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p53, Hautpigmentierung und Vitamin D: Untersuchungen zur Assoziation der Genvarianten (SNPs) von Mitgliedern der p53-Familie (p53, p63, p73) und der 25-Hydroxyvitamin- D-Serumkonzentration
Hintergrund: Der Vitamin-D-Serumspiegel wird neben seinem bereits bekannten
Ein uss auf den Kalzium-Phosphat-Haushalt in neueren Studien mit zahlreichen
Erkrankungen wie Hypertonie, kardiovaskulären Erkrankungen und der
Entstehung von Tumoren in Verbindung gebracht. Die kutane Bildung von Vitamin
D selbst wird durch die individuelle Pigmentierung der Haut sowie externe
Faktoren wie Lebensstil, Jahreszeit und Breitengrad und die damit verbundene
UV-Strahlungsexposition mitbestimmt. Neueste Erkenntnisse deuten auf eine
Mitwirkung des bekannten Tumorsuppressors p53 im durch UV-Strahlung induzierten
kutanen Pigmentierungsprozess hin. In der vorliegenden Arbeit wurde die
Möglichkeit untersucht, ob single nucleotide polymorphisms (SNPs) in Genen der
p53-Familie mit möglichem Bezug zur individuellen Hautpigmentierung mit dem
Serumspiegel von 25-Hydroxyvitamin D (25(OH)D) assoziiert werden können.
Methoden: Die verwendeten Daten wurden der Ludwigshafen Risk and Car-
diovascular Health Study (LURIC)-Studie, bestehend aus einem Kollektiv von
3.316 (hier n = 3.040) Patienten kaukasischer Herkunft entnommen. Insgesamt
wurden 91 SNPs mit möglicher Assoziation zur Hautpigmentierung untersucht,
die sich in den Genen der zur p53-Familie gehörenden Proteine p53, p63 und p73
be nden. Der Median der 25(OH)D-Werte betrug 15,5 ng/ml.
Ergebnisse: Für 4 SNPs ergab sich ein nach der Primäranalyse signi kant
erhöhter beziehungsweise erniedrigter 25(OH)D-Serumspiegel (p <0,05, Median 15,5 ng/ml) zwischen den jeweils drei pro SNP möglichen Genotypkombinationen.
Diese vier Polymorphismen sind alle im p63-Gen lokalisiert. Im paarweisen
Vergleich dieser Genotypkombinationen konnten drei SNPs auch nach Adjustierung
ihre statistische Signi kanz (p <0,05) erhalten.
9 SNPs waren mit relativ hohen D25(OH)D-Werten (>2,8 ng/ml) assoziiert,
obgleich das Signi kanzniveau nicht erreicht wurde. Diese Genpolymorphismen
be nden sich in p53, p63 und p73. In der linearen Regression, welche für Geschlecht,
body mass index (BMI), Geburtsjahr und Monat der Blutentnahme
adjustiert wurde, konnte ein R2 (Determinationskoe zient) zwischen 9,0% und
9,2% ermittelt werden. Dies zeigt auf, welcher Anteil der Varianz der 25(OH)DWerte
durch die SNPs erklärt wird.
Anhand der Kaplan-Meier-Kurve und der Cox-Regression wurde der Ein uss der
4 SNPs rs4687087, rs12630584, rs16864784 und rs9681004 auf das Überleben der
Patienten untersucht. Es ergab sich keine Signi kanz bezüglich des Überlebensrisikos.
Die Untersuchung auf Saisonalität der 25(OH)D-Serumkonzentration zeigte
die typischen jahreszeitlichen Schwankungen mit dem stärksten Vitamin-DMangel
im Winterhalbjahr von November bis April. Beim Vergleich des 25(OH)-
D-Status männlicher und weiblicher Patienten wies das männliche signi kant
(p <0,001) geringere Serumkonzentrationen als das weibliche Geschlecht auf.
Fazit: Im hier untersuchten Kollektiv kaukasischer Herkunft wurden SNPs in
Genen der p53-Familie mit möglichem Bezug zur Hautpigmentierung mit dem
25(OH)D-Serumspiegel assoziiert.
Insgesamt 4 der 91 untersuchten Genpolymorphismen zeigten eine signi kante
Korrelation mit dem 25(OH)D-Serumspiegel (p <0,05). Diese vier Polymorphismen
sind alle im für p63 codierenden Gen lokalisiert. Im paarweisen Vergleich
der je drei möglichen Genotypkombinationen ergab sich statistische Signi kanz
(p <0,05) für insgesamt drei SNPs. Diese Studie zeigt somit, dass Polymorphismen
im p63-Gen mit dem 25(OH)D-Status assoziiert sind.Background: Beside its commonly known in uence on the balance of calcium
and phosphate, recent studies regarding to numerous diseases as hypertonia, cardiovascular
diseases and the tumorigenesis are associated with serum vitamin D
level. The cutaneous generation of vitamin D is co-determined by individual
skin pigmentation as well as by external factors such as lifestyle, season of year
and latitude and the resulting exposition to UV radiation. Newest perceptions
indicate the well known tumor suppressor p53 to co-operate in the UV radiationinduced
process of cutaneous pigmentation. This study investigates the possibility
of an association of SNPs in genes of the p53 family with possible relation
to individual skin pigmentation with the serum level of 25-hydroxyvitamin D
(25(OH)D).
Methods: Used data was extracted from the LURIC study, composed of a
group of 3,316 (here n = 3,040) patients with caucasian origin. Overall, 91
SNPs with potential association on skin pigmentation were analysed. Those
SNPs are contained in the proteins p53, p63 and p73 that belong to genes of the
p53 family. The median of serum 25(OH)D concentration relating to the entire
group, was 15.5 ng/ml.
Results: After primary analysis, 4 SNPs in genes of the p53 family showed a signi
cantly raised or lowered 25(OH)D serum level (p <0.05, median 15.5 ng/ml)
for the three di erent genotype combinations of each SNP. All those polymorphisms
are located in the p63 gene. Pairwise comparison of these genotype combinations
per SNP resulted in three SNPs with statistical signi cance (p <0.05)
after adjustment.
9 SNPs were associated with relatively high D25(OH)D values (>2.8 ng/ml),
although the aimed signi cance level was not reached. Those SNPs are located
in genes of the proteins p53, p63, and p73. By using a linear regression model,
adjusted for sex, body mass index (BMI), year of birth and month of blood
sample, we calculated R2 as coe cient of determination, between 9.0% and 9.2 %. It explains the part of variance of serum 25(OH)D level that is determined
by SNPs.
On basis of Kaplan-Meier analysis and Cox regression, we determined the in-
uence of the 4 SNPs rs4687087, rs12630584, rs16864784, and rs9681004 on
patients' survival. There was no signi cance concerning risks in survival. Analysis
on saisonality of serum 25(OH)D levels showed the characteristic seasonal
variation with the strongest vitamin D de ciency in the winter period from
November to April. The comparison of serum 25(OH)D levels between male and
female patients revealed a signi cantly lower 25(OH)D serum concentration in
male gender in our cohort (p <0.001).
Conclusions: In the cohort of caucasian origin presented in this study, polymorphisms
with possible reference to skin pigmentation are associated to serum
25(OH)D levels.
In total, 4 of 91 SNPs showed a signi cant impact on serum 25(OH)D concentration.
These four SNPs are all located in the gene coding for p63. Pairwise
comparison of the three possible genotype combinations per SNP resulted in
three SNPs with statistical signi cance (p <0.05). This result shows that
polymorphisms in the p63 gene are associated with the 25(OH)D status
Phase evolution of C-(N)-A-S-H/N-A-S-H gel blends investigated via alkali-activation of synthetic calcium aluminosilicate precursors
Stoichiometrically-controlled alkali-activated pastes containing calcium-(sodium) aluminosilicate hydrate (C-(N)-A-S-H) and sodium aluminosilicate hydrate (N-A-S-H) gels are produced by alkali-activation of high-purity synthetic calcium aluminosilicate powders. These powders are chemically comparable to the glass in granulated blast furnace slag, but without interference from minor constituents. The physiochemical characteristics of these gels depend on precursor chemical composition. Increased Ca content of the precursor promotes formation of low-Al, high-Ca C-(N)-A-S-H with lower mean chain length as determined by quantification of solid state nuclear magnetic resonance spectra, and less formation of calcium carboaluminate ‘Alumino-ferrite mono’ (AFm) phases. Increased Al content promotes Al inclusion and reduced crosslinking within C-(N)-A-S-H, increased formation of calcium carboaluminate AFm phases, and formation of an additional N-A-S-H gel. Small changes in precursor composition can induce significant changes in phase evolution, nanostructure and physical properties, providing a novel route to understand microstructural development in alkali-activated binders and address key related durability issues
Implementation of GOST algorithm in embedded systems crypto applications
Artykuł poświęcono problemowi skutecznej implementacji w systemach wbudowanych blokowego symetrycznego algorytmu kryptograficznego GOST. Przeprowadzone badania programowej implementacji na platformie AVR algorytmu GOST wykazały lepszy wskaźnik wydajność/rozmiar kodu w porównaniu z innymi znanymi algorytmami. Analiza porównawcza implementacji kryptoalgorytmu GOST na bardziej zaawansowanych mikrokontrolerach (ARM) ujawniła ponadto mniejsze zapotrzebowanie na pamięć w porównaniu z najnowszym algorytmem AES przy porównywalnej wydajności.This paper discusses the implementation of a cryptographic algorithm GOST in common used 8-bit (AVR) and 32-bit (ARM) processors for embedded systems. The GOST algorithm has a Feistel network structure with 32-rounds and uses simple operations (Fig. 1), which are easily implemented in general purpose microcontrollers by system-level commands. In addition, the algorithm has no expansion key procedure, which is an advantage for lightweight-cryptography. The basic method to improve GOST performance is associated with careful substitution cycle (S1…S8) programming and, first of all, the number of reductions of such iterations (substitution boxes extension, registers exchange for bitwise rotation, key and substitution tables locations in RAM). Considering GOST as a lightweight-algorithm we obtain the best throughput/code size ratio (Fig. 3) compared with known implementations of other algorithms [1, 2]. The GOST efficiency on ARM-based architectures increases more due to the possibility of rotation (<<<11) and addition modulo 2 operations to combine in one instruction. The authors conclude that with similar performance (for AES-128), GOST implementation requires approximately 5 times less memory usage. In the identical key version AES-256 almost loses its advantage for maximum performance variant, outpacing GOST not more than 1.4 times (Tab. 2)
Production of the Yarrowia lipolytica fodder yest enriched in selenoaminoacids and B12 vitamin
Celem pracy było opracowanie warunków procesu produkcji drożdży paszowych Yarrowia lipolytica A-101, wzbogaconych o aminokwasy selenowe (selenometionina i selenocysteina) oraz w witaminę B12 (cyjanokobalaminę) w procesie prowadzonym w instalacji pilotowej (bioreaktory o pojemności roboczej do 2 m3). Stwierdzono, że dodatek do pożywki seleninu sodu oraz cyjanokobalaminy pozwala uzyskać drożdże paszowe o wysokiej wartości odżywczej. Stężenie selenometioniny i selenocysteiny w białku drożdży było w ilości odpowiednio 58 i 8 mg/100g białka. Ponadto, drożdże akumulowały do 12,5 µg/g witaminy B12.The aime of this study was to determine the effect of culture conditions and medium composition on the production of biomass Yarrowia lipolytica enriched with selenoaminocides and B12 vitamin in a pilot scale (working capacity to 2 m3). The studies showed thatthe addition of sodium selenite and cyanocobalamin into the culture broth correlated with a hight nutrition level of yeast. The concentration of selenomethionine and selenocysteine in the yeast protein was equal to 58 ang 8 mg/100g of protein, respectively. Additionally, the yeast accumulated B12 vitamin up to 12,5 µg/g