Non-invasive, innovative and promising strategy for breast cancer diagnosis based on metabolomic profile of urine, cancer cell lines and tissue

The work presented in this thesis aimed to establish the metabolomic profile of urine and breast cancer (BC) tissue from BC patients (samples cordially provided by Funchal Hospital), in addition to BC cell lines (MCF-7, MDA-MB-231, T-47D) as a powerful strategy to identify metabolites as potential BC biomarkers, helping on the development of non-invasive approaches for BC diagnosis and management. To achieve the main goal and obtain a deeper and comprehensive knowledge on BC metabolome, different analytical platforms, namely headspace solid-phase microextraction (HSSPME) combined with gas chromatography-quadrupole mass spectrometry (GC-qMS) and nuclear magnetic ressonance (1H NMR) spectroscopy were used. The application of multivariate statistical methods - principal component analysis (PCA) and orthogonal partial least square – discriminant analysis (OPLS-DA), to data matrix obtained from the different target samples allowed to find a set of highly sensitive and specific metabolites metabolites, namely, 4-heptanone, acetic acid and glutamine, able to be used as potential biomarkers in BC diagnosis. Significant group separation was observed in OPLS-DA score plot between BC and CTL indicating intrinsic metabolic alterations in each group. To attest the robustness of the model, a random permutation test with 1000 permutations was performed with OPLS-DA. The permutation test yielded R2 (represents goodness of fit) and Q2 values (represents predictive ability) with values higher than 0.717 and 0.691, respectively. Several metabolic pathways were dysregulated in BC considering the analytical approaches used. The main pathways included pyruvate, glutamine and sulfur metabolisms, indicating that there might be an association between the metabolites arising from the type of biological sample of the same donor used to perform the investigation. The integration of data obtained from different analytical platforms (GC-qMS and 1H NMR) for urinary and tissue samples revealed that five metabolites (e.g., acetone, 3-hexanone, 4-heptanone, 2methyl-5-(methylthio)-furan and acetate), were found significant using a dual analytical approach.O trabalho apresentado nesta tese teve como objetivo estabelecer o perfil metabolómico da urina e do tecido da mama de doentes com cancro de mama (BC) (amostras cordialmente fornecidas pelo Hospital do Funchal), além das linhas celulares de BC (MCF-7, MDA-MB-231, T -47D) como uma poderosa estratégia para identificar metabolitos como potenciais biomarcadores de BC, auxiliando no desenvolvimento de abordagens não invasivas para o diagnóstico e a gestão da patologia. Para obter um conhecimento mais profundo e abrangente do metaboloma de BC, diferentes plataformas analíticas, nomeadamente a microextração em fase sólida em modo headspace (HS-SPME) combinada com a cromatografia em fase gasosa acoplada à espectrometria de massa (GC-qMS) e espectroscopia de ressonância magnética nuclear (1H RMN), foram usadas para atingir o objetivo principal. A aplicação de métodos estatísticos multivariados - análise de componentes principais (PCA) e análise discriminante de mínimos quadrados parciais ortogonais (OPLS-DA) à matriz de dados obtida a partir das diferentes amostras alvo, permitiu estabelecer um grupo de metabolitos sensíveis e específicos, nomeadamente a 4-heptanona, o ácido acético e a glutamina, possíveis de serem utilizados como potenciais biomarcadores no diagnóstico de BC. Uma separação significativa entre os grupos BC e CTL foi observada pelo OPLS-DA, indicando alterações metabólicas em cada grupo. Para verificar a robustez do modelo, foi realizado um teste de permutação aleatória com 1000 permutações com o sistema OPLS-DA. Valores de R2 (representa o ajuste) e Q2 (representa a capacidade preditiva) superiores a 0,717 e 0,691, foram obtidos utilizando o teste da permutação. Diversas vias metabólicas estavam desreguladas no BC considerando as abordagens analíticas utilizadas. As principais vias incluíram os metabolismos do piruvato e glutamina, indicando que poderá haver uma associação entre os metabolitos derivados do tipo de amostra biológica do mesmo doador utilizado para realizar a investigação. A integração de dados obtidos pelas diferentes plataformas analíticas (GC-qMS e 1H RMN) para amostras urinárias e de tecido revelou cinco metabolitos significativos usando a dupla abordagem analítica. (i.e., acetona, 3-hexanona, 4-heptanona, 2-metil-5- (metiltio) - furano e acetato)

Detecção e caracterização de biomarcadores voláteis em indivíduos com patologias oncológicas

Com a realização deste trabalho, pretendeu-se traçar o perfil padrão da composição volátil típico de fluidos biológicos (urina) de indivíduos sem patologia oncológica (grupo de controlo) comparando-os com os de pacientes (grupo com patologia oncológica). As amostras de urina de ambos os grupos foram analisadas por microextracção em fase sólida em modo de headspace acoplada à espectrometria de massa (HS-SPME-GC/qMS). Com o intuito de aumentar a eficiência de extracção da SPME, foram optimizados alguns parâmetros com influência no processo extractivo, nomeadamente o tipo de fibra, o tempo e a temperatura de extracção. Assim sendo, foram testadas e comparadas seis fibras comercialmente disponíveis, polidimetilsiloxano (PDMS, 100 m), poliacrilato (PA, 85 m), carboxeno-polidimetilsiloxano (CAR/PDMS, 75 m), carbowax-divinilbenzeno (CW/DVB, 65 m), divinilbenzeno-carboxen-polidimetilsiloxano (DVB/CAR/PDMS, 50/30 m) e polidimetilsiloxano-divinilbenzeno (PDMS/DVB, 65 m). A influência do tempo (30, 45, 60 e 75 min) e temperatura (30, 50 e 60 ºC) de extracção foram optimizados de modo a obter uma melhor eficiência de extracção dos compostos voláteis presentes nas amostras de urina. Os melhores resultados foram obtidos usando a fibra carboxeno-polidimetilsiloxano (CAR/PDMS, 75 m), com uma velocidade de agitação de 800 rpm durante 75 min a uma temperatura de 50 ºC. Para os dois grupos em estudo, foram identificados 80 compostos voláteis pertencentes a diversas famílias químicas, nomeadamente, aldeídos, cetonas, derivados benzénicos, compostos terpénicos, ácidos orgânicos, compostos furânicos, compostos sulfurados, fenóis voláteis, ésteres, álcoois superiores e derivados do naftaleno. Os compostos maioritários pertencentes aos grupos analisados foram a 4-heptanona, a 2-pentanona, a acetona, a 2-butanona, o 1(2- furanil)etanona, o 3-metil-3-fenil-2-propenal, o 3,4-dimetilbenzaldeído, o decanal, o dissulfureto de dimetilo, o metanotiol, o 2-metoxitiofeno, o 4-metil-fenol, o p-tert-butil-fenol, o 2,4-bis(1,1- dimetiletil)fenol, o fenol, o m-cimeno, o p-cimeno, o tolueno, o 1-etil-3,5-diisopropilbenzeno, o 2,6-dimetil-7-octen-2-ol, a D-carvona, o vitispirano I e o vitispirano II. O teste One-Way ANOVA foi aplicado aos resultados com o intuito de verificar se existiam diferenças significativas entre os grupos avaliados (Controlo e Oncológico), sendo o dissulfureto de dimetilo, o 2-metoxitiofeno, e o p-cimeno estatisticamente significativos. A aplicação da análise multivariável às amostras de urina das diferentes patologias permitiu diferenciá-las no qual se obteve 81,02% da variância total.A aplicação da análise multivariável às amostras de urina das diferentes patologias permitiu diferenciá-las no qual se obteve 81,02% da variância total. A patologia de Hodgkin é influenciada pelas variáveis heptanal e o 2-metil-3-fenil-2-propenal. O Controlo é afectado essencialmente pelas variáveis p-cimeno, 1,4,5-trimetilnaftaleno e o dissulfureto de dimetilo. O Cólon é influenciado pelo 4-metilfenol, anisole e 1,2-dihidro-1,1,6-trimetil-naftaleno. O 1-octanol e a 3-heptanona influenciam, essencialmente as patologias da Mama e Leucemia.Centro de Ciência e Tecnologia da MadeiraRumosQRE

Mental health at the COVID-19 frontline : an assessment of distress, fear, and coping among staff and attendees at screening clinics of rural/regional settings of Victoria, Australia

Purpose: Research examining psychological well-being associated with COVID-19 in rural/regional Australia is limited. This study aimed to assess the extent of psychological distress, fear of COVID-19, and coping strategies among the attendees in COVID-19 screening clinics at 2 rural Victorian settings. Methods: A cross-sectional study was conducted during July 2020 to February 2021 inclusive. Participants were invited to fill in an online questionnaire. Kessler Psychological Distress Scale (K-10), Fear of COVID-19 Scale, and Brief Resilient Coping Scale were used to assess psychological distress, fear of COVID-19, and coping, respectively. Findings: Among 702 total participants, 69% were females and mean age (±SD) was 49 (±15.8) years. One in 5 participants (156, 22%) experienced high to very high psychological distress, 1 in 10 (72, 10%) experienced high fear, and more than half (397, 57%) had medium to high resilient coping. Participants with mental health issues had higher distress (AOR 10.4, 95% CI: 6.25-17.2) and fear (2.56, 1.41-4.66). Higher distress was also associated with having comorbidities, increased smoking (5.71, 1.04-31.4), and alcohol drinking (2.03, 1.21-3.40). Higher fear was associated with negative financial impact, drinking alcohol (2.15, 1.06-4.37), and increased alcohol drinking. Medium to high resilient coping was associated with being ≥60 years old (1.84, 1.04-3.24) and completing Bachelor and above levels of education. Conclusion: People who had pre-existing mental health issues, comorbidities, smoked, and consumed alcohol were identified as high-risk groups for poorer psychological well-being in rural/regional Victoria. Specific interventions to support the mental well-being of these vulnerable populations, along with engaging health care providers, should be considered. © 2021 The Authors. The Journal of Rural Health published by Wiley Periodicals LLC on behalf of National Rural Health Association

Causas e consequências da redução da taxa de fecundidade no Brasil

Desde meados da década de 1960 teve início, no Brasil, uma queda significativa da fecundidade, que se iniciou nas camadas sociais economicamente mais abastadas. O presente estudo tem como objetivo discutir a redução da taxa de fecundidade total (TFT) no Brasil nos últimos cinquenta anos, bem como as causas e consequências desse acontecimento. Trata-se de uma revisão de literatura no formato narrativo, cujo recorte histórico foi o dos anos de 2006 a 2016. As causas da redução da TFT podem estar associadas à urbanização crescente, à melhora do nível educacional, à ampliação do uso de métodos contraceptivos e à maior participação da mulher no mercado de trabalho. Como consequências, tem-se a redução da natalidade e o aumento da população acima de 60 anos, levando ao envelhecimento da população e ao início do processo de transição da estrutura etária brasileira. Concluiu-se que a redução da TFT ocorrida no Brasil nos últimos cinquenta anos possui causas significativas e consequências que durarão em torno de um século

Primary health care in rural Malawi - a qualitative assessment exploring the relevance of the community-directed interventions approach

BACKGROUND: Primary Health Care (PHC) is a strategy endorsed for attaining equitable access to basic health care including treatment and prevention of endemic diseases. Thirty four years later, its implementation remains sub-optimal in most Sub-Saharan African countries that access to health interventions is still a major challenge for a large proportion of the rural population. Community-directed treatment with ivermectin (CDTi) and community-directed interventions (CDI) are participatory approaches to strengthen health care at community level. Both approaches are based on values and principles associated with PHC. The CDI approach has successfully been used to improve the delivery of interventions in areas that have previously used CDTi. However, little is known about the added value of community participation in areas without prior experience with CDTi. This study aimed at assessing PHC in two rural Malawian districts without CDTi experience with a view to explore the relevance of the CDI approach. We examined health service providers’ and beneficiaries’ perceptions on existing PHC practices, and their perspectives on official priorities and strategies to strengthen PHC. METHODS: We conducted 27 key informant interviews with health officials and partners at national, district and health centre levels; 32 focus group discussions with community members and in-depth interviews with 32 community members and 32 community leaders. Additionally, official PHC related documents were reviewed. RESULTS: The findings show that there is a functional PHC system in place in the two study districts, though its implementation is faced with various challenges related to accessibility of services and shortage of resources. Health service providers and consumers shared perceptions on the importance of intensifying community participation to strengthen PHC, particularly within the areas of provision of insecticide treated bed nets, home case management for malaria, management of diarrhoeal diseases, treatment of schistosomiasis and provision of food supplements against malnutrition. CONCLUSION: Our study indicates that intensified community participation based on the CDI approach can be considered as a realistic means to increase accessibility of certain vital interventions at community level

Contribuições dos registros eletrônicos para a segurança do paciente em terapia intensiva: uma revisão integrativa

Revisão integrativa que analisou nas publicações as contribuições dos registros eletrônicos em saúde para a segurança do paciente em unidades de terapia intensiva. A pesquisa foi realizada nas bases de dados CINAHL, MEDLINE e SciELO, utilizando os descritores: registros eletrônicos de saúde, sistemas de informação, informática em enfermagem, informática médica, unidades de terapia intensiva, segurança do paciente e gerenciamento de segurança. Foram incluídos 64 artigos, sendo analisados em três categorias: “sistemas de informação e informática em saúde: o registro eletrônico para a continuidade do cuidado de Enfermagem”, “sistemas de apoio à decisão: contribuições para a segurança do paciente” e “indicadores de qualidade do cuidado e de segurança do paciente partir dos registros eletrônicos”. Os estudos apontaram como contribuições a continuidade do cuidado, a tomada de decisão baseada nos sistemas de apoio à decisão e a criação de indicadores de qualidade e segurança do paciente a partir dos registros eletrônicosIntegrative review publications that analyzed the contributions of electronic health records for patient safety in intensive care units. The survey was conducted in the databases CINAHL, MEDLINE and SciELO, using the keywords: electronic health records, information systems, nursing informatics, medical informatics, intensive care units, patient safety and security management. A total 64 articles were included and analyzed in two empirical categories: “Information systems and information technology: the electronic record for the continuity of nursing care”, “decision support systems: contributions to patient safety” and “indicators of quality of care and patient safety from the records electronics”. The studies pointed to contributions to continuity of care, decision making based on decision support systems and the creation of quality indicators and patient safety from electronic records.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Validez de diagnóstico de enfermería para consulta de enfermería en la visita domiciliaria al adulto

Objectives: to identify and confirm the priority nursing diagnosis of International Classification for Nursing Practice® for home nursing consultation to adults in Primary Health Care. Methods: qualitative study, of methodological and validation type. The 5-point Likert scale was used, with a minimum Content Validity Index of 80% consensus among judges., considering the answers “priority” or “very priority” for the list of nursing diagnoses presented. 23 expert judges participated in this survey. Results: a hundred and eleven nursing diagnoses of prepared statements lists have been grouped by human systems and sociodemographic characteristics. were grouped by human systems and sociodemographic characteristics. Eighty-three of them (74.77%) had a Content Validity Index equal or higher to 0.8; and 27 (32.5%) had an index of 1.0 (100%) among judges. Conclusions: nursing diagnosis validated can be used to assist clients in home nursing consultations in Primary Health Care.Objetivos: identificar e validar os diagnósticos de enfermagem prioritários da Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem® para a consulta de enfermagem domiciliar do adulto na Atenção Primária à Saúde. Métodos: estudo quantitativo, do tipo metodológico e de validação. Utilizou-se a escala Likert de 5 pontos, com o Índice de Validade de Conteúdo mínimo de 80% de consenso entre os juízes, considerando as respostas “prioritário” ou “muito prioritário” para a lista de diagnósticos de enfermagem apresentada. Participaram da pesquisa 23 juízes especialistas. Resultados: os 111 diagnósticos de enfermagem da lista de enunciados elaborada foram agrupados por sistemas humanos e características sociodemográficas. Destes, 83 (74,77%) obtiveram Índice de Validade de Conteúdo maior ou igual a 0,8; e 27 (32,5%) obtiveram índice 1,0 (100%) entre juízes. Conclusões: os Diagnósticos de Enfermagem validados podem ser utilizados no atendimento aos clientes nas consultas de enfermagem domiciliares na Atenção Primária à Saúde.Objetivos: identificar e validar diagnósticos de enfermería prioritarios de la Clasificación Internacional para Práctica de Enfermería® para consulta de enfermería domiciliaria del adulto en la Atención Primaria de Salud. Métodos: estudio cuantitativo, del tipo metodológico y de validez. Utilizó escala Likert de 5 puntos, con Índice de Validez de Contenido mínimo de 80% de consenso entre los jueces, considerando las respuestas “prioritario” o “muy prioritario” para la lista de diagnósticos de enfermería presentada. Participaron de la investigación 23 jueces especialistas. Resultados: los 111 diagnósticos de enfermería de la lista de enunciados elaborada, agrupados por sistemas humanos y características sociodemográficas. De estos, 83 (74,77%) obtuvieron Índice de Validez de Contenido mayor o igual a 0,8; e 27 (32,5%) obtuvieron índice 1,0 (100%) entre jueces. Conclusiones: los Diagnósticos de Enfermería validados pueden ser utilizados en la atención a los clientes en las consultas de enfermería domiciliarias en la Atención Primaria de Salud.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Global distribution and diversity of ovine-associated Staphylococcus aureus

Staphylococcus aureus is an important pathogen of many species, including sheep, and impacts on both human and animal health, animal welfare, and farm productivity. Here we present the widest global diversity study of ovine-associated S. aureus to date. We analysed 97 S. aureus isolates from sheep and sheep products from the UK, Turkey, France, Norway, Australia, Canada and the USA using multilocus sequence typing (MLST) and spa typing. These were compared with 196 sheep isolates from Europe (n = 153), Africa (n = 28), South America (n = 14) and Australia (n = 1); 172 bovine, 68 caprine and 433 human S. aureus profiles. Overall there were 59 STs and 87 spa types in the 293 ovine isolates; in the 97 new ovine isolates there were 22 STs and 37 spa types, including three novel MLST alleles, four novel STs and eight novel spa types. Three main CCs (CC133, CC522 and CC700) were detected in sheep and these contained 61% of all isolates. Four spa types (t002, t1534, t2678 and t3576) contained 31% of all isolates and were associated with CC5, CC522, CC133 and CC522 respectively. spa types were consistent with MLST CCs, only one spa type (t1403) was present in multiple CCs. The three main ovine CCs have different but overlapping patterns of geographical dissemination that appear to match the location and timing of sheep domestication and selection for meat and wool production. CC133, CC522 and CC700 remained ovine-associated following the inclusion of additional host species. Ovine isolates clustered separately from human and bovine isolates and those from sheep cheeses, but closely with caprine isolates. As with cattle isolates, patterns of clonal diversification of sheep isolates differ from humans, indicative of their relatively recent host-jump

Levantamiento y cruzamiento de las informaciones sobre evaluación clínica, diagnóstico e intervenciones de fisioterapia

Objetivo: descrever a experiência para desenvolver um registro eletrônico em fisioterapia baseado na Classificação Internacional de Funcionalidade, Incapacidade e Saúde através do mapeamento e cruzamento de informações da avaliação clínica, diagnóstico e intervenções fisioterapêuticas. Método: relato de experiência, organizado em quatro etapas: Aprofundamento teórico da Classificação Internacional de Funcionalidade; Aprofundamento teórico da avaliação em fisioterapia; Estruturação dos dados de avaliação, dos diagnósticos e intervenção fisioterapêutica; Informatização e integração de forma sistematizada dos dados da avaliação clínica, dos diagnósticos e intervenções. Resultados: a estruturação dos dados foi dividida por sistemas do corpo humano. Sendo assim, para o sistema respiratório construiu-se 15 tópicos de avaliação, 145 diagnósticos e 74 intervenções; para o sistema neuromusculoesquelético construiu-se 37 tópicos de avaliação, 132 diagnósticos e 65 intervenções; para o sistema cardiovascular construiu-se cinco tópicos de avaliação, 23 diagnósticos e cinco intervenções e para o sistema gastrointestinal e renal construiu-se sete tópicos de avaliação, 21 diagnósticos e uma intervenção. Desta forma, foram construídos 64 itens de avaliação, 318 diagnósticos baseados na Classificação de Funcionalidade e 145 intervenções fisioterapêuticas. Conclusão: o mapeamento das informações sobre avaliação fisioterapêutica, diagnósticos e intervenções para integrar um registro eletrônico em fisioterapia tornará o uso da Classificação Internacional de Funcionalidade, Incapacidade e Saúde mais segura e rápida possibilitando sua aplicabilidade diária na clínica hospitalar.Objective: to describe the experience of developing an electronic health record in physiotherapy based on the International Classification of Functioning Disability and Health through the mapping and cross-referencing of clinical evaluation information, diagnosis and physiotherapeutic interventions. Method: an experience report, organized in four stages: Theoretical development of the International Classification of Functionality; Theoretical development of evaluation in physiotherapy; Structuring of evaluation data, diagnoses and physiotherapeutic intervention; Computerization and systematized integration of data from clinical evaluation, diagnoses and interventions. Results: the structure of the data was divided by systems of the human body. Thus, for the respiratory system, 15 evaluation topics, 145 diagnoses and 74 interventions were constructed; for the neuromusculoskeletal system, 37 evaluation topics, 132 diagnoses and 65 interventions were constructed; for the cardiovascular system, five evaluation topics, 23 diagnoses and five interventions were constructed; and seven assessment topics, 21 diagnoses and one intervention were constructed for the gastrointestinal and renal systems. Thus, 64 evaluation items were constructed, 318 diagnoses based on the Functionality Classification and 145 physiotherapeutic interventions. Conclusion: the mapping of information regarding physiotherapeutic evaluation, diagnoses and interventions to integrate an electronic physiotherapy records will make use of the International Classification of Functioning, Disability and Health safer and faster, allowing it to be applied in the hospital setting.Objetivo: describir la experiencia para desarrollar un registro electrónico en fisioterapia basado en la Clasificación Internacional de Funcionalidad, Incapacidad y Salud a través del levantamiento y cruzamiento de informaciones de la evaluación clínica, diagnóstico e intervenciones fisioterapéuticas. Método: relato de experiencia realizado en cuatro etapas: Profundización teórica de la Clasificación Internacional de Funcionalidad; Profundización teórica de la evaluación en fisioterapia; Estructuración de los datos de evaluación, diagnósticos e intervención fisioterapéutica; Informatización e integración de forma sistematizada de los datos de la evaluación clínica, diagnósticos e intervenciones. Resultados: la estructuración de los datos fue dividida por sistemas del cuerpo humano. Así, para el sistema respiratorio se construyeron 15 tópicos de evaluación, 145 diagnósticos y 74 intervenciones. Para el sistema neuromusculoesquelético se construyeron 37 tópicos de evaluación, 132 diagnósticos y 65 intervenciones. Para el sistema cardiovascular se construyeron cinco tópicos de evaluación, 23 diagnósticos y cinco intervenciones y para el sistema gastrointestinal y renal se construyeron siete tópicos de evaluación, 21 diagnósticos y una intervención. De esta forma, se construyeron 64 ítems de evaluación, 318 diagnósticos basados en la Clasificación de Funcionalidad y 145 intervenciones fisioterapéuticas. Conclusión: el levantamiento de las informaciones sobre la evaluación fisioterapéutica, diagnósticos e intervenciones para integrar un registro electrónico en fisioterapia hará que el uso de la Clasificación Internacional de Funcionalidad, Incapacidad y Salud sea más seguro y rápido, posibilitando su aplicabilidad diaria en la clínica hospitalaria.info:eu-repo/semantics/publishedVersio