11,167 research outputs found

    Cheese: Food Perception and Food Choice

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    In light of the increasing interest in the economic and socio-political impact of the ‘traditional food’ trend, it is essential to understand the determinant factors that lead to traditional consumer choices. The standardization of sensory quality evaluation methods marks the pressing need for food product certification, particularly foods with specific sensory characteristics, such as those with a Protected Designation of Origin (PDO). Consumer perception of particular foods, especially for foods that are culturally and socially contingent, such as cheese, must be understood as both a psychophysical reflex and a learned social practice. Consumers create their own perceptions based on the overall intrinsic or extrinsic cheese characteristics, mainly sensory characteristics that reflect others' attributes. These characteristics are normally linked to the specific cheese manufacture process. Some patents propose the use of adapted cheesemaking equipment (EP1982582A2), suitable for the manufacture of small-scale cheeses, such as some PDO cheese. Thus, sensory evaluation of any kind of cheese is based, in the initial phase, on knowledge of the sensory methods for cheese evaluation and, in a second phase, on the familiarity of the cheese characteristics and verbalization of desirable and undesirable attributes. This paper presents a case study based on the traditional food product, Évora cheese, assembled with PDO cheeses, whose sensory and physicochemical quality attributes are essential in order to obtain this designation and ensure the genuine properties that characterize them, as well as ascertaining exactly how they are perceived and further accepted by the consumer

    A construção do sentido no gênero canção: um estudo comparativo das canções “Cultura lira paulistana” de Itamar Assumpção e “Tiempo de hibridos” de Rodrigo González

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    II Jornadas Latino-Americanas de Linguagens e Cultura. Em comemoração aos 100 anos de nascimento de Roa Bastos e 50 anos da morte de Guimarães RosaNeste artigo é apresentado um estudo analítico e interpretativo das canções “Cultura Lira Paulistana” de Itamar Assumpção e “Tiempo de Hibridos” de Rodrigo González, buscando assim, estabelecer relações entre as obras musicais pontuando as convergências e divergências existentes. Partindo da perspectiva que, no estudo do gênero canção, melodia e letra, são indissociáveis - sob pena de ser transformado em outro gênero -, buscaremos elementos contidos nesse diálogo. Para isso, nos apoiaremos no enfoque teórico produzido por Luiz Tatit sobre o estudo do cancionistaPrograma de Pós-Graduação em Literatura Comparada Programa de Pós-Graduação Interdisciplinar em Estudos Latino-Americanos Curso de Graduação em Letras – Artes e Mediação Cultura

    Determinação de arranjos moleculares em cristais líquidos nemáticos utilizando defração de raio-x

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    Dissertaçao (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas. Curso de Pós-Graduação em Físico-Química

    Undergraduate Latinas\u27 self-definition of academic success

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    This master\u27s level thesis\u27s objective was to gain a better understanding of how a sample of 13 undergraduate Latinas who graduated high school and immediately enrolled into college define academic success. Through interviews, these undergraduate Latinas explain where these self-definitions came from, mentors that may have influenced these definitions, and if their ethnicity and gender has played any role in the way they perceive academic success. The study also considers findings from previous research regarding academic resilience factors associated with Latinas, such as: being involved in college ready initiatives, obtaining academic support from significant others, having mentors, receiving various messages about the importance of academic success for future success/careers, and socio-economic stability, as well as consideration of cultural capital, social capital, and additional forms of capital. Wanting participants to define their own experiences a phenomenological approach was used, which allows for deep description and rich data collection

    Localize drug delivery systems for skin injurie via algae-based electrospun nanofibers

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    Dissertação de mestrado integral em Biomedical Engineering Biomaterials, Rehabilitation and Biomechanics BranchO crescimento excessivo e a acumulação de macroalgas está a tornar-se um problema grave para o ecossistema. Neste sentido, muitas estratégias têm sido estudadas de forma a controlar este crescimento e que permitam a valorização destas macroalgas, uma vez que representam um recurso natural de numerosos compostos valiosos, como o alginato e a celulose. Neste sentido, este projeto visa a produção de nanofibras por electrospinning baseadas em compostos extraídos de algas, nomeadamente alginato, para atuar como sistemas localizados de libertação de compostos bioativos para o tratamento de lesões da pele. Primeiramente, procedeu se à otimização da extração de alginato de sódio (SA) da alga Laminaria ochroleuca. Após várias tentativas, o SA foi extraído com sucesso da alga recorrendo ao Processo 3 que consistiu numa etapa de despigmentação com etanol, uma etapa de extração, utilizando o ácido cítrico, e com carbonato de sódio, terminando com a precipitação do SA com etanol. Todo o processo foi realizado à temperatura ambiente e com tempos de reacção curtos. O rendimento de extração foi de aproximadamente 40 %, revelando-se bastante promissor em comparação com outros estudos de extração de alginato de algas recorrendo a processos verdes. Além disso, técnicas tais como ATR-FTIR (Espectroscopia de Infravermelhos de Reflexão Total Atenuada de Fourier), XRD (Difração de Raios-X) e TGA (Análise Termogravimétrica) confirmaram o sucesso da extração. Posteriormente, realizou-se um processo de extração de nanocelulose da alga Ulva Spp.. As amostras foram analisadas com microscopia ótica e os resultados não foram os mais promissores, pelo que será necessário otimizar este processo em trabalhos futuros. Posteriormente, foram desenvolvidas nanofibras por electrospinning de SA e poli(álcool vinílico) (SA/PVA) com um rácio ótimo de 50:50 e com parâmetros de electrospinning otimizados (24 KV, 14 cm e 0.2 ml/h) e de SA/PVA/Ziziphus, um extrato natural com atividade antibacteriana comprovada contra Staphylococcus aureus. As membranas produzidas foram analisadas por ATR-FTIR e FESEM, revelando a produção de nanofibras uniformes com diâmetros médios de 170 nm (SA/PVA) e 191 nm (SA/PVA/Ziziphus). Assim, com este projeto foi possível desenvolver um método alternativo, mais verde e sustentável, de extração de SA das algas, e a sua posterior utilização em nanofibras de electrospininng para feridas da pele, com a incorporação de um agente bioativo.Several ways have been studied to control the overgrowth and accumulation of macroalgae, since they represent a natural resource of numerous valuable compounds. Therefore, this project aims to produce nanofibers by electrospinning based on compounds extracted from algae to act as localized release systems for bioactive compounds. First, the extraction of sodium alginate (SA) from the algae Laminaria ochroleuca was optimized. After several attempts, the SA was successfully extracted from the alga using Process 3, which consisted of a depigmentation step using ethanol, an extraction step, with a weaker acid citric acid in one of the samples and HCL in another, and with sodium carbonate, a precipitation step with ethanol, and a washing step using ethanol and acetone. The entire process was performed without temperature and with reduced times, highlighting the sustainability of the methodology used. The extracted samples were analyzed in terms of extraction yield, approximately 40 %, which shows much higher results than other studies of alginate extraction with green processes. Furthermore, techniques including ATR FTIR (Attenuated Total Reflectance-Fourier Transform Infrared Spectroscopy), XRD (X-Ray Diffraction) and TGA (Thermogravimetric analysis) confirmed the success of the extraction. Subsequently, an extraction process of nanocellulose from the alga Ulva spp. was performed. The samples were analyzed with optical microscopy and the results were not the most promising, so it will need to be optimized in future work. Subsequently, nanofibers were developed by electrospinning of sodium alginate and poly(vinyl alcohol) (SA/PVA) with an optimal ratio of 50:50 and with optimized electrospinning parameters (24 KV, 14 cm and 0.2 ml/h) and of SA/PVA/Ziziphus, a natural extract with proven antibacterial activity against Staphylococcus aureus. The results were very promising, showing diameters of 170 nm for SA/PVA nanofibers and 191 nm for SA/PVA/Ziziphus nanofibers, with uniform structures. Thus, with this project it was possible to develop an alternative, greener and more sustainable method of extracting SA from algae, and then using it in electrospininng nanofibers for skin wounds, with the incorporation of a bioactive agent

    Impacts of high pressure processing conditions on the microbiome of sea bass fillets

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    Fish and seafood products are some of the most important protein sources in human nutrition and more than 45% of the fish used for human consumption comes from aquaculture. However, fish products are easily perishable and often associated with human diseases, leading to development of different preservation methods. Recently, novel processing techniques like High Pressure Processing (HPP), that uses pressure to inactivate microbes without heat, are being optimized to extend shelf-life without affecting food quality. We used metagenomics (the global study of genetic material from environmental or organism samples) to characterize in a global way the microbes present in sea bass fillets treated with different pressures (300-600 MPa) and processing times (2-5 min) and after refrigerated storage for 1 or 11 days, contributing to optimize HPP of these products. We extracted and selected 42 DNA samples (of 14 experimental groups) based on their quantity and quality and sent them to a sequencing company to construct microbiome libraries based on the 16S rRNA gene sequencing. With the sequencing and bioinformatics analysis using QIIME it was possible to evaluate the impacts of HPP treatments on the bacterial microbiome of the samples. There was a decrease in bacterial load in the treated samples when compared to the control (confirmed by quantitative PCR of 16S), which was especially evident when we compared the control at 11 days with the treated samples at 11 days, notably in the 450MPa and 600MPa treatments. The most abundant genera of bacteria in the control fillets significantly changed after storage for 11 days, leading to a different composition to 300 MPa fillets and separated by PCoA from 450-600 MPa fillets. These had a microbiome more similar to the initial control fillets. These results will help optimizing HPP of fish fillets and identifying the main genera of deterioration bacteria and HPP effects.Peixes e mariscos são importantes fontes de proteína na nutrição humana. A produção de peixe aumentou ao longo dos anos, muito devido ao crescimento da aquacultura e o interesse por uma alimentação mais saudável. Atualmente mais de 45% dos peixes para consumo humano são provenientes da aquacultura e Portugal é o país mais relevante da UE em consumo per capita. No entanto os produtos alimentares à base de peixe (ricos em nutrientes e água) são facilmente deteoráveis e podem estar associados a doenças (difilobotríase), especialmente quando consumidos crus ou pouco cozinhados. Diversas técnicas de conservação têm sido utilizadas (ex. congelamento, defumação, salga). Atualmente a procura por produtos mais frescos e aumento de produção por aquacultura requer otimização de novas tecnologias de processamento para diminuir a deterioração alimentar (ex. alterações de cor, textura, cheiro ou sabor, frequentemente causada por microrganismos), estender o prazo de validade e a segurança (ex. intoxicações causadas pelos microrganismos e seus metabolitos) e diminuir o desperdício alimentar e perdas económicas (cerca de um terço da produção alimentar mundial é perdida todos os anos). Nesta tese, focámos na otimização do Processamento por Alta pressão (HPP) para preservação de filetes de robalo de aquacultura, pois é uma técnica promissora e em expansão de processamento alimentar não térmico, que aplica pressões entre 300MPa e 1000MPa durante vários minutos à temperatura ambiente para inativar microrganismos em alimentos sólidos ou líquidos. HPP tem sido aplicada a mariscos, frutas, molhos, carnes e vegetais, preservando a qualidade e sabor dos alimentos, mas aumentando a sua segurança e tempo de vida. Os parâmetros críticos são a pressão; os tempos para alcançar a pressão, de tratamento e de descompressão; as temperaturas iniciais do produto e durante tratamento e as características iniciais do produto (pH, composição nutricional e microbiológica, humidade) e o embalamento, pelo que a aplicação a novos produtos requer cuidada otimização para ser mais efetiva e ter menor custos de operação. Esta tese vem na continuação de trabalhos anteriores em que HPP melhorou a qualidade dos filetes de robalo, aumentou a sua vida útil e reduziu a carga microbiológica e proporção de géneros bacterianos de deterioração alimentar. No estudo atual, a metagenómica foi usada para estudar o microbioma presente nos filetes de robalo depois de aplicados diferentes tratamentos com o HPP (pressões de 300-600 MPa e tempos de 2-5 minutos) e tempos de armazenamento refrigerado (1-11 dias a 2ºC), para caracterizar globalmente os microrganismos nas amostras e o efeito de HPP e contribuir para a sua otimização. Os filetes sujeitos a estas condições experimentais foram fornecido por colaboradores na Grécia e no CCMAR procedeu-se à otimização e extração de DNA de amostras da sua superfície; controlo de qualidade por quantificação em espectrofotómetro Nanodrop e géis de eletroforese; seleção de amostras representativas (triplicados para 14 grupos experimentais) e envio para empresa de sequenciação (Laragen, USA) para produção de bibliotecas de microbioma, em que se usou o sequenciamento direcionado por PCR com o gene 16S rRNA como alvo. Este é o marcador taxonómico mais usado para bactérias, com zonas variáveis alternadas com conservadas, cobrindo a maioria das bactérias e boa disponibilidade em bases de dados. As bibliotecas foram analisadas usando o Qiime (com a base de dados SILVA e normalmente usado em metagenómica), em colaboração com parceiros no CCMAR. Às OTU (unidades taxonómicas operacionais, grupos de sequências identificados a um dado nível taxonómico) obtidas a partir da análise com conjunto de aplicações Qiime, foram retiradas as sequências identificadas como cloroplastos, sequencias não identificadas, singletons e doubletons (que apareceram menos de 3 vezes nas amostras) e os dados foram rarefeitos para o número mínimo de sequências obtidas nas bibliotecas. Produziram-se tabelas dos diferentes níveis taxonómicos e os cálculos da alfa diversidade (como Shannon Index e número de espécies identificadas). Identificaram-se assim os microrganismos mais abundantes ao nível do género e que poderão ser usados como potenciais marcadores para tratamentos específicos: Massilia, Carnobacterium, Shewanella e Janthinobacterium. O desenho de primers e testes para estes microrganismos mais abundantes estão a ser ainda desenvolvidos pelo que não serão inseridos nesta tese. Os resultados de culturas microbiológicas das amostras e testes sensoriais feitos pelos nossos colaboradores na Grécia (não incluídos nesta tese) apontam para uma diminuição da carga bacteriana das amostras sujeitas a pressões altas, mas pouca perda de qualidade, valores que no geral confirmam os obtidos no projeto piloto anterior (Tsironi et al. 2019). A aplicação de diferentes pressões levou a resultados muito semelhantes entre os diferentes grupos, com maior divergência no grupo 300MPa 11 dias que teve microbioma bastante diferente dos restantes a 11 dias (com o grande aumento de Carnobacterium). Nos outros grupos 450/600Mpa 11 dias houve uma diminuição de Massilia e um aumento de Shewanella, como no controlo, mas o microbioma a estas altas pressões foi mais semelhante ao do grupo controlo inicial. Resultados da diversidade com os valores de Shannon, observed_species e pelas curvas de rarefação (obtidas usando os ficheiros do Qiime com as OTUs após limpeza de dados e rarefação) confirmaram a diversidade dentro das amostras, que no global aumentou entre os 1 e 11 dias de armazenamento. O qPCR do 16S feito a maior número de amostras (n=5-7 por grupo) do que usado na sequenciação, pode confirmar que o controlo a 11 dias continha muita carga bacteriana, enquanto os tratamentos com 450MPa e 600MPa foram eficazes na redução do número de bactérias, contendo valores muito perto daqueles obtidos nas amostras com armazenamento de apenas 1 dia, e a pressão 300 MPa revelou valores intermédios. Os tratamentos com HPP com pressões de 450/600 MPa tanto em 2 mins como em 5 mins poderão ser eficazes para tratar este tipo de amostras, obtendo cargas e composições bacterianas aos 11 dias perto das do armazenamento inicial, e poderão contribuir para aumentar o seu tempo de vida útil. A pressão a 450 MPa poderá ser a melhor neste tipo de processamento de filetes por ser provável que cause menos danos físicos e sensoriais ao produto (ainda em estudo), tendo uma eficácia muito semelhante ao tratamento com 600Mpa, com menores gastos de energia.This work was carried out at the CEIB group of CCMAR and received funds and samples derived from projects “SUSHIFISH” (ended in December 2019) under grant agreement no. 321553 co-funded by EU COFASP ERANET partners including the Portuguese Foundation for Science and Technology (FCT) through project COFASP/0002/2015; project “ICHTHYS”, funded by EU H2020-MSCA-RISE grant agreement 872217; project “SEAFOODQual” (MAR-01.03.01-FEAMP-0050) PO MAR2020, Portugal2020, funded by EU through the “Fundo Europeu dos Assuntos Marítimos e das Pescas (FEAMP)” and FCT institutional projects UID/Multi/04326/2019 and UIDB/04326/2020 to CCMAR. The supervisor Patricia Pinto is in receipt of a researcher contract with the University of Algarve funded by FCT under “Norma Transitória” with reference DL57/2016/CP1361/CT0015. As detailed in section 2. Methodological Approach, the samples here analysed were produced in an experiment carried out at the National Technical University of Athens (NTUA) and then shipped to the CCMAR for this metagenomics analysis, under the frame of these projects

    Estimate of energy production in aerial systems of Wind Energy

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    O impacto ambiental resultante da produção de energia elétrica através de combustíveis fósseis determinou uma mudança na forma de obtenção desta energia aparecendo assim as energias renováveis.Nesta dissertação é abordada uma forma de produção de energia elétrica eólica utilizando um AWES (Airborne Wind Energy System), mais especificamente um Pumping Kite Generator. O sistema apresenta uma asa presa a um cabo que a liga a um gerador elétrico através de um tambor, produzindo energia elétrica através da tensão no cabo enquanto a asa se move numa trajetória aproximadamente ortogonal à direção do vento. Quando o comprimento máximo do cabo é atingido, a asa é controlada de forma a minimizar a tensão no cabo e é recolhida até uma posição inicial da qual reinicia o ciclo de produção.Com base no perfil dinâmico da asa e para efeitos de cáculo da produção de energia durante um ciclo, as fases de largada e de recolha são analisadas. São introduzidos parâmetros adimensionais que ajudam a descrever a eficiência do ciclo. As velocidades de largada e de recolha são calculadas e usadas para o cáculo da potência ao longo de um ciclo. A potência máxima obtida durante um ciclo é calculada através de duas etapas sendo que a primeira é para velocidades de vento abaixo da velocidade nominal e a segunda etapa são para velocidades acima da nominal. Através de uma seleção de vários parâmetros é também construída uma curva de potência do sistema.É ainda obtida a produção de energia anual teórica num determinado local com base em dados de vento reais.The environmental impact resulting from the production of electricity through fossil fuels has led to a change in the way this energy is obtained, thus giving rise to renewable energies.This dissertation discusses a way to produce wind power using an AWES (Airborne Wind Energy System), more specifically a Pumping Kite Generator. The system presents a wing attached to a cable that connects it to an electric generator through a drum, producing electric energy through the tension in the cable while the wing moves in a path approximately orthogonal to the direction of the wind. When the maximum cable length is reached, the wing is controlled so as to minimize the tension in the cable and is withdrawn to an initial position from which it restarts the production cycle.Based on the dynamic profile of the wing and for the purpose of calculating energy production during a cycle, the reel in and reel out phases are analyzed. Dimensional parameters are introduced to help describe the efficiency of the cycle.Reel in and reel out speeds are calculated and used to calculate power over a cycle. The maximum power obtained during a cycle is calculated through two steps, the first one being for wind speeds below the nominal speed and the second step for speeds above the nominal. Through a selection of several parameters a system power curve is also constructed.The theoretical annual energy production is also obtained in a given location based on actual wind data

    Strategic account management: the path to gain customer loyalty

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    The account management field works closely with the sales team, serving as the customer’s primary point of contact. This project’s purpose was to understand if shifting the account management from brand centric to customer centric, would be the best fit for a Portuguese Pharmaceutical company. This customer centric approach - Strategic Account Management (SAM) - was studied, understanding the implicated trade-offs to the company. The workforce was probed about the project and their comments were analyzed. The conclusion points to an implementation of SAM and proposes the adaptations to follow in order to smooth the change.NSBE - UN

    Identification of novel key factors of heart development using a systems biology approach

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    Heart diseases are the leading cause of death worldwide. Although surgical interventions can provide valuable options for treatment, current therapies in cardiovascular medicine only delay disease progression. A main reason for this shortcoming is the limited regenerative capacity of the adult human heart. In contrast to many other tissues and organs, the mammalian heart has very limited regenerative capacity. However, it has been observed that neonatal hearts in mice show remarkable capacity to regenerate lost functional muscle tissue, a capacity that rapidly disappears after the first post-natal week. Therefore, the study of heart development might give crucial cues for cardiac regenerative medicine. Heart development or cardiogenesis is a highly complex process with many components that are finely tuned in a precise manner across time and space. Regulation of gene expression plays an important role in this process. To capture this level of regulation, technologies such as microarrays or next generation sequencing provide powerful tools, as they enable the simultaneous measurement of expression levels of thousands of coding and non-coding genes. Although, it is possible to obtain the expression information of several thousand of genes, there is a clear lack of platforms in which research can scan through this information to develop or generate insightful biological questions in the field of heart study. Hence, this doctoral research work has tried to provide different systems biology approaches in order to offer new insights into gene expression events that occur mainly during heart development. These approaches include: (i) the integration of more than 20 published microarray studies related to cardiogenesis and the development of the HeartEXpress database (http://heartexpress.sysbiolab.eu/) to provide an easy and public access to the integrated data; (ii) the integrative analysis of a genome-wide study profiling coding and noncoding genes during embryonic heart development in vivo; (iii) the assessment of transcription factors and miRNAs previously associated to heart development; (iv) the integration and prioritisation of miRNA-mRNA interactions to identify novel miRNAs, mRNAs or miRNAinteractions with potential impact on cardiogenesis; (v) the development of a web-server called HeartmiR (http://heartmir.sysbiolab.eu/), which enables independent query and visualisation of miRNA-mRNA interactions obtained from the in vivo study; and (vi) comparative analysis of in vivo and in vitro studies to obtain further insights into mRNA, miRNA and miRNA-mRNA interactions during embryonic stem cell differentiation and to clarify how the in vitro experiment can be used as a faithful model to study embryonic heart formation. The main contributions of this research work for the study in the heart field are: 1. The development of HeartEXpress, which is a database that integrates the expression of more than 16400 genes and 130 experimental conditions in both human and mouse; 2. The development of HeartmiR, which is a database profiling the expression of 9211 mRNA and 386 microRNAs during the heart development period (from E10.5 to E19.5) and additionally in adult and old murine heart tissue; 3. Identification of the potential of 165 miRNAs to be involved in heart development using different methods of miRNA candidate prioritisation; 4. Identification of 102 miRNA and 214 putative novel miRNA-mRNA interactions relevant for cardiac cell development in vivo and in vitro. Furthermore, from the top20 miRNA with most interactions, 12 of the miRNA (60%) had been already associated to heart related events, indicating promising results for the remaining 8 miRNAs (40%) In summary, I have developed, implemented and applied different systems biology approaches to analyse both publicly available and new generated experimental data. As result, I was able to identify potential novel coding and non-coding key factors important for cardiogenesis that might be utilised as markers or targets in future cardiac regenerative medicine strategies.As doenças cardíacas são uma das principais causas de morte a nível mundial. Apesar das intervenções cirúrgicas serem uma opção de tratamento viável, as terapias atuais apenas conseguem atrasar a progressão da doença. A principal razão para esta insuficiência é a capacidade regenerativa limitada do coração humano adulto. Em contraste com muitos outros tecidos e órgãos, o coração do mamífero tem uma capacidade de regeneração muito limitada. No entanto, foi observado, em corações de ratinhos neonatais, que ainda existe a incrível capacidade de regenerar tecido cardíaco perdido, a qual desaparece rapidamente após a primeira semana depois do nascimento. Portanto, o estudo do desenvolvimento cardíaco poderá providenciar pistas cruciais para posteriormente aplicar à medicina regenerativa cardíaca. O desenvolvimento cardíaco, também designado por cardiogénese, é um processo altamente complexo que envolve vários intervenientes que são coordenados de uma forma precisa no espaço e no tempo. Para tornar possível a captura deste nível complexo de regulação, tecnologias como os microarrays e next generation sequencing são ferramentas poderosas que permitem a medição simultânea dos níveis de expressão de milhares de genes codificantes e não codificantes. No decorrer deste trabalho, diferentes métodos de biologia de sistemas foram implementados com o objetivo de fornecer um vislumbre da expressão genética que ocorre principalmente durante o desenvolvimento cardíaco. Como tal, foram realizadas: (i) a análise de mais de 20 estudos publicados de microarrays relacionados com o desenvolvimento cardíaco e, consequentemente, desenvolvida a ferramenta online HeartEXpress (http://heartexpress.sysbiolab.eu/) que permite o acesso público à base de dados tratados; (ii) a análise de um estudo do genoma que perfila os genes codificantes e não codificantes durante o desenvolvimento cardíaco embrionário in vivo; (iii) a análise de fatores de transcrição previamente associados com o desenvolvimento cardíaco; (iv) a apreciação de interações miRNA-mRNA para revelar novos miRNAs, mRNAs ou interações miRNA-mRNA que possam potencialmente ter um papel preponderante durante a cardiogénese; (v) o desenvolvimento de uma ferramenta online nomeada HeartmiR (http://heartmir.sysbiolab.eu/), que possibilita a consulta independente das interações obtidas no estudo do desenvolvimento cardíaco embrionário in vivo; e (vi) a análise comparativa de um estudo in vitro com o estudo in vivo para fornecer pistas adicionais sobre os miRNAs, mRNAs e interações miRNA-mRNA durante a diferenciação de células estaminais embrionárias e compreender como o modelo in vitro pode ser utilizado para o estudo do desenvolvimento do coração. As principais contribuições deste trabalho de investigação doutoral na área de estudo do coração são: 1. O desenvolvimento do HeartEXpress, sendo esta uma base de dados que integra a expressão de mais de 16400 genes e 130 condições experimentais tanto em humano como em ratinho; 2. O desenvolvimento do HeartmiR, que é uma base de dados que perfila a expressão de 9211 mRNA e 386 miRNAs durante o desenvolvimento cardíaco (de E10.5 a E19.5) e adicionalmente tecido cardíaco de ratinho em jovem adulto e velho; 3. Identificação de 165 miRNAs que podem estar potencialmente envolvidos no desenvolvimento cardíaco utilizando métodos de prioritização de candidatos; 4. Identificação de 102 miRNAs e 214 potenciais interações miRNA-mRNA relevantes para o desenvolvimento cardíaco celular in vivo e in vitro. Adicionalmente, dos top20 miRNAs com mais interações, 12 deles (60%) já foram associados a eventos cardíacos, indicando que os restantes 8 miRNAs (40%) serão promissores para investigações futuras. Os resultados demonstraram que os diferentes métodos de biologia de sistemas aplicados forneceram resultados interessantes de diferentes formas para estudos adicionais ao desenvolvimento cardíaco e, possivelmente, no futuro aplicar a estudos de medicina regenerativa. Para além dos mRNAs e miRNAs que vão ser apresentados neste trabalho e que já foram posteriormente associados ao desenvolvimento cardíaco de algum modo, muitos outros foram descobertos durante o decorrer deste trabalho com o potencial de serem inovadores na área da regeneração e desenvolvimento cardíaco. Por exemplo, a descoberta de genes co-expressos relacionados com desenvolvimento cardíaco poderão providenciar pistas sobre os padrões de expressão que ocorrem durante os eventos relacionados com o coração. Como é no caso de estudo do Isl1, um conhecido fator de transcrição cardíaco, que apresenta como padrão de co-expressão outros três conhecidos fatores ligados ao desenvolvimento cardíaco tais com o Gata3, Wnt2 e Wnt11. Apresenta ainda a co-expressão com outros genes que potencialmente poderão ser importantes no desenvolvimento cardíaco, nomeadamente três genes Riken (um codificante e dois não-codificantes longos). Em contrapartida, investigar interações miRNA-mRNA também é um passo importante, visto que o desenvolvimento cardíaco é um processo altamente regulado, sendo assim possível indiciar potenciais candidatos miRNAs que possam contribuir para o desenvolvimento cardíaco. Neste estudo foram descobertos 3 miRNAs candidatos no estudo in vivo (Let-7i, mir- 3472 e miR-490-3p) que apresentam um grande número de genes “alvo”, sendo indicados como potenciais reguladores do desenvolvimento cardíaco. Por último, a comparação dos estudos de microarrays in vitro e in vivo também foi um ponto importante, uma vez que forneceu informação fulcral sobre as semelhanças e disparidades entre estas duas distintas experiências laboratoriais, contribuindo para entender se o modelo in vitro será um paradigma apropriado para estudar o desenvolvimento cardíaco. Não obstante, os resultados revelaram ser encorajadores, visto terem sido encontradas interações miRNA-mRNA sobrepostas entre os dois estudos, contendo miRNAs que poderão ser promissores para validações experimentais futuras, como acontece, por exemplo, com o miR-608 que foi encontrado como diferencialmente expresso nos dois estudos – in vitro e in vivo – e tem como alvo seis genes que já foram previamente associados ao desenvolvimento cardíaco. Em suma, este trabalho utilizou diferentes metodologias da biologia de sistemas que permitiram utilizar e analisar informação publicamente disponível e dados laboratoriais que permitiram identificar potenciais fatores-chave codificantes e não-codificantes para a cardiogénese e, possivelmente, aplicar no futuro essa informação em validações laboratoriais e na medicina regenerativa
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