Мікробіологічна оцінка ефективності сучасних антисептиків, антимікробних матеріалів

Effectiveness of antiseptics decasan®(DC), chlorhexidine digluconate (CH), miramistin (MR), antimicrobial composition of decamethoxin (AMC, patent N 74853, Ukraine), antimicrobial dressings against isolated strains of S. aureus (n 32), E. coli (n 25), P. aeruginosa (n 20), C. albicans (n 16) in patients with diabetes having pyo-inflammatory complications has been researched. The antimicrobial properties of antiseptics have been studied by means of the serial dilutions method. The antimicrobial activity of dressings (1.0x1.0 cm), such as medical cotton impregnated with AMC; antiseptic overlay with CH (AOCH); Traumastem Biodress Disinfect®(TBD); activtex CH®, activtex CHF®, against clinical isolates of microorganisms has been studied on solid media. The bactericidal action against S. aureus in the presence of AMC (1.4±0.2 mkg/ml), DC (1.73±0.2 mkg/ml); CH (12.8±2.1 mkg/ml); MR (8.3±0.9 mkg/ml) has been found. The bactericidal properties of DC and MR in relation to E. coli in their concentrations of 6.68±0.71 and 17.9±1.9 mkg/ml, respectively, have been determined. AMC (4.9±0.5 mkg/ml) was six times more active than CH (p<0.001). The antipseudomonal action of DC against P. aeruginosa was 1.5 times higher than CH. AMC had also 2.8 times higher activity (p<0.001). The bactericidal action of MR was registered in the presence of 72.9±2.2 mkg/ml. It has been found that C. albicans is sensitive to AMC (7.4±1.9 mkg/ml), DC (14.6±1.9 mkg/ml), MR (26.0±3.6 mkg/ml). CH has a low effectiveness in relation to C. albicans (32.8±7.4 mkg/ml). Advantages of the antimicrobial activity of modern antimicrobial dressings with AMC against S. aureus, E. coli, P. aeruginosa, fungi of Candida genus have been found.Исследовали эффективность антисептиков декасана (ДС), хлоргексидина биглюконата (ХГ), мирамистина (МР), антимикробной композиции декаметоксина (АМК, пат. №74853, Украина), противомикробных перевязочных материалов в отношении выделенных штаммов микроорганизмов S. aureus (n 32), E. coli (n 25), P. аureginosa (n 20), C. albicans (n 16) от больных сахарным диабетом с гнойно-воспалительными осложнениями. Противомикробные свойства антисептиков изучали методом серийных двукратных разведений. Противомикробную активность образцов (1,0x1,0 см) медицинской хлопчатобумажной ткани, импрегнированной АМК; официнальных перевязочных материалов: салфеток антисептических с хлоргексидином (САХ); Traumastem Biodress Disinfect® (TBD); активтекс® Х; активтекс®ХФ на клинические изоляты микроорганизмов изучали на плотных питательных средах. Установлено бактерицидное действие на S. aureus в присутствии АМК (1,4±0,2 мкг/мл); ДС (1,73±0,2 мкг/мл); ХГ (12,8±2,1 мкг/мл); МР (8,3±0,9 мкг/мл). Бактерицидные свойства ДС и МР в отношении E. соli определяли в присутствии 6,68±0,71 мкг/мл и 17,9±1,9 мкг/мл соответственно. АМК (4,9±0,5 мкг/мл) действовала в 6 раз активнее на E. соli по сравнению с ХГ (р<0,001). Антипсевдомонадное действие ДС было в 1,5 раза выше (79,2±7,4 мкг/мл), а у АМК в 2,8 раза выше, чем у ХГ (р<0,001). Бактерицидное действие МР в отношении P. aeruginosa установили в количестве 72,9±2,2 мкг/мл. Установлена чувствительность C. albicans к АМК (7,4±1,9 мкг/мл), ДС (14,6±1,9мкг/мл), мирамистина (26,0±3,6 мкг/мл). ХГ выявил низкую эффективность в отношении C. albicans (32,8±7,4 мкг/мл). Определены преимущества противомикробного действия современных антимикробных перевязочных материалов с АМК в отношении S. aureus, E. coli, P. aeruginosa, C. albicans (р<0,05).Досліджена ефективність антисептиків декасану (ДС), хлорогексидину біглюконату (ХГ), мірамістину (МР), антимікробної композиції декаметоксину (АМК, пат. №74853, Україна), антимікробних перев’язувальних матеріалів щодо виділених штамів мікроорганізмів S. aureus (n 32), E. coli (n 25), P. аureginosa (n 20), C. albicans (n 16) від хворих на цукровий діабет з гнійно-запальними ускладненнями. Антимікробні властивості антисептиків вивчали методом серійних двократних розведень. Антимікробну активність зразків (1,0x1,0 см) медичної бавовни, імпрегнованої АМК; офіцинальних перев’язувальних матеріалів: серветок антисептичних з хлорогексидином (САХ); Traumastem Biodress Disinfect®(TBD); активтекс®Х; активтекс®ХФ на клінічні ізоляти мікроорганізмів вивчали на щільних поживних середовищах. Встановлено бактерицидну дію на S. aureus в присутності АМК (1,4±0,2 мкг/мл); ДС (1,73±0,2 мкг/мл); ХГ (12,8±2,1 мкг/мл); МР (8,3±0,9 мкг/мл). Бактерицидні властиво- сті ДС і МР щодо E. соli визначали в присутності 6,68±0,71 та 17,9±1,9 мкг/мл відповідно. АМК (4,9±0,5 мкг/мл) була в 6 разів активнішою щодо E. соli порівняно з ХГ (р<0,001). Антипсевдомонадна дія ДС була в 1,5 рази вищою (79,2±7,4 мкг/мл), а АМК у 2,8 рази вищою, ніж у ХГ (р<0,001). Бактерицидну дію МР щодо P. aeruginosa встановили в присутності 72,9±2,2 мкг/мл. Встановлено чутливість C. albicans до АМК (7,4±1,9 мкг/мл), декасану (14,6±1,9мкг/мл), мірамістину (26,0±3,6 мкг/мл). ХГ виявив низьку ефективність щодо C. albicans (32,8±7,4 мкг/мл). Визначені переваги антимікробної дії сучасних антимікробних перев’язувальних матеріалів з АМК щодо S. aureus, E. coli, P. aeruginosa, C. albicans (р<0,05)

Endoparasites of rabbits (Oryctolagus cuniculus domesticus) in Southern Ukraine

One of the main tasks of ecological parasitology at the present stage is to establish patterns of spread of invasive diseases of animals in the environment through a thorough epidemiological examination, as well as to determine the main directions and factors of spread of parasites in Ukraine. Among the many pathogens, endoparasites play a major role in a number of diseases in rabbits with increased morbidity and mortality. In the body of both wild and domestic rabbits several species of parasites that form a parasitocenosis can be localized. The latter have a pathogenic effect on organs and tissues, leading to reduced weight gain, premature slaughter and even mortality. The prevalence of endoparasitoses was studied in weaned rabbits 60 days of age, 120 days of age at fattening, 180 days of age – mating age and adults of 320 days of age to determine the extensiveness and intensity of the dominant invasion. A total of 720 head was studied, 180 animals from each age group. Three species of nematodes were recorded in the rabbits: Trichostrongylus retortaeformis (Zeder, 1800), Nematodirus leporis (Ransom, 1907) and Passalurus ambiguus (Rudolphi, 1819); the cestode Taenia pisiformis (Bloch, 1780); three species of Emeria: Eimeria stiedae (Lindermann, 1865), which parasitizes in the bile ducts of the liver and gallbladder, E. magna (Perard, 1925) and E. media (Kessel, 1929) – in the epithelial cells of the intestine. The prevalence of the infestation depends on the age of the animals. According to the data obtained, eimeriosis was one of the main parasitic diseases of the rabbits. Dominant invasions of Eimeria in the intestines of 60-day-old rabbits were found in the studied animals, their extensiveness reached 19.4%, while the spread of hepatic Eimeria was registered in 13.3% of the examined rabbits. The total infestation of weaned rabbits with helminths was 22.2%, in rabbits for fattening – 26.7%, and in rabbits of mating age and adults – 20.0% and 20.6%, respectively. Global climate change will change the distribution and dynamics of soil-borne helminthiases, but host immunity may also affect host-parasite interactions. Subsequent studies will be aimed at elucidating the effect of mono and mixed invasions on the body of rabbits. Updated data on helminthiasis will expand the screening strategy to maintain rabbit health and reduce economic losses

RESEARCH IN SENSITIVITY TO ANTIBIOTICS, ANTISEPTICS IN PSEUDOMONAS AERUGINOSA STRAINS ISOLATED FROM PATIENTS WITH INFECTIOUS COMPLICATIONS

Background. Infections caused by Pseudomonas are one of the topical issues of medicine.Objective. The aim of the research was to study sensityvity to antibiotics, antiseptics of P. aeruginosa clinical strains that cause infectious complications in patients with burns.Methods. Microbiological study of biological material, received from 435 patients with burns of the 3rd-4th stages (2011-2015 years). In early terms of burn disease 127 clinical strains of P. aeruginosa were isolated from patients. Standard methods were used to identify clinical isolates of P. aeruginosa by their morphological, tinctirial, culture and biochemical properties. The research of antimicrobial action of antiseptics, antibiotics against Pseudomonas were carried out by means of standard methods according to the Directive of the Ministry of Health of Ukraine (No. 167 from 05.04.2007 р.) and guidelines of National Committee of Clinical and Laboratory Study (NCCLS, 2002).Results. It was established that P. aeruginosa caused infectious complications in 23.9% of patients among other pathogens. Clinical isolates of P. aeruginosa were found to be low sensitive to amoxicillin/clavulanate (30.76%), ceftazidime (25.92%), cefoperazonum/sulbactam (46.15%), aztreonam (51.85%), tobramycin (38.46%), amicacin (70.34%), doxiciclini (26.92%), fluoroquinolones (59.26%). The analitical progistic criteria of decrease of sensitivity to ceftazidime, cefepim, meropenem and gatifloxacin were found in P. aeruginosa. This pathogen was determined to be sensitive to decasan ®, antimicrobial composition of decamethoxine ®, iodine pvidone.Conclusions. Clinical strains of Pseudomonas aeruginosa, being highly resistant to antibiotics, are also very sensitive to antiseptics decasan ®, antimicrobial of decamethoxine®, povidone iodine

Антимікробні властивості генериків декаметоксину®

In the article presents the results of the research of antimicrobial qualities of domestic generic of decamethoxin (DCM) against museum (S. aureus ATCC 25923 E. coli M-17, E. coli ATCC 25922, P. aeruginosa ATCC 27853, E. faecalis ATCC 29212, B. subtilis ATCC 6632) and clinical strains of opportunistic microorganisms (S. aureus, S. epidermidis, E. coli, P. aeruginosa, C. albicans). The study of antimicrobial qualities were studied in two generics in comparison with patented original decamethoxin. Museum and clinical strains obtained typical biological qualities. The substances of DCM were found to have microbicidal activity according Staphylocci, Enterococci, Escherichia coli and Candidaalbicans, with moderate preference of patented substance of decamethoxin. Antiseptic remedies such as auridecsan, horosten, decasan, septefril, containing generic substance of decamethoxin® (1*), also had high cidal qualities against antibioticresistance clinical strains of Staphylococci.В статье приведены результаты исследования антимикробных свойств отечественного генерического лекарственного антисептического препарата “Декаметоксина” (ДКМ) в отношении музейных (S. aureus ATCC 25923 E. coli M-17, E. coli ATCC 25922, P. aeruginosa ATCC 27853, E. faecalis ATCC 29212, B. subtilis ATCC 6632) и клинических штаммов условно-патогенных микроорганизмов (S. aureus, S. epidermidis, E. coli, P. aeruginosa, C. albicans). Противомикробныt свойствf изучали на двух генериках в сравнении с патентированным оригинальным препаратом “Декаметоксина®”. Музейные и клинические штаммы владели типичными биологическими свойствами. Установлено, что субстанции ДКМ® микробоцидно действовали на стафилококки, энтерококки, кишечную палочку и Candida albicans с заметным преимуществом патентированного образца субстанции ДКМ®. Лекарственные антисептические препараты “Ауридексан”, “Горостен®”, “Декасан®”, “Септифрил”, которые содержат генерическую субстанцию ДКМ® (1*), также имели высокое микробоцидное влияние на антибиотикорезистентные клинические штаммы стафилококков (р<0,001–0,05).В статті наведенj результати дослідження антимікробних властивостей вітчизняного генеричного лікарського антисептичного препарату “Декаметоксин®” (ДКМ®) щодо музейних (S. aureus ATCC 25923 E. coli M-17, E. coli ATCC 25922, P. aeruginosa ATCC 27853, E. faecalis ATCC 29212, B. subtilis ATCC 6632) та клінічних штамів умовно-патогенних мікроорганізмів (S. aureus, S. epidermidis, E. coli, P. aeruginosa, C. albicans). Протимікробні властивості вивчали на двох генериках порівняно з патентованим оригінальним препаратом “Декаметоксин®”. Музейні та клінічні штами мали типові біологічні властивості. Встановлено, що субстанції ДКМ® мікробоцидно діяли на стафілококи, ентерококи, кишкову паличку та Candida albicans із помітною перевагою патентованого взірця субстанції ДКМ®. Лікарські антисептичні препарати “Аурідексан”, “Горостен®”, “Декасан®”, “Септефрил”, що містять генеричну субстанцію ДКМ® (1*), також мали високий мікробоцидний вплив на антибіотикорезистентні клінічні штами стафілококів (р<0,001–0,05).оків (р<0,001–0,05)

Вивчення антимікробних властивостей лікарських антисептичних препаратів, що містять декаметоксин

In the research the effectiveness of antiseptic remedies, which contain decamethoxin® (DCM). Microbicidal (Pilot Manufacturing of Institute of Organic Chemistry of National Academy of Sciences of Ukraine) and its remedies’ forms (auridexan (AU), horosten® (HS), decasan® (DS), septefril (SF). The study was carried out on clinical strains of S. aureus (n 85), E. coli (n 22), P. aeruginosa (n 16), C. albicans (n 12) and was compared with museum strains, got from the museum of alive microbe cultures of Vinnytsya National Pirogov Memorial Medical University. Antimicrobial qualities of antiseptics were studied by means of serial dilutions method. The results of antimicrobial activity of remedies was analysed by minimal cidal concentration (МСС). We found, that DCM® (MCC – 3,67±2,71 mkg/ml), HS® (3,44±1,60 mkg/ml, DS® (3,06±1,95 mkg/ml), SF (4,32±2,47 mkg/ml) had their microbicidal activity against clinical strains of S. aureus. Such remedies of generic  DCM® asAU, HS®, DS were found to have no difference in antimicrobial activity (р<0,05). Antimicrobial activity of DCM® (MCC – 26,8±17,5 mkg/ml) and its remedies horosten®, septefril on clinical strains of E. coli was significantly alike antimicrobial activity of museum strain of E. coli ATCC 25922 (MCC – 7,8 – 31,25 mkg/ml). clinical strains of P. aeruginosa were resistant to remedies of generic DCM® (MCC – 125-250 mkg/ml). C. albicans were sensitive to remedies of DCM® in cidal concentrations 3,9 – 31,25 mkg/ml. Effective antimicrobial qualities of generic decamethoxin® and its remedies (auridexan, horosten®, decasan®, septefril) are advisable to be used in fighting infection, caused by antibiotocresistant strains of S. aureus, E. coli, C. albicans.В работе исследовали эффективность лекарственных антисептических препаратов, которые содержат декаметоксин®. Исследовали микробоцидную активность генерического декаметоксина® (Опытное производство Института органической химии Национальной академии наук Украины) и его лекарственных форм (ауридексан (АУ), горостен® (ГС), декасан® (ДС), септефрил (СФ). Исследования проводили на клинических полирезистентных к антибиотикам штаммах S. aureus (n 85), E. coli (n 22), P. aeruginosa (n 16), C. albicans (n 12) в сравнении с эталонными штаммами S. aureus ATCC 25923, E. coli ATCC 25922, P. aeruginosa ATCC 27853, C. albicans CCM 885, которые получали с музея живых культур микроорганизмов кафедры микробиологии Винницкого национального медицинского университета имени Н. И. Пирогова. Противомикробные свойства антисептиков изучали методом серийных двукратных разведений, результаты оценивали по минимальной бактерицидной, фунгицидной концентрациях (МБцК, МФцК).Установлено, что препараты ДКМ® (МБцК – 3,67±2,71 мкг/мл), АУ (2,63±1,69 мкг/мл), ГС® (3,44±1,60 мкг/мл), ДС® (3,06±1,95 мкг/мл), СФ (4,32±2,47 мкг/мл) владели микробоцидной активностью в отношении клинических штаммов S. aureus. Установили отсутствие отличий в противомикробной активности лекарственных форм (горостен®, декасан®, септефрил), которые содержат действующее лекарственное вещество генерического декаметоксина® (р<0,05). Противомикробная активность ДКМ® (МБцК 26,8±17,5 мкг/мл), его лекарственных форм (горостен, септефрил) на клинические штаммы кишечной палочки достоверно не отличаются от противомикробной активности в отношении музейного штамма E. coli ATCC 25922 (МБцК 7,8 – 31,25 мкг/мл). Клинические штаммы P. aeruginosa проявляли устойчивость к лекарственным препаратам генерического ДКМ® (МБцК 125-250 мкг/мл). С. albicans были чувствительными к лекарственным препаратам ДКМ в присутствии МФцК 3,9 – 31,25 мкг/мл. Эффективные противомикробные свойства генерического препарата декаметоксина® и его лекарственных форм (ауридексан, горостен®, декасан®, септефрил) обосновывают целесообразность их применения в борьбе с инфекцией, вызванной антибиотикорезистентными штаммами S. aureus, E. coli, С. albicans.В роботі досліджували ефективність лікарських антисептичних препаратів, що містять декаметоксин®. Досліджували мікробоцидну активність генеричного декаметоксину® (Дослідне виробництво Іституту органічної хімії Національної академії наук України) та його лікарських форм (аурідексан (АУ), горостен® (ГС), декасан® (ДС), септефрил (СФ). Дослідження проводили на клінічних полірезистентних до антибіотиків штамах S. aureus (n 85), E. coli (n 22), P. aeruginosa (n 16), C. albicans (n 12) в порівнянні із еталонними штамами S. aureus ATCC 25923, E. coli ATCC 25922, P. aeruginosa ATCC 27853, C. albicans CCM 885, які одержали з музею живих культур мікроорганізмів кафедри мікробіології Вінницького національного медичного університету імені М. І. Пирогова. Протимікробні властивості антисептиків вивчали методом серійних двократних розведень, результати оцінювали за мінімальною бактерицидною, фунгіцидною концентраціями (МБцК, МФцК). Встановлено, що препарати ДКМ® (МБцК – 3,67±2,71 мкг/мл), АУ (2,63±1,69 мкг/мл), ГС® (3,44±1,60 мкг/мл), ДС® (3,06±1,95 мкг/мл), СФ (4,32±2,47 мкг/мл) володіли мікробоцидною активністю щодо до клінічних штамів S. aureus. Встановили відсутність відмінностей у протимікробній активності лікарських форм (горостен®, декасан®, септефрил) що містять діючу лікарську речовину генеричного декаметоксину® (р<0,05). Протимікробна активність ДКМ® (МБцК 26,8±17,5 мкг/мл), його лікарських форм (горостен, септефрил) на клінічні штами кишкової палички достовірно не відрізнялась від протимікробної активності щодо музейного штаму E. coli ATCC 25922 (МБцК 7,8 – 31,25 мкг/мл). Клінічні штами P. aeruginosa проявляли стійкість до лікарських препаратів генеричного ДКМ® (МБцК 125-250 мкг/мл). С. albicans проявляли чутливість до лікарських препаратів ДКМ в присутності МФцК 3,9–31,25 мкг/мл. Ефективні протимікробні властивості генеричного препарату декаметоксину® та його лікарських форм (аурідексан, горостен®, декасан®, септефрил) обґрунтовують доцільність їх застосування в боротьбі з інфекцією, спричинененою антибіотикорезистентними штамами S. aureus, E. coli, С. albicans

On the driven Frenkel-Kontorova model: I. Uniform sliding states and dynamical domains of different particle densities

The dynamical behavior of a harmonic chain in a spatially periodic potential (Frenkel-Kontorova model, discrete sine-Gordon equation) under the influence of an external force and a velocity proportional damping is investigated. We do this at zero temperature for long chains in a regime where inertia and damping as well as the nearest-neighbor interaction and the potential are of the same order. There are two types of regular sliding states: Uniform sliding states, which are periodic solutions where all particles perform the same motion shifted in time, and nonuniform sliding states, which are quasi-periodic solutions where the system forms patterns of domains of different uniform sliding states. We discuss the properties of this kind of pattern formation and derive equations of motion for the slowly varying average particle density and velocity. To observe these dynamical domains we suggest experiments with a discrete ring of at least fifty Josephson junctions.Comment: Written in RevTeX, 9 figures in PostScrip

Effect of Systemic Hypertension With Versus Without Left Ventricular Hypertrophy on the Progression of Atrial Fibrillation (from the Euro Heart Survey).

Hypertension is a risk factor for both progression of atrial fibrillation (AF) and development of AF-related complications, that is major adverse cardiac and cerebrovascular events (MACCE). It is unknown whether left ventricular hypertrophy (LVH) as a consequence of hypertension is also a risk factor for both these end points. We aimed to assess this in low-risk AF patients, also assessing gender-related differences. We included 799 patients from the Euro Heart Survey with nonvalvular AF and a baseline echocardiogram. Patients with and without hypertension were included. End points after 1 year were occurrence of AF progression, that is paroxysmal AF becoming persistent and/or permanent AF, and MACCE. Echocardiographic LVH was present in 33% of 379 hypertensive patients. AF progression after 1 year occurred in 10.2% of 373 patients with rhythm follow-up. In hypertensive patients with LVH, AF progression occurred more frequently as compared with hypertensive patients without LVH (23.3% vs 8.8%, p = 0.011). In hypertensive AF patients, LVH was the most important multivariably adjusted determinant of AF progression on multivariable logistic regression (odds ratio 4.84, 95% confidence interval 1.70 to 13.78, p = 0.003). This effect was only seen in male patients (27.5% vs 5.8%, p = 0.002), while in female hypertensive patients, no differences were found in AF progression rates regarding the presence or absence of LVH (15.2% vs 15.0%, p = 0.999). No differences were seen in MACCE for hypertensive patients with and without LVH. In conclusion, in men with hypertension, LVH is associated with AF progression. This association seems to be absent in hypertensive women

Progression From Paroxysmal to Persistent Atrial Fibrillation. Clinical Correlates and Prognosis

Objectives: We investigated clinical correlates of atrial fibrillation (AF) progression and evaluated the prognosis of patients demonstrating AF progression in a large population. Background: Progression of paroxysmal AF to more sustained forms is frequently seen. However, not all patients will progress to persistent AF. Methods: We included 1,219 patients with paroxysmal AF who participated in the Euro Heart Survey on AF and had a known rhythm status at follow-up. Patients who experienced AF progression after 1 year of follow-up were identified. Results: Progression of AF occurred in 178 (15%) patients. Multivariate analysis showed that heart failure, age, previous transient ischemic attack or stroke, chronic obstructive pulmonary disease, and hypertension were the only independent predictors of AF progression. Using the regression coefficient as a benchmark, we calculated the HATCH score. Nearly 50% of the patients with a HATCH score >5 progressed to persistent AF compared with only 6% of the patients with a HATCH score of 0. During follow-up, patients with AF progression were more often admitted to the hospital and had more major adverse cardiovascular events. Conclusions: A substantial number of patients progress to sustained AF within 1 year. The clinical outcome of these patients regarding hospital admissions and major adverse cardiovascular events was worse compared with patients demonstrating no AF progression. Factors known to cause atrial structural remodeling (age and underlying heart disease) were independent predictors of AF progression. The HATCH score may help to identify patients who are likely to progress to sustained forms of AF in the near future. \ua9 2010 American College of Cardiology Foundation

Site-specific labeling of nucleotides for making RNA for high resolution NMR studies using an E. coli strain disabled in the oxidative pentose phosphate pathway

Escherichia coli (E. coli) is a versatile organism for making nucleotides labeled with stable isotopes (13C, 15N, and/or 2H) for structural and molecular dynamics characterizations. Growth of a mutant E. coli strain deficient in the pentose phosphate pathway enzyme glucose-6-phosphate dehydrogenase (K10-1516) on 2-13C-glycerol and 15N-ammonium sulfate in Studier minimal medium enables labeling at sites useful for NMR spectroscopy. However, 13C-sodium formate combined with 13C-2-glycerol in the growth media adds labels to new positions. In the absence of labeled formate, both C5 and C6 positions of the pyrimidine rings are labeled with minimal multiplet splitting due to 1JC5C6 scalar coupling. However, the C2/C8 sites within purine rings and the C1′/C3′/C5′ positions within the ribose rings have reduced labeling. Addition of 13C-labeled formate leads to increased labeling at the base C2/C8 and the ribose C1′/C3′/C5′ positions; these new specific labels result in two- to three-fold increase in the number of resolved resonances. This use of formate and 15N-ammonium sulfate promises to extend further the utility of these alternate site specific labels to make labeled RNA for downstream biophysical applications such as structural, dynamics and functional studies of interesting biologically relevant RNAs

Changes of the human gut microbiome induced by a fermented milk product

The gut microbiota (GM) consists of resident commensals and transient microbes conveyed by the diet but little is known about the role of the latter on GM homeostasis. Here we show, by a conjunction of quantitative metagenomics, in silico genome reconstruction and metabolic modeling, that consumption of a fermented milk product containing dairy starters and Bifidobacterium animalis potentiates colonic short chain fatty acids production and decreases abundance of a pathobiont Bilophila wadsworthia compared to a milk product in subjects with irritable bowel syndrome (IBS, n = 28). The GM changes parallel improvement of IBS state, suggesting a role of the fermented milk bacteria in gut homeostasis. Our data challenge the view that microbes ingested with food have little impact on the human GM functioning and rather provide support for beneficial health effects