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Self-assembly of Fmoc-tetrapeptides based on the RGDS cell adhesion motif
Self-assembly in aqueous solution has been investigated for two Fmoc [Fmoc ¼ N-(fluorenyl)-9-methoxycarbonyl] tetrapeptides comprising the RGDS cell adhesion motif from fibronectin or the scrambled sequence GRDS. The hydrophobic Fmoc unit confers amphiphilicity on the molecules, and
introduces aromatic stacking interactions. Circular dichroism and FTIR spectroscopy show that the self-assembly of both peptides at low concentration is dominated by interactions among Fmoc units, although Fmoc-GRDS shows b-sheet features, at lower concentration than Fmoc-RGDS. Fibre X-ray diffraction indicates b-sheet formation by both peptides at sufficiently high concentration. Strong
alignment effects are revealed by linear dichroism experiments for Fmoc-GRDS. Cryo-TEM and smallangle
X-ray scattering (SAXS) reveal that both samples form fibrils with a diameter of approximately 10 nm. Both Fmoc-tetrapeptides form self-supporting hydrogels at sufficiently high concentration. Dynamic shear rheometry enabled measurements of the moduli for the Fmoc-GRDS hydrogel, however syneresis was observed for the Fmoc-RGDS hydrogel which was significantly less stable to shear. Molecular dynamics computer simulations were carried out considering parallel and antiparallel b-sheet configurations of systems containing 7 and 21 molecules of Fmoc-RGDS or Fmoc-GRDS, the results being analyzed in terms of both intermolecular structural parameters and energy contributions
Ultrasensitive quantitation of human papillomavirus type 16 E6 oncogene sequences by nested real time PCR
Patología neurológica en una unidad de cuidados intensivos pediátricos de tercer nivel. Evolución funcional. Nuestra experiencia
Introducción
La enfermedad neurológica representa una parte importante en las unidades de cuidados intensivos pediátricos (UCIP) y es causa de morbimortalidad. El objetivo de este trabajo es analizar la evolución funcional del niño crítico con enfermedad neurológica.
Material y método
Estudio retrospectivo descriptivo, de niños con enfermedad neurológica ingresados en una UCIP durante 3 años (2012-2014), valorando pronóstico vital y funcional, al alta y al año del ingreso, según las Categorías de estado general y cerebral pediátrico (CEGP-CECP) y la Escala de estado funcional (FSS). Los resultados se comparan con nuestros datos previos (años 1990-1999) y con los del estudio multicéntrico internacional PANGEA.
Resultados
Se estudió a 266 niños. La mortalidad fue del 3%, sin que los modelos PRISM-II y PIM2 muestren capacidad predictiva. La salud funcional refleja empeoramiento clínicamente significativo al alta de UCIP, en el 30% según CEGP, en el 15% según CECP y en el 5% según FSS. Transcurrido un año, la funcionalidad mejora según CEGP-CECP, pero no según FSS. Los niños sin enfermedad neurológica de base presentan afectación funcional en mayor porcentaje, que se mantiene en el tiempo. Comparada con nuestros datos previos, la mortalidad global y neurocrítica disminuye (5, 60 vs. 2, 1%; p = 0, 0003 y 8, 44 vs. 2, 63%; p = 0, 0014, respectivamente). En relación con el estudio multicéntrico PANGEA, tanto la mortalidad como el empeoramiento funcional cerebral del niño neurocrítico son menores en el estudio actual (1, 05 vs. 13, 32%; p < 0, 0001 y 10, 47 vs. 23, 79%; p < 0, 0001, respectivamente).
Conclusiones
Alrededor de un tercio de los niños críticos muestran enfermedad neurológica. Un porcentaje importante, sobre todo de niños sin enfermedad neurológica basal, presenta repercusión funcional clínicamente significativa al alta de UCIP y transcurrido un año. La repercusión en el pronóstico funcional del niño crítico apoya la importancia de la neuromonitorización y neuroprotección, medidas necesarias para mejorar la asistencia del niño crítico y la valoración evolutiva de la salud funcional
The Absence of Caspase-8 in the Dopaminergic System Leads to Mild Autism-like Behavior
In the last decade, new non-apoptotic roles have been ascribed to apoptotic caspases. This family of proteins plays an important role in the sculpting of the brain in the early stages of development by eliminating excessive and nonfunctional synapses and extra cells. Consequently, impairments in this process can underlie many neurological and mental illnesses. This view is particularly relevant to dopamine because it plays a pleiotropic role in motor control, motivation, and reward processing. In this study, we analyze the effects of the elimination of caspase-8 (CASP8) on the development of catecholaminergic neurons using neurochemical, ultrastructural, and behavioral tests. To do this, we selectively delete the CASP8 gene in cells that express tyrosine hydroxylase with the help of recombination through the Cre-loxP system. Our results show that the number of dopaminergic neurons increases in the substantia nigra. In the striatum, the basal extracellular level of dopamine and potassium-evoked dopamine release decreased significantly in mice lacking CASP8, clearly showing the low dopamine functioning in tissues innervated by this neurotransmitter. This view is supported by electron microscopy analysis of striatal synapses. Interestingly, behavioral analysis demonstrates that mice lacking CASP8 show changes reminiscent of autism spectrum disorders (ASD). Our research reactivates the possible role of dopamine transmission in the pathogenesis of ASD and provides a mild model of autism.Ministerio de Economía y Competitividad RTI2018-098645-B-I00, PID2019-109569GB-I00, RTI2018-099778-B-I00Junta de Andalucía P18-RT-1372, US-1264806, PI-0080-2017, PI-0009-2017, PI-0134-2018, PEMP-0008-2020, P20_00958, CTS-510Instituto de Salud Carlos III PI18/01691Instituto de Investigación e Innovación en Ciencias Biomédicas de Cádiz-INiBICA LI19/06IN-CO22, IN-C09European Union 95568
The Absence of Caspase-8 in the Dopaminergic System Leads to Mild Autism-like Behavior
In the last decade, new non-apoptotic roles have been ascribed to apoptotic caspases. This family of proteins plays an important role in the sculpting of the brain in the early stages of development by eliminating excessive and nonfunctional synapses and extra cells. Consequently, impairments in this process can underlie many neurological and mental illnesses. This view is particularly relevant to dopamine because it plays a pleiotropic role in motor control, motivation, and reward processing. In this study, we analyze the effects of the elimination of caspase-8 (CASP8) on the development of catecholaminergic neurons using neurochemical, ultrastructural, and behavioral tests. To do this, we selectively delete the CASP8 gene in cells that express tyrosine hydroxylase with the help of recombination through the Cre-loxP system. Our results show that the number of dopaminergic neurons increases in the substantia nigra. In the striatum, the basal extracellular level of dopamine and potassium-evoked dopamine release decreased significantly in mice lacking CASP8, clearly showing the low dopamine functioning in tissues innervated by this neurotransmitter. This view is supported by electron microscopy analysis of striatal synapses. Interestingly, behavioral analysis demonstrates that mice lacking CASP8 show changes reminiscent of autism spectrum disorders (ASD). Our research reactivates the possible role of dopamine transmission in the pathogenesis of ASD and provides a mild model of autism
Valoración funcional tras tratamiento neurointensivo pediátrico. Nueva escala de estado funcional (FSS)
Introducción: La salud funcional, parámetro adecuado de morbilidad, debería constituir un estándar pronóstico de las unidades de cuidados intensivos pediátricos (UCIP), siendo fundamental el desarrollo de escalas para su valoración. Las categorías de estado global y cerebral pediátrico (CEGP-CECP) se han empleado clásicamente en estudios pediátricos; el desarrollo de la nueva Escala de estado funcional (FSS) busca mejorar la objetividad. El objetivo del trabajo es comprobar si la escala FSS es un instrumento válido frente a la clásica CEGP-CECP, y si, incluso, posee mejores cualidades evaluadoras de la funcionalidad neurológica.
Pacientes y método: Estudio retrospectivo descriptivo de los 266 niños con enfermedad neurológica ingresados en la UCIP durante 3 años (2012-2014). Se valora su salud funcional al alta y tras un año del ingreso en UCIP, según las categorías CEGP-CECP y la nueva FSS, comparando ambas escalas mediante análisis de correlación (Rho de Spearman).
Resultados: La comparación de varianzas de FSSglobal en cada intervalo de CEGP muestra buena correlación para todas las comparaciones (p < 0, 001), excepto en la categoría «5 = coma-vegetativo». La dispersión de FSSglobal aumenta a medida que lo hace la categoría CEGP. La correlación es similar en la versión neurológica de ambas escalas.
Discusión: La nueva escala FSS parece ser un método útil para evaluar salud funcional en nuestro medio, tras su comparación con las clásicas categorías CEGP-CECP. La dispersión de los valores de la escala FSS indica falta de precisión del sistema CEGP-CECP, comparado con la nueva escala FSS, más desglosada y objetiva
Association mapping for maize stover yield and saccharification efficiency using a multiparent advanced generation intercross (MAGIC) population
Cellulosic ethanol derived from fast growing C4 grasses could become an alternative to finite fossil fuels. With the potential to generate a major source of lignocellulosic biomass, maize has gained importance as an outstanding model plant for studying the complex cell wall network and also to optimize crop breeding strategies in bioenergy grasses. A genome-wide association study (GWAS) was conducted using a subset of 408 Recombinant Inbred Lines (RILs) from a Multi-Parent Advanced Generation Intercross (MAGIC) Population in order to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with yield and saccharification efficiency of maize stover. We identified 13 SNPs significantly associated with increased stover yield that corresponded to 13 QTL, and 2 SNPs significantly associated with improved saccharification efficiency, that could be clustered into 2 QTL. We have pointed out the most interesting SNPs to be implemented in breeding programs based on results from analyses of averaged and yearly data. Association mapping in this MAGIC population highlight genomic regions directly linked to traits that influence the final use of maize. Markers linked to these QTL could be used in genomic or marker-assisted selection programs to improve biomass quality for ethanol production. This study opens a possible optimisation path for improving the viability of second-generation biofuelsPlan Estatal de Ciencia y Tecnología de España | Ref. RTI2018–096776-B-C21Plan Estatal de Ciencia y Tecnología de España | Ref. RTI2018–096776-B-C2
HPV genotype distribution and anomalous association of HPV33 to cervical neoplastic lesions in San Luis Potosí, Mexico
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Rarity of monodominance in hyperdiverse Amazonian forests.
Tropical forests are known for their high diversity. Yet, forest patches do occur in the tropics where a single tree species is dominant. Such "monodominant" forests are known from all of the main tropical regions. For Amazonia, we sampled the occurrence of monodominance in a massive, basin-wide database of forest-inventory plots from the Amazon Tree Diversity Network (ATDN). Utilizing a simple defining metric of at least half of the trees ≥ 10 cm diameter belonging to one species, we found only a few occurrences of monodominance in Amazonia, and the phenomenon was not significantly linked to previously hypothesized life history traits such wood density, seed mass, ectomycorrhizal associations, or Rhizobium nodulation. In our analysis, coppicing (the formation of sprouts at the base of the tree or on roots) was the only trait significantly linked to monodominance. While at specific locales coppicing or ectomycorrhizal associations may confer a considerable advantage to a tree species and lead to its monodominance, very few species have these traits. Mining of the ATDN dataset suggests that monodominance is quite rare in Amazonia, and may be linked primarily to edaphic factors
Research in the Bioarchaeology Laboratory in the International Institute for Prehistoric Research (IIIPC) - University of Cantabria
RESUMEN: Cantabria se caracteriza por ser una región especialmente rica en yacimientos de época prehistórica. En ellos, se han podido recuperar múltiples evidencias que, con la aplicación de las técnicas metodológicas adecuadas, permiten reconstruir los modos de vida de los grupos humanos del pasado, la explotación que realizaban del medio, su tipo de dieta, su movilidad, así como el tipo de clima y medioambiente en que habitaron, entre otros aspectos. Una de las líneas de investigación más novedosas desarrollada en la región es la Bioarqueología, entendida como el estudio y análisis de restos biológicos procedentes de yacimientos arqueológicos. En este artículo se muestran las diferentes colecciones de referencia de materiales bioarqueológicos que alberga el Laboratorio de Bioarqueología del Instituto Internacional de Investigaciones Prehistóricas de Cantabria (Universidad de Cantabria), así como las investigaciones desarrolladas en dicha institución sobre esta temática en los últimos años.ABSTRACT: Cantabria is a region characterised as especially rich in prehistoric archaeological sites. These sites can be investigated using stateof- the art methodologies, making it possible to reconstruct the way of life of humans in the past, answering questions about diet and mobility, and what the climate and environment was like, amongst other things. One of these newly-developed lines of research in the region is bioarchaeology, which is the study and analysis of biological remains recovered from archaeological sites. This article introduces the different bioarchaeological reference collection materials housed in the Bioarchaeology Laboratory at the International Institute of Prehistoric Research in Cantabria (University of Cantabria), as well as the bioarchaeological research that has been carried out within the institution in the last few years.La investigación llevada a cabo por el grupo de investigadores del Laboratorio de Bioarqueología ha sido posible gracias a diversas fuentes de financiación españolas y europeas. En primer lugar, a título personal señalar las siguientes ayudas: Programa Ramon y Cajal a ABMA (RYC-2011-00695), Programa Juan de la Cierva a IGZ (JCI-2012-12094) y DCS (IJCI- 2014-20590), Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowship a JJ (H2020-MSCA-IF-2014-Ref. 656122), Becas Predoctorales FPI a JMG (BES-2013-063309) y RSR (BES-2014-070075), AH (BES-2015-075176), Predoctorales UC a ILD y AGE y Técnicos de Apoyo I+D a LAP (PTA2013-8401-I). En segundo lugar, parte de estas investigaciones forma o ha formado parte de los siguientes proyectos de investigación financiados por la Comisión Europea (FP7-PEOPLE- 2012-CIG (322112), la British Academy y The Royal Society (Newton International Fellowship NF100413), y el Ministerio de Economía y Competitividad de España (HAR2008-06477-C03-00/HIST; HAR2010- 22115-C02-01; HAR2011-29907-C03-00; HAR2012- 33956; HAR2013-46802-P; HAR2014-51830-P). Por último, queremos agradecer el acceso a los fondos de museos como los depositados en el Museo de Prehistoria y Arqueología de Cantabria (MUPAC), el Museo de Altamira, Centro de Patrimonio Cultural Mueble de Gipuzkoa (Gordailua), Museo Arqueológico de Asturias, Grupo de Ingeniería Fotónica de la Universidad de Cantabria, Laboratorio de la División de Ciencia e Ingeniería de los Materiales de la Universidad de Cantabria (LADICIM) e Instituto de Biomedicina y Biotecnología de Cantabria
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