal da IL-2) enquanto a sequência 1-792 foi clonada no vetor pcDNA3.1-hIgG1-Fc2 (secreção utilizando o peptídeo sinal da ADAM23). As três construções foram transfectadas nas linhagens N2A (neuroblastoma de camundongo), HEK-293T (rim humano) e CHO-K1 (ovário de hamster) e tanto os extratos celulares como os sobrenadantes de cultura foram analisados para a expressão das quimeras. A linhagem N2A apresentou a mais eficiente secreção das três proteínas quiméricas. As quimeras ADAM23C1 e ADAM23C2, foram adequadamente expressas e recuperadas dos sobrenadantes das culturas de células N2A e HEK-293T. A quimera ADAM23C3 (full-length do ecdomínio) foi identificada sempre na forma processada, indicando que seu peptídeo sinal foi reconhecido pelas maquinarias de secreção e processamento das células utilizadas. Diferentes métodos de purificação das quimeras foram comparados, sendo que a precipitação por sulfato de amônio mostrou-se ser o mais adequado, por aliar economicidade de recursos e retenção da estrutura da proteína. Paralelamente foi avaliada a expressão de ADAM23 em diferentes linhagens e tecidos, além do estabelecimento da localização celular das formas imatura e processada da ADAM23. Com a ajuda do anticorpo monoclonal DL11C8 foi possível determinar que a forma processada de ADAM23 (70 kDa) é a mais abundante no encéfalo de camundongos e é expressa na face externa da membrana plasmática da linhagem N2A. Estes dados mostram pela primeira vez que há uma baixa expressão da forma de 100 kDa (não-processada) no sistema nervoso, ao contrário do que foi observado em linhagens tumorais. A relevância da razão de expressão entre as formas imatura e processada para a função da ADAM23 no sistema nervoso, como a sua relevância na progressão do fenótipo tumoral merecem mais investigação. Palavras-chave: ADAM23. Ectodomínio. Desintegrina. Metaloprotease. Proteínas Fc quiméricas.Abstract: ADAM23 is a transmembrane protein, member of ADAM (A Disintegrin and Metalloprotease) family, highly expressed in neuronal cells, whose biological role is not yet totally elucidated. It is known that ADAM23 is involved in the cellular adhesion process in neuroblastoma. ADAM23 interacts with integrins promoting cell adhesion. However, ADAM23 full-involvement in cellular adhesion mechanisms remains to be established. The present study aimed for the development of biological tools, particularly the production of expression vectors that code for chimeric proteins containing human ADAM23 ectodomain fused to a human IgG Fc region. Nucleotide fragments coding for the residues 60-792 (ADAM23C1) and 287-792 (ADAM23C2) were cloned in the vector pINFUSE-hIgG1-Fc2 while the sequence 1-792 (ADAM23C3) was inserted onto modified plasmid pcDNA3.1-hIgG1-Fc2. Three different cell lineages (N2A, HEK-293T and CHO-K1) were transfected with the expression plasmids and the chimeric proteins detected in both cell extracts and culture supernatants by monoclonal antibody DL11C8. N2A cell lineage presented the most efficient expression/secretion of the three chimeric proteins. CHO-K1 showed chimeric ADAM23C1 and ADAM23C2 secretion, although ADAM23C3 was not observed in supernatants. The full-length construction (C3) was always detected as a processed protein, indicating that endogenous ADAM23 signal peptide and processing signals were correctly translated by cellular host machinery. Several protocols were compared for purification of chimeric proteins from culture supernatant, being ammonium sulfate salting-out the most practical and convenient. Besides, it was established that mature ADAM23 (70 kDa) is the abundant form in the mouse brain and the processed protein is located at N2A cell surface. In addition it was showed, for the first time, that non-processed ADAM23 (100 kDa) has low expression in the central nervous system when compared with the processed 70 kDa form. Interestingly, tumoral cell lines (MDA-MB-435 and N2A) presented the opposite behavior. If the non-processed/mature ratio profile is specific for each cell line or has a role in the tumoral phenotype will be further investigated in future. Key words: ADAM23. Ectodomain. Disintegrin. Metalloprotease. Fc chimeric proteins

    Estudo in vitro das citocinas envolvidas na resposta inflamatória de macrófagos murinos à infecção pelo vírus da dengue.

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    TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.A dengue é uma doença que tem como agente etiológico o Dengue virus (DENV), da família Flaviviridae, do gênero Flavivirus. Mais de 50 milhões de infecções ocorrem anualmente no mundo. Níveis altos de diferentes citocinas foram observados na infecção por DENV. Sabe-se que após a infecção pelo DENV in vitro, os macrófagos, após o reconhecimento do vírus, liberam TNF-α, IFN-α, IL-1 e IL-6 fator ativador de plaquetas e histaminas. Outras citocinas também foram correlacionadas in vivo com a doença. Dentre as citocinas pró-inflamatórias encontradas in vivo e in vitro, em células infectadas com o DENV ou em pacientes com a febre hemorrágica da dengue (DHF), estão o TNF-α, o IFN-γ, o IFN-β, a IL-2, a IL-4, a IL-5, a IL-6, a IL-10, o IFN-α e o hCF. Outros mediadores da resposta inflamatória foram encontrados em pacientes com infecção aguda pelo DENV, como a enzima NOS2. As citocinas desempenham um papel sinérgico na superfície endotelial, contribuindo para o extravasamento do plasma e os seus níveis altos resultam no quadro grave da doença. Este estudo acompanhou, através de PCR em tempo real, as diferenças de cinética de expressão dos genes das principais citocinas inflamatórias (TNF-α, IFN-β, IL-10, IL-6 e IL-12p40) e da enzima NOS2 liberadas por macrófagos murinos RAW 264.7 durante a infecção pelo DENV-1 e DENV-4 e durante o estímulo com LPS. No presente trabalho, foram observadas diferenças nas cinéticas de expressão dos genes destas citocinas e enzima quando induzidos por DENV-1, DENV-4 e LPS. Os genes do IFN-β e da IL-6 apresentaram expressão precoce. Os genes do TNF-α, IFN-β, IL-10, IL-6 e IL-12p40 apresentaram expressão intermediária, intermediária-tardia e tardia. O gene da enzima NOS2 também apresentou expressão tardia.Dengue is a disease whose etiological agent is Dengue virus (DENV). This virus belongs to Flaviviridae family and Flavivirus genus. More than 50 million infections occur annually in the world. Elevated levels of different cytokines were observed in Dengue virus infection. It is well known that after DENV in vitro infection, macrophages, after virus recognition, secrete TNF-α, IFN-α, IL-1 and IL-6, which is an activating factor of platelets and histamine. Other cytokines were also in vivo correlated with dengue disease. Among pro-inflammatory cytokines identified in vivo and in vitro, in infected cells or in DHF patients, are TNF-α, IFN-γ, IFN-β, IL-2, IL-4, IL-5, IL-6, IL-10, IFN-α and hCF. Other mediators of the inflammatory response were observed in patients with acute DENV infection, for example, the NOS2 enzyme. The cytokines play a mutually synergistic role in endothelial surface, inducing plasma leakage and their elevated level results in dengue severity. This study has identified, through real time PCR technique, the differences among the kinetics of genes expression of the major inflammatory cytokines (TNF-α, IFN-β, IL-10, IL-6 and IL-12p40) and of the NOS2 enzyme released by RAW 264.7 murine macrophage lineage during DENV-1 and DENV-4 infection and during LPS stimuli. In the current study, were observed differences between the gene expression kinetics of these cytokines and enzyme when induced by DENV-1, DENV-4 and LPS. The INF-β and IL-6 genes had early expression. The TNF-α, IFN-β, IL-10, IL-6 and IL-12p40 genes had intermediate, intermediate-late and late expression. The NOS2 gene also had late expression

    Estudo das vias/mecanismos de internalização e tráfego intracelular da desintegrina e metaloprotease ADAM23

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    Orientador: Prof. Dr. Silvio Marques ZanataTese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Defesa : Curitiba, 20/03/2020Inclui referências: p. 113-121Resumo: ADAM (A Disintegrin and Metalloprotease) é uma família de proteínas transmembranas envolvidas em funções biológicas tais como: liberação de fatores de crescimento e citocinas, desenvolvimento da musculatura e fertilização. No sistema nervoso as ADAMs parecem ter papéis importantes no desenvolvimento, regulando proliferação, migração, diferenciação e sobrevivência de vários tipos celulares, bem como a regulação do crescimento axonal e mielinização. Para estudar a internalização de ADAM23, foi utilizado um ensaio de biotinilação de proteínas de superfície celular de neuroblastomas transientemente transfectados com ADAM23. Foi observado que ADAM23 foi constitutivamente internalizada e esteve relativamente estável em quantidade na membrana plasmática por 72h após o início da internalização. Após o início da internalização, ADAM23 co-localizou com ambos endossomos precoce e de reciclagem, parecendo ser rapidamente transportada de volta para a membrana pela via do Rab4 ou mais lentamente pela via do Rab11. A partir do ensaio com a marcação com anti-ADAM23, a ADAM23 pareceu ser rapidamente (menos de 1 h) e continuamente reciclada, considerando a rápida reciclagem vista através de Rab4. A reciclagem de ADAM23 através de ambos os endossomos de reciclagem rápida (Rab4) e lenta (Rab11) pode ter a ver com duração e estabilidade da quantidade de proteína ADAM23 na superfície celular. Além disso, foi vista co-localização da ADAM23 com endossomo precoce (EEA1) e com endossomo intermediário (Rab5). Foi observada também co-localização da ADAM23 com fagossomo Rab7 o pré-cursor da via lisossomal. Considerando o papel da ADAM23 no câncer e em doenças neurológicas como epilepsia, o potencial da sua atividade na membrana plasmática, especialmente interagindo com integrinas, LGIs e PrPc, sua localização na superfície celular, sua internalização e reciclagem provavelmente são mecanismos bem controlados. A regulação da expressão de ADAM23 na membrana, o processo de endocitose e a reciclagem da ADAM23 podem estar relacionados à severidade dessas condições clínicas e ser potenciais alvos terapêuticos. Dessa forma, o presente trabalho teve como objetivo a descrição da via de internalização da ADAM23 e seu tráfego intracelular. Palavras-chave: ADAM23. Desintegrina metaloprotease. Endocitose. Internalização. Endossomo. Reciclagem. Degradação. Estabilidade.Abstract: ADAM (A Disintegrin and Metalloprotease) is a family of transmembrane proteins involved in a variety of biological functions such as: growth factors and cytokines secretion, muscular tissue development and fertilization. In nervous system, many ADAMs seem to have important roles during development, regulating proliferation, migration, differentiation and survival of various cell types, in addition to axonal growth and mielinization regulation. In order to study ADAM23 internalization, it was performed a biotynilation assay of plasma membrane proteins in transiently ADAM23 transfected neuroblastomas. It was observed that ADAM23 was constitutively internalized and that this protein quantity was relatively stable in plasma membrane 72h after the beginning of internalization. After the initiation of internalization, ADAM23 co-localized with both early and recycling endosomes, suggesting that ADAM23 might be quickly transported back to plasma membrana through Rab4 endosome or more slowly through endosome Rab11 pathway. Through anti-ADAM23 labeling assay, ADAM23 seemed to be rapidly (less than 1 hour) and continuously recycled, considering its co-localization with Rab4. ADAM23 recycling through rapid (Rab4) and slow (Rab11) recycling pathways might be related to ADAM23 duration and stability at cell surface. In addition, it was observed ADAM23 colocalization with early endosome (EEA1) and with intermediate endosome (Rab5). Interestingly, it was also seen ADAM23 colocalization with Rab7 phagosome, the lysosomal pathway precursor. Regarding ADAM23 role in cancer and in neurological diseases such as epilepsy, its potential of activity in plasma membrane, specially interacting with integrins, LGIs and PrPc, its location at cell surface, its internalization and recycling are probably wellcontrolled mechanisms. The regulation of ADAM23 expression at plasma membrane, the endocytosis process and recycling of ADAM23 might be related to clinical severity and be potential therapeutic targets. In this matter, the present work had as an objective the description of the internalization pathway and intracellular traffic of ADAM23. Keywords: ADAM23. Disintegrin Metalloprotease. Endocytosis. Internalization. Endosome. Recycling. Degradation

    DESAFIOS E INOVAÇÕES NA TERAPÊUTICA DE DOENÇAS NEGLIGENCIADAS: O PAPEL DOS FITOTERÁPICOS NA BUSCA POR SOLUÇÕES EFICIENTES

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    Neglected Diseases (ND) are endemic illnesses caused by infectious and parasitic agents that impact physical, cognitive, and socioeconomic aspects, especially in low-income communities in developing countries. In Brazil, the Ministry of Health prioritizes neglected diseases such as Dengue, Chagas disease, and Tuberculosis, demanding an approach that considers social, economic, and cultural factors. The World Health Organization estimates that over a billion people worldwide are affected, but the lack of economic interest hinders treatment development, impacting research funding and affecting child growth and productivity. Combating these diseases requires innovation, research, and development, with a highlighted emphasis on biodiversity-derived products. The ancestral practice of using medicinal plants in Brazil stands out, but there is a gap in research regarding their effectiveness and safety. Methodology: The research reviewed literature on "Challenges and Innovations in Neglected Disease Therapeutics: The Role of Phytotherapeutics in Seeking Efficient Solutions," encompassing articles from 2019 to 2023 in databases such as BVS Brazil, Scielo, Pubmed, and LILACS. Inclusion criteria considered original articles in English, Spanish, or Portuguese, open access, related to herbal medicine in treating neglected diseases, and published in the last 5 years. Results: Studies reveal that natural agents from various plants have therapeutic potential against neglected parasitic diseases, such as Chagas Disease, Leishmaniasis, Schistosomiasis, Dengue, Tuberculosis, Malaria, Cryptococcosis, Paracoccidioidomycosis, and Trichomoniasis. Highlights include the antiparasitic potential of Plinia cauliflora extract in Chagas Disease and the effectiveness of Mentha hirsuta essential oil against Schistosomiasis. Moreover, Norantea brasiliensis extracts showed antiviral effects in Dengue. These results indicate the broad therapeutic potential of natural agents for treating various parasitic diseases. Conclusion: In the last two decades, knowledge about derivatives of medicinal plants for neglected diseases has grown, with significant Brazilian contributions. Despite the increase in scientific production, a gap persists between the global burden of these diseases and new medications. Crucial strategies include open access policies, global funding for R&D, and partnerships. In Brazil, it is urgent to reverse the decline in investments and create a favorable environment for R&D of biodiversity-derived compounds to drive therapeutic advancements. As Doenças Negligenciadas (DN) são enfermidades endêmicas, causadas por agentes infecto-parasitários, que afetam física, cognitiva e socioeconomicamente, especialmente em comunidades de baixa renda em países em desenvolvimento. No Brasil, o Ministério da Saúde prioriza doenças negligenciadas como Dengue, doença de Chagas e Tuberculose, exigindo uma abordagem que considere fatores sociais, econômicos e culturais. A OMS estima que mais de um bilhão de pessoas no mundo são afetadas, mas a falta de interesse econômico dificulta o desenvolvimento de tratamentos, impactando o financiamento para pesquisas e afetando o crescimento infantil e a produtividade. O combate a essas doenças requer inovação, pesquisa e desenvolvimento, sendo destacada a importância de produtos derivados da biodiversidade. A prática ancestral de utilizar plantas medicinais no Brasil destaca-se, mas há uma lacuna em pesquisas sobre sua eficácia e segurança. Metodologia: A pesquisa revisou literatura sobre "Desafios e Inovações na Terapêutica de Doenças Negligenciadas: O Papel dos Fitoterápicos na Busca por Soluções Eficientes", abrangendo artigos de 2019 a 2023 em bancos de dados como BVS Brasil, Scielo, Pubmed e LILACS. Critérios de inclusão consideraram artigos originais em inglês, espanhol ou português, de acesso aberto, relacionados à fitoterapia no tratamento de doenças negligenciadas e publicados nos últimos 5 anos. Resultados: Os estudos revelam que agentes naturais de diversas plantas têm potencial terapêutico contra doenças parasitárias negligenciadas, como Doença de Chagas, Leishmaniose, Esquistossomose, Dengue, Tuberculose, Malária, Criptococose, Paracoccidioidomicose e Tricomoníase. Destaques incluem o potencial antiparasitário do extrato de Plinia cauliflora na Doença de Chagas e a eficácia do óleo essencial de Mentha hirsuta contra a Esquistossomose. Além disso, extratos de Norantea brasiliensis mostraram efeitos antivirais na Dengue. Esses resultados indicam o amplo potencial terapêutico de agentes naturais para o tratamento de diversas doenças parasitárias. Conclusão: Nas últimas duas décadas, o conhecimento sobre derivados de plantas medicinais para doenças negligenciadas cresceu, com contribuições significativas brasileiras. Apesar do aumento na produção científica, persiste a lacuna entre a carga global dessas doenças e novos medicamentos. Estratégias cruciais incluem políticas de acesso aberto, financiamento global para P&D e parcerias. No Brasil, é urgente reverter o declínio nos investimentos e criar ambiente favorável à P&D de derivados da biodiversidade para impulsionar avanços terapêuticos

    A Companhia de Jesus na Índia e o Colégio de São Paulo em Goa: vicissitudes de 1552 a 1558

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    The Jesuit presence in the State of India dates back to 1542, when Francisco Xavier arrived in Goa. In 1548, the Jesuits founded the College of São Paulo, which became the reference center for the activities of the Society of Jesus in the East. The objective of this work is to discuss the College of São Paulo and the activities undertaken through it in the period between 1552 and 1558. In 1552 Francisco Xavier sets out on his mission to China, leaving Father Gaspar Barzeo in his place. Xavier's death still occurs in 1552 and that of Barzeo in 1553. After that, there is a period that we call in the work as a “command vacuum” in the Jesuit hierarchy in India, only remedied with the arrival of the new provincial and rector, in 1558. The sources used are contained in volumes II, III and IV of the Documenta Indica and in volume V of the Documentation for the history of the missions of the Portuguese Patronage of the East. It is concluded that the activities undertaken by these priests are, above all, cultural, religious and educational activities. Looking at these activities and their impacts on the local society at the time helps us to understand the dynamics of social and cultural interactions and power relations existing in the period studied. Key words: College of São Paulo. Company of Jesus. Goa. State of India. A presença jesuítica no Estado da Índia remonta ao ano de 1542, quando Francisco Xavier chega a Goa. Em 1548, os jesuítas fundam o Colégio de São Paulo, que passa a ser o centro referencial das atividades da Companhia de Jesus no Oriente. O objetivo deste artigo é versar sobre o Colégio de São Paulo e as atividades por meio dele empreendidas no período entre 1552 e 1558. Em 1552 Francisco Xavier sai em sua missão rumo à China, deixando em seu lugar o padre Gaspar Barzeo. A morte de Xavier ocorre ainda em 1552 e a de Barzeo em 1553. Depois disso, há um período que denominamos no trabalho como um “vazio de comando” na hierarquia jesuítica na Índia, apenas sanada com a chegada dos novos provincial e reitor, em 1558. A fontes utilizadas estão contidas nos volumes II, III e IV da Documenta Indica e no volume V da Documentação para a história das missões do Padroado português do Oriente. Conclui-se que as atividades empreendidas por estes padres são, sobretudo, atividades culturais, religiosas, educacionais. Olhar para tais atividades e seus impactos na sociedade local da época nos ajudam a compreender a dinâmica das interações sociais, culturais e das relações de poder existentes no período estudado.Palavras-chave: Colégio de São Paulo. Companhia de Jesus. Goa. Estado da Índia

    Inclusão escolar de alunos portadores de Transtorno do Espectro Autista na educação infantil: uma revisão sistemática: School inclusion of students with Autistic Spectrum Disorder in early childhood education: a systematic review

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    Este artigo debate o problema da inclusão escolar de crianças com transtorno do espectro autista (TEA). Para estabelecer o debate, foi feito um levantamento bibliográfico e referencial para uma revisão sistemática do tema. O objetivo é clarificar os conceitos de inclusão escolar e TEA para debater como é feito o processo educacional de crianças com TEA. Sendo assim, a partir da pesquisa científica de descritores como “inclusão escolar”, “transtorno do espectro autista”, foi observado, pelos diversos autores trabalhados, que ainda há muito o que se debater e trabalhar para que ocorra a inclusão escolar de crianças com TEA. Apesar das muitas tentativas, erros e acertos, o tema ainda é pouco trabalhado e divulgado, visto que há poucos profissionais capacitados na área

    Adesão ao tratamento dietético e evolução nutricional e clínica de pacientes com diabetes mellitus tipo 2.

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    O Diabetes Mellitus (DM) acomete em média 300 milhões de pessoas no mundo. O conhecimento a cerca das características da doença e sobre a adesão ao tratamento nutricional em pacientes ambulatoriais é fundamental para um melhor controle da patologia. Esse estudo teve como objetivo avaliar a adesão ao tratamento dietético e a evolução do estado nutricional e clínico de pacientes diabéticos assistidos pelo Ambulatório de Nutrição do Hospital Universitário de Sergipe. Participaram do estudo 30 pacientes, sendo avaliados os momentos da primeira consulta e depois de 6 ± 2 meses de tratamento nutricional. Foram coletados dos protocolos de atendimento do ambulatório de nutrição dados antropométricos, bioquímicos, história clínica dos mesmos e da adesão ao consumo alimentar. Analisou-se peso, IMC, colesterol total e frações, glicemia de jejum, glicemia pós-prandial, triglicérides, prevalência de comorbidades e percentual de adesão à dieta. Foi encontrada uma prevalência de 40% de pacientes obesos. As comorbidades mais prevalentes no estudo foram hipertensão (80%) e dislipidemia (36%). Quanto ao tratamento nutricional, observou-se que apenas 13,3% da amostra aderiram ao plano alimentar proposto e que não houve evolução significativa do perfil antropométrico e bioquímico dos pacientes participantes do estudo

    Encruzilhada. Artigos dos estudantes de arte contemporânea da Unifesp (2023)

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    A arte contemporânea é, acima de tudo, multidisciplinar. A experimentação e a quebra de limites são primordiais para a existência desse campo tão vibrante e diversificado que permite que os artistas se expressem de forma livre, provocativa, desconcertante, e até controversa, incentivando o público a refletir sobre a percepção do mundo ao seu redor. ENCRUZILHADA é um projeto que reúne, não só, uma série de artigos, mas a tentativa de ampliar os horizontes da arte contemporânea, dialogando com suas inquietações e desafiando as hierarquias estabelecidas

    ATLANTIC BIRD TRAITS: a data set of bird morphological traits from the Atlantic forests of South America

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    Scientists have long been trying to understand why the Neotropical region holds the highest diversity of birds on Earth. Recently, there has been increased interest in morphological variation between and within species, and in how climate, topography, and anthropogenic pressures may explain and affect phenotypic variation. Because morphological data are not always available for many species at the local or regional scale, we are limited in our understanding of intra- and interspecies spatial morphological variation. Here, we present the ATLANTIC BIRD TRAITS, a data set that includes measurements of up to 44 morphological traits in 67,197 bird records from 2,790 populations distributed throughout the Atlantic forests of South America. This data set comprises information, compiled over two centuries (1820–2018), for 711 bird species, which represent 80% of all known bird diversity in the Atlantic Forest. Among the most commonly reported traits are sex (n = 65,717), age (n = 63,852), body mass (n = 58,768), flight molt presence (n = 44,941), molt presence (n = 44,847), body molt presence (n = 44,606), tail length (n = 43,005), reproductive stage (n = 42,588), bill length (n = 37,409), body length (n = 28,394), right wing length (n = 21,950), tarsus length (n = 20,342), and wing length (n = 18,071). The most frequently recorded species are Chiroxiphia caudata (n = 1,837), Turdus albicollis (n = 1,658), Trichothraupis melanops (n = 1,468), Turdus leucomelas (n = 1,436), and Basileuterus culicivorus (n = 1,384). The species recorded in the greatest number of sampling localities are Basileuterus culicivorus (n = 243), Trichothraupis melanops (n = 242), Chiroxiphia caudata (n = 210), Platyrinchus mystaceus (n = 208), and Turdus rufiventris (n = 191). ATLANTIC BIRD TRAITS (ABT) is the most comprehensive data set on measurements of bird morphological traits found in a biodiversity hotspot; it provides data for basic and applied research at multiple scales, from individual to community, and from the local to the macroecological perspectives. No copyright or proprietary restrictions are associated with the use of this data set. Please cite this data paper when the data are used in publications or teaching and educational activities. © 2019 The Authors. Ecology © 2019 The Ecological Society of Americ

    ATLANTIC BIRD TRAITS

    No full text
    Scientists have long been trying to understand why the Neotropical region holds the highest diversity of birds on Earth. Recently, there has been increased interest in morphological variation between and within species, and in how climate, topography, and anthropogenic pressures may explain and affect phenotypic variation. Because morphological data are not always available for many species at the local or regional scale, we are limited in our understanding of intra- and interspecies spatial morphological variation. Here, we present the ATLANTIC BIRD TRAITS, a data set that includes measurements of up to 44 morphological traits in 67,197 bird records from 2,790 populations distributed throughout the Atlantic forests of South America. This data set comprises information, compiled over two centuries (1820–2018), for 711 bird species, which represent 80% of all known bird diversity in the Atlantic Forest. Among the most commonly reported traits are sex (n = 65,717), age (n = 63,852), body mass (n = 58,768), flight molt presence (n = 44,941), molt presence (n = 44,847), body molt presence (n = 44,606), tail length (n = 43,005), reproductive stage (n = 42,588), bill length (n = 37,409), body length (n = 28,394), right wing length (n = 21,950), tarsus length (n = 20,342), and wing length (n = 18,071). The most frequently recorded species are Chiroxiphia caudata (n = 1,837), Turdus albicollis (n = 1,658), Trichothraupis melanops (n = 1,468), Turdus leucomelas (n = 1,436), and Basileuterus culicivorus (n = 1,384). The species recorded in the greatest number of sampling localities are Basileuterus culicivorus (n = 243), Trichothraupis melanops (n = 242), Chiroxiphia caudata (n = 210), Platyrinchus mystaceus (n = 208), and Turdus rufiventris (n = 191). ATLANTIC BIRD TRAITS (ABT) is the most comprehensive data set on measurements of bird morphological traits found in a biodiversity hotspot; it provides data for basic and applied research at multiple scales, from individual to community, and from the local to the macroecological perspectives. No copyright or proprietary restrictions are associated with the use of this data set. Please cite this data paper when the data are used in publications or teaching and educational activities. © 2019 The Authors. Ecology © 2019 The Ecological Society of Americ
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