Ips acuminatus kills pines in southern Finland

201

IoT-käyttöliittymän luonti pilvipalvelua käyttäen

Insinöörityön tarkoituksena oli tutkia esineiden internetin nykytilaa ja mahdollisuuksia ja luoda Cumulocity-pilvipalvelulla loppukäyttäjille suunnattu käyttöliittymä. Työ tehtiin yhteistyössä teleoperaattoriyrityksen kanssa. Työssä tutkittiin teleoperaattoreiden kiinnostusta esineiden internetiin ja suomalaisen teleoperaattoriyrityksen tämänhetkistä esineiden internet -tarjontaa. Työhön kuului myös haastattelu, jonka avulla avattiin hieman teleoperaattoreiden tavoitteita näillä markkinoilla. Haastattelusta selvisi, että teleoperaattorit haluavat IoT:n mukanaan tuoman taloudellisen hyödyn. Pilvipalvelut tukevat esineiden internetiä hyvin, sillä se tuo tehokkaan ja helppopääsyisen alustan kerätyn datan analysointiin ja seurantaan. Insinöörityössä keskityttiin vahvasti Cumulocity-pilvipalveluun ja siihen, mitä Cumulocity pystyy tekemään. Cumulocity on joustava ja muokattavissa oleva palvelu, johon on helppo yhdistää omat dataa keräävät sensorit käyttäen esimerkiksi Raspberry Pi -laitetta. Työssä tutkittiin hieman Cumulocityn toimintoja ja sen käyttämiä teknologioita, kuten REST-rajapintaa ja AngularJS -sovelluskehystä. Cumulocity todettiin tehokkaaksi, mutta jatkojalostusta vaativaksi alustaksi tulevaisuuden IoT-toteutuksille. Työssä haastateltiin kymmentä yritystä, mutta IoT:n nykytilasta ja tulevaisuudesta kysyvä sähköpostihaastattelu herätti enemmän kysymyksiä kuin vastauksia. Talokeskus ja sen kiinteistöihin erikoistunut Tampuuri-järjestelmä herätti mielenkiinnon. Jatkohaastattelu Talokeskuksen kanssa paljasti, että Tampuurissa on jo valmiina muutama IoT-sovellus ja lisää on kehitteillä. Työssä päädyttiin siihen, että esineiden internet on lähitulevaisuuden innovaatioiden lähde ja yritysmaailmassa kehityskohteena, joka vapauttaa edullisesti lukemattomia henkilötyötunteja. Lisäksi Cumulocity on hyvin toimiva alusta esineiden internet -sovelluksille sekä valmiina pohjana että sovelluskehittäjien työkaluna.The objective for the thesis was to study the state of the Internet of Things today and the opportunities it offers in the future, and to create an end-user interface on a cloud service called Cumulocity. This work was done in co-operation with an international tele operator. This thesis studies the operator’s interest in the Internet of Things and the operator’s current IoT products. The thesis also includes an interview that showcases the operator's goals on the IoT market. The interview demonstrates that operators want to harness the economic benefit of IoT applications. This study also explores IoT and cloud services and how they synergize with each other. Cloud services support IoT applications excellently, since cloud-technology offers a powerful and accessible platform for analyzing and tracking gathered data. The main focus of the thesis is the Cumulocity cloud service and what it can be used to create. Cumulocity is a flexible service that can be used to monitor one’s own sensor network using, for example, Raspberry Pi-devices as gateways. This thesis describes Cumulocity and the technologies it uses, such as the REST interface and the AngularJS framework. Cumulocity is determined to be a powerful basis for future IoT applications, but in need of additional development. A questionnaire about the current state and future of IoT was sent to chosen companies as a part of this study. Unfortunately, not many answered the questionnaire. The lack of replies raised more questions than answers, but one of the companies, Talokeskus, came through with their interesting real-estate data platform, Tampuuri. A further interview with Talokeskus showed, that they had some IoT already implemented to the platform and a thirst for more. In conclusion, the Internet of Things will be a source of innovations in the near future and, being a powerful tool that will save countless of man-hours, a place for improvement in corporate life. In addition, Cumulocity is a great platform for the Internet of Things applications both as a ready template and as a powerful API for software developers

Muuttaisiko metsälakiehdotus metsäluonnon arvokkaiden elinympäristöjen turvaamisen käytäntöjä?

Tieteen tori: Metsälakiuudistu

Genetics of inherited small vessel diseases – in search of a novel small vessel disease and modifiers of the clinical course of CADASIL

The genetic and environmental risk factors of vascular cognitive impairment are still largely unknown. This thesis aimed to assess the genetic background of two clinically similar familial small vessel diseases (SVD), CADASIL (Cerebral Autosomal Dominant Arteriopathy with Subcortical Infarcts and Leukoencephalopathy) and Swedish hMID (hereditary multi-infarct dementia of Swedish type). In the first study, selected genetic modifiers of CADASIL were studied in a homogenous Finnish CADASIL population of 134 patients, all carrying the p.Arg133Cys mutation in NOTCH3. Apolipoprotein E (APOE) genotypes, angiotensinogen (AGT) p.Met268Thr polymorphism and eight NOTCH3 polymorphisms were studied, but no associations between any particular genetic variant and first-ever stroke or migraine were seen. In the second study, smoking, statin medication and physical activity were suggested to be the most profound environmental differences among the monozygotic twins with CADASIL. Swedish hMID was for long misdiagnosed as CADASIL. In the third study, the CADASIL diagnosis in the Swedish hMID family was ruled out on the basis of genetic, radiological and pathological findings, and Swedish hMID was suggested to represent a novel SVD. In the fourth study, the gene defect of Swedish hMID was then sought using whole exome sequencing paired with a linkage analysis. The strongest candidate for the pathogenic mutation was a 3’UTR variant in the COL4A1 gene, but further studies are needed to confirm its functionality. This study provided new information about the genetic background of two inherited SVDs. Profound knowledge about the pathogenic mutations causing familial SVD is also important for correct diagnosis and treatment options.Perinnöllisten aivojen pienten suonten tautien genetiikkaa – uuden taudin geneettinen tausta ja CADASILIN taudinkuvaa muuntelevat tekijät Verisuoniperäisistä häiriöistä johtuvan kognition heikentymisen syntyyn vaikuttavia geneettisiä ja ympäristötekijöitä tunnetaan toistaiseksi vähän. Tässä työssä tutkittiin kahden kliinisesti samankaltaisen aivojen pienten suonten taudin, CADASILin (Cerebral Autosomal Dominant Arteriopathy with Subcortical Infarcts and Leukoencephalopathy) ja ruotsalaisessa suvussa esiintyvän perinnöllisen multi-infarktidementian (Swedish hMID) genettistä taustaa. Ensimmäisessä osatyössä CADASILin taudinkuvaan vaikuttavia tekijöitä tutkittiin 134:n samaa NOTCH3-geenin mutaatiota (p.Arg133Cys) kantavan suomalaisen potilaan aineistossa. Potilaiden apolipoproteiini E (APOE) -genotyypit, angiotensinogeeniä koodittavan geenin (AGT) p.Met268Thr-polymorfia ja kahdeksan NOTCH3-polymorfiaa tutkittiin, mutta minkään niistä ei voitu osoittaa assosioituvan potilaan ensimmäisen aivoinfarktin tai migreenin kanssa. Toisessa osatyössä tupakointi, statiinilääkitys ja aktiivinen liikunta osoittatutuivat merkittävimmiksi eroiksi elintavoissa taudinkuvaltaan toisistaan poikkeavien CADASILia sairastavien identtisten kaksosten välillä. Kolmannessa osatyössä ruotsalaisen multi-infarktidementiaa sairastavan suvun CADASIL-diagnoosi osoitettiin vääräksi geneettisten, radiologisten ja patologisten tutkimusten perusteella. Neljännessä osatyössä pyrittiin selvittämään tämän taudin taustalla oleva geenivirhe eksomisekvensoinnin ja kytkentäanalyysin avulla. Tutkimusten perusteella lupaavin variantti sijaitsee COL4A1-geenin 3’UTR-alueella. Koska kyseessä on UTR-alueen variantti, lisätutkimukset ovat tarpeen variantin patogeenisyyden osoittamiseksi. Tämä tutkimus valotti kahden perinnöllisen vaskulaarisen taudin geneettistä taustaa. Taudin aiheuttavan geenivirheen ja taudinkuvaa muuntelevien tekijöiden tunteminen helpottaa sairauksien diagnostiikkaa ja uusien hoitomuotojen kehittämistä.Siirretty Doriast

Faunistic records of Carabidae and Staphylinidae (Coleoptera) caught by pitfall trapping in western Finnish Lapland

New faunistic records are given based on a total collection of 41 601 Coleoptera, of which 6 364 are Carabidae and 30 414 Staphylinidae. They were collected mostly by pitfall trapping in different forest and mire habitats in western Finnish Lapland. A total of 52 carabid and 186 staphy linid species are reported. Of these, 6 (11 %) and 49 (26 %) species, respectively, were new for the province Lapponia kemensis occidentalis (LkW). Microdota wireni Brundin is reported as new for Finland. Notes on the occurrence and biology of the following species are given: Platynus (Agonum) mannerheimii, Harpalus nigritarsis, Philonthus lederi, Lesteva monticola, Oxypoda operta, Mocyta (A theta) amblystegii, Lomechusa pubicollis and Myllaena hyperborea

Digitaalisen opetuksen kasvuyritysten kansainvälistymiseen vaikuttavat tekijät

As well as many other industries, education is currently being disrupted by new emerging digital solutions. Teachers all around the world are adopting new digital materials to their everyday teaching including digital books and educational games. This recent trend engenders opportunity for new companies to emerge with cutting-edge digital educational solutions. Furthermore, with a digital solution expansion to international markets without heavy investments is possible. However, for example in Finland only few companies have been able to successfully enter new markets with educational technology. Internationalization strategies have been widely studied during the past few decades. The early studies already identified a set of different market entry modes including export, licensing, franchising, joint ventures and wholly-owned subsidiaries. However, for small resource-limited companies, export is the most viable option. Export allows company to maintain the full control of the process and product without making heavy investments on the internationalization. The export performance framework shows that the export strategy is depending on both internal (company resources) and external factors (country and industry characteristics). More recent studies have also identified alternative entry modes such as cooperative strategies and innovative use of internet. However, the previous literature has not studied this topic purely in education industry and therefore does not provide detailed knowledge for startups planning international expansion in digital education industry. The aim of this study is to identify key determinants for market entry strategy selection for startups in digital education, and identify different strategies for addressing the major challenges in the digital education markets. To study this topic, 15 interviews were carried out to both experts of internationalization of digital education and companies that are pursuing international expansion with digital educational solutions. The data analysis followed Gioia methodology (Gioia, Corley, & Hamilton, 2012), in which 1st-order terms are identified first, and then the 2nd-order themes are established accordingly. The findings revealed several market-level factors that drive the market entry strategy selection. These factors were related to cultural and regulatory differences, trust and reliability, different customer types and customer needs. In addition, the findings showed several strategies how companies can address the challenges related to the above market-level factors. Therefore, this study provides managers of startups with insights of digital education markets as well as a toolkit for addressing the market-level challenges in digital education.Opetusala on kokemassa suuria muutoksia uusien digitaalisten ratkaisuiden myötä. Opettajat ympäri maailmaa ottavat opetuskäyttöön uusia digitaalisia ratkaisuja kuten digitaalisia oppikirjoja sekä oppimispelejä. Opetuksen digitalisaatio synnyttää uusia yrityksiä, jotka tuottavat innovatiivisia ja moderneja teknologiaratkaisuja opetuskäyttöön. Tämänlaisille digitaalisia ratkaisuja tuottaville yrityksille on mahdollista myös kasvaa kansainvälisesti ilman suuria alkuinvestointeja. Kuitenkin vain muutama suomalainen digitaalisia ratkaisuja tuottava yritys on kyennyt onnistuneesti laajentumaan uusille markkinoille. Kansainvälistymisstrategioita on tutkittu laajalti viimeisten vuosikymmenien aikana. Jo aikaiset tutkimukset määrittelivät erilaisia tapoja tunkeutua uusille markkinoille. Näitä tapoja ovat muun muassa vienti, lisensointi, franchise-periaate, yhteisyritys sekä tytäryhtiö. Useimmille pienille yrityksille suora vienti on kuitenkin parhaiten sopiva tapa kansainvälistyä. Suora vienti antaa yritykselle täyden kontrollin operaatiosta ja tuotteesta vaatimatta kuitenkaan suuria alkuinvestointeja. Viennin suorituskyky –malli osoittaa, että vientistrategia perustuu sekä sisäisiin (yrityksen resurssit) että ulkoisiin tekijöihin (markkina- ja toimiala kohtaisiin tekijöihin). Uudemmat tutkimukset ovat lisäksi esittäneet vaihtoehtoisia tapoja tunkeutua markkinoille kuten yhteistyöhön perustuvat strategiat ja internetin innovatiivinen hyödyntäminen. Kirjallisuus ei kuitenkaan ole tutkinut kansainvälistymistä pelkästään opetusalan näkökulmasta, eikä täten tarjoa yksityiskohtaista tietoa pienten digitaalisia ratkaisuja tuottavan yrityksen kansainvälistymisestä. Tämän tutkimuksen tavoitteena on tunnistaa keskeisimmät tekijät, jotka vaikuttavat pienten kasvuyritysten tapaan tunkeutua markkinoille, sekä tunnistaa erilaisia strategioita markkinoiden keskeisimpien haasteiden ylittämiseen. Tutkimuksessa suoritettiin 15 haastattelua sekä opetuksen kansainvälistämisen eksperteille että pienille kasvuyrityksille, jotka ovat kansainvälistyneet digitaalisen opetuksen alalla. Haastatteludata analysoitiin käyttämällä Gioia-metodia (Gioia et al., 2012), jossa tunnistetaan ensin ensimmäisen tason aiheet, joiden perusteella voidaan luoda laajempia toisen tason teemoja. Tutkimuksen tulokset toivat ilmi useita markkina-tason tekijöitä, jotka vaikuttavat yrityksen tapaan tunkeutua markkinoille. Nämä tekijät liittyivät kulttuuriin ja sääntelyyn, luotettavuuteen, erilaisiin asiakastyyppeihin, sekä asiakkaiden tarpeisiin. Tulokset toivat esiin myös useita tapoja, joilla yritykset voivat ylittää keskeiset haasteet liittyen edellä mainittuihin markkina-tason tekijöihin. Tutkimuksen tulokset tuovat esiin markkinoiden keskeisiä piirteitä sekä erilaisia tapoja vastata markkinoiden erityispiirteistä syntyviin haasteisiin

The Effects of Creative Destruction on Industry-Specific Productivity Growth:Creative Destruction During Economic Shocks

Productivity in Finland has been extremely stagnant since the Great Recession. This thesis studies the dynamics of industry-specific microstructural changes in labor productivity, focusing on four different productivity shocks including the opening to international trade and of capital markets that lead to a productivity shock in the mid-1980s, the early 1990s depression, the dot com bubble in the turn of the millennial and the Great Recession. Creative destruction is a mechanism in which resources inside an industry are reallocated in a more productive way due to non-viable firms exiting and more productive businesses entering the market as well as changes in the labor productivity shares of firms. The underlying theoretical framework is based on Schumpeterian new growth theory. The study seeks to find out whether the creative destruction process accelerates during economic downturns like theory suggests, and how the structure of labor productivity growth varies in time and in different sectors. The aim is also to determine the nature of the industries in terms of creative destruction, classifying the sectors accordingly. An empirical shift-share analysis is conducted using data that is decomposed according to the geometric Diewert–Fox decomposition method. The data covers years 1975–2011 and is micro level firm statistics on the Finnish manufacturing sectors. The analysis focuses on the so-called between component, which is considered as the most accurate measure for creative destruction. Among the four shocks studied, the Great Recession showed to have triggered most creative destruction as measured by a positive between component and net entry effect. In comparison, the 1990s recession triggered structural change to a lot smaller extent. Economic downturns appear to enhance creative destruction in certain sectors, but generally not in all manufacturing sectors simultaneously. To determine the nature of the industries studied, the sectors are classified both according to their R&D-, capital- and labor-intensity as well as according to their dependence on either domestic or export demand. Structural change seemed to be best associated with the R&D-intensive sectors and least with capital but not R&D-intensive sectors. Labor-intensive sectors fell between the two, with a significant net entry in common. Since the results varied among the sectors in each of the groups, and an optional classification was thus proposed. Domestic demand, measured as consumption growth, explained productivity growth only in one industry, whereas export growth appeared to explain the productivity growth in all other sectors. Many of the export-dependent sectors also experienced lots of creative destruction, except for the export-dependent industries also capital-intensive with little R&D, which did not seem to profit from creative destruction. The alternative classification sheds light on the differences among the sectors. While different sectors suffered productivity losses during different productivity shocks, the industries that most suffered in the Great Recession were also export-dependent. On the other hand, the domestic demand dependent sector actually saw its labor productivity increase under the same period. In addition, the increasing positive contribution of net entry indicates that the ’destructive’ effect of creative destruction is lately on the rise, and could significate that the creative destruction process continues as strong also in the 2010s.siirretty Doriast

Glycosylation and Glycodiversification in Polyketide Antibiotics: Unraveling Biosynthetic Steps in Nogalamycin Formation

Soil-dwelling Streptomyces bacteria are known for their ability to produce biologically active compounds such as antimicrobial, immunosuppressant, antifungal and anticancer drugs. S. nogalater is the producer of nogalamycin, a potential anticancer drug exhibiting high cytotoxicity and activity against human topoisomerases I and II. Nogalamycin is an anthracycline polyketide comprising a four-ring aromatic backbone,a neutral deoxy sugar at C7, and an amino sugar attached via an O–C bond at C1 and a C–C bond between C2 and C5´´. This kind of attachment of the amino sugar is unusual thus making the structure of the compound highly interesting. The sugar is also associated with the biological activity of nogalamycin, as it facilitates binding to DNA. Furthermore, the sugar moieties of anthracyclines are often crucial for their biological activity. Together the interesting attachment of the amino sugar and the general reliance of polyketides on the sugar moieties for bioactivity have made the study of the biosynthesis of nogalamycin attractive. The sugar moieties are typically attached by glycosyltransferases, which use two substrates: the donor and the acceptor. The literature review of the thesis is focused on the glycosylation of polyketides and the possibilities to alter their glycosylation patterns. My own thesis work revolves around the biosynthesis of nogalamycin. We have elucidated the individual steps that lead to its rather unique structure. We reconstructed the whole biosynthetic pathway in the heterologous host S. albus using a cosmid and a plasmid. In the process, we were able to isolate new compounds when the cosmid, which contains the majority of the nogalamycin gene cluster, was expressed alone in the heterologous host. The new compounds included true intermediates of the pathway as well as metabolites, which were most likely altered by the endogenous enzymes of the host. The biological activity of the most interesting new products was tested against human topoisomerases I and II, and they were found to exhibit such activities. The heterologous expression system facilitated the generation of mutants with inactivated biosynthetic genes. In that process, we were able to identify the functions of the glycosyltransferases SnogE and SnogD, solve the structure of SnogD, discover a novel C1-hydroxylase system comprising SnoaW and SnoaL2, and establish that the two homologous non-heme α-ketoglutarate and Fe2+ dependent enzymes SnoK and SnoN catalyze atypical reactions on the pathway. We demonstrated that SnoK was responsible for the formation of the additional C–C bond, whereas SnoN is an epimerase. A combination of in vivo and in vitro techniques was utilized to unravel the details of these enzymes. Protein crystallography gave us an important means to understand the mechanisms. Furthermore, the solved structures serve as platforms for future rational design of the enzymes.Maaperässä esiintyvät Streptomyces-suvun bakteerit tunnetaan niiden kyvystä tuottaa biologisesti aktiivisia yhdisteitä. Nogalamysiini on potentiaalinen syöpälääke, joka on solumyrkyllinen ja aktiivinen ihmisen topoisomeraasi I:tä ja II:ta vastaan. S. nogalater -kanta tuottaa sitä. Nogalamysiini on antrasykliinipolyketidi, joka koostuu nelirenkaisesta aromaattisesta rungosta ja siihen C7-asemaan liittyneestä neutraalista sokerista sekä aminosokerista, joka on liittynyt sekä O–C-sidoksella asemaan C1 että C–C-sidoksella C2- ja C5´´-aseman välillä. Yhdisteen rakenne on hyvin mielenkiintoinen, sillä aminosokeri on kiinnittynyt hyvin epätyypillisellä tavalla ja on omalta osaltaan vastuussa nogalamysiinin biologisesta aktiivisuudesta, sillä se auttaa molekyylin sitoutumisessa DNA:han. Myös yleisellä tasolla sokeriosat ovat usein vastuussa polyketidien biologisesta aktiivisuudesta. Yhdessä rakenteen epätavallisuus sekä sokeriosien tärkeys ovat tehneet nogalamysiinin tutkimisesta olennaista. Sokeriosien kiinnittämisestä vastaa tyypillisesti sokerinsiirtäjäentsyymi glykosyylitransferaasi. Tämä entsyymi käyttää substraatteinaan kahta molekyyliä, aktivoitua sokeria ja vastaanottajamolekyyliä, johon sokeri liitetään. Työni kirjallisuuskatsaus keskittyy sokerien liittämiseen polyketideihin sekä mahdollisuuksiin muuttaa näitä sokerointimalleja. Omat tutkimustulokseni liittyvät nogalamysiinin biosynteesiin, jonka yksittäisiä askeleita olemme tutkineet selvittääksemme, mistä yhdisteen lähes ainutlaatuinen rakenne johtuu. Siirsimme nogalamysiinin biosynteesistä vastaavan geeniklusterin heterologiseen isäntään, S. albukseen, kosmidin ja plasmidin avulla. Kun siirsimme isäntäkantaan ainoastaan kosmidin, joka sisälsi suurimman osan klusterista, mutta ei kaikkia geenejä, havaitsimme kannan tuottavan uusia yhdisteitä. Työssä mittasimme uusien yhdisteiden bioaktiivisuuden ihmisen topoisomeraaseja I:tä ja II:ta vastaan, ja niissä huomattiin olevan aktiivisuutta. Biosynteesiin liittyvien geenien ilmentäminen heterologisessa isännässä mahdollisti inaktivointimutanttien teon. Työn aikana pystyimme selvittämään kahden sokerinsiirtäjäentsyymin, SnogE:n ja SnogD:n, toimintaa sekä SnogD:n rakenteen. Lisäksi löysimme uudenlaisen C1-aseman hydroksylaatiosysteemin, joka koostuu SnoaW:stä ja SnoaL2:sta, sekä kaksi homologista hemitöntä α-ketoglutaraatti- ja rauta2+ -riippuvaista entsyymiä: SnoK:n ja SnoN:n. Osoitimme, että SnoK on vastuussa epätyypillisen hiili–hiilisidoksen muodostumisesta, kun taas SnoN on epimeraasi. Entsyymien toiminnan yksityiskohtien selvittämiseksi käytimme sekä in vivo- että in vitro -tekniikoita. Proteiinikristallografian avulla selvitimme kolmen entsyymin kolmiulotteiset rakenteet, joiden avulla pystyimme ymmärtämään entsyymien reaktiomekanismeja paremmin. Lisäksi rakenteet helpottavat proteiinien muokkausta.Siirretty Doriast

Lakes and seas of Titan

Abstract. This thesis reviews studies about the lakes and seas of Saturn’s moon, Titan. Conditions on Titan’s surface are first estimated to validate that substances in Titan’s atmosphere can exist in liquid phase. This is followed by descriptions of devices that have been used to study Titan from Earth, space and on its surface. Research concerning the detection and distribution of the lakes are then discussed. Features of the lakes such as surface areas, chemical compositions and formations like shores are looked into. Results from models that describe liquid currents driven by tidal forces, wind, temperature differences and rain induced density differences are given. This leads into discussion of liquid surface waves. Titan’s potential for supporting life is also considered. Observation of a disappearing and reappearing region in Titan’s sea, the Magic Island phenomenon, is construed and possible causes for this phenomenon are examined. Lastly, future mission projects that are capable of studying the lakes in situ are described with the emphasis on the Titan Submarine project