Comparison of APACHE II and Imrie Scoring Systems in predicting the severity of Acute Pancreatitis

There has been an increasing amount of work worldwide in search for tests not only to be able to absolutely diagnose acute pancreatitis, but more importantly to prognosticate patients at admission. While the tests are still within the realm of research laboratories and involve complex computing and analytical methods, we believed that the already widely practiced methods of scoring needed to be verified in the Indian context. And, hence, the study

Modelos lineares generalizados em simulação hidrológica

O projeto e operação de sistemas de recursos hídricos usualmente requerem simulação de sequências de vazão, a fim de que a frequência com a qual o sistema falha possa ser estimada para determinação das demandas hídricas. Um modelo de simulação frequentemente empregado para sequências de vazões mensais é o modelo Thomas-Fiering, baseado em regressão linear. A aplicação deste modelo supõe a distribuição Normal dos desvios e a homogeneidade da variância. A falha destas suposições pode ser, algumas vezes, retificada por uma transformação Box-Cox da variável resposta o que pode prover benefícios adicionais de aproximações à normalidade e à aditividade. Nos anos recentes, uma família mais ampla de modelos (Modelos Lineares Generalizados), a qual inclui regressão linear como um caso particular, tem sido desenvolvida; esta dissertação explora o uso de MLGs em simulação de sequências de vazão. Em MLGs, a suposição de normalidade e homogeneidade de variância são relaxadas pela possibilidade de escolha de outra distribuição que a Normal e por permitir a aditividade dos efeitos sistemáticos na escala transformada, sendo a escolha da escala (função de ligação) independente da escolha da distribuição. Assim, um modelo adequado para modelagem de vazões mensais possivelmente seria o MLG log-Gama ou simplesmente Gama, o que provê um padrão de dispersão adequado das séries geradas a partir deste. Embora as abordagens acima possam ser adotadas, frequentemente é de interesse permitir explicitamente a heterogeneidade da variância (heterocedasticidade) na análise. A dificuldade é encontrar e ajustar um modelo satisfatório para variância. Logo, outra alternativa possível ao modelo Thomas-Fiering é o MLG Normal para a média das vazões mensais juntamente com o MLG log-Gama para a variância das mesmas. Como às vezes torna-se necessária a geração de sequências simultâneas de vazões mensais de vários postos, visando preservar a estrutura correlacional cruzada entre vazões mensais para cada par de postos, é proposto aqui uma abordagem multivariada para os modelos acima. Além disto, também é estudado o problema da geração de vazões mensais em rios intermitentes, sugerindo-se uma modificação no método de geração para levar em consideração não só a variabilidade das vazões mensais, mas também de sua ocorrência.The design and operation of water resource systems usually requires simulation of river flow sequences, in order that the frequency can be estimated with which the system fails to meet water demands. A common simulation model for monthly flow sequences is the Thomas-Fiering model, based in linear regression. The application of this model assumes Normal distribution of deviations and homogeneous variance. Any failure in these assumptions may, sometimes, be corrected by a Box-Cox transformation of the response variable, which provides additional benefits of approximations to normality and additivity. In recent years, a much broader family of models (Generalized Linear Models) which include linear regression as a particular case, has been developed; this thesis explores the use of GLMs for simulating sequences of river flows. In GLMs, the assumptions of normality and homogeneous variance are relaxed by the possibility of choosing a distribution different from the Normal one, and allowing additivity of systematic effects in the transformed scale, and the choice of distribution. Thus, an adequate model for the modelling of monthly flows might be the log-Gamma or simply Gamma GLM, which supplies an adequate dispersion pattern of the series generated from this model. Although the approaches shown above may be used, frequently it is useful explicity to allow heterogeneity of variance (heterocedascity) in analysis. The difficult lies in finding and adjusting a satisfactory model for variance. Therefore, another possible alternative to the Thomas-Fiering model is the Normal GLM for mean monthly flows, together with log-Gamma GLM for their variance. Since it is sometimes necessary to generate simultaneous sequences of monthly flows from several stations, to preserve the cross correlation structure between monthly flows for each pair of stations, a multivariate approach to the models above is proposed here. The problem of monthly flow generation in intermittent rivers is also studied, and a modification in the generation method is suggested to take into account not only the variability of monthly flows, but also their occurrence

Young broiler feeding kinematic analysis as a function of the feed type

The present study aims to compare the kinematic feeding variables of 3-4 days old broiler chickens using three different feed types: fine mash (F1), coarse mash (F2), and crumbled (F3); size was 476 mu m, 638 mu m, and 1243 mu m, respectively. The head displacement and the maximum beak gape were automatically calculated by computational image analysis to find the feeding behavior of broilers. The results did not show strong correlations between birds' weight, beak size (length and width), and the kinematic variables. The "catch-and-throw" movements in F1 (the smallest feed particle) generally occurred in the first mandibulation, while in F3 (the largest feed particle) occurred in the latest mandibulation. It can be suggested that the adoption of "catch-and-throw" in the latest mandibulations increases with larger particles. Abstract Past publications describe the various impact of feeding behavior of broilers on productivity and physiology. However, very few publications have considered the impact of biomechanics associated with the feeding process in birds. The present study aims at comparing the kinematic variables of young broiler chicks (3-4 days old; 19 specimens) while feeding them with three different feed types, such as fine mash (F1), coarse mash (F2), and crumbled feed (F3). The feeding behavior of the birds was recorded using a high-speed camera. Frames sequences of each mandibulation were selected manually and classified according to the temporal order that occurred (first, second, third, or fourth, and further). The head displacement and the maximum beak gape were automatically calculated by image analysis. The results did not indicate strong correlations between birds' weight, beak size (length and width), and the kinematic variables of feeding. The differences between the tested feed were found mostly in the first and second mandibulations, probably explained by the higher incidence of "catch-and-throw" movements in F3 (33%) and F1 (26%) than F2 (20%). The "catch-and-throw" movements in F1 (the smallest feed particle) mostly occurred in the first mandibulation, as in F3 (the largest feed particle) also occurred in the latest mandibulations. It might be suggested that the adoption of "catch-and-throw" in the latest mandibulations increases with larger particles. The kinematic variables in the latest mandibulations (from the third one on) seem to be similar for all feed types, which represent the swallowing phase. It might be inferred that the temporal sequence of the mandibulations should be essential to describe the kinematics of a feeding scene of broiler chickens, and the first and second mandibulations are potentially the key factors for the differences accounted by the diverse feed particle sizes912CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQsem informaçã

Divergência genética em híbridos de sorgo cultivados sob diferentes níveis de fósforo, em solução nutritiva.

Os objetivos deste trabalho consistiram em identificar a presença de diversidade genética entre acessos de sorgo, em diferentes condições de disponibilidade de P, em solução nutritiva, e determinar quais as características que mais contribuíram para a discriminação dessa divergência. O experimento foi conduzido em casa-de-vegetação, num arranjo fatorial 9x4, sendo nove híbridos de sorgo e quatro doses de P (3, 32, 97 e 129 µM de P.L-1 de solução nutritiva), sob delineamento em blocos ao acaso, com três repetições. Os dados foram submetidos à análise de variância e, posteriormente, ao estudo de dissimilaridade genética, utilizando a matriz de distância generalizada de Mahalanobis e a contribuição relativa das características para a divergência, pelo método de Singh (1981). Concluiu-se que a dose de 3 µM de P.L-1 de solução apresentou valores discrepantes dos demais, sendo desconsiderados seu valores para análise de variância conjunta. Diferenças significativas para todas as características avaliadas foram observadas entre os híbridos, nas doses de P analisadas (32, 97 e 129 µM de P.L-1 de solução nutritiva). A concentração de 97 µM de P.L-1 gerou o maior número de grupos de genótipos. Entretanto, variabilidade genética foi observada também nas demais doses de P. Sob as concentrações de P avaliadas, verificou-se que a característica massa seca total foi a que mais contribuiu para a expressão da dissimilaridade genética entre os híbridos. O híbrido experimental 0735019 apresentou eficiência e responsividade a utilização de P, demonstrando os maiores valores para as características avaliadas nos diferentes níveis de P estudados

Validation of a food frequency questionnaire for the adult population

OBJETIVO: Investigar a validade e a reprodutibilidade de um questionário de freqüência de consumo alimentar desenvolvido para a população adulta. MÉTODOS: Foram entrevistados, em três momentos, 69 indivíduos, de ambos os sexos, freqüentadores de restaurantes industriais em dois órgãos públicos de Brasília, Distrito Federal. Na primeira e terceira entrevistas foram aplicados um recordatório 24 horas e um questionário de freqüência de consumo alimentar, e na segunda entrevista, um recordatório 24 horas. A duração média do estudo foi de 181 dias. Macronutrientes, vitaminas A e C, cálcio, ferro, zinco, colesterol, fibras e energia total foram analisados utilizando-se os coeficientes de correlação intraclasse e de Pearson, este último na forma bruta e deatenuada. RESULTADOS: Quanto à reprodutibilidade, o questionário de freqüência de consumo alimentar obteve desempenho adequado, apresentando resultados acima de 0,7 para lipídeo, colesterol, energia e proteína. Para a validade, os melhores coeficientes deatenuados foram observados para vitamina C (r=0,66), ferro (r=0,58), proteína (r=0,55) e carboidrato (r=0,55) e os piores, para colesterol (r=0,32) e vitamina A (r=0,37). CONCLUSÃO: A obtenção de coeficientes de correlação expressivos para alguns nutrientes indica que este questionário de freqüência de consumo alimentar constitui-se em um bom instrumento de pesquisa para estudos epidemiológicos em população adulta, podendo fornecer informações importantes para a implementação de ações na área de saúde e nutrição.OBJECTIVE: The aim of the present study was to investigate the validity and reproducibility of a food frequency questionnaire developed for the adult population. METHODS: Sixty-nine individuals from both genders who attended industrial restaurants from two government divisions in Brasília, Federal District, Brazil, were interviewed on three different occasions. In the first and third interviews, a 24h recall and a food frequency questionnaire were applied, and in the second interview only a 24h recall was applied. The study lasted 181 days. Macronutrients, vitamins A and C, calcium, iron, zinc, cholesterol, fibers and total energy were analyzed using the intraclass and Pearson's correlation coefficients, this last one in a crude and deattenuated manner. RESULTS: Regarding reproducibility, the food frequency questionnaire provided adequate results, presenting correlation coefficients above 0.7 for lipid, cholesterol, energy and protein. For validity, the best deattenuated coefficients were observed for vitamin C (r=0.66), iron (r=0.58), protein (r=0.55) and carbohydrate (r=0.55) and the worst for cholesterol (r=0.32) and vitamin A (r=0.37). CONCLUSION: The expressive correlation coefficients obtained for some nutrients indicates that this food frequency questionnaire constitutes a good research instrument for epidemiological studies in the adult population, as it can supply important dietary information allowing the implementation of actions in the health and nutrition areas

O impacto da COVID-19 na população idosa: revisão bibliográfica

RESUMO: Objetivo: o objetivo do presente estudo foi evidenciar o impacto da covid-19 na população idosa, identificando os problemas enfrentados por esse grupo durante a pandemia. Método: Foi realizada busca bibliográfica na base de dados Scielo no dia 19 /12/2020, utilizando os idiomas português e espanhol, resultando em 1.643 artigos que após a inserção de novo filtro - covid e idosos- resultou em 71 artigos. Foram selecionados artigos que continham no título "idoso e COVID-19" e, após a remoção de artigos duplicados, selecionamos 6 trabalhos que atendiam a todos os critérios. Resultados: Pessoas idosas com multimorbidades têm um risco aumentado de apresentar a forma grave da COVID – 19. As informações que cada país veiculava sobre o tema eram heterogêneas, visto que as características de cada lugar são singulares e a forma como cada governo se porta diante das informações e se prepara para receber a população idosa difere de um local para outro. A Pandemia também ocasionou e amplificou casos de violência contra os idosos, inclusive a discriminação dos mesmos. Conclusão: A pandemia do vírus Covid – 19 ocasionou e exacerbou vários problemas na população idosa. Foi identificada nos trabalhos estudados, a questão da pessoa idosa estar inserida no grupo de risco e, o aumento do risco de complicações dessa parcela da população quando associadas idade e comorbidades. Evidenciou-se também, a presença do aumento da violência nos seus vários aspectos e da comunicação inapropriada em geral, como por exemplo as ¨Fake News” cibernéticas e televisivas. O Sistema único de saúde tem um papel importante por intermédio da Estratégia de saúde da família de amenizar as iniquidades sociais, assim como controlar as doenças crônicas e sua prevenção, diminuindo as comorbidades e a suscetibilidade da pessoa idosa a agravos. A pandemia traz reflexões importantes sobre a implementação de políticas públicas sociais e de saúde que assegurem o esclarecimento e os direitos da população idosa

Efficient CRISPR-mediated base editing in Agrobacterium spp.

Agrobacterium spp. are important plant pathogens that are the causative agents of crown gall or hairy root disease. Their unique infection strategy depends on the delivery of part of their DNA to plant cells. Thanks to this capacity, these phytopathogens became a powerful and indispensable tool for plant genetic engineering and agricultural biotechnology. Although Agrobacterium spp. are standard tools for plant molecular biologists, current laboratory strains have remained unchanged for decades and functional gene analysis of Agrobacterium has been hampered by time-consuming mutation strategies. Here, we developed clustered regularly inter-spaced short palindromic repeats (CRISPR)-mediated base editing to enable the efficient introduction of targeted point mutations into the genomes of both Agrobacterium tumefaciens and Agro-bacterium rhizogenes. As an example, we generated EHA105 strains with loss-of-function mutations in recA, which were fully functional for maize (Zea mays) transformation and confirmed the importance of RolB and RolC for hairy root development by A. rhizogenes K599. Our method is highly effective in 9 of 10 colonies after transformation, with edits in at least 80% of the cells. The genomes of EHA105 and K599 were resequenced, and genome-wide off-target analysis was applied to investigate the edited strains after curing of the base editor plasmid. The off-targets present were characteristic of Cas9-independent off-targeting and point to TC motifs as activity hotspots of the cytidine deaminase used. We anticipate that CRISPR-mediated base editing is the start of "engineering the engineer," leading to improved Agrobacterium strains for more efficient plant transformation and gene editing

An Essential Nuclear Protein in Trypanosomes Is a Component of mRNA Transcription/Export Pathway

In eukaryotic cells, different RNA species are exported from the nucleus via specialized pathways. The mRNA export machinery is highly integrated with mRNA processing, and includes a different set of nuclear transport adaptors as well as other mRNA binding proteins, RNA helicases, and NPC-associated proteins. The protozoan parasite Trypanosoma cruzi is the causative agent of Chagas disease, a widespread and neglected human disease which is endemic to Latin America. Gene expression in Trypanosoma has unique characteristics, such as constitutive polycistronic transcription of protein-encoding genes and mRNA processing by trans-splicing. In general, post-transcriptional events are the major points for regulation of gene expression in these parasites. However, the export pathway of mRNA from the nucleus is poorly understood. The present study investigated the function of TcSub2, which is a highly conserved protein ortholog to Sub2/ UAP56, a component of the Transcription/Export (TREX) multiprotein complex connecting transcription with mRNA export in yeast/human. Similar to its orthologs, TcSub2 is a nuclear protein, localized in dispersed foci all over the nuclei —except the fibrillar center of nucleolus— and at the interface between dense and non-dense chromatin areas, proposing the association of TcSub2 with transcription/processing sites. These findings were analyzed further by BrUTP incorporation assays and confirmed that TcSub2 is physically associated with active RNA polymerase II (RNA pol II), but not RNA polymerase I (RNA pol I) or Spliced Leader (SL) transcription, demonstrating participation particularly in nuclear mRNA metabolism in T. cruzi. The double knockout of the TcSub2 gene is lethal in T. cruzi, suggesting it has an essential function. Alternatively, RNA interference assays were performed in Trypanosoma brucei. It allowed demonstrating that besides being an essential protein, its knockdown causes mRNA accumulation in the nucleus and decrease of translation levels, reinforcing that Trypanosoma-Sub2 (Tryp-Sub2) is a component of mRNA transcription/export pathway in trypanosomes