Detecting Repetitions and Periodicities in Proteins by Tiling the Structural Space

The notion of energy landscapes provides conceptual tools for understanding the complexities of protein folding and function. Energy Landscape Theory indicates that it is much easier to find sequences that satisfy the "Principle of Minimal Frustration" when the folded structure is symmetric (Wolynes, P. G. Symmetry and the Energy Landscapes of Biomolecules. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 14249-14255). Similarly, repeats and structural mosaics may be fundamentally related to landscapes with multiple embedded funnels. Here we present analytical tools to detect and compare structural repetitions in protein molecules. By an exhaustive analysis of the distribution of structural repeats using a robust metric we define those portions of a protein molecule that best describe the overall structure as a tessellation of basic units. The patterns produced by such tessellations provide intuitive representations of the repeating regions and their association towards higher order arrangements. We find that some protein architectures can be described as nearly periodic, while in others clear separations between repetitions exist. Since the method is independent of amino acid sequence information we can identify structural units that can be encoded by a variety of distinct amino acid sequences

Ejercicio del derecho a la libertad sexual desde la perspectiva del principio del interés superior del niño

El presente trabajo, desarrollara el tema del derecho a la libertad sexual otorgado mediante la sentencia N° 00008-2012-PI/TC a los menores de edad cuyas edades son entre los 14 a 18 años de edad, frente al principio del interés superior del niño; es así que su objetivo general de estudio, será analizar si en el ejercicio del derecho a la libertad sexual del menor entre los 14 años y 18 años, se le brinda mayor protección o se lesiona el principio al interés superior del niño vulnerándose su libre desarrollo de la personalidad. Para el análisis del tema se ha utilizado mecanismos de recolección de datos como las entrevistas, las cuales ha sido dirigidos a profesionales del derecho, siendo las interrogantes enfocadas a resolver el problema principal y específicos, el cual está básicamente enfocado a demostrar de qué manera el ejercicio del derecho a la libertad sexual se materializa en la sociedad desde la perspectiva del principio al interés superior del niño, y si las normas se encuentran correctamente interpretadas, o si existe una propuesta de educación sexual integral que se encuentre coordinada de manera interinstitucional para brindar la información sexual suficiente a los menores de edad en el Perú. Dejando en claro que no se pretende la creación de nuevas leyes ni la derogación de las existentes, sino demostrar que no basta con las mismas, si es que no existe coordinación de manera inter institucional que brinde información sexual y protección suficiente a los menores de edad en el Perú

Detecting repetitions and periodicities in proteins by tiling the structural space

The notion of energy landscapes provides conceptual tools for understanding the complexities of protein folding and function. Energy landscape theory indicates that it is much easier to find sequences that satisfy the “Principle of Minimal Frustration” when the folded structure is symmetric (Wolynes, P. G. Symmetry and the Energy Landscapes of Biomolecules. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 14249–14255). Similarly, repeats and structural mosaics may be fundamentally related to landscapes with multiple embedded funnels. Here we present analytical tools to detect and compare structural repetitions in protein molecules. By an exhaustive analysis of the distribution of structural repeats using a robust metric, we define those portions of a protein molecule that best describe the overall structure as a tessellation of basic units. The patterns produced by such tessellations provide intuitive representations of the repeating regions and their association toward higher order arrangements. We find that some protein architectures can be described as nearly periodic, while in others clear separations between repetitions exist. Since the method is independent of amino acid sequence information, we can identify structural units that can be encoded by a variety of distinct amino acid sequences.Fil: Parra, Rodrigo Gonzalo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Espada, Rocío. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Sánchez Miguel, Ignacio Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Sippl, Manfred J.. Universität Salzburg; AustriaFil: Ferreiro, Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentin

“Esto no es un castigo de Dios”. Gestión local del agua en Guatemala: el caso de los municipios de Chiantla y Huehuetenango

En Guatemala coexisten muchos y variados sistemas de gestión del agua basados en tradiciones comunitarias, los cuales han nacido mayoritariamente debido a la ausencia de servicios públicos estatales. Sin embargo, una gran proporción de la población aún tiene problemas de acceso al agua, y los conflictos sociales son frecuentes. El objetivo de este artículo es la caracterización de los sistemas locales de gestión del agua: sus ventajas y desventajas. Además, se analizan algunas de las causas generales de los problemas particulares encontrados. Según nuestro análisis, muchos de los problemas a que se enfrentan los gestores locales del recurso hídrico se deben a: i) la descoordinación entre las instituciones (públicas y privadas) encargadas de la gestión ambiental, ii) un débil marco legal para la gestión de los recursos naturales, y iii) la falta de recursos sociales, económicos y técnicos a escala local debidos a un proceso de descentralización incompleto.Guatemala, diversidad institucional, descentralización, gestión integrada del agua, participación pública.

Continuing education: Biomedical Databases (II): MEDLINE/PubMed.

MEDLINE/PubMed es una de las bases de datos de bibliografía biomédica más grandes e importantes y el principal componente de PubMed que cubre las áreas de: Medicina, Enfermería, Odontología, Veterinaria, Sistemas de Salud y Ciencias Preclínicas. La interfaz de PubMed permite realizar búsquedas no solamente en MEDLINE sino también en otras 35 bases de datos del NCBI (Centro Nacional para la Información Biotecnológica). MEDLINE fue desarrollado por la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos (NLM) que forma parte del Instituto Nacional de Salud (NIH). En esta sexta entrega de Educación Continua se describen la estructura, el funcionamiento y las características de los principales componentes de MEDLINE/PubMed que permitirán al usuario realizar una búsqueda bibliográfica más eficiente.MEDLINE / PubMed is one of the largest and most important databases of biomedical literature and the main component of PubMed, covering the areas of medicine, nursing, dentistry, veterinary, health systems and preclinical sciences. The PubMed interface allows searching not only in MEDLINE but also in another 35 databases of NCBI (National Center for Biotechnology Information). MEDLINE was developed by the National Library of Medicine of the United States (NLM) which is part of the National Institute of Health (NIH). In this sixth part of Continuing Education we describe the structure, operation and features of the main components of MEDLINE/PubMed that will allow the user to perform a more efficient bibliographic search.Facultad de Ciencias Médica

Continuing education: Biomedical Databases (II): MEDLINE/PubMed.

MEDLINE/PubMed es una de las bases de datos de bibliografía biomédica más grandes e importantes y el principal componente de PubMed que cubre las áreas de: Medicina, Enfermería, Odontología, Veterinaria, Sistemas de Salud y Ciencias Preclínicas. La interfaz de PubMed permite realizar búsquedas no solamente en MEDLINE sino también en otras 35 bases de datos del NCBI (Centro Nacional para la Información Biotecnológica). MEDLINE fue desarrollado por la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos (NLM) que forma parte del Instituto Nacional de Salud (NIH). En esta sexta entrega de Educación Continua se describen la estructura, el funcionamiento y las características de los principales componentes de MEDLINE/PubMed que permitirán al usuario realizar una búsqueda bibliográfica más eficiente.MEDLINE / PubMed is one of the largest and most important databases of biomedical literature and the main component of PubMed, covering the areas of medicine, nursing, dentistry, veterinary, health systems and preclinical sciences. The PubMed interface allows searching not only in MEDLINE but also in another 35 databases of NCBI (National Center for Biotechnology Information). MEDLINE was developed by the National Library of Medicine of the United States (NLM) which is part of the National Institute of Health (NIH). In this sixth part of Continuing Education we describe the structure, operation and features of the main components of MEDLINE/PubMed that will allow the user to perform a more efficient bibliographic search.Facultad de Ciencias Médica

Continuing education: Biomedical Databases (II): MEDLINE/PubMed

MEDLINE/PubMed es una de las bases de datos de bibliografía biomédica más grandes e importantes y el principal componente de PubMed que cubre las áreas de: Medicina, Enfermería, Odontología, Veterinaria, Sistemas de Salud y Ciencias Preclínicas. La interfaz de PubMed permite realizar búsquedas no solamente en MEDLINE sino también en otras 35 bases de datos del NCBI (Centro Nacional para la Información Biotecnológica). MEDLINE fue desarrollado por la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos (NLM) que forma parte del Instituto Nacional de Salud (NIH). En esta sexta entrega de Educación Continua se describen la estructura, el funcionamiento y las características de los principales componentes de MEDLINE/PubMed que permitirán al usuario realizar una búsqueda bibliográfica más eficiente.MEDLINE/PubMed is one of the largest and most important databases of biomedical literature and the main component of PubMed, covering the areas of medicine, nursing, dentistry, veterinary, health systems and preclinical sciences. The PubMed interface allows searching not only in MEDLINE but also in another 35 databases of NCBI (National Center for Biotechnology Information). MEDLINE was developed by the National Library of Medicine of the United States (NLM) which is part of the National Institute of Health (NIH). In this sixth part of Continuing Education we describe the structure, operation and features of the main components of MEDLINE/PubMed that will allow the user to perform a more efficient bibliographic search.Facultad de Ciencias Médica

Continuing education: Biomedical Databases (II): MEDLINE/PubMed.

MEDLINE/PubMed es una de las bases de datos de bibliografía biomédica más grandes e importantes y el principal componente de PubMed que cubre las áreas de: Medicina, Enfermería, Odontología, Veterinaria, Sistemas de Salud y Ciencias Preclínicas. La interfaz de PubMed permite realizar búsquedas no solamente en MEDLINE sino también en otras 35 bases de datos del NCBI (Centro Nacional para la Información Biotecnológica). MEDLINE fue desarrollado por la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos (NLM) que forma parte del Instituto Nacional de Salud (NIH). En esta sexta entrega de Educación Continua se describen la estructura, el funcionamiento y las características de los principales componentes de MEDLINE/PubMed que permitirán al usuario realizar una búsqueda bibliográfica más eficiente.MEDLINE / PubMed is one of the largest and most important databases of biomedical literature and the main component of PubMed, covering the areas of medicine, nursing, dentistry, veterinary, health systems and preclinical sciences. The PubMed interface allows searching not only in MEDLINE but also in another 35 databases of NCBI (National Center for Biotechnology Information). MEDLINE was developed by the National Library of Medicine of the United States (NLM) which is part of the National Institute of Health (NIH). In this sixth part of Continuing Education we describe the structure, operation and features of the main components of MEDLINE/PubMed that will allow the user to perform a more efficient bibliographic search.Facultad de Ciencias Médica

The Effects of Treadmill or Overground Walking Training Program on Gait in Parkinson's Disease

[Abstract] Background. Gait impairment in Parkinson's disease (PD) patients is characterized by the inability to generate appropriate stride length. Treadmill training has been proposed as a therapeutic tool for PD patients. However, it remains unknown whether treadmill training effects are different from overground walking training. Thus, our goal was to explore the effects of two training programs, walking on a treadmill and walking overground, in PD patients. Methods. 22 PD patients were randomly assigned to a treadmill or overground training group. The training program consisted of 5 weeks (3 sessions/week). Before and after the program we evaluated gait kinematics during walking at preferred and maximal speed; Timed Up and Go (TUG); static posturography and knee extensors strength. Gait parameters were reevaluated in the treadmill training group one month after the cessation of the training. Results. Preferred speed walking improved in both groups after the training program. The treadmill training program, but not the overground, led to an improvement in the stride length at the preferred and maximal walking speed in the PD patients. In addition, the treadmill training group showed improvement of the TUG and static posturography tests. The improvement in gait parameters was maintained one month after the cessation of the treadmill training. Conclusions. This study provides evidence of a specific therapeutic effect of treadmill training on Parkinsonian gait and balance. Walking on a treadmill may be used as an easy, effective and accessible way to improve the stride length and balance in PD patients. Background. Gait impairment in Parkinson's disease (PD) patients is characterized by the inability to generate appropriate stride length. Treadmill training has been proposed as a therapeutic tool for PD patients. However, it remains unknown whether treadmill training effects are different from overground walking training. Thus, our goal was to explore the effects of two training programs, walking on a treadmill and walking overground, in PD patients. Methods. 22 PD patients were randomly assigned to a treadmill or overground training group. The training program consisted of 5 weeks (3 sessions/week). Before and after the program we evaluated gait kinematics during walking at preferred and maximal speed; Timed Up and Go (TUG); static posturography and knee extensors strength. Gait parameters were reevaluated in the treadmill training group one month after the cessation of the training. Results. Preferred speed walking improved in both groups after the training program. The treadmill training program, but not the overground, led to an improvement in the stride length at the preferred and maximal walking speed in the PD patients. In addition, the treadmill training group showed improvement of the TUG and static posturography tests. The improvement in gait parameters was maintained one month after the cessation of the treadmill training. Conclusions. This study provides evidence of a specific therapeutic effect of treadmill training on Parkinsonian gait and balance. Walking on a treadmill may be used as an easy, effective and accessible way to improve the stride length and balance in PD patients.Ministerio de Ciencia e Innovación;DEP-2011-2246

Creación de proyectos TIC y colaboración profesor-alumno: el Sistema Integral de Información Distribuida (SIID)

En este trabajo se presenta un proyecto de innovación docente basado en la metodología de Aprendizaje Basado en el desarrollo de Proyectos Colaborativos (ABPC) con el que se ha llevado a cabo un sistema de comunicaciones basado en la tecnología Bluetooth denominado Sistema Integral de Información Distribuida (SIID) (Cuevas Martínez, et al., 2009; 1ª Jornadas Andaluzas de Innovación Docente Universitaria), el cual permite el intercambio de información entre la comunidad universitaria usando tecnologías ampliamente conocidas y de bajo coste. Este sistema se basa en una arquitectura centralizada fija formada por un servidor web avanzado, que funciona como núcleo del sistema, y una serie configurable de puntos de acceso al servicio y, por otro lado, una estructura móvil formada por los terminales de usuario. El sistema SIID proporciona la posibilidad de gestionar y enviar mensajes a usuarios que dispongan de terminales móviles con la tecnología Bluetooth y se encuentren en el entorno de los puntos de acceso del sistema. Todas las funciones de envío y gestión de mensajes se controlan por medio del portal web. Además, los usuarios podrán descargarse a través del sistema una aplicación para su terminal móvil que les permitirá enviar mensajes a los usuarios del sistema sin coste para ellos