Communautés locales et gibiers dans la région de Daraina, extrême Nord-Est de Madagascar

Wild meats take part in the daily protein sources for many Malagasy rural communities. Many animal species are affected by hunting, which is practiced during almost all seasons in Madagascar. In the Daraina region, animal groups hunted by local people are mainly mammals, birds, fishes, and reptiles. As the natural habitats within this region are actually highly perturbated by human activities, and as this region shows a high population growth, hunting may constitute a severe threat for many species. Sustainable management of these later depends on local population awareness regarding the threats of intensive hunting on animals as well as on the natural ecosystems

Diversité des caméléons forestiers de la region d’Andasibe (Madagascar) et modèle de distribution de cette communauté selon les différents types physionomiques

Chameleons have undergone a spectacular adaptive radiation in Madagascar. In the eastern humid forest of Madagascar a considerable number of species may occur in sympatry. Distance sampling census techniques with line transects were undertaken within the Andasibe region, central-eastern Madagascar, to evaluate chameleon densities. Eight sites including five within protected areas and three in non-protected areas were sampled. In total, 12 chameleon species were recorded, and their species richness was 6.6 ± 1.92 per site. However, the density of the species represented at each site was not equally distributed as measured by an index of equitability. Nevertheless, within the protected areas the equitability index was notably higher, which suggests a «stable » chameleon community at these sites. The results of a two-way ANOVA of chameleon abundance means indicate that there are significant differences for various forest types. Mean abundances are higher along water courses, which suggests the importance of this habitat in the maintenance of chameleon communities. Populations are mainly composed of adult individuals ; although, juveniles constitute a great proportion of the population for many species. It was not possible to determine the sex of all individuals, and therefore the sex ratio of the community ; however, the observation of some authors who report a female biased sex-ratio for Malagasy chameleon is supported for at least three species.Les caméléons malgaches ont subi une «radiation adaptative» très remarquable. Le plus grand assemblage sympatrique se trouve dans les forêts pluviales de l’est de Madagascar. Un recensement avec des lignes de transect utilisant la méthodologie «distance sampling» a été effectué dans la région d’Andasibe, centre-est de Madagascar. 8 sites ont été échantillonnés (5 inclus dans les aires protégées et 3 non-protégés), permettant de répertorier 12 taxa avec un taux de sympatrie de 6,6 ± 1,92 espèces par site. La distribution de l’équitabilité de l’abondance de chaque espèce dans chaque site s’est avérée très variable. Néanmoins, cette équitabilité était assez forte pour l’ensemble des sites des aires protégées, ce qui pourrait y suggérer une «stabilité» de la communauté de caméléons. Une analyse de variance des moyennes d’abondance des caméléons a montré que celles-ci sont significativement différentes selon les divers types physionomiques de forêts. Cependant ces moyennes d’abondance étaient plus élevées pour les échantillonnages effectués au voisinage des cours d’eau, ce qui suggère l’importance de ces types de forêt dans le maintien de la communauté de caméléons. Les populations étaient essentiellement composées d’individus adultes bien que, pour la plupart des espèces répertoriées, les jeunes animaux représentaient une proportion non négligeable. Il ne fut pas possible de déterminer le sexe de tous les individus rencontrés, et par conséquent le sex-ratio pour l’ensemble de la communauté. Toutefois, le fait que certains auteurs rapportent que les caméléons malgaches auraient des sex-ratios en faveur des femelles est au moins partiellement corroboré par nos observations sur trois espèces.Rakotondravony Hery A. Diversité des caméléons forestiers de la region d’Andasibe (Madagascar) et modèle de distribution de cette communauté selon les différents types physionomiques. In: Revue d'Écologie (La Terre et La Vie), tome 59, n°4, 2004. pp. 529-544

Conséquences de la variation des superficies forestières sur les communautés de reptiles et d’amphibiens dans la région Loky-Manambato, extrême nord-est de Madagascar

The effects of forest-size variation on reptile and amphibian communities in the Loky-Manambato region, extreme northeastern Madagascar. — Field studies were undertaken on reptile and amphibian communities within 11 forest blocks (size > 1000 ha) and fragments (size < 1000 ha) from October 2002 to March 2003 and from October 2003 to March 2004 in the Loky-Manambato region, extreme northeastern Madagascar. Previous studies with different vertebrate groups on the island have found a close positive relationship between forest size and species richness. However, in the Loky-Manambato region, it appears that forest size plays a “secondary role” in terms of explaining species richness ; the most important factor seems to be habitat heterogeneity associated with elevational variation. In this region, the amphibian and reptile communities form nested subsets, with species assemblages from homogenous habitat forest blocks comprising subsets of forest sites with more heterogeneous habitats. These analyses indicate that 15 amphibian species and 13 reptiles are vulnerable to extinction or local extirpation following the destruction of their natural habitats ; these species were mainly recorded within the three largest and most diversifi ed forest habitats of the Loky-Manambato region. This research provides further evidence of the importance of larger forest blocks with heterogeneous habitat structure for the conservation of terrestrial vertebrates in Madagascar. Nonetheless, a few species were only recorded in the smaller forest fragments, which also supports the importance of these latter in conservation programs ; the fact that these populations seem to be more and more isolated shows the urgency of a conservation policy that considers these threats.Le présent travail rend compte des études conduites entre octobre 2002 et mars 2003 et entre octobre 2003 et mars 2004 sur les effets de la taille des massifs forestiers isolés sur les communautés de reptiles et d’amphibiens dans onze massifs forestiers en région Loky-Manambato. Il en ressort l’importance des grands blocs forestiers pour la conservation de la diversité biologique car ils abritent généralement beaucoup plus d’espèces d’amphibiens et de reptiles, fait déjà constaté dans d’autres sites pour d’autres groupes d’organismes à Madagascar. Toutefois, il apparaît dans la région Loky-Manambato que les superficies des massifs forestiers ne joueraient que des rôles «secondaires» sur la diversité des reptiles et des amphibiens ; le facteur le plus prépondérant semble être l’hétérogénéité engendrée par la variation altitudinale des habitats naturels. Les analyses en termes d’assemblages spécifiques des communautés d’amphibiens et de reptiles mettent en évidence que la faune herpétologique de la région Loky-Manambato représente des structures en séries emboîtées, où les communautés des massifs forestiers ayant des habitats naturels plus homogènes constituent des sous-groupes (ou des «subsets») de celles des massifs plus hétérogènes. Ces analyses soulignent également la présence de 15 espèces d’amphibiens et 13 de reptiles menacées d’extinction locale par la destruction des habitats forestiers naturels dans la région, la majeure partie d’entre-elles étant localisée dans les trois grands blocs forestiers les plus diversifiés. Ces faits appuient l’importance pour la conservation des Vertébrés terrestres malgaches des grands massifs forestiers possédant des habitats naturels plus hétérogènes. Néanmoins la présence de quelques espèces uniquement répertoriées dans les massifs forestiers de moindre superficie où les habitats naturels sont plus homogènes semblent témoigner d’une certaine importance de ces derniers pour la conservation de la diversité biologique ; et le fait que ces populations semblent s’isoler davantage est en faveur de la prise d’une mesure de conservation qui tienne compte de ces menaces.Rakotondravony Hery A. Conséquences de la variation des superficies forestières sur les communautés de reptiles et d’amphibiens dans la région Loky-Manambato, extrême nord-est de Madagascar. In: Revue d'Écologie (La Terre et La Vie), tome 62, n°2-3, 2007. pp. 209-227

Étude de la distribution des communautés d’amphibiens et de reptiles à partir d’inventaires et analyses biogéographiques dans la région de Daraina

This study deals with the main factors affecting the distribution of reptiles and amphibians communities in the northern part of Madagascar. It is essentially based on fieldwork conducted in the vicinity of Daraina (October 2002-March 2003; October 2003- March 2004), and some undertaken in the region of Analamerana (January 2004), Andavakoera (February 2004), Ankarana (April 2002) and Marojejy (October 2001). These field studies, combined with lab work in museums, were completed with a literature review related to the geological, geographical and biotic features of these regions.The main result of this work is the important role that the Daraina forest blocks as well as those of other sites in this part of the island play in maintaining terrestrial vertebrate diversity, despite their relatively small size. Secondly, this investigation determines clearly the effects of three major factors on reptiles and amphibians distribution (altitudinal gradient, variation in the natural habitat diversity, and bioclimatic regime); this latter varying significantly across the altitudinal gradient, particularly in the Daraina region. The amphibian and reptile species richness distribution pattern follows a hump-shaped distribution; and a successional pattern of species assemblages is observed every 300 m of elevation across the altitudinal gradient. Within the Daraina region, it seems that forest size plays only a “secondary role” in terms of species richness; the most important factor seems to be that of habitat heterogeneity caused by altitudinal variation.This investigation shows the existence of at least three major bioclimatic subdivisions in Northern Madagascar; each subdivision seems to constitute a particular area of endemism, which demonstrates the important role of bioclimatic factors on biological diversity. This dissertation provides also evidence of montane vicariance caused by climatic shifts since the latest glacial periods of Pleistocene.Cette étude concerne la distribution des communautés de reptiles et d’amphibiens dans une région du Nord de Madagascar. Elle est basée sur des travaux d’inventaire de reptiles et d’amphibiens dans quelques massifs forestiers de la région septentrionale de l’île, essentiellement dans la région de Daraina (octobre 2002-mars 2003 ; octobre 2003-mars 2004). Ces inventaires ont été complétés par ceux entrepris dans la région d’Analamerana (janvier 2004), d’Andavakoera (février 2004), d’Ankarana (avril 2002) et de Marojejy (octobre 2001). Les travaux de terrains, et les travaux muséologiques qui s’en suivaient, ont été combinés à des études bibliographiques qui couvraient les caractéristiques géologiques, géographiques et biotiques des régions concernées.À son issu, ce travail a, en premier lieu, mis en évidence l’importance des massifs forestiers en mosaïques de Daraina et de l’ensemble de la région septentrionale de Madagascar dans le maintien de ses diversités en vertébrés terrestres malgré leurs superficies relativement modestes à l’échelle de ce pays. Par la suite, il a permis d’évaluer les effets de quelques facteurs majeurs sur la distribution des reptiles et des amphibiens (gradient altitudinal, variation de la diversité des habitats naturels et caractéristiques bioclimatiques généraux) ; les bioclimats variant considérablement le long du gradient altitudinal particulièrement dans la région de Daraina. Dans la région d’étude, les distributions altitudinales des richesses spécifiques suivent le modèle de distribution à bosse pour les deux communautés et où l’existence d’une série d’espèces d’amphibiens et de reptiles qui se succèdent d’une manière transitoire à 300 m d’altitude d’intervalles a pu être démontrée.Par ailleurs, il apparaît que les superficies des massifs forestiers ne joueraient que des rôles « secondaires » sur la diversité des reptiles et des amphibiens ; le facteur le plus prépondérant semble être l’hétérogénéité engendrée par la variation altitudinale des habitats naturels. À partir de l’investigation ici rapportée, l’existence d’au moins trois principales subdivisions bioclimatiques dans le Nord de Madagascar a pu également être démontrée; chaque subdivision semble constituer une aire d’endémisme particulière, témoignant des effets considérables que détiennent les facteurs bioclimatiques sur la biodiversité. Ce travail a permis également de mettre en évidence l’importance des phénomènes de vicariance engendrée par le réchauffement climatique qui s’était produit après les dernières phases de glaciations du Pléistocène

Aspects de la Conservation des Reptiles et des Amphibiens dans la Région de Daraina

This paper deals with conservation aspects of amphibians and reptiles in the Daraina region, north eastern part of Madagascar, where herpetological surveys undertaken between October 2002 and March 2003 and between October 2003 and March 2004 lead to the discovery of 36 amphibians and 74 reptiles. Thirteen taxa among them are currently known only within the Daraina forest areas, and 20 are listed in the CITES (Convention on International Trade in Endangered Species of Wild Fauna and Flora) Appendices II and I. These high herpetofaunal species diversity and endemism demonstrate the value of this site in terms of terrestrial vertebrate conservation in Madagascar, and the need of an urgent conservation strategy to protect these natural resources

BEAST infile for Oplurus cuvieri, constant pop size

XML formated infile for estimation of Oplurus cuvieri gene tree and divergence times in BEAST 1.6.2. Includes sequence data for ND1 and ND1 flanking regions and assumes constant population size model

BEAST infile for Oplurus cyclurus, exponential growth

XML formated infile for estimation of Oplurus cyclurus gene tree and divergence times in BEAST 1.6.2. Includes sequence data for ND1 and ND1 flanking regions and assumes exponential growth model

BEAST infile for Oplurus cuvieri, exponential growth

XML formated infile for estimation of Oplurus cuvieri gene tree and divergence times in BEAST 1.6.2. Includes sequence data for ND1 and ND1 flanking regions and assumes exponential growth model

Data from: Defining spatial and temporal patterns of phylogeographic structure in Madagascar's iguanid lizards (Genus Oplurus)

Understanding the remarkably high species diversity and levels of endemism found among Madagascar’s flora and fauna has been the focus of many studies. One hypothesis that has received much attention proposes that Pleistocene climate fluctuations spurred diversification. However, while spatial patterns of distribution and phylogenetic relationships can provide support for biogeographic predictions, temporal estimates of divergence are required to determine the fit of these geospatial patterns to climatic or biogeographic mechanisms. We use multilocus DNA sequence data to test whether divergence times among Malagasy iguanid lizards of the subfamily Oplurinae are compatible with a hypotheses of Quaternary diversification. We estimate the oplurine species tree and associated divergence times under a relaxed clock model. In addition, we examine the phylogeographic structure and population divergence times within two sister-species of Oplurus primarily distributed in the northwest and southwest of Madagascar (O. cuvieri and O. cyclurus, respectively). We find that divergence events among oplurine lineages occurred in the Oligocene and Miocene and are thus far older and incompatible with the hypothesis that recent climate fluctuations are related to current species diversity. However, the timing of intraspecific divergences and spatial patterns of population genetic structure within O. cuvieri and O. cyclurus suggest a role for both intrinsic barriers and recent climate fluctuations at population-level divergences. Integrating information across spatial and temporal scales allows us to identify and better understand the mechanisms generating patterns diversity

BEAST infile for Oplurus cuvieri, Watershed Model Zone 8

XML formated infile for extended Bayesian skyline plot analysis of Oplurus cuvieri from watershed model (Wilme et al. 2006) Zone 8 in BEAST 1.6.2. Includes sequence data for ND1, ND1 flanking regions, PRLR, and UBN1