How theories of meaning resemble attributed situations: methodological suggestions for representing how people conceive the contents of theories of meaning, extracting signifiers’ identity conditions, and measuring domains for allowed influences

This thesis develops methods for representing how the contents of theories of meaning become conceived by their users. These contents are treated as the range of systematically elicited conceptions afforded by a designated corpus of key texts. The approach being taken involves first detailing a formal scheme for the components of situations attributed to various entities (e.g. ‘your situation’). This scheme is then applied as a framing device to form a template which accounts for the shared structure between the mental spaces which embody how people conceive different theories of meaning. For the purposes of this task, cognition is treated as embodied in the sense that both the form and content of personal conceptualisations are largely dependent on what both bodily and ecological factors afford. The purpose of this approach is to help understand how theories operate when viewed as worldly entities within a materialist framework. The significance of such understanding lies in enabling analyses and comparisons which account for the effects of material restrictions such as how a theory’s presentation must necessarily be selective and how human cognition operates on models set by precedent. The framework being provided here allows the conceptions each individual theory of meaning elicits to be reduced to formal, commensurate models which account for differences between typical influences on the conceptions characteristic of different demographics such as experts of related fields. Approaching theories of meaning from this angle also reveals new avenues of comparison concerning otherwise implicit details. One involves theory-internal conditions on the full material identity of meaning-instantiating entities. The other concerns the extent of the domains for aggregating applicable influences for which a theory accounts and the range of those it may accommodate

Viestiminen tilintarkastuksen kannalta keskeisistä seikoista suomalaisten pörssiyhtiöiden tilintarkastuskertomuksissa

Suomalaisten pörssiyhtiöiden tilintarkastuskertomuksiin sisältyi keväällä 2017 ensimmäistä kertaa raportointi tilintarkastuksen kannalta keskeisistä seikoista eli KAM:eista (Key Audit Matters). KAM:eja ovat seikat, jotka ovat olleet merkittävimpiä yhtiön tilikauden tilintarkastuksessa. Uudistuksen taustalla on halu lisätä tilintarkastuskertomuksen informaatioarvoa ja tilintarkastuksen läpinäkyvyyttä. Tilintarkastuskertomuksia on etenkin pörssiyhtiöiden kohdalla kritisoitu siitä, etteivät ne kuvasta riittävän yksilöllisesti suoritettua tilintarkastusta ja keskeisimpiä havaintoja. Aikaisemmin pörssiyhtiöiden tilintarkastuskertomukset ovat olleet sisällöltään käytännössä identtisiä, mutta uuden ISA 701 –standardin myötä tilintarkastuskertomukset sisältävät jatkossa yhtiökohtaista tietoa suoritetusta tilintarkastuksesta. Listayhtiöiden tilintarkastuskertomuksiin on 15.12.2016 ja sen jälkeen päättyneiden tilikausien osalta tullut sisällyttää osio, jossa tulee kuvata, miksi raportoidun seikan on katsottu olevan tilintarkastuksen kannalta keskeinen seikka, ja kuvata, miten kyseistä seikkaa on käsitelty tilintarkastuksessa. Tämä tutkielma tarkastelee, miten kyseisistä seikoista on raportoitu suomalaisten pörssiyhtiöiden tilintarkastuskertomuksissa standardin ensimmäisenä vuonna. Tarkasteltavia osa-alueita ovat eri KAM:ien yleisyys, pörssiyritysten markkina-arvon ja toimialan merkitys raportoituihin seikkoihin sekä tilintarkastusyhteisöjen väliset erot raportoinnissa. Tutkielma on toteutettu kvantitatiivisena tutkimuksena, jonka taustalla on nomoteettinen tutkimusote. Tutkielman aineisto muodostuu Helsingin pörssin päälistalla noteerattujen yhtiöiden tilintarkastuskertomuksista, jotka on annettu tilikaudelta 2016. Aineistoon on valittu ne yhtiöt, jotka ovat olleet päälistalla 31.12.2016 ja joiden vuoden 2016 tilikausi on päättynyt 15.12.2016 tai sen jälkeen. Lisäksi aineistosta on rajattu pois ne yhtiöt, joiden kotipaikka ei ole Suomi. Rajausten jälkeen aineisto muodostuu 120 tilintarkastuskertomuksesta. Tutkielman aineistoon kuuluvia yhtiöitä on luokiteltu kolmen eri kriteerin perusteella. Nämä kriteerit ovat toimiala, yhtiön markkina-arvo sekä yhtiökokouksen valitsema tilintarkastusyhteisö. Tilintarkastuskertomuksissa raportoidut KAM:it on puolestaan luokiteltu tutkielmassa kahdeksaantoista kategoriaan. Kategoriat on lähtökohtaisesti jaoteltu taseen ja tuloslaskelman avulla. Luokittelun perusteella havaittiin, että yleisimmät kolme kategoriaa koskevat liikevaihtoa, liikearvoa ja muita aineettomia hyödykkeitä sekä vaihto-omaisuutta. Aineiston tilintarkastuskertomuksissa KAM:ien määrä vaihteli yhden ja kuuden välillä keskiarvon ollessa 2,89. 89,2 prosenttia kaikista tilintarkastuskertomuksista sisälsi joko kaksi, kolme tai neljä KAM:ia. Tulosten perusteella havaittiin, että markkina-arvoltaan suurissa yhtiöissä kuvattiin enemmän KAM:eja kuin keskisuurissa ja pienissä yrityksissä. KAM:ien raportoinnissa havaittiin myös toimialakohtaisia eroja. KAM:it ovat maailmanlaajuisesti vielä melko tuore asia, joten aikaisempaa tutkimustietoa ei ole vielä kovinkaan paljoa saatavilla. KAM:ien myötä tilintarkastuskertomukset ovat huomattavasti yhtiökohtaisempia ja informatiivisempia kuin aiemmin. KAM:ien suurin informaatiohyöty liittyy siihen, että tilinpäätösinformaation käyttäjät saavat tilintarkastajalta tietoa siitä, mihin osa-alueisiin tilintarkastuksessa on erityisesti kiinnitetty huomiota ja minkälaisia tilintarkastustoimenpiteitä näille osa-alueille on tehty. Tilintarkastajien ja johdon vastuunjaon takia KAM:it eivät ole uuden tilinpäätösinformaation lähteitä, joten niillä ei tule olemaan merkittävää vaikutusta markkinareaktioihin, mutta KAM:it lisäävät kuitenkin merkittävästi tilintarkastuksen läpinäkyvyyttä

Binding of cholera toxin to lipid bilayers of various compositions

During the last decades, several cholera pandemics have taken place. Still, cholera currently continues to be a major cause of morbidity and mortality making it a worldwide health problem. The causative agent of the disease is the bacterium V ibrio cholerae, and the toxin responsible for the symptoms is called cholera toxin (CT). CT is an AB5 hexameric enterotoxin consisting of two non-covalently bound parts: A and B subunits. The A subunit is responsible for the toxicity functions of CT while the B-pentamer is responsible for the binding of CT to the plasma membrane (PM) in the intestinal lumen of human body. The B-pentamer has been found to tether to GM1 gangliosides in the lipid rafts in PM. One way to investigate these kinds of events is to use fluorescence spectroscopy, where fluorescent markers, such as BODIPY dyes, are employed. In this study, we investigate the effect of the composition of lipid bilayers on the binding of CT. For this purpose, we employ atomic-scale molecular dynamics simulations for a total of 2.8 microseconds. We consider two different lipid environments: a bilayer consisting of DOPC (1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine) in a liquid-disordered phase (ld) and a bilayer consisting of SSM (N-stearoyl-d-erythro-sphingosylphosphorylcholine) and cholesterol in a liquid-ordered phase (lo). These membranes are enriched with both the native GM1 and the BODIPY-labeled GM1 resulting in four different lipid environments. In addition to four 500-nanosecond simulations of these membranes in the presence of the protein we also study the same four systems for 200 nanoseconds without the B-pentamer, this case serving as a reference. The results show that cholera toxin binds rapidly to all simulated membranes. However, membrane properties important to the toxin binding were noticed to be dependent on the composition of the lipid bilayer. Electrostatic potential was observed to change significantly between the ld and lo phases. Also the geometry of the head group of GM1, essential for the receptor–ligand fitting, was noticed to change as the composition of the bilayer was altered. The results support the idea of CT binding to the GM1 ganglioside, and the membrane in the ld phase was noticed to be the most favorable for the toxin binding

Assessment of mutation probabilities of KRAS G12 missense mutants and their long-timescale dynamics by atomistic molecular simulations and Markov state modeling

A mutated KRAS protein is frequently observed in human cancers. Traditionally, the oncogenic properties of KRAS missense mutants at position 12 (G12X) have been considered as equal. Here, by assessing the probabilities of occurrence of all KRAS G12X mutations and KRAS dynamics we show that this assumption does not hold true. Instead, our findings revealed an outstanding mutational bias. We conducted a thorough mutational analysis of KRAS G12X mutations and assessed to what extent the observed mutation frequencies follow a random distribution. Unique tissue-specific frequencies are displayed with specific mutations, especially with G12R, which cannot be explained by random probabilities. To clarify the underlying causes for the nonrandom probabilities, we conducted extensive atomistic molecular dynamics simulations (170 its) to study the differences of G12X mutations on a molecular level. The simulations revealed an allosteric hydrophobic signaling network in KRAS, and that protein dynamics is altered among the G12X mutants and as such differs from the wild-type and is mutation-specific. The shift in long-timescale conformational dynamics was confirmed with Markov state modeling. A G12X mutation was found to modify KRAS dynamics in an allosteric way, which is especially manifested in the switch regions that are responsible for the effector protein binding. The findings provide a basis to understand better the oncogenic properties of KRAS G12X mutants and the consequences of the observed nonrandom frequencies of specific G12X mutations.Peer reviewe

Negatively Charged Gangliosides Promote Membrane Association of Amphipathic Neurotransmitters

Lipophilic neurotransmitters (NTs) such as dopamine are chemical messengers enabling neurotransmission by adhering onto the extracellular surface of the post-synaptic membrane in a synapse, followed by binding to their receptors. Previous studies have shown that the strength of the NT-membrane association is dependent on the lipid composition of the membrane. Negatively charged lipids such as phosphatidylserine, phosphatidylglycerol, and phosphatidic acid have been indicated to promote NT-membrane binding, however these anionic lipids reside almost exclusively in the intracellular leaflet of the post-synaptic membrane instead of the extracellular leaflet facing the synaptic cleft. Meanwhile, the extracellular leaflet is relatively rich in biologically relevant anionic gangliosides such as monosialotetrahexosylganglioside (GM1), yet the role of gangliosides in NT-membrane association is not clear. Here, we explored the role of GM1 in modulating the binding of dopamine and histamine (as amphipathicicationic NTs) as well as acetylcholine (as a hydrophilic/cationic NT) with the post-synaptic membrane surface. Atomistic molecular dynamics simulations and free energy calculations indicated that GM1 fosters membrane association of histamine and dopamine. For acetylcholine, this effect was not observed. The in silico results suggest that gangliosides form a charge-based vestibule in front of the post-synaptic membrane, attracting amphipathic NTs to the vicinity of the membrane. The results also stress the importance to understand the significance of the structural details of NTs, as exemplified by the GM1-acetylcholine interaction. In a larger context, the NT-membrane adherence, coupled to lateral diffusion in the membrane plane, is proposed to improve neurotransmission efficiency by advancing NT entry into the membrane-embedded ligand-binding sites. (C) 2018 IBRO. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.Peer reviewe

Eteisvärinää sairastavien potilaiden antikoagulaatiohoito ja palveluiden käyttö Suomessa

Lähtökohdat Suoria antikoagulantteja ja varfariinia käytetään ei-läppäperäiseen eteisvärinään liittyvän aivohalvauksen estossa, mutta toistaiseksi eri antikoagulaatiolääkityksellä olevista suomalaisista potilaista on rajallisesti tosielämän tietoon perustuvia tutkimuksia. Menetelmät Tutkimme rekisteritiedolla antikoagulaatiohoitoa saavien eteisvärinäpotilaiden palvelukäyttöä, lääkitystä sekä potilasprofiilia. Tarkastelimme lääkesegmenteittäin sosiaali- ja terveyspalvelujen käyttöä ja kustannuksia sekä aivotapahtumista ja ruoansulatuskanavan vuodoista johtuvia erikoissairaanhoidon ja ­perusterveydenhuollon käyntejä ja hoitopäiviä potilailla, jotka olivat käyttäneet vähintään vuoden ­samaa antikoagulanttia. Tulokset Varfariinia ja apiksabaania määrätään keskimäärin vanhemmille ja korkeamman riskin potilaille kuin muita antikoagulantteja. Eteisvärinäpotilaiden yhteenlasketut sote-palveluiden kustannukset olivat vuonna 2018 noin 2 miljardia euroa. Haittatapahtumista aivoinfarktit ja aivotapahtumien jälkitilat aiheuttivat eteisvärinä­potilaille eniten palvelukäyttöä. Päätelmät Eteisvärinäpotilaiden hoidosta kertyy yhteiskunnalle suuria kustannuksia. Suoria antikoagulantteja ja varfariinia käyttävien potilaiden välillä on eroja potilasprofiilissa sekä palvelukäytössä ja sen kustannuksissa.</p

UV-Sensing Cellulose Fibers Manufactured by Direct Incorporation of Photochromic Minerals

Textile-based wearable sensors integrated into daily wear offer opportunities for on-demand, real-time self-diagnosis to monitor health conditions with changing environmental surroundings and hazards. One still underrated environmental hazard is accumulated UV irradiation, causing skin burns, accelerated aging, and skin cancers. Here, we have demonstrated a sustainable fiber manufacture process to integrate photochromic hackmanite micro-particles directly into a cellulose body to achieve UV-sensing functionality in daily-life textiles. The hackmanite particles were dispersed into an ionic liquid cellulose dope using ultrasonication and nanofibrillated cellulose as a dispersant, resulting in good spinnability. The obtained fibers possess high mechanical strength with up to 10% photochromic hackmanite loading. To demonstrate its application in wearable UV sensors, the fibers were spun into yarn and then knitted into a piece of jersey fabric. The coloration of hackmanite-incorporated textiles under UV irradiation is readily quantified by image analysis using red–green–blue ratios, which was further utilized for UV dosimetry with a smartphone application showcasing the practical use of the UV sensor. The UV-sensing functionality remained the same after intensive washing and abrasion tests, further demonstrating the feasibility of its application in everyday garments.</p

The Center of Excellence in Atmospheric Science (2002–2019) — from molecular and biological processes to the global climate

The study of atmospheric processes related to climate requires a multidisciplinary approach, encompassing physics, chemistry, meteorology, forest science, and environmental science. The Academy of Finland Centre of Excellence in atmospheric sciences (CoE ATM) responded to that need for 18 years and produced extensive research and eloquent results, which are summarized in this review. The work in the CoE ATM enhanced our understanding in biogeochemical cycles, ecosystem processes, dynamics of aerosols, ions and neutral clusters in the lower atmosphere, and cloud formation and their interactions and feedbacks. The CoE ATM combined continuous and comprehensive long-term in-situ observations in various environments, ecosystems and platforms, ground- and satellitebased remote sensing, targeted laboratory and field experiments, and advanced multi-scale modeling. This has enabled improved conceptual understanding and quantifications across relevant spatial and temporal scales. Overall, the CoE ATM served as a platform for the multidisciplinary research community to explore the interactions between the biosphere and atmosphere under a common and adaptive framework