Phylogenetic analysis of an epidemic outbreak of acute hepatitis C in HIV-infected patients by ultra-deep pyrosequencing

Background: The incidence of acute hepatitis C (AHC) among HIV-infected men who have sex with men (MSM) has increased significantly in the last 10 years. Several studies point to a social and sexual network of HIV-positive MSM that extends internationally. Objectives: The aim of our study was to investigate the dynamics of HCV transmission in an outbreak of AHC in HIV-infected MSM in Barcelona by ultra-deep pyrosequencing. Study design: Between 2008 and 2013, 113 cases of AHC in HIV-infected MSM were diagnosed in the Infectious Diseases Unit, Hospital Clínic, Barcelona. Massive sequencing was performed using the Roche 454 GS Junior platform. To define possible transmission networks, maximum likelihood phylogenetic trees were constructed, and levels of genetic diversity within and among patients were compared. Results: Among the 70 cases analyzed, we have identified 16 potential clusters of transmission: 8 for genotype 1a (23 cases involved), 1 for genotype 1b (3 cases) and 7 for genotype 4d (27 cases). Although the initial phylogenetic reconstruction suggested a local transmission cluster of HCV gt4d, our approach based on low genetic differentiation did not corroborate it. Indeed, gt4d strains formed 4 independent groups related to patients from other countries. Conclusions: Frequent clustering of HIV-positive MSM shows that HCV infection has spread through a local network in Barcelona. This outbreak is related to a large international HCV transmission network among MSM. Public health efforts are needed to reduce HCV transmission among this high-risk group

Oral saliva swab reverse transcription PCR for Covid-19 in the paediatric population

8Pág. Centro de Investigación en Sanidad Animal (CISA)To evaluate the performance of oral saliva swab (OSS) reverse transcription PCR (RT-PCR) compared with RT-PCR and antigen rapid diagnostic test (Ag-RDT) on nasopharyngeal swabs (NPS) for SARS-CoV-2 in children.The study was funded by: Project PI20/00095, from the Instituto de Salud Carlos III (Ministry of Economy, Industry and Competitiveness) and cofounded by the European Regional Development Fund, by Infanta Sofia University Hospital and Henares University Hospital Foundation for Biomedical Research and Innovation (FIIB HUIS HHEN), and by SERMAS-Fundación para la Investigación Biomédica del Hospital 12 de Octubre. EC-C is supported by the Spanish Society of Paediatrics (Asociación Española de Pediatría); Grant COVID-19 EPICO-AEP 2020. JMM is funded by SERMAS-Fundación para la Investigación Biomédica del Hospital Infanta Sofía y del Henares and by Universidad Europea de Madrid, Spain. MdlS is funded by Grant Cantera de Investigación Santander, Fundación Universidad Europea de Madrid, Spain. ED is funded by the Juan de la Cierva–Incorporación granted by the Spanish Ministry of Science and Innovation. DB-G is funded by the Spanish Ministry of Science and Innovation—Instituto de Salud Carlos III and Fondos FEDER by ’Contratos para la intensificación de la actividad investigadora en el Sistema Nacional de Salud, 2020 (INT20/00086)’.Peer reviewe

Validation of the Barthel Index as a Predictor of In-Hospital Mortality among COVID-19 Patients

In order to predict the high mortality due to COVID-19, simple, useful and remote instruments are required. To assess the validity of the baseline Barthel Index score as a predictor of in-hospital mortality among COVID-19 patients, a validation study of a clinical prediction tool in a cohort of patients with COVID-19 was conducted. The primary variable was mortality and the Barthel Index was the main explanatory variable. Demographic, clinical and laboratory variables were collected. Other mortality predictor scores were also assessed: Pneumonia Severity Index, CURB-65 and A-DROP. The Receiver Operating Characteristic Area under the Curve (ROC AUC), sensitivity and specificity were calculated for both the Barthel Index and the other predictor scores. An analysis of the association between the main variables was conducted, adjusting by means of three multivariate models. Three hundred and twelve patients were studied. Mortality was 16.4%. A mortality Odds Ratio (OR) of 5.95 was associated with patients with a Barthel Index ≤ 90. The model number 3 was developed to predict in-hospital mortality before COVID-19 infection occurs. It exhibits an OR of 3.44, a ROC AUC of 0.792, a sensitivity of 74.5% and a specificity of 73.9%. The Baseline Barthel Index proved useful in our population as a predictor of in-hospital mortality due to COVID-19

Atención farmacéutica en personas que han sufrido episodios coronarios agudos (estudio TOMCOR)

Background: This study evaluates the effects on coronary patients of a new practice in community pharmacies called Pharmaceutical Care (PhC) as compared to the traditional pattern of pharmacy practice. It attempts to ascertain whether pharmaceutical care is feasible in addition to ascertaining differences in effectiveness for coronary patients’ pharmacotherapeutic health outcomes, potentially attributable to PhC. Methods: A randomized prospective controlled-intervention study was conducted in 83 community pharmacies in the provinces of Asturias, Barcelona, Madrid and Biscay in a one-year monitoring of the drug-use of 735 patients at the start of the study (330 intervention patients and 405 control) and 600 at the end. Results: Differences were fund in favor of the intervention group in: a) the use of health care services as a morbidity indicator such as frequency of hospital emergency room visits 1.27 I (CI95 %; 1.10 - 1.44) and 1.63C (CI95 %; 1.36 - 1.90) or average length-of-stay in Intensive Care Units 2.46 I (CI95 %; 1.56 - 3.36) and 5.87 C (CI95 %; 3.57 - 8.17), both due to coronary causes; b) health-related quality of life score (physical functioning dimension difference of 4.7 (p < 0.05); c) average patient knowledge of coronary heart disease risk factors having improved by 10 % (p < 0002 - 0.007 depending on dimension); d) patient knowledge of the name and identification of their drugs having improved by 10 % (p < 0.001) along with their subjective perception of the antiagregans drugs relative importance having improved by 12 % (p < 0.009) and effects of beta-blockers having improved by 25 % (p < 0.02); e) average satisfaction with pharmaceutical care service and perception of pharmacist’s professional competence having improved by 2 % (p < 0.000 to 0.05 depending on dimension). Conclusions: A decrease in emergency health care demand due to coronary causes, a fewer number of patient hospitalizations and a shorter length-of-stay in Coronary Intensive Care Units due to hospitalization regarding coronary patients on pharmaceutical care would suggest that patients who suffered an acute coronary heart episode made a better use of drugs and would tend to be less ill. Furthermore, coronary patients who received pharmaceutical care services showed a better knowledge of the reasons for their pharmacotherapy and therefore took better advantage of health care resources and improved their health condition.Fundamento: Este estudio valora los efectos de un nuevo modelo de trabajo en las farmacias, denominado Atención Farmacéutica, frente al modelo tradicional. Se pretende conocer su factibilidad y las diferencias, potencialmente debidas a la Atención Farmacéutica, respecto de los resultados de salud de la farmacoterapia usada, en una muestra de pacientes que han sufrido episodios coronarios agudos. Métodos: Es un estudio prospectivo con un grupo de intervención (330 personas) y un grupo control (405 personas), realizado en 83 farmacias de Asturias, Barcelona, Madrid y Vizcaya, en las que se hizo seguimiento durante un año del uso de medicamentos en 735 personas, de las cuales finalizaron el estudio 600. Resultados: Hubo diferencias favorables al grupo intervención, respecto de: a) uso de servicios sanitarios indicativos de mayor morbilidad, tales como la frecuencia de consultas hospitalarias urgentes por paciente 1,27Interv. (IC95 %:1,10 a 1,44) y 1,63Contr.(IC95 %:1,36 a 1,90) o los días promedio de UCI por paciente hospitalizado: 2,46Interv.(IC95 %:1,56 a 3,36) y 5,87Contr.(IC95 %: 3,57 a 8,17), por causa cardiológica; b) calidad de vida con diferencia de 4,7 (p < 0,05) en la dimensión de función física; c) conocimiento de factores de riesgo de enfermedad coronaria, promedio de +10 % (p < 0,02 - 0,07, según dimensión); d) identificación nominal de los medicamentos usados +10 % (p < 0,01); importancia subjetiva otorgada a los antiagregantes + 12 % (p < 0,009), los beta-bloqueantes, así como sus efectos +25 % (p < 0,02); y e) satisfacción con la AF y percepción de la competencia profesional, promedio de + 12 % (p < 0,000 - 0,05, según dimensión). Conclusiones: Los valores menores de: demanda individual urgente coronaria, frecuencia de hospitalizaciones y número de días de Unidad de Cuidados Intensivos coronaria por hospitalización, sugerirían que los pacientes que tras un episodio coronario agudo reciben Atención Farmacéutica tienden a estar menos enfermos en los doce meses del seguimiento realizado. Bajo el modelo de Atención Farmacéutica los pacientes conocen mejor las razones de su farmacoterapia y, por ello, utilizan mejor los servicios sanitarios del sistema, alcanzando un mayor nivel de salud

Gender Differences among Nurses in Managing Arterial Puncture-Related Pain: A Multicenter Cross-Sectional Study

There is evidence that healthcare can be executed differentially depending on the gender of patients, researchers, and clinicians. The aim was to analyze the possible existence of nursing gender differences in pain management produced by arterial puncture for blood gas analysis. A cross-sectional, multicenter study designed was conducted in Castilla-la Mancha (Spain). Variables of interest were collected from nurses in the public health system of a European region through a questionnaire. Data were collected for four months; the primary outcome was the use of any intervention to reduce pain and the explanatory variable was the nurse’s gender. Bivariate analysis was carried out to assess associations between gender and pain-reducing interventions and a multivariate model was created with those factors that were relevant using logistic regression. A significantly higher proportion of men reported using some form of intervention (45% vs. 30%) and had more specific training (45.9% vs. 32.4%). The adjusted probability of using pain-reducing interventions by men was 71% higher than women. Thus, we found gender differences in the management of pain caused by arterial punctures performed by nurses as the main healthcare providers

Atención farmacéutica en personas que han sufrido episodios coronarios agudos (estudio TOMCOR)

Fundamento: Este estudio valora los efectos de un nuevo modelo de trabajo en las farmacias, denominado Atención Farmacéutica, frente al modelo tradicional. Se pretende conocer su factibilidad y las diferencias, potencialmente debidas a la Atención Farmacéutica, respecto de los resultados de salud de la farmacoterapia usada, en una muestra de pacientes que han sufrido episodios coronarios agudos. Métodos: Es un estudio prospectivo con un grupo de intervención (330 personas) y un grupo control (405 personas), realizado en 83 farmacias de Asturias, Barcelona, Madrid y Vizcaya, en las que se hizo seguimiento durante un año del uso de medicamentos en 735 personas, de las cuales finalizaron el estudio 600. Resultados: Hubo diferencias favorables al grupo intervención, respecto de: a) uso de servicios sanitarios indicativos de mayor morbilidad, tales como la frecuencia de consultas hospitalarias urgentes por paciente 1,27Interv. (IC95 %:1,10 a 1,44) y 1,63Contr.(IC95 %:1,36 a 1,90) o los días promedio de UCI por paciente hospitalizado: 2,46Interv.(IC95 %:1,56 a 3,36) y 5,87Contr.(IC95 %: 3,57 a 8,17), por causa cardiológica; b) calidad de vida con diferencia de 4,7 (p < 0,05) en la dimensión de función física; c) conocimiento de factores de riesgo de enfermedad coronaria, promedio de +10 % (p < 0,02 - 0,07, según dimensión); d) identificación nominal de los medicamentos usados +10 % (p < 0,01); importancia subjetiva otorgada a los antiagregantes + 12 % (p < 0,009), los beta-bloqueantes, así como sus efectos +25 % (p < 0,02); y e) satisfacción con la AF y percepción de la competencia profesional, promedio de + 12 % (p < 0,000 - 0,05, según dimensión). Conclusiones: Los valores menores de: demanda individual urgente coronaria, frecuencia de hospitalizaciones y número de días de Unidad de Cuidados Intensivos coronaria por hospitalización, sugerirían que los pacientes que tras un episodio coronario agudo reciben Atención Farmacéutica tienden a estar menos enfermos en los doce meses del seguimiento realizado. Bajo el modelo de Atención Farmacéutica los pacientes conocen mejor las razones de su farmacoterapia y, por ello, utilizan mejor los servicios sanitarios del sistema, alcanzando un mayor nivel de salud

Atención farmacéutica en personas que han sufrido episodios coronarios agudos (estudio tomcor)

Fundamento: Este estudio valora los efectos de un nuevo modelo de trabajo en las farmacias, denominado Atención Farmacéutica, frente al modelo tradicional. Se pretende conocer su factibilidad y las diferencias, potencialmente debidas a la Atención Farmacéutica, respecto de los resultados de salud de la farmacoterapia usada, en una muestra de pacientes que han sufrido episodios coronarios agudos. Métodos: Es un estudio prospectivo con un grupo de intervención (330 personas) y un grupo control (405 personas), realizado en 83 farmacias de Asturias, Barcelona, Madrid y Vizcaya, en las que se hizo seguimiento durante un año del uso de medicamentos en 735 personas, de las cuales finalizaron el estudio 600. Resultados: Hubo diferencias favorables al grupo intervención, respecto de: a) uso de servicios sanitarios indicativos de mayor morbilidad, tales como la frecuencia de consultas hospitalarias urgentes por paciente 1,27Interv. (IC95 %:1,10 a 1,44) y 1,63Contr.(IC95 %:1,36 a 1,90) o los días promedio de UCI por paciente hospitalizado: 2,46Interv.(IC95 %:1,56 a 3,36) y 5,87Contr.(IC95 %: 3,57 a 8,17), por causa cardiológica; b) calidad de vida con diferencia de 4,7 (p < 0,05) en la dimensión de función física; c) conocimiento de factores de riesgo de enfermedad coronaria, promedio de +10 % (p < 0,02 - 0,07, según dimensión); d) identificación nominal de los medicamentos usados +10 % (p < 0,01); importancia subjetiva otorgada a los antiagregantes + 12 % (p < 0,009), los beta-bloqueantes, así como sus efectos +25 % (p < 0,02); y e) satisfacción con la AF y percepción de la competencia profesional, promedio de + 12 % (p < 0,000 0,05, según dimensión). Conclusiones: Los valores menores de: demanda individual urgente coronaria, frecuencia de hospitalizaciones y número de días de Unidad de Cuidados Intensivos coronaria por hospitalización, sugerirían que los pacientes que tras un episodio coronario agudo reciben Atención Farmacéutica tienden a estar menos enfermos en los doce meses del seguimiento realizado. Bajo el modelo de Atención Farmacéutica los pacientes conocen mejor las razones de su farmacoterapia y, por ello, utilizan mejor los servicios sanitarios del sistema, alcanzando un mayor nivel de salud

Desarrollo entorno colaborativo de apoyo a la docencia de asignaturas de teoría de la señal

En el proyecto se ha desarrollado una herramienta que permita a los alumnos. 1. Hacer operaciones en modo individual sobre tratamiento de imágenes. 2. Hacer operaciones en modo colaborativo sobre este tema. Se ha tratado de crear un entorno de trabajo amigable y fácilmente expandible. Para ello, hemos hecho uso de otros esquemas de procesado de imagen (fundamentalmente lehors y matlab) tratando de incorporar a nuestra aplicación las ventajas de éstos. Asimismo, se han incorporado las ideas de entornos actualmente en uso, concretamente, BSCW, con el objetivo de conseguir crear una auténtica conciencia de grupo en los participantes. Esperamos que esta herramienta consiga a través del intercambio de conocimientos y experiencias, los objetivos educativos perseguidos. La evaluación se llevará a cabo en el segundo cuatrimestre del curso 2001-2002, y en función de ella, se decidirá su publicación.Junta de Castilla y León. Dirección General de Universidades e Investigación. Monasterio Ntra. Sra. del Prado. Autovia Puente Colgante s/n. 47071 Valladolid. Teléfono: 983-41.18.87Castilla y LeónES