DPYD pathogenic variants associated with fluoropyrimidines toxicity

Background: Genetic variants in dihydropyrimidine dehydrogenase gene (DPYD) coding for the key enzyme (DPD) of fluoropyrimidines (FPs) catabolism. DPYD contributes to the development of severe FPs-related toxicity, and pathogenic DPYD variants detection reduces side effects and complications associated with FP-toxicity. The allelic frequency of these variants in the Mexican population is currently unknown. Methods: The study was carried out at the Centro Universitario Contra el Cáncer (CUCC) of the Universidad Autónoma de Nuevo León (UANL) in Monterrey México. Genomic DNA was isolated from 154 subjects using the QIAamp DNA Blood Midi kit (QIAGEN) following the manufacturer\u27s recommendations. We analyze the variants c.1156G-\u3eT, c.2846A-\u3eT, and c.1129-5923C-\u3eG by qPCR using predesigned probes. For the remaining genomic variants (c.1905+1G-\u3eA, c.1679T-\u3eG, c.1898delC and c.299_302delTCAT), we design sequencing oligos using the software Oligo Primer v.7®. The allele frequency was calculated for each variant. Results: We analyzed a total of 154 samples to detect the seven variants analyzed. So far, only 2 samples have been found that presented the variant c.1129-5923C\u3eG in a state of heterozygosis, representing 1.2987% of the total of our population. Conclusions: The allele frequency for the variant c.1129-5923C-\u3eG was higher than reported in other populations. So this allele is more common in our population, which could attribute to the large percentage of side effects in our patients. However, more studies and increasing the number of samples are needed to establish DPYD the allele frequency more precisely

Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2

The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality

Impact of opioid-free analgesia on pain severity and patient satisfaction after discharge from surgery: multispecialty, prospective cohort study in 25 countries

Background: Balancing opioid stewardship and the need for adequate analgesia following discharge after surgery is challenging. This study aimed to compare the outcomes for patients discharged with opioid versus opioid-free analgesia after common surgical procedures.Methods: This international, multicentre, prospective cohort study collected data from patients undergoing common acute and elective general surgical, urological, gynaecological, and orthopaedic procedures. The primary outcomes were patient-reported time in severe pain measured on a numerical analogue scale from 0 to 100% and patient-reported satisfaction with pain relief during the first week following discharge. Data were collected by in-hospital chart review and patient telephone interview 1 week after discharge.Results: The study recruited 4273 patients from 144 centres in 25 countries; 1311 patients (30.7%) were prescribed opioid analgesia at discharge. Patients reported being in severe pain for 10 (i.q.r. 1-30)% of the first week after discharge and rated satisfaction with analgesia as 90 (i.q.r. 80-100) of 100. After adjustment for confounders, opioid analgesia on discharge was independently associated with increased pain severity (risk ratio 1.52, 95% c.i. 1.31 to 1.76; P < 0.001) and re-presentation to healthcare providers owing to side-effects of medication (OR 2.38, 95% c.i. 1.36 to 4.17; P = 0.004), but not with satisfaction with analgesia (beta coefficient 0.92, 95% c.i. -1.52 to 3.36; P = 0.468) compared with opioid-free analgesia. Although opioid prescribing varied greatly between high-income and low- and middle-income countries, patient-reported outcomes did not.Conclusion: Opioid analgesia prescription on surgical discharge is associated with a higher risk of re-presentation owing to side-effects of medication and increased patient-reported pain, but not with changes in patient-reported satisfaction. Opioid-free discharge analgesia should be adopted routinely

Productividad y estructura vertical de un bosque templado con incidencia de incendios forestales

Se evaluaron las afectaciones ocasionadas por un incendio forestal, la estructura vertical y la asociación de las especies arbóreas y su relación con la productividad a través de variables dasométricas. Se trabajó en dos áreas, una incendiada y otra no incendiada, en las que se establecieron 36 sitios circulares de 11.28 m de radio y de 400 m2. Mediante el índice de Pretzsch, se hizo una clasificación de tres estratos: estrato I (80-100 %), estrato II (50-80 %) y estrato III (0-50 %). Se determinó la productividad utilizando datos dasométricos como densidad individual (ha-1), área basal (m2 ha-1), área de copa (m2 ha-1) y volumen (m3 ha-1). Se hizo un análisis estadístico en el programa r-Studio® (Ver. 3.1.1), mediante una comparación de medias entre grupos independientes de los parámetros dasométricos. El análisis de la estructura vertical se realizó mediante el índice A de Pretzsch, reveló que el área incendiada fue mayor con Amax de 2.71 contra 2.20 de la no incendiada. El estrato II fue el que concentró mayor número de individuos por hectárea, en las dos áreas (50 % y 33 %), con una altura máxima de 23.9 y 26 m, respectivamente. La productividad fue superior en el área incendiada, lo que se atribuye a la abundancia de Pinus pseudostrobus; mientras que la no incendiada registró menos individuos por hectárea, diferido a menor proporcionalidad en volumen (m3 ha-1). Se concluye que existen beneficios en la estructural y productividad en un bosque sometido a incendio

Recuperación del estrato arbóreo de un ecosistema de alta montaña impactado por el fuego

Con la finalidad de evaluar la recuperación ecológica de un ecosistema forestal de alta montaña, se compararon las estructuras florística y horizontal de la vegetación arbórea de dos zonas aledañas, una impactada por el fuego y otra no impactada. Bajo cada una se establecieron cinco unidades de muestreo en forma de conglomerado, compuestas por cuatro sitios circulares de 400 m2, donde se registraron las especies arbóreas (DAP ≥ 7.5 cm). Se describió la vegetación a nivel de comunidad mediante el índice de valor de importancia (IVI), se hizo una categorización diamétrica, la estimación de la riqueza mediante el índice de Margalef (DMg) y de diversidad de especies con el índice de Shannon (H´). Se realizó un análisis estadístico de comparación de medianas considerando dos variables de la estructura florística y tres de la estructura horizontal (densidad, área de copa y área basal). En ambas condiciones, la especie con mayor representatividad fue Pinus pseudostrobus. Las variables de la estructura florística (índice de Margalef e índice de Shannon) y la densidad no presentaron diferencias estadísticas (p > 0.05), mientras que en la estructura horizontal, los valores de área de copa y área basal fueron estadísticamente diferentes (p < 0.05). Los resultados indican que a 19 años de la ocurrencia del incendio, la vegetación arbórea registra una recuperación parcial

Wildfire severity effect on the asexual regeneration of woody species in a mixed (Pinus-Quercus) ecosystem in the Chipinque Ecological Park, Mexico

In SpanishEduardo Alanís-Rodríguez, Oscar Aguirre-Calderón, Javier Jiménez-Pérez, Marisela Pando-Moreno, Eduardo J. Treviño-Garza, Rafael Aranda-Ramos and Pamela A. Canizales Velázque

Auditoría de estados financieros de Cooperativa IntegralAgrícola Esquipulteca, R.L. por el período terminado el 31 de diciembre de 2018.

El objetivo general es emitir una opinión sobre la razonabilidad de los estados financieros de la Cooperativa Integral Agrícola Esquipulteca Responsabilidad Limitada (CIAESQ, R.L.) de conformidad con las Normas Internacionales de Auditoría, por el período del 1 de enero al 31 de diciembre de 2018, para determinar si la información financiera presentada se encuentra de acuerdo a criterios establecidos por la entidad, normas y procedimientos de control de las operaciones. Para conseguir el objetivo general se plantearon los siguientes objetivos específicos: a) revisar que los registros contables operados por la Cooperativa, se encuentran debidamente respaldados, respecto a la naturaleza de sus operaciones; b) evaluar la eficiencia y eficacia del control interno de la Cooperativa, de modo que asegure la calidad de sus operaciones; c) evaluar el cumplimiento de regulaciones aplicables a la Cooperativa. El procedimiento aplicado para la revisión y análisis de la información se basa en la evaluación de los registros contables e integraciones auxiliares que reflejan los saldos a la fecha sujeta a revisión y, como resultado la opinión del auditor se encuentre debidamente fundamentada con argumentos confiables y razonables. El alcance de la auditoría resalta las cuentas de los estados financieros consideradas en el programa de auditoría, con la finalidad de confirmar la razonabilidad de cada una de las cuentas. Identificando así también la veracidad y significatividad de los saldos reflejados en las cuentas relevantes del balance general y estado de ingresos y egresos. En el desarrollo del trabajo surgieron limitaciones que afectaron el alcance de la auditoría, y a su vez la opinión del auditor, entre ellas: a) los requerimientos y actividades de auditoría no fueron atendidos oportunamente; b) no se tuvo acceso a la documentación que soporte el ingreso por aportaciones ordinarias y extraordinarias, las cuales ascienden a Q.2,390,480, reservas equivalentes a Q.419,080 representando el 99% del patrimonio; c) no se tuvo acceso a la documentación que respalde el pago de sueldos, salarios y prestaciones laborales, que asciende a Q.1,742,578 representando 54% de los egresos; d) no se tuvo acceso a la documentación de respaldo de los préstamos por pagar a largo plazo, que asciende a Q. 9,962,569, representando el 98 % del total del pasivo. Se concluyó que: a) de conformidad con las Normas Internacionales de Auditoría, los estados financieros de la Cooperativa Integral Agrícola Esquipulteca, R. L. y en base a la NIA 705 hemos emitido nuestra opinión sobre los estados financieros auditados. Se emitió dictamen con abstención de opinión, considerando que la evidencia de auditoría no es suficiente para proporcionar una base razonable, para dar una opinión favorable a los estados financieros; b) las operaciones de la Cooperativa Integral Agrícola Esquipulteca, R. L. se registran de acuerdo al manual de contabilidad adoptado y a la naturaleza de sus operaciones, sin embargo, las operaciones no se registran contablemente en el momento en que realizan; c) el control interno de la Cooperativa cuenta con deficiencias, ya que no existen políticas, reglamentos y procedimientos, para el control adecuado de sus operaciones

An Artificial Neural Network Model for the Prediction of Perioperative Blood Transfusion in Adult Spinal Deformity Surgery

Prediction of blood transfusion after adult spinal deformity (ASD) surgery can identify at-risk patients and potentially reduce its utilization and the complications associated with it. The use of artificial neural networks (ANNs) offers the potential for high predictive capability. A total of 1173 patients who underwent surgery for ASD were identified in the 2017–2019 NSQIP databases. The data were split into 70% training and 30% testing cohorts. Eighteen patient and operative variables were used. The outcome variable was receiving RBC transfusion intraoperatively or within 72 h after surgery. The model was assessed by its sensitivity, positive predictive value, F1-score, accuracy (ACC), and area under the curve (AUROC). Average patient age was 56 years and 63% were female. Pelvic fixation was performed in 21.3% of patients and three-column osteotomies in 19.5% of cases. The transfusion rate was 50.0% (586/1173 patients). The best model showed an overall ACC of 81% and 77% on the training and testing data, respectively. On the testing data, the sensitivity was 80%, the positive predictive value 76%, and the F1-score was 78%. The AUROC was 0.84. ANNs may allow the identification of at-risk patients, potentially decrease the risk of transfusion via strategic planning, and improve resource allocation

Identification of Differentially Expressed Genes Associated with Prognosis of B Acute Lymphoblastic Leukemia

Background. Acute lymphoblastic leukemia type B (B-ALL) is a neoplastic disorder with high mortality rates. The aim of this study was to validate the expression profile of 45 genes associated with signaling pathways involved in leukemia and to evaluate their association with the prognosis of B-ALL. Methods. 219 samples of peripheral blood mononuclear cells obtained from 73 B-ALL patients were studied at diagnosis, four, and eight weeks after starting treatment. Gene expression was analyzed by quantitative real-time polymerase chain reaction. Results. Normalized delta Cq values of 23 genes showed differences between B-ALL and controls at diagnosis time (P values < 0.05). There were significant associations between B-ALL patients relapse/death and the expression levels of IL2RA, SORT1, DEFA1, and FLT3 genes at least in one of the times evaluated (P values < 0.05 and odds ratio ranges: 3.73–27). The association between FLT3 deregulation and relapse/death was a constant in the times studied and their overexpression significantly increased the odds of relapse/death in a range of 3.73 and 6.05 among study population (P values < 0.05). Conclusions. Overexpression of FLT3 and DEFA1 genes retained independent prognostic significance for B-ALL outcome, reflected as increased risks of relapse/death among the study population