Praktická aplikace imunohistochemických a molekulárně - genetických metod v diferenciální diagnostice lézí urogenitálního a gynekologického traktu

This thesis focuses on gynecopathology. It consists of a collection of seven papers published in pathology journals with impact factor. Introduction section contains selection of examples showing scientific application of molecular genetic methods. Further on the aims of individual research projects are described. The first project comprises histomophologic study of skin endometriosis addressing "mullerian" differentiation. A case report of a rare tumor namely borderline papillary serous tumor of the fimbriated end of the fallopian tube follows with molecular genetic analysis of KRAS, BRAF and p53 gene mutation status. Prospective longitudinal study on high grade squamous dysplasia (HSIL) of the cervix in HPV vaccinated women, so called DAV (dysplasia after vaccination), aims to elucidate pathogenesis of this phenomenon. Two other studies focus on incidence of fumarate hydratase deficient leiomyomas of the uterus and hereditary leiomyomatosis and renal cell carcinoma syndrome (HLRCC). The aim of those studies is to improve our diagnostic capability and increase detection rate of the patients with HLRCC syndrome. Finally a new subtype of HSIL namely bizarre cell dysplasia is described in two separate studies. Conclusion remarks contemplate the role of molecular genetics in surgical pathology.Dizertačná práca je komentovaným súborom siedmich publikácií uverejnených v anglicky písaných impaktovaných časopisoch. Hlavnou témou je hľadanie optimálnej stratégie využitia imunohistochemických metód a metód molekulovej genetiky pri diagnostike zriedkavých a nových nádorov či podtypov nádorových jednotiek v gynekopatológii a aj v patológii urogenitálneho traktu. Ťažiskovou témou je gynekopatológia. Všeobecnejší úvod je výberovým náčrtom spôsobov akými patológovia môžu aplikovať metódy molekulovej genetiky vo výskume. Ciele práce stručne charakterizujú výskumné zámery jednotlivých projektov. Prvý predstavený projekt sa zaoberá histomorfologickou "mulleriánskou" variabilitou kožnej endometriózy. Nasleduje raritná kazuistika serózneho papilárneho borderline tumoru fimbrií tuby s analýzou prítomnosti mutácií génov KRAS, BRAF a p53. Prospektívna longitudinálna štúdia ťažkej dysplázie dlaždicového epitelu (HSIL) krčka maternice u HPV vakcinovaných žien sa snaží odhaliť príčiny tohoto fenoménu. Ďalšie dve štúdie sa zaoberajú incidenciou fumarát hydratáza (FH) deficientných leiomyómov maternice a syndrómu hereditárnej leiomyomatózy a renálneho karcinómu (HLRCC) s cieľom prispieť k zlepšeniu diagnostiky a zvýšiť záchytnosť tohoto syndrómu. Napokon je v podobe dvoch publikácií predstavená bizarná...Šiklův ústav patologieLékařská fakulta v PlzniFaculty of Medicine in Pilse

Implementation of Immunohistochemical and Molecular-Genetic Methods in Differential Diagnosis of Urogenital and Gynecologic Tract Lesions

This thesis focuses on gynecopathology. It consists of a collection of seven papers published in pathology journals with impact factor. Introduction section contains selection of examples showing scientific application of molecular genetic methods. Further on the aims of individual research projects are described. The first project comprises histomophologic study of skin endometriosis addressing "mullerian" differentiation. A case report of a rare tumor namely borderline papillary serous tumor of the fimbriated end of the fallopian tube follows with molecular genetic analysis of KRAS, BRAF and p53 gene mutation status. Prospective longitudinal study on high grade squamous dysplasia (HSIL) of the cervix in HPV vaccinated women, so called DAV (dysplasia after vaccination), aims to elucidate pathogenesis of this phenomenon. Two other studies focus on incidence of fumarate hydratase deficient leiomyomas of the uterus and hereditary leiomyomatosis and renal cell carcinoma syndrome (HLRCC). The aim of those studies is to improve our diagnostic capability and increase detection rate of the patients with HLRCC syndrome. Finally a new subtype of HSIL namely bizarre cell dysplasia is described in two separate studies. Conclusion remarks contemplate the role of molecular genetics in surgical pathology

Additional file 2: of Human papillomavirus infection and p16 expression in the immunocompetent patients with extragenital/extraungual Bowen’s disease

The datasets supporting the conclusions of the article. (XLSX 19 kb

Imunohistochemické a vybrané genetické reflexní testy pro všechny děložní leiomyosarkomy a STUMP pro genové přeskupení ALK mohou poskytovat účinný screeningový nástroj pro identifikaci mezenchymálních nádorů s přeskupeným ALK

Zkoumali jsme hodnotu cíleného molekulárního screeningu pro identifikaci mezenchymálních nádorů s přesmykem děložního anaplastického lymfomu (ALK), včetně imunohistochemie ALK následované molekulárně genetickým testováním, u všech děložních leiomyosarkomů a STUMP (nádory hladkého svalstva s nejistým maligním potenciálem). Všechny případy leiomyosarkomu a STUMP diagnostikované v 10letém období (2006–2016) na LF UK v Plzni byly získány a přezkoumány. Z 23 případů byl jeden případ (LMS [leiomyosarkom]) pozitivní na přeskupení ALK, a to fúzní gen PPP1CB – ALK. V tomto případě nebyly pozorovány žádné specifické histologické znaky (tj. Lymfocytární infiltrát a stromální edém). To naznačuje, že histologické rysy podobné zánětlivým myofibroblastickým nádorům (IMT) nemusí být počátečním spolehlivým screeningovým nástrojem při identifikaci děložních IMT případů. Navrhli jsme tedy dvoustupňové IHC a molekulární genetické testování (jako reflexní test) na IMT ve všech případech LMS a STUMP dělohy. To zlepší správnou detekci nádorů tohoto typu v populaci a tím se vytvoří možnost pro dostupnou a cílenou terapii.In a recent paper in Electron. J. Combin. 23 (2016) Estélyi and Pisanski raised a question whether there exist vertex-transitive Haar graphs that are not Cayley graphs. In this note we construct an infinite family of trivalent Haar graphs that are vertex-transitive but non-Cayley. The smallest example has 40 vertices and is the well-known Kronecker cover over the dodecahedron graph G(10,2), occurring as the graph ‘40’ in the Foster census of connected symmetric trivalent graphs

A tribute to Prof. Ondrej Hes, MD, PhD (1968-2022)

No abstract availabl