A telomerase e a terapêutica do cancro: futuras perspectivas

Os telómeros localizam-se nas terminações dos cromossomas, sendo essenciais para a manutenção da sua integridade, prevenindo fusões terminais. Grande parte das proteínas com localização nos telómeros foram recentemente identificadas, contudo muitas das suas funções continuam por esclarecer. Mutações em genes codificantes destas proteínas causam diversas síndromes genéticas raras, caracterizadas por instabilidade genética, cromossómica e predisposição para cancro. A compreensão do funcionamento biológico do telómero, permitirá o desenvolvimento de novos métodos de diagnóstico, prevenção e terapêuticas mais eficazes para cada síndrome. Telomeres are located at chromosomes ends, having essential roles in preventing terminal fusions. Several telomeric proteins were recently identified, however most of their functions are not yet understood. Mutations at the genes encoding these proteins cause a number of rare genetic syndromes, characterized by genetic and/or chromosome instability and predisposition to cancer. The understanding of the whole mechanism of operation of telomere biology, will enable the development of new methods of diagnosis, prevention and more effective treatment for each syndrome

Construyendo una facultad de medicina innovadora en Portugal : la experiencia de la Universidad de Minho

Hallelujah!’, proclaimed in October 8, 2001, 27 years after the first proposal delivered to the Portuguese government, the project’s founder, Professor Joaquim Pinto Machado, at the beginning of educational activities at the School of Medicine (formerly School of Health Sciences), University of Minho (SM-UMinho), Braga, Portugal. This manuscript reviews the strategy implemented and the outcomes 15 years after welcoming the first medical students.‘¡Aleluya!’. Así, 27 años después de la primera propuesta presentada al gobierno portugués, el fundador del proyecto, el Profesor Joaquim Pinto Machado, proclamaba el 8 de octubre de 2001 el inicio de las actividades educativas de la nueva Facultad de Medicina (anteriormente Escuela de Ciencias de la Salud) de la Universidad de Minho (SM-UMinho), Braga, Portugal. Este artículo revisa la estrategia utilizada para la implementación de la nueva facultad y los resultados 15 años después de dar la bienvenida a los primeros estudiantes de medicinainfo:eu-repo/semantics/publishedVersio

Extensão da equação de estado soft-SAFT para sistemas poliméricos

Doutoramento em Engenharia QuímicaAo longo da história da termodinâmica moderna, a procura de um modelo matemático que permita descrever o equilíbrio de fases de polímeros tem sido constante. Industrialmente, o desenvolvimento de um modelo de equilíbrio de fases de sistemas poliméricos reveste-se de uma enorme importância, especialmente no processo de fabrico propriamente dito onde o polímero é misturado com solvente (no caso da polimerização em solução) e com monómero. Podem ainda existir outros compostos em solução, tais como surfactantes e/ou iniciadores da reacção de polimerização, embora a sua concentração seja normalmente tão baixa que não afecta o equilíbrio de fases de um modo significativo. A previsão do comportamento do equilíbrio de fases é também importante no passo de purificação do polímero, onde este tem que ser separado do monómero que não reagiu e é recirculado para o reactor de polimerização. Esta tese constitui mais um passo no sentido de aprofundar o desenvolvimento de tais modelos. O principal problema na modelação termodinâmica de polímeros é o facto de estes não poderem ser decompostos em termos matemáticos, físicos ou químicos tal como outros tipos de moléculas, já que os polímeros são diferentes não só na estrutura química como também nas eventuais ramificações, na massa molecular ou na distribuição de massas moleculares, entre outras propriedades. O objectivo deste trabalho é descrever o equilíbrio de fases de misturas envolvendo polímeros usando vários modelos que pertencem a diferentes tipos de abordagem, nomeadamente modelos de energia livre baseados no modelo “Universal Quasi Chemical Activity Coefficient” (UNIQUAC), e equações de estado, tais como a “Statistical Associating Fluid Theory” (SAFT), em particular as versões soft-SAFT e PC-SAFT. Com o objectivo de obter um conhecimento mais aprofundado do equilíbrio de fases de polímeros, o estudo inicia-se quando possível na caracterização dos seus precursores, i. e., monómeros e oligómeros. Este facto permitiu a compreensão da evolução das propriedades termodinâmicas com a massa molecular numa dada série de compostos, tais como os n-alcanos e os etilenoglicois, ocasionando o desenvolvimento de esquemas de correlação e possibilitando o uso da SAFT de uma maneira preditiva. Especial atenção foi dada a sistemas polímero-solvente com associação, o qual foi programado e testado pela primeira vez na soft-SAFT. Os modelos SAFT provaram que conseguem vários tipos de equilíbrio de fases, nomeadamente equilíbrio líquidolíquido com temperatura critica superior de solução e temperatura critica inferior de solução, liquido-vapor e equilíbrio gás-liquido.Throughout the history of modern thermodynamics the search for a suitable mathematical model that could describe the phase equilibria of polymers has been a constant. Industrially, the existence of a model to accurately describe the phase equilibria of polymers is of extreme importance. This is true for the manufacturing process where polymer is mixed with solvent (in case of solution polymerization) and monomer. Other substance may sometimes be present as such as initiators of the polymerization reaction but their quantity will not affect the phase equilibria in a significant way. Another process where phase equilibria prediction is needed is in the purification process of the polymer where the solvent and monomer have to be separated from the polymer and recycled to the process. This thesis is another step forward in this search and development of that model. The main handicap in polymer thermodynamics modeling is the fact that they cannot be built, in mathematical, physical and chemical terms, as other types of molecules, since they differ not only in chemical structure but also in branching, molecular weight, molecular weight distribution, to mention a few. The goal of this work is to model phase equilibria of polymer mixtures by means of several modeling approaches, namely GE models, based in the Universal Quasi Chemical Activity Coefficient (UNIQUAC) model, and equations of state, such as the Statistical Associating Fluid Theory (SAFT), in particular the soft-SAFT and PC-SAFT versions. In order to gain some grasp of polymer modeling, not only polymers were described, but their precursors, i.e., monomers and oligomers were also modeled. This allowed the understanding of the evolution of the thermodynamic properties with the molecular weight in a given series, such as the n-alkane series and ethylene glycol series and the development of correlation schemes which enable the use of the SAFT models in a predictive way. Special attention was also paid to polymer-solvent associating systems, which was coded and tested for the first time for the soft-SAFT equation of state. The SAFT models showed that they can describe several types of phase equilibria namely the liquid-liquid equilibria with Upper Critical Solution Temperature and/or Lower Critical Solution Temperature, vapor-liquid and gas-liquid equilibria

Improving the Clinical Use of Magnetic Resonance Spectroscopy for the Analysis of Brain Tumours using Machine Learning and Novel Post-Processing Methods

Magnetic Resonance Spectroscopy (MRS) provides unique and clinically relevant information for the assessment of several diseases. However, using the currently available tools, MRS processing and analysis is time-consuming and requires profound expert knowledge. For these two reasons, MRS did not gain general acceptance as a mainstream diagnostic technique yet, and the currently available clinical tools have seen little progress during the past years. MRS provides localized chemical information non-invasively, making it a valuable technique for the assessment of various diseases and conditions, namely brain, prostate and breast cancer, and metabolic diseases affecting the brain. In brain cancer, MRS is normally used for: (1.) differentiation between tumors and non-cancerous lesions, (2.) tumor typing and grading, (3.) differentiation between tumor-progression and radiation necrosis, and (4.) identification of tumor infiltration. Despite the value of MRS for these tasks, susceptibility differences associated with tissue-bone and tissue-air interfaces, as well as with the presence of post-operative paramagnetic particles, affect the quality of brain MR spectra and consequently reduce their clinical value. Therefore, the proper quality management of MRS acquisition and processing is essential to achieve unambiguous and reproducible results. In this thesis, special emphasis was placed on this topic. This thesis addresses some of the major problems that limit the use of MRS in brain tumors and focuses on the use of machine learning for the automation of the MRS processing pipeline and for assisting the interpretation of MRS data. Three main topics were investigated: (1.) automatic quality control of MRS data, (2.) identification of spectroscopic patterns characteristic of different tissue-types in brain tumors, and (3.) development of a new approach for the detection of tumor-related changes in GBM using MRSI data. The first topic tackles the problem of MR spectra being frequently affected by signal artifacts that obscure their clinical information content. Manual identification of these artifacts is subjective and is only practically feasible for single-voxel acquisitions and in case the user has an extensive experience with MRS. Therefore, the automatic distinction between data of good or bad quality is an essential step for the automation of MRS processing and routine reporting. The second topic addresses the difficulties that arise while interpreting MRS results: the interpretation requires expert knowledge, which is not available at every site. Consequently, the development of methods that enable the easy comparison of new spectra with known spectroscopic patterns is of utmost importance for clinical applications of MRS. The third and last topic focuses on the use of MRSI information for the detection of tumor-related effects in the periphery of brain tumors. Several research groups have shown that MRSI information enables the detection of tumor infiltration in regions where structural MRI appears normal. However, many of the approaches described in the literature make use of only a very limited amount of the total information contained in each MR spectrum. Thus, a better way to exploit MRSI information should enable an improvement in the detection of tumor borders, and consequently improve the treatment of brain tumor patients. The development of the methods described was made possible by a novel software tool for the combined processing of MRS and MRI: SpectrIm. This tool, which is currently distributed as part of the jMRUI software suite (www.jmrui.eu), is ubiquitous to all of the different methods presented and was one of the main outputs of the doctoral work. Overall, this thesis presents different methods that, when combined, enable the full automation of MRS processing and assist the analysis of MRS data in brain tumors. By allowing clinical users to obtain more information from MRS with less effort, this thesis contributes to the transformation of MRS into an important clinical tool that may be available whenever its information is of relevance for patient management

Impacto do robustecimento de sistemas no desempenho de serviços Internet

O recurso a medidas preventivas, no âmbito da Segurança de Sistemas Informáticos, tem uma importância cada vez maior. Neste contexto, os mecanismos do tipo Role-Based Access Control - RBAC representam uma das abordagens mais promissoras. Todavia, para que sejam largamente aceites, é desejável que: i) tenham um impacto reduzido no desempenho dos sistemas e aplicações, ii) sejam escaláveis e iii) sejam facilmente administráveis. Para além da abordagem RBAC, existem outros mecanismos complementares, para a detecção e contenção de erros. Por exemplo, mecanismos como o - PAX intervêm ao nível da gestão de memória efectuada pelo núcleo do sistema operativo, tornando um sistema virtualmente imune a situações do tipo buffer overflow. Neste artigo descreve-se uma aplicação (e respectiva avaliação) do mecanismo RBAC da plataforma grsecurity, baseado em listas de controle de acesso (ACLs), em conjunção com a plataforma PAX. Em traços gerais, e para a gama de testes utilizada, concluímos que, para serviços nos quais a memória é partilhada entre os vários fios de execução que fazem o atendimento dos pedidos, o impacto do hardening no desempenho dos serviços é mínimo; já em situações em que a memória não é partilhada, a intervenção dos mecanismos de validação PAX torna-se evidente, prejudicando o desempenho global dos serviços