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    Implicación de las ectoenzimas ectonucleósido trifosfato difosfohidrolasas (familia CD39) en mecanismos de progresión del cáncer de endometrio

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    [spa] El cáncer de endometrio es una patología compleja en cuanto a su diagnóstico y tratamiento. El estudio de nuevas opciones diagnósticas y terapéuticas que aborde la heterogeneidad intra e intertumoral en este tipo de tumores resulta de especial interés. La adenosina trifosfato (ATP) y la propia adenosina activan una cascada de señalización (purinérgica) en el microambiente tumoral que se relaciona con fenómenos como la proliferación celular, la angiogénesis y la inmunosupresión, que permite al tumor evadir el sistema inmunitario. En esta Tesis hemos estudiado las ectonucleotidasas como principales enzimas reguladores de los niveles extracelulares de ATP y adenosina. Dos ectonucleotidasas, el tándem CD39-CD73, se han indentificado como las principales responsables de la acumulación de adenosina extracelular en los tumores y existen terapias antitumorales (principalmente inmunooncoterapias con anticuerpos monoclonales inhibidores) con estas enzimas como dianas. En el cáncer de endometrio su expresión también es elevada en el estroma. Sin embargo, no son las únicas ectoenzimas expresadas en el endometrio y ya se ha demostrado su papel en el endometrio funcional, no patológico. Nuestra hipótesis es que cambios en la expresión y actividad de las ectonucleotidasas endometriales juegan un papel la progresión tumoral en el cáncer de endometrio. El objetivo de la Tesis es esclarecer si la vía purinérgica, con las ectonucleotidasas como diana, debe valorarse como objetivo terapéutico en el cáncer de endometrio. Los principales objetivos son determinar la expresión y actividad de las familias de ectonucleotidasas en los diferentes tumores de endometrio, mediante experimentos de inmunomarcaje y actividad in situ, así como desarrollar modelos celulares de utilidad para el estudio de las ectonucleotidasas en el contexto del cáncer de endometrio. Los resultados confirman que cambios en la expresión de ectonucleotidasas se relacionan con la progresión e invasión tumorales y con el pronóstico de la enfermedad en mujeres que la padecen. De este estudio se concluye que dos ectonucleotidasas de la familia de las ectonucleótido trifosfato difosfohidrolasas (NTPDasas o familia CD39), NTPDasa2 y NTPDasa3 son relevantes en estos tumores. Así, la pérdida de NTPDasa2 en el estroma de la interfase tumor-miometrio se relaciona con el fenotipo invasivo de los tumores y NTPDasa3, en el componente epitelial tumoral, jugaría un papel supresor de tumores. Por otra parte, hemos generado herramientas moleculares para el estudio de estas proteínas expresándolas como proteínas de fusión en células de cáncer de endometrio y los estudios en cultivos 2D, en organoides (3D) y en un modelo in vivo en ratones nos han permitido definir mejor su papel en los tumores. A través de estudios de expresión génica mediante arrays de expresión, hemos identificado genes de proliferación y motilidad celulares directamente influidos por NTPDasa3. Demostramos que la sobreexpresión de NTPDasa3 provoca la disminución génica y proteica de algunas metaloproteinasas de matriz y de integrinas, fenómeno relacionado con la adopción de fenotipos migratorios de tipo ameboide. Además, esta Tesis contribuye a la mejora metodológica del estudio de las ectonucleotidasas en tejidos y células humanas, lo que supone un avance para el estudio de nuevos inhibidores con posible uso terapéutico en esta y otras patologías con alteraciones en la vía purinérgica

    In Situ Identification of Ectoenzymes Involved in the Hydrolysis of Extracellular Nucleotides

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    Adenosine triphosphate (ATP) and other nucleotides and nucleosides, such as adenosine, are signaling molecules involved in many physiological and pathophysiological processes. The group of cell and tissue responses mediated by these molecules is known as purinergic signaling. Ecto-nucleotidases are ectoenzymes expressed at the cell membrane that act sequentially to efficiently hydrolyze extracellular ATP into adenosine, and they are key elements of this signaling. There is growing interest in studying these enzymes in relation to various pathologies, especially those with an inflammatory component such as cancer. This review summarizes the main protocols for the study of the expression and in situ activity of ectoenzymes in tissue slices and cultured cells

    Fabrication and characterization of 2D photonic crystals for new optoelectronic devices

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    Photonic crystals were discovered in the 80s as a possible solution to the control of the spontaneous emission and localization of light. Nevertheless only in recent years, with the spreading of nanotechnologies, the first applications with high technological impact have been achieved, like planar photonic crystal lasers or the nanostructured photonic crystal waveguides. Nowadays new types of optoelectronic devices like single photon emitters based on photonic crystal nanocavities are being pursued. In this talk we will show the fabrication and characterization of new photonic bandgap devices, like Suzuki-phase laser emitters or ring-like emitters, and we will show their emission properties in the far field and their tuning by the fabrication process. These new devices may be used as new optical sensors and as efficient nanosources of laser light.Los cristales fotónicos fueron planteados a finales de los años ochenta como una posible solución al control de la emisión espontánea y a la localización de la luz. Sin embargo, sólo en los últimos años, con el advenimiento de las tecnologías de nanofabricación, se han conseguido las primeras aplicaciones prácticas de elevado impacto tecnológico, como los láseres de cristal fotónico o las guías de onda nanoestructuradas con gap fotónico. En la actualidad se están planteando nuevos dispositivos que permitan la emisión eficiente de un solo fotón o la captura de un átomo en el interior de una nanocavidad de cristal fotónico. En este seminario se mostrará la fabricación y caracterización de nuevos dispositivos con gap fotónico, como emisores láser de fase Suzuki o resonadores láser de anillo, y se mostrarán sus propiedades de emisión en el campo lejano y de sintonización mediante el control preciso del proceso de fabricación. Estos nuevos dispositivos pueden ser usados como nuevos sensores ópticos y como eficientes nanoemisores de luz láser.A. R. Alija agradece una beca predoctoral FPU AP2002-0474 del MEC. L. J. Martínez agradece una beca predoctoral I3P-CSIC. P. A. Postigo agradece un contrato "Ramón y Cajal" y los proyectos CAM GR\MAT\0729\2004 y CICYT TIC2002- 04096-C03-03.Peer reviewe

    Inhomogeneity detection in phytoplankton time series using multivariate analyses

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    Phytoplankton communities have long been used as water quality indicators within environmental policies. This has fostered the development of national and international phytoplankton monitoring programs, but these networks are subject to sources of uncertainty due to laboratory issues. Nevertheless, studies regarding the interference associated with these aspects are not well-documented. Hence, a long time series (2003-2015) from the Basque continental shelf (southeastern Bay of Biscay) was analyzed to evaluate the uncertainty given by laboratory strategies when studying phytoplankton variability. Variability in phytoplankton communities was explained not only by environmental conditions but also by changes in fixatives (glutaraldehyde and acidic Lugol's solution) and laboratory staff. Based on Bray-Curtis distances, phytoplankton assemblages were found to be significantly dissimilar according to the effect of changes in the specialist handling the sample and the employed fixative. The pair-wise permutational multivariate analysis of variance (PERMANOVA) showed significant differences between the two fixatives utilized and also between the three taxonomists involved. Thus, laboratory-related effects should be considered in the study of phytoplankton time series.The data for this study were obtained from the project "Program for the monitoring and assessment of the ecological status of transitional and coastal waters of the Basque Country" funded by URA, the Basque Water Agency, through a convention with AZTI. This work was supported by the project "IM17MUSSELS". The participation of O. Muniz was funded by a grant from the Department of Economic Development and Competitiveness of the Basque Government (BOPV num. 201; 2013/4467). This paper is contribution number 956 from AZTI (Marine Research Division). We also thank Proof-Reading-Service for their great professional proof reading and editing service, as well as the anonymous reviewers for their comments and suggestions

    Assessment of a Sheltered Euhaline Area of the Southeastern Bay of Biscay to Sustain Bivalve Production in Terms of Phytoplankton Community Composition

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    This study describes the phytoplankton community in sheltered euhaline waters of the Basque coast (southeastern Bay of Biscay). Phytoplankton composition, cell size, abundance, biomass and the presence of potentially toxic taxa, together with chlorophyll a, nutrients and hydrographic and optical conditions were measured, from August 2016 to August 2017, in the Mutriku port, with the main aim of assessing the suitability of the phytoplankton community as a food resource for bivalves. The water column in Mutriku showed the typical environmental conditions of Basque marine waters, with no significant nutrient enrichment caused by anthropogenic pressures. Haptophytes represented the greatest contribution to cell abundance (31-47%), and diatoms were the dominant group in terms of biomass (52-79%),which could favour mussel growth due to their high fatty acid content. In addition, the size structure of the phytoplankton community was suitable for mussel ingestion, since the predominant cell size was 2-20 mu m. Regarding toxic phytoplankton, the genera that pose a risk for human health and those that affect negatively mussel physiology and survival were considered. Altogether, ten toxic phytoplankton taxa were identified, contributing in less than 5% to the total cell abundance of Mutriku. However, median chlorophyll a concentration was low (0.5 mu g L-1), reflecting the oligotrophic conditions of the area. Therefore, even if the composition of the phytoplankton community could be favourable for bivalve aquaculture, biomass values are low compared to other zones of bivalve productionThis study was partially supported by the project EGRECOST CALIDAD -Control de Calidad de Aguas Cultivos Marinos (Departamento de Desarrollo Economico e Infraestructuras del Gobierno Vasco) and the project PPG17/67 funded by the University of the Basque Country (UPV/EHU). J. Bilbao was funded by a grant from the University of the Basque Country (UPV/EHU -PIF 18/306). This paper is contribution number 991 from AZTI (Marine Research Division

    Molecular Epidemiology, Antimicrobial Surveillance, and PK/PD Analysis to Guide the Treatment of Neisseria gonorrhoeae Infections

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    The aim of this study was to apply molecular epidemiology, antimicrobial surveillance, and PK/PD analysis to guide the antimicrobial treatment of gonococci infections in a region of the north of Spain. Antibiotic susceptibility testing was performed on all isolates (2017 to 2019, n = 202). A subset of 35 isolates intermediate or resistant to at least two antimicrobials were selected to search for resistance genes and genotyping through WGS. By Monte Carlo simulation, we estimated the probability of target attainment (PTA) and the cumulative fraction of response (CFR) of the antimicrobials used to treat gonorrhea, both indicative of the probability of treatment success. In total, 2.0%, 6.4%, 5.4%, and 48.2% of the isolates were resistant to ceftriaxone, cefixime, azithromycin, and ciprofloxacin, respectively. Twenty sequence types were identified. Detected mutations were related to antibiotic resistance. PK/PD analysis showed high probability of treatment success of the cephalosporins. In conclusion, multiple populations of N. gonorrhoeae were identified. We can confirm that ceftriaxone (even at the lowest dose: 250 mg) and oral cefixime are good candidates to treat gonorrhea. For patients allergic to cephalosporins, ciprofloxacin should be only used if the MIC is known and ≤0.125 mg/L; this antimicrobial is not recommended for empirical treatment.This research was funded by the University of the Basque Country UPV/EHU (GIU20/048; PA20/03), Spain

    CROS: A Contingency Response multi-agent system for Oil Spills situations

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    This paper presents CROS, a Contingency Response multi-agent system for Oil Spill situations. The system uses the Case-Based Reasoning methodology to generate predictions to determine the probability of finding oil slicks in certain areas of the ocean. CBR uses past information to generate new solutions to the current problem. The system employs a SOA-based multi-agent architecture so that the main components of the system can be remotely accessed. Therefore, all functionalities (applications and services) can communicate in a distributed way, even from mobile devices. The core of the system is a group of deliberative agents acting as controllers and administrators for all applications and services. CROS manages information such as sea salinity, sea temperature, wind speed, ocean currents and atmosphere pressure, obtained from several sources, including satellite images. The system has been trained using historical data obtained after the Prestige accident on the Galician west coast of Spain. Results have demonstrated that the system can accurately predict the presence of oil slicks in determined zones after an oil spill. The use of a distributed multi-agent architecture has been shown to enhance the overall performance of the system

    Autopistas salvajes: propuesta de WWF España para una Red Estratégica de Corredores Ecológicos entre espacios Red Natura 2000

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    La propuesta de corredores realizada en este documento se basa en los resultados del siguiente estudio encargado por WWF España: Estudio para la identificación de redes de conectividad entre espacios forestales de la Red Natura 2000 en España. ETSI Montes, Forestal y del Medio Natural. Universidad Politécnica de Madrid. 2016. Autores: María Cruz Mateo Sánchez, Begoña de la Fuente Martín, Aitor Gastón González y Santiago Saura Martínez de Toda.[ES] Un territorio donde los espacios de valor natural estén conectados y se permita el movimiento de fauna y flora, el intercambio de genes y, en un sentido más amplio, el funcionamiento de procesos ecológicos, es clave para conservar la biodiversidad y los recursos naturales y para afrontar con mayores garantías los efectos indeseables del cambio climático. En España, además, sometida a fuertes procesos de transformación del paisaje y a los efectos del cambio climático, el freno a los procesos de aislamiento y fragmentación de hábitats para las especies y la búsqueda de soluciones para garantizar la conectividad ecológica se convierten en tareas especialmente relevantes para detener la pérdida de biodiversidad. Y es que diversos estudios ya han constatado que no es posible alcanzar los objetivos de conservación basándose únicamente en la declaración de espacios protegidos aislados (Franklin, 1993; Krosby y otros, 2010; Laurance y otros, 2012; Juffe-Bignoli y otros, 2014; Saura y otros, 2018). Esto ha tenido como consecuencia que comience a considerarse, en un número creciente de países, la necesidad de establecer redes de conectividad que faciliten el flujo de organismos y procesos ecológicos entre dichos espacios. A la vista de esto, y de las obligaciones legales derivadas de las legislaciones europea y nacional, WWF presenta en este documento una visión de conectividad para la España peninsular con una propuesta de corredores ecológicos como nexos entre espacios de la Red Natura 2000. Es una identificación que tiene en cuenta los corredores transfronterizos, que funcionan como conectores entre espacios ubicados en territorio español y trascurren en parte de su trazado por territorio de países limítrofes (Portugal, Francia y Andorra). Por motivos metodológicos no se incluyen en el estudio los territorios insulares. Esta propuesta ha sido generada a partir de un estudio realizado por la Universidad Politécnica de Madrid por encargo de WWF España. Se han identificado los corredores prioritarios entre los hábitats forestales de Red Natura 2000 con el objetivo de garantizar la movilidad de las especies forestales. Se ha elegido este enfoque por la amplia representación de este tipo de hábitats en España y en la Red Natura 2000, así como por la mayor disponibilidad de información necesaria para los análisis de conectividad. También se ha determinado qué corredores tienen mayor necesidad de ser restaurados para mejorar la conectividad de la red, cuáles son prioritarios para la conservación, de manera que se mantengan al menos en sus condiciones actuales, y qué tramos de estos corredores están actuando como cuellos de botella, dificultando el movimiento de las especies y con condiciones particularmente frágiles para garantizar su papel conector. Esta propuesta se ha realizado usando las mejores y más recientes herramientas y metodologías disponibles para el análisis de la conectividad (Saura y Pascual-Hortal, 2007; Saura y Torné, 2009; McRae y Kavanagh, 2011; De la Fuente y otros, 2018) y se centra en las necesidades de movimiento de un amplio grupo de especies forestales y en favorecer la conexión para una variedad de hábitat (bosques densos, bosques claros y matorrales) y procesos ecológicos asociados a los mismos. Sin embargo, la propuesta no abarca aspectos como la conectividad para especies y hábitats de tipo más estepario y de ámbito agrario, así como la de hábitats acuáticos. Sin duda, sería de gran interés analizar dichas carencias en el futuro para sumar información al presente estudio. En conclusión, los resultados aportan información geográfica explícita clave para ser tenida en cuenta por políticas ambientales y sectoriales —de planificación territorial, agricultura o transporte— y alcanzar así las obligaciones y compromisos de España respecto a la conservación de la biodiversidad. Autopistas Salvajes. Propuesta de WWF España para una Red Estratégica de Corredores Ecológicos entre espacios Red Natura 2000 aporta una visión necesaria y de futuro que también será muy valiosa para alcanzar la conectividad ecológica entre países europeos.Este trabajo ha sido posible gracias al apoyo de la Fundación MAVA

    Operational oceanography applied to the management of offshore aquaculture on the Basque coast (SE Bay of Biscay)

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    With the support of the Basque Government, offshore longlines have been used for mussel production in Mendexa (“Bivalve Mollusc Production Area”) since 2019. This area is located about 2 nautical miles from the Basque coast (SE Bay of Biscay). Here, an Integrated Marine Observing System (IMOS) has been established to identify toxic HABs. This system includes in situ data, sampling activity, satellite images, numerical models and other external sources of information.Peer Reviewe

    Preferred reporting items for systematic review and meta-analysis protocols (PRISMA-P) 2015 statement

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    Traducción de: Moher D, Shamseer L, Clarke M, Ghersi D, LiberatI A, Petticrew M, Shekelle P, Stewart LA, PRISMA-P Group. Preferred reporting items for systematic review and meta-analysis protocols (PRISMA-P) 2015 statement. Systematic Reviews. 2015; 4(1): 1 - 9. doi: 10.1186/2046-4053-4-1. Traducción con permiso de los/las autores/as. Los autores originales no han revisado ni verificado la traducción del manuscrito al español, y no necesariamente están de acuerdo con su contenido.Las revisiones sistemáticas deben establecerse sobre la base de un protocolo que describa la justificación, la hipótesis y los métodos planificados de la revisión, antes de su realización o publicación; sin embargo pocas revisiones publicadas informan sobre la existencia previa de un protocolo. Disponer de un protocolo detallado y bien escrito puede facilitar la comprensión y valoración de la metodología de la revisión, así como la detección de modificaciones en la metodología o la publicación selectiva en revisiones completadas. El presente trabajo describe el desarrollo de unas directrices de presentación de la información, Preferred Reporting Items for Systematic reviews and Meta-analyses for Protocols 2015 (PRISMA-P 2015). Las directrices PRISMA-P se componen de una lista de verificación de 17 elementos que pretenden facilitar la preparación y presentación de un protocolo sólido para la revisión sistemática. Las instituciones financiadoras y quienes encargan las revisiones podrían considerar la posibilidad de exigir la lista de verificación, a fin de facilitar la presentación de la información relevante del protocolo, para solicitar financiación. De forma similar, los revisores por pares y editores pueden utilizar las directrices para determinar la integridad y transparencia de un protocolo de revisión sistemática presentado a una revista u otro medio para su publicación.Systematic reviews should build on a protocol that describes the rationale, hypothesis, and planned methods of the review; few reviews report whether a protocol exists. Detailed, well-described protocols can facilitate the understanding and appraisal of the review methods, as well as the detection of modifications to methods and selective reporting in completed reviews. We describe the development of a reporting guideline, the Preferred Reporting Items for Systematic reviews and Meta-Analyses for Protocols 2015 (PRISMA-P 2015). PRISMA-P consists of a 17-item checklist intended to facilitate the preparation and reporting of a robust protocol for the systematic review. Funders and those commissioning reviews might consider mandating the use of the checklist to facilitate the submission of relevant protocol information in funding applications. Similarly, peer reviewers and editors can use the guidance to gauge the completeness and transparency of a systematic review protocol submitted for publication in a journal or other medium
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