90 research outputs found

    Mechanism and substrate specificity of the flavin reductase ActVB from Streptomyces coelicolor.

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    International audienceActVB is the NADH:flavin oxidoreductase participating in the last step of actinorhodin synthesis in Streptomyces coelicolor. It is the prototype of a whole class of flavin reductases with both sequence and functional similarities. The mechanism of reduction of free flavins by ActVB has been studied. Although ActVB was isolated with FMN bound, we have demonstrated that it is not a flavoprotein. Instead, ActVB contains only one flavin binding site, suitable for the flavin reductase activity and with a high affinity for FMN. In addition, ActVB proceeds by an ordered sequential mechanism, where NADH is the first substrate. Whereas ActVB is highly specific for NADH, it is able to catalyze the reduction of a great variety of natural and synthetic flavins, but with K(m) values ranging from 1 microm (FMN) to 69 microm (lumiflavin). We show that both the ribitol-phosphate chain and the isoalloxazine ring contribute to the protein-flavin interaction. Such properties are unique and set the ActVB family apart from the well characterized Fre flavin reductase family

    First appraisal to define prospective seismogenic sources from historical earthquake damages in southern Upper Rhine Graben

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    The southern portion ofthe Upper Rhine Graben, a major oblique rift among France, Germany and Switzerland, shows a weak instrumental seismic record despite its remarkable physiographic imprint within the Northern Alpine foreland. Since traces of active deformation can be found in this region and based on experience in other European areas with high seismic hazard and dense population, we searched for past earthquakes recorded in historical catalogues. Based on the fact that tectonic deformation cumulates through geological time and considering that long-term effects tend to leave characteristic signatures on present-day landscape arrangement, our goal was to identify faults that could have caused the damage of recorded historical events. We isolated five main earthquakes, ofmoderate Richter magnitude, essentially located on the E flank of the graben (as is the case with recent seismic activity). To such events, we were able to associate a specific prospective structure through the use ofa procedure thus far successfully employed in Southern European contexts. We concentrated on three events which showed (a) notable sensitivity to the density of the historical felt reports and (b) accordance with on-going subtle deformation pattern. Another, most relevant earthquake (M 5.5) yielded a promising match with the known deformation network in the region. As a template to better constrain earthquake cycle and damage potential, historical seismicity offers an invaluable tool, since it contains a specific record, although not always unambiguous. Cross-checking such data with pertinent geological information allows to devise a realistic fault geometry capable of being responsible for a specific seismic event

    Influence of lithology on hillslope morphology and response to tectonic forcing in the northern Sierra Nevada of California

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    Many geomorphic studies assume that bedrock geology is not a first-order control on landscape form in order to isolate drivers of geomorphic change (e.g., climate or tectonics). Yet underlying geology may influence the efficacy of soil production and sediment transport on hillslopes. We performed quantitative analysis of LiDAR digital terrain models to examine the topographic form of hillslopes in two distinct lithologies in the Feather River catchment in northern California, a granodiorite pluton and metamorphosed volcanics. The two sites, separated by <2 km and spanning similar elevations, were assumed to have similar climatic histories and are experiencing a transience in landscape evolution characterized by a propagating incision wave in response to accelerated surface uplift c. 5 Ma. Responding to increased incision rates, hillslopes in granodiorite tend to have morphology similar to model predictions for steady state hillslopes, suggesting that they adjust rapidly to keep pace with the incision wave. By contrast, hillslopes in metavolcanics exhibit high gradients but lower hilltop curvature indicative of ongoing transient adjustment to incision. We used existing erosion rate data and the curvature of hilltops proximal to the main channels (where hillslopes have most likely adjusted to accelerated erosion rates) to demonstrate that the sediment transport coefficient is higher in granodiorite (8.8 m2 ka-1) than in metavolcanics (4.8 m2 ka-1). Hillslopes in both lithologies get shorter (i.e., drainage density increases) with increasing erosion rates

    Etudes biochimique et physico-chimique de deux hydrogenases a nickel de bacteries sulfato-reductrices du genre Desulfovibrio

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    INIST T 71621 / INIST-CNRS - Institut de l'Information Scientifique et TechniqueSIGLEFRFranc

    La couleur de la dent naturelle (détermination et communication)

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    AIX-MARSEILLE2-BU Méd/Odontol. (130552103) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

    Prothèse complète immédiate "d'usage" (données actuelles)

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    AIX-MARSEILLE2-BU Méd/Odontol. (130552103) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

    Superoxyde réductase (mécanisme de transfert d'électrons vers le site actif et rôle de la lysine 48 dans la catalyse)

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    La superoxyde réductase (SOR) est une métalloprotéine qui catalyse la réduction du radical superoxyde en peroxyde d'hydrogène. Son site actif est constitué d'un centre mononucléaire de fer pentacoordiné tout à fait particulier de type [FeHisN4CysS1]. Pour son activité catalytique, la SOR nécessite des partenaires physiologiques comme donneur d'électron (réductases cellulaires). Les SORs de Classe 1, telle que celle de Desulfoarculus baarsii, possèdent en plus du site actif, un centre de type rubrédoxine [Fe(SCys)4] qui ne réagit pas avec le superoxyde et dont la fonction est inconnue. Nous avons montré que ce centre rubrédoxine peut jouer un rôle de relais électronique entre les réductases et le site actif de la SOR. Cependant, ce transfert d'électron entre le centre rubrédoxine et le site actif ne se fait pas de façon intramoléculaire mais intermoléculaire, entre deux molécules de SOR. Nous proposons que la présence de ce centre permet à la SOR de s'adapter à une très large gamme de réductases cellulaires et optimise ainsi l'activité de détoxification du radical superoxyde de la SOR. Le mécanisme catalytique de la SOR a été très étudié par la technique de radiolyse pulsée. Nous montrons que les études antérieures sur la SOR de D. baarsii ont été perturbées par un phénomène photochimique, résultant d'une propriété particulière d'un des intermédiaires réactionnels du cycle catalytique. Les études du mécanisme de la SOR ont été reprises en absence de cet effet photochimique et nous ont permis de proposer un nouveau mécanisme réactionnel de réduction du superoxyde par la SOR de D. baarsii. Nos études sur le mutant SOR K48I de D. baarsii nous ont permis de mettre en évidence le rôle essentiel que joue la lysine 48 dans la protonation de l'intermédiaire réactionnel Fe3+-hydroperoxyde. En absence de cette lysine, nous avons observé une modification profonde de la réactivité de cet intermédiaire, qui ne conduit plus à la formation du produit de la réaction H2O2. Nous avons montré que l'espèce Fe3+-hydroperoxyde formée au sein de ce mutant est alors capable de réaliser des réactions d'oxydation spécifiques, telle la transformation de thioanisole en méthyl phényl sulfoxyde. Nos données suggèrent fortement qu'en absence de cette lysine, l'intermédiaire Fe3+-hydroperoxyde évolue vers une espèce à haut degré d'oxydation de type fer-oxo, fortement oxydante, responsable de ces oxydations. Ainsi, la lysine 48 apparaît comme un résidu essentiel, qui permet pour la SOR d'orienter l'évolution de l'intermédiaire Fe3+-hydroperoxyde vers la production de H2O2, plutôt que vers la formation d'entités de type fer-oxo à haut degré d'oxydation, comme le font les oxygénases de type cytochrome P450.Superoxide reductase (SOR) is a metalloprotein which catalyses the reduction of the radical superoxide into hydrogen peroxide. Its active site is constituted by a mononuclear iron center pentacoordinated [FeHisN4CysS1]. For its catalytic activity, SOR requires physiological partners as electron donor (cellular reductases). SORs of Class 1, such as that of Desulfoarculus baarsii, possess besides the active site, an additional iron center, rubredoxin [Fe(SCys)4] type, which does not react with the superoxide and with an unknown function. We showed that this rubredoxin center plays a role of electronic relay between reductases and the active site of the SOR. However, we show that this electron transfer between the rubredoxin center and the active site is not intramolecular but intermolecular, between two molecules of SOR. We propose that the presence of this iron center allows the SOR to adapt to various cellular reductases in order to optimize its detoxification activity. The catalytic mechanism of the SOR had been studied by pulsed radiolysis. We show that the previous studies on the SOR from D. baarsii were perturbed by a photochemical phenomenon, resulting from a particular property of one of the key reaction intermediates of the catalytic cycle. The reaction mechanism has been reinvestigated in the absence of this photochemical effect and allowed us to propose a new reaction mechanism of reduction of the superoxide by the SOR of D. baarsii. Our studies on the SOR mutant K48I of D. baarsii allowed us to bring to light the essential role of that lysine 48 in the protonation of the reaction intermediate Fe3+-hydroperoxyde. In absence of this lysine, we observed a modification of the reactivity of this reaction intermediate, which does not drive any more to the formation of the product of the reaction H2O2. We showed that the species Fe3+-hydroperoxyde formed within this mutant is then capable to carry out specific reactions of oxidation, such the transformation of thioanisole methyl phenyl sulfoxyde. Our data strongly suggest that in absence of this lysine, the intermediate Fe3+-hydroperoxide evolves towards a high degree oxidation species, iron-oxo type, strongly oxidizing, responsible for these oxidations. So, the lysine 48 appears as an essential residue, which allows the SOR to direct the evolution of the intermediary Fe3+-hydroperoxyde to the production of H2O2, rather than to the formation of high-valent iron-oxo species, as observed in the cytochrome P450 oxygenases.GRENOBLE1-BU Sciences (384212103) / SudocSudocFranceF

    Contribution à l'étude lexico-sémantique des dénominations chromatiques en russe et en français

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    Le but de ce travail est d'étudier, au travers de la nomenclature du corpus défini (magazines de mode en russe et en français de 1998-2004), le processus de dénomination de la couleur comme ensemble de phénomènes linguistiques multilatéraux, d'établir les liens avec les facteurs linguistiques et extralinguistiques y compris la nature pragmatique des textes étudiés en russe et en français. Pour cela, il a été procédé à l'étude de la méthodologie et de la précision des notions principales de la linguistique de la couleur (aspects évolutif, comparatif, cognitif, psycholinguistique) ; à l'analyse comparative des différents modèles de termes chromatiques russes et français ; à l'étude des corrélations entre l'évolution du vocabulaire des couleurs et les phénomènes sociaux ; et à l'étude comparative du contenu des termes chromatiques en russe et en français au cours de laquelle les problèmes de traduction des termes chromatiques sont soulevés.NANCY2-BU Lettres (543952103) / SudocSudocFranceF
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