Efecto de dos citocininas y un inhibidor del crecimiento en la tuberización in vitro de dos genotipos de Solanum tuberosum L. vars. Atlantic y Alpha

This investigation was carried out to evaluate the effect of two cytokinins: 6-benzilaminopurine (BAP) (6.5 mg l-1) and kinetin (K) (2.5 mg l-1), as well as the growth inhibitor abscisic acid (ABA) (1.0 mg l-1) on the in vitro tuberization capacity of two potato varieties: Atlantic and Alpha. The basal culture medium MS (1962) was used as a control. The responses were different between varieties. In cv. Atlantic, the analysis of the number (NM), weight (WM) and diameter (DM) of microtubers indicated that the addition of growth regulators did not affect induction and development of microtubers. However, when BAP was used, a non-significant increment of 41 % was observed in the number of the microtubers compared to the control treatment, from 2.6 to 4.4. The addition of cytokinins and ABA to the medium did not have a significant impact on the development of microtubers. In cv. Alpha the cytokinins used without ABA increased the number of microtubers, which were larger and heavier than those of the control treatment. In this variety, ABA significantly reduced the values of the NM, WM and DM variables. The exogenous action of cytokinins in the culture medium is likely to have caused an endogenous hormonal imbalance in the Atlantic and Alpha genotypes which interfered with their innate microtuberization ability, a result that was even more evident for cv. Alpha, which showed the need to continue optimizing protocols of genotype-specific systems in potato tissue culture to increase yield and seed quality.La presente investigación se llevó a cabo con el objetivo de evaluar el efecto de dos citocininas 6-benzilaminopurina (BAP) (6.5 mg l-1) y kinetina (K) (2.5 mg l-1), más un inhibidor de crecimiento ácido abscísico (ABA) (1.0 mg l-1) sobre la capacidad de tuberización in vitro de dos variedades de papa, Atlantic y Alfa. El medio de cultivo usado como testigo fue el básico MS (1962) sin reguladores del crecimiento. Los resultados obtenidos evidenciaron una respuesta diferente entre variedades. En la variedad Atlantic, el análisis de los datos en relación con las variables número (NM), peso (PM) y diámetro (DM) de microtubérculos indicó que la adición de reguladores de crecimiento no afectó favorablemente la inducción y el desarrollo de microtubérculos, con respecto al testigo. Al utilizar BAP, se notó un incremento no significativo de 41 % en el número promedio de microtubérculos en comparación con el tratamiento control, pasando de 2.6 a 4.4. La adición de citocininas y ABA al medio no provocó efectos positivos en el desarrollo de los microtubérculos. En la variedad Alfa, la utilización de citocininas en ausencia de ABA estimuló el NM y estos fueron más pesados y de mayor diámetro que en el tratamiento testigo. En esta variedad, el ABA causó un efecto negativo en el NM, así como en las variables PM y DM. Probablemente la acción exógena de las citocininas en los medios de cultivo ocasionó un desbalance hormonal endógeno en los genotipos Atlantic y Alfa, que interfirió sobre la capacidad innata de microtuberización, resultado que se evidenció en mayor magnitud para la variedad Alfa, lo cual reveló la necesidad de continuar optimizando los protocolos genotipo-específicos de los sistemas de cultivo de tejidos en papa para aumentar el rendimiento y la calidad de la semilla

Socialización de conceptos, aplicaciones y beneficios

Actualización sobre los conceptos, aplicaciones y beneficios de la biotecnología, para aumentar su aceptaciónUpdate on the concepts, applications and benefits of biotechnology to increase acceptanc

Monitoring of the Greenhouse Gases Concentrations in Madrid (MEGEI-MAD)

Ponencia presentada en: XVIII Congreso de la Asociación Española de Teledetección celebrado en Valladolid del 24 al 27 septiembre 2019.[ES]Las áreas urbanas concentran actualmente el 50% de las emisiones globales de Gases de Efecto Invernadero (GEIs). Este porcentaje está aumentando, ya que la población mundial cada vez más se concentra en las áreas urbanas, y se estima que pase del 50% hoy en día al 70% en 2050. Consecuentemente, las medidas de las emisiones urbanas de GEIs, a escalas temporales y espaciales pequeñas, son cruciales para diseñar políticas efectivas de control y mitigación de los GEIs. En este contexto, este trabajo presenta el proyecto MEGEI-MAD (Medida de las Concentraciones de Gases de Efecto Invernadero en Madrid), que es la primera iniciativa española para la monitorización de las emisiones de GEIs en ambientes urbanos. En particular, MEGEI-MAD tiene como objetivo la caracterización completa de las emisiones urbanas de dióxido de carbono (CO2) y metano (CH4), en Madrid, la ciudad más densamente poblada de España. Este objetivo central fue abordado con una campaña de medidas llevada a cabo entre el 16 de Septiembre y el 9 de Octubre de 2018 en la zona metropolitana de Madrid, donde las observaciones de CO2 y CH4 en la columna total atmosférica fueron medidas simultáneamente con observaciones in situ a nivel de superficie.[EN]Urban areas currently contribute over 50% of the global emissions of Greenhouse Gases (GHGs). This percentage is growing since worldwide population is increasingly concentrating in the urban areas, going from over 50% nowadays to 70% by 2050. Consequently, monitoring urban GHGs emissions at small temporal and spatial scales is crucial to design effective GHGs control and mitigation policies. In this context, this work gives an overview of the Project MEGEI-MAD (Monitoring of the Greenhouse Gases Concentrations in Madrid), which is the first Spanish initiative to monitor GHGs emissions in urban environments. Particularly, MEGEI-MAD aims to comprehensively characterize the urban emissions of carbon dioxide (CO2) and methane (CH4) of Madrid, the highest population density city in Spain. This core objective was reached by a field campaign carried out between 16th September-9th October 2018 in the Madrid Metropolitan area, where CO2 and CH4 total column amounts observations have been measured simultaneously with ground-level records

Diversidad genética entre especies del género lemna (lemnaceae) utilizando fragmentos polimórficos de ADN amplificados al azar (rapds)

Lemna aequinoctialis and Lemna valdiviana were tested genetic similarity by random amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprinting. Of 60 primers (10-mer) tested, 26 generated polymorphic products. 143 bands were found from 200bp up to 1500bp, 109 were polymorphic (76,2%), with an average of 4,19. Of these, only 18 were specific of L. aequinoctialis, while 91 bands were specific for L. valdiviana. Data were used to generate Jaccard’s similarity coefficients and to construct a dendrogram using UPGMA method in the BiodiversityPro statistical package. It is concluded from this study that there were clear differences (high genetic diversity) between L. aequinoctialis and L. valdiviana and that RAPD sesults are comparable with those obtained from studies on morphology, It is a practical method to assess the relationships between these species.La similitud genética entre Lemna aequinoctialis y Lemna valdiviana fue determinada utilizando el análisis de fragmentos polimórficos de ADN amplificados al azar (RAPDs). Un total de 26 de los 60 iniciadores (10 nucleótidos) monitoreados fueron capaces de amplificar ADN, generando 143 bandas desde 200pb  hasta 1500pb, de las cuales 109 son polimórficas (76,2%) con una media de 4,19 bandas polimórficas por iniciador. De estas solo 18 fueron específicas de L. aequinoctialis, mientras que 91 bandas fueron específicas para L. valdiviana. Las distancias genéticas se estimaron por medio del coeficiente de similitud Jaccard. Con base en las distancias genéticas, se construyó un dendrograma mediante el método UPGMA, usando el programa BioDiversityPro. Se concluye de este estudio que hay claras diferencias (alta diversidad genética) entre L. aequinoctialis y L. valdiviana y que el  uso de marcadores RAPD es muy eficiente en la identificación de estas especies

Diversidad genética entre especies del género lemna (lemnaceae) utilizando fragmentos polimórficos de ADN amplificados al azar (rapds)

La similitud genética entre Lemna aequinoctialis y Lemna valdiviana fue determinada utilizando el análisis de fragmentos polimórficos de ADN amplificados al azar (RAPDs). Un total de 26 de los 60 iniciadores (10 nucleótidos) monitoreados fueron capaces de amplificar ADN, generando 143 bandas desde 200pb  hasta 1500pb, de las cuales 109 son polimórficas (76,2%) con una media de 4,19 bandas polimórficas por iniciador. De estas solo 18 fueron específicas de L. aequinoctialis, mientras que 91 bandas fueron específicas para L. valdiviana. Las distancias genéticas se estimaron por medio del coeficiente de similitud Jaccard. Con base en las distancias genéticas, se construyó un dendrograma mediante el método UPGMA, usando el programa BioDiversityPro. Se concluye de este estudio que hay claras diferencias (alta diversidad genética) entre L. aequinoctialis y L. valdiviana y que el  uso de marcadores RAPD es muy eficiente en la identificación de estas especies.Lemna aequinoctialis and Lemna valdiviana were tested genetic similarity by random amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprinting. Of 60 primers (10-mer) tested, 26 generated polymorphic products. 143 bands were found from 200bp up to 1500bp, 109 were polymorphic (76,2%), with an average of 4,19. Of these, only 18 were specific of L. aequinoctialis, while 91 bands were specific for L. valdiviana. Data were used to generate Jaccard’s similarity coefficients and to construct a dendrogram using UPGMA method in the BiodiversityPro statistical package. It is concluded from this study that there were clear differences (high genetic diversity) between L. aequinoctialis and L. valdiviana and that RAPD sesults are comparable with those obtained from studies on morphology, It is a practical method to assess the relationships between these species

Implementación de una técnica inmunoenzimática para el diagnóstico de la paragonimiasis humana

La paragonimiasis es una enfermedad zoonótica parasitaria que se considera desatendida y subdiagnosticada en nuestro país. El hombre se infecta al ingerir cangrejos de río crudos o mal cocinados que contienen el tremátodo. Debido a que no existe prueba diagnóstica inmunológica para determinar la presencia de paragonimiasis extrapulmonar en la población humana de Costa Rica, el objetivo del presente estudio fue analizar diferentes cisteínas-proteasas recombinantes del parásito, para determinar su uso potencial como antígenos en una prueba inmunoenzimática.Paragonimiasis is a zoonotic parasitic disease that is considered neglected and underdiagnosed in our country. considered neglected and underdiagnosed in our country. Humans become man is infected by ingesting raw or undercooked crayfish containing the trematode. trematode. Because there is no immunological diagnostic test to determine the presence of paragonimiasis, there is no the presence of extrapulmonary paragonimiasis in the human population of Costa Rica, the objective of the population of Costa Rica, the objective of the present study was to analyze different cysteine different recombinant cysteine-proteases of the parasite, to determine their their potential use as antigens in an enzyme-linked immunosorbent assay. enzyme-linked immunosorbent assay.Escuela de Medicina Veterinari

Evaluación de proteínas recombinantes PwCP4, PwCP7 y PwCP9 usando sueros de ratas Wistar infectadas experimentalmente con Paragonimus mexicanus

Suplemento XXII Congreso Nacional de Medicina Veterinaria, Costa Rica 2017La paragonimiasis es una enfermedad zoonótica parasitaria que se considera desatendida y subdiagnosticada en nuestro país. El ser humano puede infectarse a través del consumo de cangrejos de agua dulce crudos o insuficientemente cocidos. Desde 1976 se han reportado 27 casos en Costa Rica, generalmente fueron diagnosticados en niños (90 %) que vivían en zonas rurales (vertiente Atlántica y Pacífica), y estos niños presentaron en un 50 % de los casos enfermedad extrapulmonar. La aplicación de una prueba intradérmica en escolares de Talamanca en el año 1999 determinó un 23 % (23/100) de los niños con reacciones positivas a Paragonimus mexicanus. Otro estudio realizado en el 2015 estableció un alto consumo de cangrejo de agua dulce (21 %) en la población, y determinó un 12.7 % (44/347) de cangrejos de 67 % (8/12) sitios analizados como infectados con el parásito. Debido a que no existe prueba diagnóstica inmunológica para determinar la presencia de paragonimiasis extrapulmonar en la población humana de Costa Rica, el objetivo del presente estudio fue obtener y caracterizar diferentes proteínas recombinantes del parásito, para ser utilizadas como antígenos en una prueba inmunoenzimática. Se expresaron y purificaron diferentes cisteínas proteasas (CP) recombinantes de Paragonimus westermani (Pw), las cuales, posteriormente, se evaluaron mediante la técnica de immunoblot con sueros de ratas Wistar infectadas experimentalmente con P. mexicanus y ratas Wistar controles (no infectadas con P. mexicanus). Los tres antígenos recombinantes (PwCP4, PwCP7 y PwCP9) resultaron ser específicos, ya que reconocieron los anticuerpos presentes en el suero de ratas infectadas, no así en las ratas no infectadas. Se concluye, que estas proteínas parecen ser promisorias para ser utilizadas en el diagnóstico inmunológico de la parasitosis.Paragonimiasis is a parasitic zoonotic disease that is considered neglected and underdiagnosed in our country. Humans can become infected through the consumption of crabs raw or insufficiently cooked freshwater. Since 1976, 27 cases have been reported in Costa Rica, were generally diagnosed in children (90%) who lived in rural areas (slope Atlantic and Pacific), and these children presented extrapulmonary disease in 50% of the cases. The application of an intradermal test in schoolchildren from Talamanca in 1999 determined a 23 % (23/100) of children with positive reactions to Paragonimus mexicanus. Another study carried out in 2015 established a high consumption of freshwater crab (21%) in the population, and determined a 12.7% (44/347) of crabs from 67% (8/12) sites analyzed as infected with the parasite. Due because there is no immunological diagnostic test to determine the presence of paragonimiasis extrapulmonary in the human population of Costa Rica, the objective of the present study was to obtain and characterize different recombinant proteins of the parasite, to be used as antigens in an enzyme immunoassay. Different cysteine ​​proteases (CP) were expressed and purified. recombinants of Paragonimus westermani (Pw), which were subsequently evaluated using the immunoblot technique with sera from Wistar rats experimentally infected with P. mexicanus and control Wistar rats (not infected with P. mexicanus). The three recombinant antigens (PwCP4, PwCP7 and PwCP9) turned out to be specific, since they recognized the antibodies present in the serum of infected rats, but not in uninfected rats. It is concluded that these proteins appear to be promising to be used in the immunological diagnosis of parasitosis.Universidad Nacional, Costa RicaEscuela de Ciencias BiológicasEscuela de Medicina Veterinari

Detection of Human Paragonimiasis by ELISA Using Recombinant Paragonimus westermani Cysteine Protease 7

Paragonimiasis is an important but neglected foodborne trematodiasis caused by Paragonimus mexicanus in Costa Rica. Immunological techniques for diagnosing this parasitosis in humans do not exist in Central America. The objective of the present study was to use recombinant Paragonimus westermani cysteine protease 7 to standardize an ELISA for the detection of antibodies against Paragonimus spp. Human sera positive for P. westermani, P. mexicanus, or Paragonimus spp., human sera infected with other helminths, as well as sera of healthy humans without parasitic infections, were analyzed. The sensitivity of the ELISA was 92.9%, and the specificity was 91.9%. This report is the first to describe the development of an ELISA for the diagnosis of Paragonimus spp. in Costa Rica and Central America. Using this ELISA in the health system of Costa Rica is recommended to detect infections.La paragonimiasis es una importante pero desatendida trematodiasis de transmisión alimentaria causada por Paragonimus mexicanus en Costa Rica. En Centroamérica no existen técnicas inmunológicas para diagnosticar esta parasitosis en humanos. El objetivo del presente estudio fue utilizar la cisteína proteasa 7 recombinante de Paragonimus westermani para estandarizar un ELISA para la detección de anticuerpos contra Paragonimus spp. Se analizaron sueros humanos positivos para P. westermani, P. mexicanus o Paragonimus spp., sueros humanos infectados con otros helmintos, así como sueros de humanos sanos sin infecciones parasitarias. La sensibilidad del ELISA fue del 92,9% y la especificidad del 91,9%. Este informe es el primero que describe el desarrollo de una prueba ELISA para el diagnóstico de Paragonimus spp. en Costa Rica y Centroamérica. Se recomienda el uso de este ELISA en el sistema de salud de Costa Rica para detectar infecciones.Universidad Nacional, Costa RicaEscuela de Medicina Veterinari

Experiencia práctica: socialización de conceptos, aplicaciones y beneficios de la biotecnología en Costa Rica

Practical experience: socializing the concepts, applications and benefits of biotechnology in Costa Rica. Biotechnological processes have accompanied humanity since the beginning of civilization; proof of this is the use of yeasts for the preparation of bread, wine and beer. Biotechnology has also been fundamental in the improvement of plants and animals that are part of the human diet; and in vitro culture techniques have accelerated the processes for obtaining better crops for our growing population. The project “Biotechnology for everyone: Socialization of concepts, applications and benefits” socializes the concepts, applications and benefits of biotechnology among educators, opinion-forming groups, and producers in the agricultural and food sectors. The project has successfully used new technologies to reach its goals.Los procesos biotecnológicos han acompañado a la humanidad desde los inicios de la civilización; prueba de este se encuentra el uso de levaduras para la elaboración de pan, vino y cerveza. La biotecnología también ha sido fundamental en el mejoramiento de plantas y animales que forman parte de la dieta humana; y las técnicas de cultivo in vitro han aceleró los procesos para obtener mejores cultivos para nuestra creciente población. El proyecto “Biotecnología para todos: Socialización de conceptos, aplicaciones y beneficios” socializa los conceptos, aplicaciones y beneficios de la biotecnología entre educadores, grupos de opinión y productores de los sectores agrícola y alimentario. El proyecto ha utilizado con éxito nuevas tecnologías para alcanzar sus objetivos.Universidad Nacional, Costa RicaUniversidad de Costa Rica, Costa RicaEscuela de Ciencias Biológica

Fungal Extracellular Lipases from Coffee Plantation Environments for the Sustainable Management of Agro-Industrial Coffee Biomass

Coffee wastes have large amounts of by-products rich in phenolic compounds such as chlorogenic and caffeic acid, with potential applications for developing fine chemicals such as caffeic acid phenethyl ester (CAPE). A screening for microorganisms was undertaken in a coffee plantation environment to isolate native tropical species able to modify secondary metabolites present in this kind of biomass enzymatically. From the screening, 130 fungal strains could grow in lipase inducer media. Fungal strains were identified via ITS-based sequencing. Classification based on BLAST assigned 51 isolates to 12 different genera, including Absidia, Aspergillus, Cunninghamella, Fusarium, Metarhizium, Meyerozyma, Mucor, Neocosmospora, Papiliotrema, Penicillium, Rhizopus, and Trichoderma. DNA sequencing identified 14 putative extracellular lipases. According to the extracellular lipase activity, the most promising strain was identified as Fusarium sp. by DNA barcoding. Extracellular lipases from this strain exhibited maximal hydrolytic activity at a temperature of 45 °C, a pH of 7.00, and 200 ppm of NaCl, with an affinity towards substrates having carbon chain lengths of 8 or longer. Under these conditions, lipase instead of esterase activity is the main feature. The Km and Vmax values calculated using p-nitrophenyl palmitate (pNPP) as hydrolysis substrate were 0.003 mM and 299.8 μmol min−1 mg−1, respectively. Fusarium sp. lipases presented high stability during freeze–thawing, allowing the storage of enzyme solutions at −20 °C, but not as a lyophilized powder. According to our kinetic study, these lipases catalyzed CAPE hydrolysis, showing a progressive decrease in the concentration of the CAPE and a correspondent increase in the caffeic acid concentration as a product of this hydrolysis. Being able to carry out this type of reaction under mild conditions shows that Fusarium sp. lipases recognize CAPE as substrate and suggest CAPE synthesis (reverse reaction) and transformation can be engineered, using caffeic acid from coffee biomass, as a potential industrial application for these lipases.Los desechos del café tienen grandes cantidades de subproductos ricos en compuestos fenólicos como el ácido clorogénico y cafeico, con aplicaciones potenciales para el desarrollo de productos químicos finos como el éster fenetílico del ácido cafeico (CAPE). Se realizó un screening de microorganismos en un ambiente de plantación de café para aislar especies tropicales nativas capaces de modificar enzimáticamente metabolitos secundarios presentes en este tipo de biomasa. A partir del análisis, 130 cepas de hongos pudieron crecer en medios inductores de lipasa. Las cepas de hongos se identificaron mediante secuenciación basada en ITS. La clasificación basada en BLAST asignó 51 aislados a 12 géneros diferentes, incluidos Absidia, Aspergillus, Cunninghamella, Fusarium, Metarhizium, Meyerozyma, Mucor, Neocosmospora, Papiliotrema, Penicillium, Rhizopus y Trichoderma. La secuenciación del ADN identificó 14 supuestas lipasas extracelulares. Según la actividad de la lipasa extracelular, la cepa más prometedora fue identificada como Fusarium sp. mediante códigos de barras de ADN. Las lipasas extracelulares de esta cepa exhibieron actividad hidrolítica máxima a una temperatura de 45 °C, un pH de 7,00 y 200 ppm de NaCl, con una afinidad hacia sustratos que tienen longitudes de cadena de carbono de 8 o más. En estas condiciones, la característica principal es la actividad lipasa en lugar de la esterasa. Los valores de Km y Vmax calculados utilizando palmitato de p-nitrofenilo (pNPP) como sustrato de hidrólisis fueron 0,003 mM y 299,8 μmol min-1 mg-1, respectivamente. Fusariumsp. Las lipasas presentaron alta estabilidad durante la congelación-descongelación, lo que permitió el almacenamiento de soluciones enzimáticas a -20 °C, pero no como polvo liofilizado. Según nuestro estudio cinético, estas lipasas catalizaron la hidrólisis de CAPE, mostrando una disminución progresiva en la concentración de CAPE y un correspondiente aumento en la concentración de ácido cafeico como producto de esta hidrólisis. Poder realizar este tipo de reacciones en condiciones suaves demuestra que Fusarium sp. Las lipasas reconocen a CAPE como sustrato y sugieren que se puede diseñar la síntesis de CAPE (reacción inversa) y la transformación, utilizando ácido cafeico de la biomasa del café, como una posible aplicación industrial para estas lipasas.Universidad Nacional, Costa RicaMultidisciplinary Digital Publishing Institute, SuizaEscuela de Ciencias BiológicasEscuela de Químic