Culture effects on business intelligence systems success

Dissertation presented as the partial requirement for obtaining a Master's degree in Information Management, specialization in Knowledge Management and Business IntelligenceBusiness Intelligence (BI) enables users to quickly access real time information to support their decision-making processes. Recently it has become one of the principal tools used by corporations to analyze business data and turn it into actionable insights. This study identifies the effects that culture has on the main and essential drivers for the success of a BI system in an organization. This research combines two culture dimensions (innovation culture and data-driven culture), with the Delone & Mclean information systems success model, in order to evaluate BI success in the post-adoption stage. Based on a sample of 201 users, the results reveal that the usage, user satisfaction, and data-driven culture are important precedents of net benefits. Both use and user satisfaction have a significant relationship between each other, and information quality, system quality, service quality, and innovation culture positively affect user satisfaction. Previous research has focused mainly on the adoption of BI information systems. However, this study evaluates the effects of cultural dimensions on a BI system’s success in the post-adoption stage, while also identifying the critical success factors of this technology

Retinoic acid: a key regulator of vertebrate embryonic development

Tese de mestrado em Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2015O ácido retinóico é uma molécula sinalizadora, sintetizada a partir da vitamina A, necessária para o correto desenvolvimento embrionário dos vertebrados, uma vez que regula a transcrição de genes essenciais durante vários processos da embriogénese. A relação entre a sua produção e degradação, respetivamente através das enzimas Raldh2 e Cyp26a1, leva a que a sua atividade sinalizadora ocorra de uma forma bastante específica quer em termos de dose, localização da sua atuação (tecido) ou quer em termos temporais. De facto, a alteração dos níveis de ácido retinóico durante o desenvolvimento embrionário pode ser letal ou dar origem a doenças congénitas (como por exemplo, spina bífida). Uma das etapas mais importantes na embriogénese dos vertebrados é a gastrulação. Durante esta, para que a formação dos três folhetos germinativos (que mais tarde irão dar origem a todos os tecidos e órgãos do organismo) possa ocorrer devidamente, é necessário um correto controlo da atividade sinalizadora mediada pelo ácido retinóico, que nesta fase do desenvolvimento é fundamentalmente fornecido por via materna (caso dos ratinhos), dado que alterações na sua degradação enzimática pelas Cyp26 podem resultar na morte do embrião. Tal ocorre uma vez que o ácido retinóico controla a expressão de Nodal (excesso de ácido retinóico provoca a indução ectópica de Nodal), proteína indispensável para que se dê o início da gastrulação através da formação da linha primitiva, decorrente da migração das células do epiblasto para a parte mais posterior do embrião7. Aparentemente a introdução de um transgene (T-streakCreERT) juntamente com o alelo repórter ROSA26R-β-gal em ratinhos mutantes para o gene Gdf11, produziu letalidade embrionária durante a gastrulação8. Após verificarmos que o efeito não era devido ao transgene por si próprio, mas sim possivelmente ao local onde este foi inserido no genoma de uma linha particular (#47), procurámos caracterizar molecularmente os embriões Gdf11-/-::T-streak-CreERT#47+/0 de forma a tentar encontrar a causa desta aparente letalidade. A alteração dos níveis de ácido retinóico observada nos embriões Gdf11-/- durante a transição entre a formação de tecidos do tronco e da cauda, fez-nos considerar a possibilidade de durante a gastrulação ocorrer uma alteração semelhante desses níveis, que combinada com possíveis efeitos do transgene pudesse resultar na morte dos referidos embriões. No entanto, as experiências realizadas não só não permitiram a identificação de qualquer problema durante a gastrulação, decorrente da mutação no gene Gdf11 e/ou do transgene T-streak-CreERT#47+/0, como demonstraram a correta formação da linha primitiva nos embriões Gdf11-/-::T-streak-CreERT#47+/0. Estudos adicionais mostraram ainda viabilidade dos embriões Gdf11-/-::T-streak-CreERT#47+/0 a E10.5. Uma possível explicação para este facto prende-se com a estratégia utilizada na genotipagem do alelo mutante de Gdf11, pois usava iniciadores desenhados para amplificar parte da cassete de neomicina (introduzida para criar a mutação nesse gene9) que também está presente no alelo repórter ROSA26-β-gal, que formava parte das experiências originais que levaram à nossa hipótese inicial. Assim sendo, é bastante provável que os erros cometidos na determinação do genótipo dos progenitores dos embriões Gdf11::ROSA26R-β-gal+/0::T-streakCreERT#47+/0, tenham levado a utilizar ratinhos Gdf11+/+ e não Gdf11+/- nos cruzamentos, criando a ilusão de uma ausência de embriões Gdf11-/- nestas ninhadas. De qualquer forma, relativamente à hipótese da alteração dos níveis de ácido retinóico nos mutantes Gdf11, foi possível concluir que aparentemente essa alteração não se verifica durante a gastrulação, uma vez que a expressão tanto de Cyp26a1, como de Nodal permaneceram sem alterações. Após a gastrulação, nos vertebrados, dá-se primeiro a formação da cabeça (na parte mais anterior do embrião) e depois por um processo de extensão axial, no sentido anterior para posterior, é formado o pescoço, a seguir o tronco e por último a cauda. Apesar do desenvolvimento destas estruturas ser progressivo e de depender dos progenitores axiais, parece que a forma como estas diferentes partes do corpo são criadas é diferente. Mutações nos genes T, Cdx e Wnt3a suportam esta teoria, segundo a qual a posição dos membros superiores e inferiores delimita os referidos blocos estruturais do embrião (cabeça/pescoço, tronco e cauda). Como referido anteriormente, o mecanismo segundo o qual ocorre a transição tronco-cauda já foi demonstrado pelo nosso laboratório, mas a transição entre a formação da cabeça e do tronco ainda permanece por esclarecer. Curiosamente a mutação da enzima Raldh2, que leva à inexistência de ácido retinóico nos tecidos neurais e na mesoderme, leva à morte do embrião após o desenvolvimento ser interrompido ao nível dos membros anteriores. Mas, se for administrado ácido retinóico até essa altura do desenvolvimento (~E8.25) o embrião é capaz de ultrapassar esse bloqueio e formar as seguintes estruturas (tronco e cauda). Esse facto fez-nos considerar a hipótese de que o ácido retinóico pode estar a controlar o mecanismo de transição entre a formação da cabeça e do tronco. Para identificar essa necessária mudança nos progenitores axiais, dependente do ácido retinóico, efetuámos uma análise transcriptómica comparativa a partir de ARN isolado das caudas de embriões “tipo selvagem” a E8.75/E9.0 (ou seja, onde a transição já foi efetuada e estão a ser criados os tecidos do tronco) e de embriões Raldh2-/- da mesma idade (nos quais esta transição encontra-se bloqueada). Após análise dos resultados presentes na RNA-seq, foi selecionado um grupo de genes candidatos com base na grandeza da expressão diferencial observada entre embriões tipo selvagem e Raldh2-/-, e tendo em conta a sua significância e função biológica. Vários genes desse grupo (exemplo: Wnt3a, Dkk1 e Cav1) estão associados à sinalização Wnt, cuja atividade canónica (via -catenina) parece estar diminuída na cauda dos embriões mutantes. Esta observação é bastante interessante, tendo em conta a comparação dos fenótipos dos embriões mutantes para Wnt3 (que apresentam ausência total de mesoderme), com o fenótipo dos embriões Wnt3a-/- (em que o desenvolvimento apenas ocorre de forma normal até ao nível do membro anterior), sugerindo que a atividade do ácido retinóico possa ser responsável por esta mudança na sinalização Wnt (de depender de Wnt3 e passar a depender de Wnt3a). Sendo que esta hipótese contrasta com a observação de que a expressão de Wnt3a parece estar aumentada na cauda dos mutantes, é possível que a existência de regulação diferencial dos vários componentes da sinalização Wnt nos embriões Raldh2-/- possa resultar na incapacidade dos progenitores de responder apropriadamente a Wnt3a, ocorrendo dessa forma a inibição da sinalização canónica de Wnt. Por esse motivo, através de hibridação in situ procurámos observar a expressão de alguns desses genes envolvidos na sinalização Wnt e complementámos esses estudos com uma abordagem de sobre-expressão através da utilização de transgénicos (onde o gene avaliado foi associado ao promotor de Cdx2 que expressa nos progenitores do eixo). Estudos similares foram também feitos com outros genes não associados à sinalização Wnt (Mesp1 e Fgf4). No entanto as nossas experiências não permitiram determinar o mecanismo inerente à mudança nos progenitores, necessária para que o embrião termine de criar tecidos da cabeça e inicie a produção de tecidos do tronco. Ainda sobre a forma como a atividade do ácido retinóico influência os progenitores axiais, através de hibridação in situ, confirmámos que na mesoderme pré-somítica, a área onde tanto T como Sox2 são expressos é menor nos embriões Raldh2-/-. Em experiências preliminares foi possível observar, através de imunofluorescência, a existência de células que expressam T e Sox2 (apesar de não ter sido possível contabilizá-las), indicando dessa forma a presença dos progenitores axiais nos embriões Raldh2-/-. Por último, surpreendentemente ao que está publicado, verificámos que em alguns embriões Raldh2-/- é possível observar umas pequenas protuberâncias onde Tbx5 (marcador da indução dos membros anteriores) encontra-se expresso mais tarde no desenvolvimento (do que aquilo que seria suposto) e em menor quantidade. Por isso, considerando o fenótipo decorrente da mutação de Cyp26a1 (onde ocorre uma transformação homeótica da vertebra cervical C5 para C6 e da C7 para uma vertebra torácica), é possível que o ácido retinóico seja crucial durante este período do desenvolvimento, definindo o tempo em que ocorre a transição entre a formação da cabeça (pescoço) e do tronco no embrião. Apesar desta hipótese necessitar de uma validação experimental, conectando a transição cabeça-tronco e a indução dos membros anteriores, todas as evidências apontam no sentido de que a atividade do ácido retinóico nos progenitores axiais é apenas necessária durante a transição cabeça-tronco (e não durante todo o processo de extensão axial) sendo depois restringida, pela Cyp26a1, a zonas mais anteriores do embrião.Retinoic acid (RA) is a signalling molecule, derived from vitamin A, necessary for proper vertebrate embryonic development. It acts in a tissue, time and dose specific manner, shaping the embryo through the regulation of several master transcription factors. Alterations in RA levels during embryonic development are known to cause several problems, including embryonic lethality. During gastrulation, the formation of the three germ layers requires balanced interaction between RA and Cyp26 molecules, which is crucial for Nodal expression7. Interestingly, in Mallo’s lab, embryos carrying a transgene (T-streakCreERT), the cre reporter allele ROSA26R-β-gal, and a total inactivation of Gdf11, seemed to die during this stage8. Considering the interaction between Gdf11 and Cyp26a1, we hypothesized that the transgene, together with Gdf11 might have affected RA signalling. However our experiments failed to find any indication of patterning problems that could justify the early lethality that was initially observed. Additional analyses indicate that the original phenotype might have resulted from incorrect genotyping of the parent lines. Also, we could conclude that despite what happens during the trunk to tail transition in Gdf11-/-, in these mutants RA signalling seems not to be affected during gastrulation. Embryos lacking RA (Raldh2-/-) become truncated at the forelimb level. Since Raldh2 mutant embryos exposed to acute RA treatments at E8.25 acquire trunk and tail structures we concluded that RA signalling controls the mechanism regulating the head to trunk transition. To understand this process we performed a comparative transcriptomic analysis between tails of Raldh2-/- and wild type embryos. So far, we could not elucidate the mechanism for this transition but our evidence suggests that it possibly involves Wnt signalling. Also our experiments, concomitantly with data regarding Cyp26a1, seem to indicate that RA activity in the axial progenitors is only necessary during this transition, thus setting the time at which it occurs

The Role of networked robotic systems to survey coastal phenomena: the Douro river plume case study

Propagation of river plumes along the coast strongly depends on several physical processes, which determine the plume fate over the shelf. The Douro is one of the largest rivers of the Iberian Peninsula, representing the most important freshwater input into the Atlantic Ocean on the northwestern Portuguese coast. Traditional methods of in situ measurements are often complicated and expensive due to the high spatial and temporal variability of its dominant drivers. By now, the general dispersion patterns of the Douro River Plume was mostly studied by numerical models and remote sensing imagery, considering the main drivers involved: river discharge, wind, and tide. From those results, the Douro River plume is classified as large-scale and surface-advected, presenting characteristics of a prototypical plume. The wind was found to play an essential role in the plume dispersion and fate. For example, southerly winds increase the velocity of the northward current, frequently merging the Douro plume with the northerly generated Minho plume. Both riverine water masses can propagate to the Rias Baixas (Spain), dramatically changing their normal circulation. By these reasons, the development of accurate and reliable plume monitoring systems is an important and challenging task. This work reports the recent use of robotic systems (AUVs and UAVs) to detect, track and survey the Douro Plume front autonomously. These systems can survey this highly dynamic environment and characterize the frontal regions of the plume regarding salinity, water temperature, turbidity, and chlorophyll concentrations under summer conditions when the plume area is small and mainly tidally driven. Results from several frontal crossings, coincident with satellite imagery acquisitions (some of which were obtained in near real-time by the new Sentinel-2 mission), demonstrated the AUVs capability to fairly detect the front structure. Cross-frontal exchanges observed in the water column by AUVs along the front emphasize the importance of new technologies use on the monitoring and detection of high spatial and temporal dynamical phenomena such as river plumes.Peer Reviewe

Eficiência energética e geração fotovoltaica em condomínios

Tese de mestrado integrado, Engenharia da Energia e do Ambiente, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2020Os efeitos das alterações climáticas são cada vez mais visíveis e requerem uma mudança do paradigma energético para criar um sistema mais eficiente e sustentável, baseado no uso de fontes de energia renováveis que permitem reduzir as emissões de gases efeito estufa no sector energético. A União Europeia está focada em atingir a neutralidade carbónica até 2050 e para isso criou o Pacote Legislativo “Energia Limpa para Todos os Europeus” que prevê a implementação de práticas como a partilha de energia renovável através de Comunidade de Energia. Este é um conceito recente e amplamente debatido na comunidade científica pelo seu elevado potencial na descentralização do sistema elétrico e da democratização do mercado de energia. Esta realidade já se encontra prevista na legislação portuguesa com a criação do Decreto-Lei nº162/2019 de 25 de outubro de 2019. Esta dissertação foca-se em demonstrar esse potencial, especialmente para casos de grandes edifícios domésticos, através de uma análise exaustiva da literatura atual, assim como, em conjunto com a Coopérnico, estudar o caso de um condomínio localizado em Lisboa constituído por oito edifícios e cerca de 150 habitações que dispõe de um sistema fotovoltaico previamente instalado, de modo a obter um conjunto de ferramentas que auxiliem o desenvolvimento e implementação destas entidades, tais como dois manuais que elucidam sobre os requerimentos legais no processo inicial de inscrição no Portal Aplicacional da DGEG, para autoconsumo coletivo e comunidades de energia renovável, associados a uma ferramenta Excel que permite simular o seu funcionamento e representar os seus benefícios económicos. A análise preliminar, baseada nas faturas mensais, revelou que o presente sistema deste condomínio, instalado em dezembro de 2019, foi capaz de amortizar os consumos energéticos das partes comuns de todos os edifícios em cerca de 20% Esta fase inicial de trabalhos permitiu também o planeamento da ampliação do sistema PV que maximize a área disponível dos telhados, sugerindo um sistema que totaliza uma potência de pico igual a 52.2 kWp. Para verificar e exemplificar a utilização da ferramenta criada foram simulados três cenários ilustradores diferentes situações que podem surgir para estes autoconsumos coletivos constituídos por grandes condomínios. O primeiro considera-se a partilha de energia apenas entre as diferentes habitações sem injeção de potência na rede elétrica de serviço público, que apresenta um período de retorno de cerca de 4 anos e taxas de consumo na ordem de 75%. No segundo caso, considera-se injeção de potência na rede, que apresenta um período de retorno de mais de 7 anos devido à necessidade de pagar taxas de utilização da rede no nível BTN. No terceiro cenário considera-se a combinação dos consumos domésticos com as partes comuns do condomínio, cenário mais proveitoso, com período de retorno de 3.7 anos e taxa de autoconsumo de 88%.The increasing effects of climate change require a shift in the energy paradigm to create a more efficient and sustainable system, based on the use of renewable energy to reduce greenhouse gas emissions in the sector. The European Union is focused on achieving carbon neutrality by 2050 and, to this end it has created the “Legislative Package Clean Energy for All Europeans” which provides for the implementation of practices such as energy sharing through Energy Communities. This is a recent and widely debated concept in the scientific community for its high potential in the decentralization of the electric system and the democratization of the energy market. This reality is already foreseen in the Portuguese legislation with the creation of Decreto-Lei n.º162/2019 of October 25, 2019. This dissertation focuses on demonstrating this potential, especially for cases of large residential buildings, through an comprehensive analysis of current literature, as well as, together with the solar cooperative Coopérnico, study the case of a condominium located in Lisbon consisting of eight buildings with about 150 dwellings with a previously installed photovoltaic system to obtain a set of tools that assist the development and implementation of these entities, including two tutorials that clarify the legal requirements in the initial registration process in the DGEG Application Portal, for collective self-consumption and renewable energy communities, associated with an software tool that allows to simulate its operation and economic benefits. The preliminary analysis, based on the monthly electricity bills, of this work revealed that the present photovoltaic system, installed in December 2019, was able to satisfy the energy consumption of the common parts of all buildings by approximately 20%. This initial phase of work also allowed planning the expansion of the PV system that maximizes the available area of the roofs, recommending a system that totals a peak power equal to 52.2 kWp. To verify and exemplify the use of the software tool created, three scenarios were simulated that intend to illustrate different situations that may arise for these collective self-consumptions consisting of large condominiums. The first addresses the sharing of energy between the different dwellings without injection of power in the public service electric network, which represents a payback period of about 4 years and a self-consumption rate close to 75%. The second case considers injection of power in the network, which represents a payback period longer than 7 years due to the necessity of paying tax related to the utilization of the public grid in the BTN tension level. The third considers the combination of household consumption with the common parts of the condominium, which is the most profitable, with a payback period of 3.7 years and a self-consumption rate of 88%

Evaluation of the protective effect of Hypericum perforatum phenolics compounds, in the toxicity induced by heterologous expression of α-synuclein

Parkinson’s disease (PD), first described by James Parkinson in 1817, is a chronic, progressive neurodegenerative disorder. The pathologic hallmark is a deterioration of the substantia nigra of yet unknown causes, resulting in a deficiency of dopamine, an important neurotransmitter for the basal ganglia circuit and the presence of cytoplasmic eosinophilic inclusions named Lewy bodies, in which α-synuclein is the major constituent. Recent work implicates abnormal protein accumulation, protein phosphorylation, mitochondrial dysfunction and oxidative stress as common pathways implicated in PD pathogenesis. Polyphenolic compounds are commonly found in both edible and medicinal plants, and they have been reported to have multiple biological effects, including antioxidant activity. The budding yeast Saccharomyces cerevisiae has been used as a model to study several neurodegenerative diseases, including biological function of α-synuclein, as well as its toxicity. The heterologous expression of wild-type and A53T mutant form of α-synuclein causes toxicity in cells. Therefore, the aim of this study was to evaluate the possible protective effect of Hypericum perforatum phenolic compounds (quercetin, kaempferol and biapigenine), in the toxicity induced by the heterologous expression of α-synuclein, using the yeast Saccharomyces cerevisiae as a model. Preliminary results indicate that the presence of these phenolic compounds decrease the protein accumulation in cells expressing α-synuclein. We concluded that these phenolic compounds apparently have beneficial biological properties that consequently could have a potential use in preventing Parkinson’s disease.Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT

Como construir um modelo híbrido de previsão para o S&P500 usando um modelo VECM com um algoritmo LSTM?

A previsão de séries financeiras faz parte do processo de decisão das políticas monetárias por parte dos bancos centrais. Mendes, Ferreira e Mendes (2020) propõem um modelo híbrido que junta um VECM (modelo vetorial corretor de erro) com um algoritmo de aprendizagem profunda o LSTM (memória de longo curto-prazo) para uma previsão multivariada do índice acionista norte-americano S&P500, utilizando-se as séries do Nasdaq, Dow Jones e as taxas de juro dos bilhetes do tesouro americano a 3 meses no mercado secundário, com dados semanais, entre 19/04/2019 e 17/04/2020. Nesta dissertação, replicou-se esse artigo e construiu-se um modelo híbrido semelhante com a mesma finalidade e obteve-se um erro de previsão MAPE 86% inferior (4% versus 28%), mesmo incluindo a crise da COVID-19. Analisou-se o período sem crise e obteve-se um MAPE de 1.9%. Verificou-se que o vazamento de dados entre os períodos de teste e treino é um problema que prejudica os resultados. Comparou-se diferentes formas de construir o modelo híbrido variando o número de desfasamentos e de épocas de treino no LSTM, verificou-se o impacto de logaritmizar as séries, e comparou-se com modelos de referência (LSTM univariado/multivariado). Além disso, testou-se a causalidade à Granger entre os períodos com forte intervenção por parte da FED (décadas de 70 e 80, e crise da COVID-19 em fevereiro de 2020), concluindo-se que a variação das taxas de juro causam à Granger os retornos dos índices acionistas analisados, invertendo-se essa relação causal fora desses períodos.The forecasting of financial series is part of the decision-making process of monetary policies by central banks. Mendes, Ferreira and Mendes (2020) proposed a hybrid model that combines a VECM (Vector Error Correction Model) with a deep learning algorithm LSTM (Long Short-Term Memory) for a multivariate forecast of the U.S. stock index S&P500, using Nasdaq, Dow Jones and U.S. treasury bills for 3 months yields of the secondary market series, with weekly data, between 19/04/2019 and 17/04/2020. In this dissertation, this article was replicated, and a similar hybrid model was constructed with the same purpose and an 86% lower MAPE forecast error was obtained (4% versus 28%), even including the COVID-19 crisis. The time period without the crisis was analyzed and a MAPE of 1.9% was obtained. It was found that data leakage between the test and training periods is a problem that impairs the results. Different ways of constructing the hybrid model were compared by varying the number of lags and training epochs in LSTM, the impact of using the log-series was verified, and benchmarking with univariate and multivariate LSTM was made. In addition, granger causality was tested between the time periods with strong intervention by the FED (1970s and 1980s, and the COVID-19 crisis in February 2020) concluding that the changes in yields Granger cause the stock indices returns. In contrast, this causal relationship outside these time periods was the opposite, with the indices returns causing the changes in yields

A comparison of direct macrofaunal mortality using three types of clam dredges

The white clam Spisula solida is harvested along the entire coast of Portugal using mechanical dredges. In this study, the total direct mortality of the macrobenthic community caused by three types of clam dredges (north dredge—ND, traditional dredge—TD, and the metallic grid dredge—GD) used in the S. solida fishery was determined and compared. The relationship between mortality and catching efficiency for each type of dredge was also assessed. Our results showed significant differences for total direct mortality between the ND and both the GD and TD dredges. This difference was largely attributed to the mortality of animals that died in the dredge track as a direct result of the physical damage inflicted by the dredge passing. It was also found that the damage to uncaught individuals is directly related to gear efficiency. The lower catching efficiency of the ND (64%) led to a higher proportion of damaged individuals being left in the dredge path, when compared with the more efficient GD (98%) and TD (90%) dredges. Short and long-term implications of the impact of dredging on the composition of benthic communities are discussed. From fisheries management and ecological points of view, there are obvious advantages to introduce into the bivalve dredge fisheries more efficient and selective dredges in order to reduce the number of damaged individuals and by-catch, and consequently decreasing the impact on the macrobenthic communities

Novi soj bakterije, izoliran iz bolivijskog slanog jezera, prikladan za proizvodnju poli[(R)-3-hidroksibutirata]

Poly[(R)-3-hydroxybutyrate] (PHB) constitutes a biopolymer synthesized from renewable resources by various microorganisms. This work focuses on finding a new PHB-producing bacterium capable of growing in conventional media used for industrial biopolymer production, its taxonomical identification, and characterization of its biopolymer. Thus, a bacterial isolation process was carried out from environmental samples of water and mud. Among the isolates, strain S29 was selected and used in a fed-batch fermentation to generate a biopolymer. This biopolymer was recovered and identified as PHB homopolymer. Surprisingly, it featured several fractions of different molecular masses, and thermal properties unusual for PHB. Hence, the microorganism S29, genetically identified as a new strain of Bacillus megaterium, proved to be interesting not only due to its growth and PHB accumulation kinetics under the investigated cultivation conditions, but also due to the thermal properties of the produced PHB.Poli[(R)-3-hidroksibutirat] (PHB) je biopolimer kojega sintetiziraju različiti mikroorganizmi iz obnovljivih izvora. Težište je rada bilo na pronalasku novog soja bakterije koji može proizvesti PHB na različitim industrijskom podlogama, te provesti taksonomsku identifikaciju soja i karakterizaciju biopolimera. Stoga su iz uzoraka vode i mulja izolirani sojevi bakterija, te je šaržnim postupkom fermentacije s pritokom supstrata pomoću odabranog soja S29 proizveden biopolimer, kasnije određen kao homopolimer PHB. Iznenađujuće je što je biopolimer imao više frakcija različitih molekularnih masa i termička svojstva neuobičajena za PHB. Time je potvrđeno da je novi soj bakterije Bacillus megaterium S29 zanimljiv ne samo zbog kinetičkih značajki rasta i akumulacije PHB, već i zbog termičkih svojstava proizvedenog biopolimera

Age-Related Changes of the Synucleins Profile in the Mouse Retina

OK Funding Information: This research was funded by Fundação para a Ciência e a Tecnologia, grant number PTDC/MED-PAT/29656/2017. L.S. was funded by FCT PhD studentship (SFRH/BD/144743). Additionally, it was supported by iNOVA4Health—UIDB/04462/2020 and UIDP/04462/2020 and by the Associated Laboratory LS4FUTURE (LA/P/0087/2020), two programs financially supported by Fundação para a Ciência e Tecnologia/Ministério da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior. This work was developed with the support from the research infrastructure Congento, co-financed by Lisboa Regional Operational Programme (Lisboa2020), under the PORTUGAL 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development Fund (ERDF) and Fundação para a Ciência e Tecnologia (Portugal) under the project LISBOA-01-0145-FEDER-022170. Publisher Copyright: © 2023 by the authors.Alpha-synuclein (aSyn) plays a central role in Parkinson’s disease (PD) and has been extensively studied in the brain. This protein is part of the synuclein family, which is also composed of beta-synuclein (bSyn) and gamma-synuclein (gSyn). In addition to its neurotoxic role, synucleins have important functions in the nervous system, modulating synaptic transmission. Synucleins are expressed in the retina, but they have been poorly characterized. However, there is evidence that they are important for visual function and that they can play a role in retinal degeneration. This study aimed to profile synucleins in the retina of naturally aged mice and to correlate their patterns with specific retinal cells. With aging, we observed a decrease in the thickness of specific retinal layers, accompanied by an increase in glial reactivity. Moreover, the aSyn levels decreased, whereas bSyn increased with aging. The colocalization of both proteins was decreased in the inner plexiform layer (IPL) of the aged retina. gSyn presented an age-related decrease at the inner nuclear layer but was not significantly changed in the ganglion cell layer. The synaptic marker synaptophysin was shown to be preferentially colocalized with aSyn in the IPL with aging. At the same time, aSyn was found to exist at the presynaptic endings of bipolar cells and was affected by aging. Overall, this study suggests that physiological aging can be responsible for changes in the retinal tissue, implicating functional alterations that could affect synuclein family function.publishersversionpublishe