A method for continuous-range sequence analysis with jensen-shannon divergence

Mutual Information (MI) is a useful Information Theory tool for the recognition of mutual dependence between data sets. Several methods have been developed fore estimation of MI when both data sets are of the discrete type or when both are of the continuous type. However, MI estimation between a discrete range data set and a continuous range data set has not received so much attention. We therefore present here a method for the estimation of MI for this case, based on the kernel density approximation. This calculation may be of interest in diverse contexts. Since MI is closely related to the Jensen Shannon divergence, the method developed here is of particular interest in the problems of sequence segmentation and set comparisons.Fil: Re, Miguel Angel. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomia y Física. Sección Física. Grupo de Física de la Atmosfera; ArgentinaFil: Aguirre Varela, Guillermo Gabriel. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomia y Física. Sección Física. Grupo de Física de la Atmosfera; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentin

En la soledad del taxi: Los conductores víctimas mortales del terrorismo de ETA

In the following article, the authors analyse the assassination of taxi drivers by the terrorist group ETA. Based on primary sources, they consider the attacks against these workers as a form of social control through the dissemination of fear to which ETA subjected those members of the public who might have had any contact with the state security forces. Likewise, the constant harassment of the taxi trade was part of a strategy aimed at isolating police officers and the Guardia Civil, creating a vacuum and hostile opposition around them.En el siguiente artículo, los autores analizan el asesinato de taxistas por parte de la banda terrorista ETA. A partir de fuentes primarias, se analiza como los atentados de los taxistas constituyeron una herramienta de control utilizada por la organización terrorista para conseguir someter a la ciudadanía a un régimen de terror. Asimismo, el acoso constante al gremio del taxi fue parte de una estrategia que tuvo como objetivo aislar a los agentes de la Policía y de la Guardia Civil, creando a su alrededor un vacío y una oposición hostil

Identificación y caracterización de unidades de paisaje del área de influencia del corredor Córdoba - Carlos Paz para el planeamiento territorial

El corredor vial (RN20) que conecta las ciudades de Córdoba con Carlos Paz cumple un importante rol turístico y posee valorables cualidades paisajístico-ambientales. Actualmente está experimentando una rápida dinámica de cambio en el carácter del paisaje ocasionada en parte por los asentamientos exurbanos de la ciudad de Córdoba que a manera de islas o parches surgen sobre el territorio rural. El estudio del sector por parte de un equipo interdisciplinario mediante la definición, descripción, y modelado tridimensional de tipos y áreas de carácter del paisaje, servirá para una comprensión más ajustada de la conformación del territorio, permitiendo la generación de hipótesis sobre su estructura y función, y contribuyendo a la planificación del área metropolitana de Córdoba. El método de Estudio del Carácter del Paisaje se utiliza en Inglaterra y Escocia desde hace 15 años y desde el año 2000 forma parte del Convenio Europeo del Paisaje. La adaptación y aplicación del método a la realidad local permitirá la incorporación de una herramienta de interpretación del territorio que integra las clasificaciones de paisaje tradicionales con la percepción, acercando de esta manera la información a los pobladores. Se agregará como una innovación el modelado tridimensional y la visualización de los tipos de carácter de paisaje definidos. El logro del proyecto será el diseño de mapas con la descripción de los tipos y áreas de carácter del paisaje, la detección de los elementos clave que lo forman, y la generación de imágenes que a manera de modelos simples favorecerán la participación y estimularán el emponderamiento de la población. También se contribuirá a la comprensión de la estructura de la periferia urbana y de los factores que hacen a su calidad paisajística, los que deben ser protegidos por su carácter de bien público. Los datos obtenidos servirán para, en una segunda instancia y mediante el análisis de series temporales, modelar la dinámica del paisaje permitiendo obtener imágenes fotorrealistas de su evolución que se valorarán mediante técnicas participativas.Fil: Martiarena, Miguel Ángel. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Arquitectura; ArgentinaFil: Re, Gustavo Enrique. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Arquitectura; ArgentinaFil: Eynard, María Cecilia. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Arquitectura; Argentin

Identificación y caracterización de unidades de paisaje del área de influencia del corredor Córdoba-Carlos Paz para el planeamiento territorial

El corredor vial (RN20) que conecta las ciudades de Córdoba con Carlos Paz cumple un importante rol turístico y posee valorables cualidades paisajístico-ambientales. Actualmente está experimentando una rápida dinámica de cambio en el carácter del paisaje ocasionada en parte por los asentamientos exurbanos de la ciudad de Córdoba, que a manera de islas o parches, surgen sobre el territorio rural. El estudio del sector por parte de un equipo interdisciplinario mediante la definición, descripción, y modelado tridimensional de tipos y áreas de carácter del paisaje, servirá para una comprensión más ajustada de la conformación del territorio, permitiendo la generación de hipótesis sobre su estructura y función, y contribuyendo a la planificación del área metropolitana de Córdoba. El método de Estudio del Carácter del Paisaje se utiliza en Inglaterra y Escocia desde hace 15 años y desde el año 2000 forma parte del Convenio Europeo del Paisaje. La adaptación y aplicación del método a la realidad local permitirá la incorporación de una herramienta de interpretación del territorio que integra las clasificaciones de paisaje tradicionales con la percepción, acercando de esta manera la información a los pobladores. Se agregará como una innovación el modelado tridimensional y la visualización de los tipos de carácter de paisaje definidos. El logro del proyecto será el diseño de mapas con la descripción de los tipos y áreas de carácter del paisaje, la detección de los elementos clave que lo forman, y la generación de imágenes que a manera de modelos simples favorecerán la participación y estimularán el emponderamiento de la población. También se contribuirá a la comprensión de la estructura de la periferia urbana y de los factores que hacen a su calidad paisajística, los que deben ser protegidos por su carácter de bien público. Los datos obtenidos servirán para, en una segunda instancia y mediante el análisis de series temporales, modelar la dinámica del paisaje permitiendo obtener imágenes fotorrealistas de su evolución que se valorarán mediante técnicas participativasFil: Martiarena, Miguel Ángel. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Arquitectura; ArgentinaFil: Re, Gustavo Enrique. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Arquitectura; ArgentinaFil: Eynard, María Cecilia. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Arquitectura; Argentin

Identificación y caracterización de unidades de paisaje del área de influencia del corredor Córdoba-Carlos Paz para el planeamiento territorial

El corredor vial (RN20) que conecta las ciudades de Córdoba con Carlos Paz cumple un importante rol turístico y posee valorables cualidades paisajístico-ambientales. Actualmente está experimentando una rápida dinámica de cambio en el carácter del paisaje ocasionada en parte por los asentamientos exurbanos de la ciudad de Córdoba, que a manera de islas o parches, surgen sobre el territorio rural. El estudio del sector por parte de un equipo interdisciplinario mediante la definición, descripción, y modelado tridimensional de tipos y áreas de carácter del paisaje, servirá para una comprensión más ajustada de la conformación del territorio, permitiendo la generación de hipótesis sobre su estructura y función, y contribuyendo a la planificación del área metropolitana de Córdoba. El método de Estudio del Carácter del Paisaje se utiliza en Inglaterra y Escocia desde hace 15 años y desde el año 2000 forma parte del Convenio Europeo del Paisaje. La adaptación y aplicación del método a la realidad local permitirá la incorporación de una herramienta de interpretación del territorio que integra las clasificaciones de paisaje tradicionales con la percepción, acercando de esta manera la información a los pobladores. Se agregará como una innovación el modelado tridimensional y la visualización de los tipos de carácter de paisaje definidos. El logro del proyecto será el diseño de mapas con la descripción de los tipos y áreas de carácter del paisaje, la detección de los elementos clave que lo forman, y la generación de imágenes que a manera de modelos simples favorecerán la participación y estimularán el emponderamiento de la población. También se contribuirá a la comprensión de la estructura de la periferia urbana y de los factores que hacen a su calidad paisajística, los que deben ser protegidos por su carácter de bien público. Los datos obtenidos servirán para, en una segunda instancia y mediante el análisis de series temporales, modelar la dinámica del paisaje permitiendo obtener imágenes fotorrealistas de su evolución que se valorarán mediante técnicas participativasFil: Martiarena, Miguel Ángel. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Arquitectura; ArgentinaFil: Re, Gustavo Enrique. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Arquitectura; ArgentinaFil: Eynard, María Cecilia. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Arquitectura; Argentin

The Plasmodium falciparum, Nima-related kinase Pfnek-4: a marker for asexual parasites committed to sexual differentiation

<b>Background</b> Malaria parasites undergo, in the vertebrate host, a developmental switch from asexual replication to sexual differentiation leading to the formation of gametocytes, the only form able to survive in the mosquito vector. Regulation of the onset of the sexual phase remains largely unknown and represents an important gap in the understanding of the parasite's complex biology. <b>Methods:</b> The expression and function of the Nima-related kinase Pfnek-4 during the early sexual development of the human malaria parasite Plasmodium falciparum were investigated, using three types of transgenic Plasmodium falciparum 3D7 lines: (i) episomally expressing a Pfnek-4-GFP fusion protein under the control of its cognate pfnek-4 promoter; (ii) episomally expressing negative or positive selectable markers, yeast cytosine deaminase-uridyl phosphoribosyl transferase, or human dihydrofolate reductase, under the control of the pfnek-4 promoter; and (iii) lacking a functional pfnek-4 gene. Parasite transfectants were analysed by fluorescence microscopy and flow cytometry. In vitro growth rate and gametocyte formation were determined by Giemsa-stained blood smears. <b>Results:</b> The Pfnek-4-GFP protein was found to be expressed in stage II to V gametocytes and, unexpectedly, in a subset of asexual-stage parasites undergoing schizogony. Culture conditions stimulating gametocyte formation resulted in significant increase of this schizont subpopulation. Moreover, sorted asexual parasites expressing the Pfnek-4-GFP protein displayed elevated gametocyte formation when returned to in vitro culture in presence of fresh red blood cells, when compared to GFP- parasites from the same initial population. Negative selection of asexual parasites expressing pfnek-4 showed a marginal reduction in growth rate, whereas positive selection caused a marked reduction in parasitaemia, but was not sufficient to completely abolish proliferation. Pfnek-4- clones are not affected in their asexual growth and produced normal numbers of stage V gametocytes. <b>Conclusions:</b> The results indicate that Pfnek-4 is not strictly gametocyte-specific, and is expressed in a small subset of asexual parasites displaying high rate conversion to sexual development. Pfnek-4 is not required for erythrocytic schizogony and gametocytogenesis. This is the first study to report the use of a molecular marker for the sorting of sexually-committed schizont stage P. falciparum parasites, which opens the way to molecular characterization of this pre-differentiated subpopulation

Using zeta-potential measurements to quantify peptide partition to lipid membranes

© The Author(s) 2011. This article is published with open access at Springerlink.com.Open Access: This article is distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Noncommercial License which permits any noncommercial use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author(s) and source are credited.Many cellular phenomena occur on the biomembranes. There are plenty of molecules (natural or xenobiotics) that interact directly or partially with the cell membrane. Biomolecules, such as several peptides (e.g., antimicrobial peptides) and proteins, exert their effects at the cell membrane level. This feature makes necessary investigating their interactions with lipids to clarify their mechanisms of action and side effects necessary. The determination of molecular lipid/water partition constants (Kp) is frequently used to quantify the extension of the interaction. The determination of this parameter has been achieved by using different methodologies, such as UV-Vis absorption spectrophotometry, fluorescence spectroscopy and ζ-potential measurements. In this work, we derived and tested a mathematical model to determine the Kp from ζ-potential data. The values obtained with this method were compared with those obtained by fluorescence spectroscopy, which is a regular technique used to quantify the interaction of intrinsically fluorescent peptides with selected biomembrane model systems. Two antimicrobial peptides (BP100 and pepR) were evaluated by this new method. The results obtained by this new methodology show that ζ-potential is a powerful technique to quantify peptide/lipid interactions of a wide variety of charged molecules, overcoming some of the limitations inherent to other techniques, such as the need for fluorescent labeling.This work was partially supported by project PTDC/QUI/ 69937/2006 from Fundação para a Ciência e Tecnologia-Ministério da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior (FCT-MCTES, Portugal), and by Fundação Calouste Gulbenkian (Portugal). JMF and MMD also thank FCT-MCTES for grants IMM/BT/37-2010 and SFRH/BD/41750/2007, respectively

The challenge of sustainability: Long-term results from the Fifty-Fifty peer group-based intervention in cardiovascular risk factors.

The Fifty-Fifty trial demonstrated that a peer-group-based intervention was able to improve healthy behaviors in individuals with cardiovascular (CV) risk factors immediately post-intervention. To determine the long-term sustainability of a one-year peer-group-based intervention focused on CV health and behavior. A total of 543 adults aged 25 to 50 years with at least 1 CV risk factor were screened and recruited, received initial training through workshops, and were then randomized 1:1 to a peer-group-based intervention group (IG) or a self-management control group (CG) for 12 months. At a median of 52 months from baseline, 321 participants were re-assessed (~60% retention). The primary outcome was the mean change in a composite health score related to blood pressure, exercise, weight, alimentation, and tobacco use (Fuster-BEWAT score [FBS], range 0-15). Intervention effects were assessed using linear-mixed effects models. The mean age of retained participants was 48.0 years (SD: 5.4), and 73% were female. Consistent with previous results, the change of overall FBS was significantly greater in the IG than in the CG at 12-month follow-up (between-group difference, 0.60 points; 95% CI, 0.08-1.12; P = .025). Assessment of long-term sustainability (52-month follow-up) showed that there were no between-group differences in the mean overall FBS (IG mean score, 8.52; 95% CI, 7.97-9.07 vs CG mean score, 8.51; 95% CI, 7.93-9.10; P = .972) or in the change of overall FBS from screening (IG mean change, 0.64; 95% CI, 0.00-1.28; CG mean change, 0.46; 95% CI, -0.20-1.12; P = .497). A one-year peer-group-based intervention showed favorable results at immediate post-intervention but did not demonstrate significant differences between the IG and CG at 52 months. Combination of an initial training period (workshops) with the maintenance of peer-support groups or other re-intervention strategies may be required to achieve sustained effects on healthy behaviors. ClinicalTrials.gov identifier NCT02367963. Registered (https://clinicaltrials.gov/show/NCT02367963).This study was co-funded by the SHE Foundation -“la Caixa” Foundation (LCF/PR/CE16/10700001 and LCF/PR/MS19/12220001) and the Ministry of Health, Social Services and Equality. R.F-J is recipient of funding from the Instituto de Salud Carlos III-Fondo de Investigacion Sanitaria (PI19/01704) co-funded by the European Regional Development Fund/European Social Fund (“A way to make Europe”/“Investing in your future”). The CNIC is supported by the Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), the Ministry of Science and Innovation, and the Pro CNIC Foundation and is a Severo Ochoa Center of Excellence (SEV-2015-0505).S