Development of a framework for the classification of antibiotics adjuvants

Dissertação de mestrado em BioInformaticsThroughout the last decades, bacteria have become increasingly resistant to available antibiotics, leading to a growing need for new antibiotics and new drug development methodologies. In the last 40 years, there are no records of the development of new antibiotics, which has begun to shorten possible alternatives. Therefore, finding new antibiotics and bringing them to market is increasingly challenging. One approach is finding compounds that restore or leverage the activity of existing antibiotics against biofilm bacteria. As the information in this field is very limited and there is no database regarding this theme, machine learning models were used to predict the relevance of the documents regarding adjuvants. In this project, the BIOFILMad - Catalog of antimicrobial adjuvants to tackle biofilms application was developed to help researchers save time in their daily research. This application was constructed using Django and Django REST Framework for the backend and React for the frontend. As for the backend, a database needed to be constructed since no database entirely focuses on this topic. For that, a machine learning model was trained to help us classify articles. Three different algorithms were used, Support-Vector Machine (SVM), Random Forest (RF), and Logistic Regression (LR), combined with a different number of features used, more precisely, 945 and 1890. When analyzing all metrics, model LR-1 performed the best for classifying relevant documents with an accuracy score of 0.8461, a recall score of 0.6170, an f1-score of 0.6904, and a precision score of 0.7837. This model is the best at correctly predicting the relevant documents, as proven by the higher recall score compared to the other models. With this model, our database was populated with relevant information. Our backend has a unique feature, the aggregation feature constructed with Named Entity Recognition (NER). The goal is to identify specific entity types, in our case, it identifies CHEMICAL and DISEASE. An association between these entities was made, thus delivering the user the respective associations, saving researchers time. For example, a researcher can see with which compounds "pseudomonas aeruginosa" has already been tested thanks to this aggregation feature. The frontend was implemented so the user could access this aggregation feature, see the articles present in the database, use the machine learning models to classify new documents, and insert them in the database if they are relevant.Ao longo das últimas décadas, as bactérias tornaram-se cada vez mais resistentes aos antibióticos disponíveis, levando a uma crescente necessidade de novos antibióticos e novas metodologias de desenvolvimento de medicamentos. Nos últimos 40 anos, não há registos do desenvolvimento de novos antibióticos, o que começa a reduzir as alternativas possíveis. Portanto, criar novos antibióticos e torna-los disponíveis no mercado é cada vez mais desafiante. Uma abordagem é a descoberta de compostos que restaurem ou potencializem a atividade dos antibióticos existentes contra bactérias multirresistentes. Como as informações neste campo são muito limitadas e não há uma base de dados sobre este tema, modelos de Machine Learning foram utilizados para prever a relevância dos documentos acerca dos adjuvantes. Neste projeto, foi desenvolvida a aplicação BIOFILMad - Catalog of antimicrobial adjuvants to tackle biofilms para ajudar os investigadores a economizar tempo nas suas pesquisas. Esta aplicação foi construída usando o Django e Django REST Framework para o backend e React para o frontend. Quanto ao backend, foi necessário construir uma base de dados, pois não existe nenhuma que se concentre inteiramente neste tópico. Para isso, foi treinado um modelo machine learning para nos ajudar a classificar os artigos. Três algoritmos diferentes foram usados: Support-Vector Machine (SVM), Random Forest (RF) e Logistic Regression (LR), combinados com um número diferente de features, mais precisamente, 945 e 1890. Ao analisar todas as métricas, o modelo LR-1 teve o melhor desempenho para classificar artigos relevantes com uma accuracy de 0,8461, um recall de 0,6170, um f1-score de 0,6904 e uma precision de 0,7837. Este modelo foi o melhor a prever corretamente os artigos relevantes, comprovado pelo alto recall em comparação com os outros modelos. Com este modelo, a base de dados foi populda com informação relevante. O backend apresenta uma caracteristica particular, a agregação construída com Named-Entity-Recognition (NER). O objetivo é identificar tipos específicos de entidades, no nosso caso, identifica QUÍMICOS e DOENÇAS. Esta classificação serviu para formar associações entre entidades, demonstrando ao utilizador as respetivas associações feitas, permitindo economizar o tempo dos investigadores. Por exemplo, um investigador pode ver com quais compostos a "pseudomonas aeruginosa" já foi testada graças à funcionalidade de agregação. O frontend foi implementado para que o utilizador possa ter acesso a esta funcionalidade de agregação, ver os artigos presentes na base de dados, utilizar o modelo de machine learning para classificar novos artigos e inseri-los na base de dados caso sejam relevantes

Estresse no ambiente de trabalho: aplicação de um programa de intervenção com profissionais da saúde de uma Unidade de Terapia Intensiva

O presente trabalho foi realizado em 44 profissionais de saúde de uma Unidade de Terapia Intensiva (UTI) de um hospital particular. O objetivo do trabalho foi avaliar e melhorar o nível de estresse nos profissionais de saúde atuantes nessa UTI, através da realização de entrevistas semiestruturadas e aplicação de questionário de Escala de Estresse no Trabalho (EET) validado por Paschoal e Tamayo (2004), realização de um programa para alívio e prevenção do estresse ocupacional, e avaliação do impacto do programa após as intervenções. Para análise dos dados do questionário EET e comparação dos resultados antes e após o projeto foi utilizado o teste T pareado, e o teste T independente, sendo p≤0.05. Os resultados encontrados mostraram que o nível de estresse dos funcionários que participaram da pesquisa era baixo, com média de 1.97 (DP=.537), e irritação com discriminação/favoritismo no ambiente de trabalho foi o item encontrado com médias mais elevadas. Mesmo não havendo significância estatística nas médias encontradas a partir dos dados obtidos nos questionários dessa pesquisa, através da avaliação das entrevistas concluiu-se que a aplicação de programas de redução de níveis de estresse em UTI’s pode trazer benefícios para a saúde do profissional e para a empresa.The present study was carried out in 44 healthcare professionals of an Intensive Care Unit (ICU) of a private hospital. The objective of this study was to evaluate and improve the level of stress in the healthcare professionals working in this ICU, through semi-structured interviews and the application of a Work Stress Scale questionnaire validated by Paschoal and Tamayo (2004), a program for relief and prevention of occupational stress, and evaluation of the impact of the program after the interventions. For data analysis of the TSE questionnaire and comparison of the results before and after the project the paired T test was used, and the independent T test, being p≤0.05. The results showed that the level of stress of the employees who participated in the study was low, with an average of 1.97 (SD=.537), and irritation with discrimination / favoritism in the workplace was the item found with higher means. Even though there was no statistical significance in the averages found from the data obtained in the questionnaires of this research, through the evaluation of the interviews it was concluded that the application of programs to reduce stress levels in ICU’s can bring benefits to the health of the professional and to the company

Avaliação da fadiga e da qualidade de vida de pacientes com câncer colorretal em quimioterapia

Objetivo: Avaliar a fadiga e a qualidade de vida relacionada à saúde de pacientes com câncer colorretal em quimioterapia.Método:estudo descritivo, realizado com 69 pacientes entre janeiro a setembro/2019, em um hospital público de Minas Gerais. Instrumentos utilizados: questionário sociodemográfico e clínico, Quality of Life Questionnaire-Core30 e Escala de Fadiga de Piper, analisados segundo medidas de frequência, média e desvio padrão pelo softwarePSPP.Resultados: A maioria era mulheres, acima de 60 anos, casadas, aposentadas, donas de casa, com médio nível de escolaridade. Os escores de estado geral de saúde, das funções social, física, emocional e desempenho de papel foram considerados satisfatórios (médias 50-70), da função cognitiva foi boa (média>70); sintomas mais prevalentes foram perda de apetite, fadiga, dor e insônia. Quanto à fadiga, todas as dimensões tiveram média <4, considerado fadiga leve.Conclusão: A qualidade de vida apresentou escores satisfatórios e a fadiga foi classificada como leve nos pacientes em quimioterapia. Palavras-chave: Neoplasias colorretais. Qualidade de vida. Fadiga. Tratamentofarmacológico

Perceção de excesso de peso em adolescentes: contributos para a enfermagem de saúde escolar

Apresentação efetuada no VI Encontro de Benchmarking em Pediatria "A Saúde da Criança e do Adolescente na Comunidade", em Braga, Portugal, 2017Introdução: O excesso de peso tem vindo a assumir contornos preocupantes em Portugal e no mundo (Ng et al., 2014). Estudos recentes revelam que a sua prevalência ronda os 36% nos adolescentes portugueses (Lopes et al., 2017). Os adolescentes obesos são mais propensos a sofrer de depressão (Quek et al, 2017), particularmente as raparigas (Meagher et al, 2017). O programa nacional da saúde escolar (DGS, 2014), integra linhas orientadoras para a promoção da saúde na escola, de onde destacamos a alimentação e a atividade física. Objetivo: Avaliar as associações existentes entre a perceção de excesso de peso e o estado ponderal objetivamente monitorizado em adolescentes da região norte. Método: Este estudo integra um projeto mais alargado denominado “Saúde.Escola”. Participaram neste estudo transversal 311 adolescentes, 176 (56.6%) raparigas com idades compreendidas entre os 10 e os 18 anos, média (desvio padrão), 12.1 (1.8) anos, pertencentes a duas escolas da região norte. Os pais (ou representante legal) assinaram o consentimento informado e, os adolescentes assentiram em participar. Os adolescentes foram questionados sobre a sua perceção de excesso de peso e foram monitorizadas a massa corporal e a estatura. O que o estado pondera teve por base os pressuposto de Cole e colaboradores (2000). Procedeu-se à análise descritiva dos dados recolhidos e ao teste de Qui quadrado. Resultados: Dos adolescentes avaliados, 64 (20.6%) referiram ter excesso de peso, 39 (22.5%) raparigas. 128 (41.2%), apresentam excesso de peso objetivamente monitorizado, 69 (53.9%) raparigas. Das 39 raparigas que se percepcionam com excesso de peso, 36 (92.3%) apresentam-no objetivamente (Qui quadrado=60.9, p<.0001) e, dos 25 rapazes que se percepcionam, em todos se verifica excesso de peso (Qui quadrado=43.5, p<.0001). Analisando os dados sob uma outra perspetiva, da totalidade de raparigas com excesso de peso, 36 (53.7%) percepcionam-se desse modo. Por outro lado, dos 53 rapazes com excesso de peso, 28 (52.8%) não se percepcionam como tal. Conclusões/Recomendações: A percepção e a presença de excesso de peso são variáveis que se manifestam de diferente modo na rapariga e no rapaz adolescente, ainda que estejam correlacionadas entre si. A promoção da saúde do adolescente numa perspetiva global merece um olhar centrado na identidade do mesmo. O enfoque na alimentação, atividade física e outros determinantes de estilos de vida são particularmente relevantes não só para a prevenção do excesso de peso, como para a saúde e perceção de bem-estar do adolescente em contexto escolar.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

(Re)inventar a ação em creches: o contributo da formação de educadores de infância

Publicado em "Pedagogia para a autonomia – imaginar e fazer a mudança em tempos difíceis : 6º Encontro do Grupo de Trabalho-Pedagogia para a Autonomia (GT-PA) : atas". ISBN 978-989-8525-28-4Os desafios da atualidade impõem uma pedagogia emancipatória, crítica, tolerante na incerteza e assente numa articulação com a sociedade que se afigura heterogénea e composta de singularidades. O texto que apresentamos pretende analisar as potencialidades e constrangimentos sentidos pelas educadoras de infância numa experiência de educação e formação, que decorreu no âmbito de um estudo mais alargado, em desenvolvimento desde 2012, em creches da cidade de Braga. Dezoito educadoras de infância de sete creches participaram nas sessões de formação, desenvolvidas e dinamizadas por um grupo de investigadores/formadores da Escola Superior de Enfermagem, onde se abordaram conteúdos relacionados com o desenvolvimento infantil, diversificação alimentar e segurança e higiene alimentar. Privilegiámos processos reflexivos sobre e a partir da experiência dos participantes, com vista à sua (re)construção. Explorámos as representações das educadoras de infância, negociámos os conteúdos e as práticas de ensino e avaliação, num movimento de centralização no pensamento e ação das mesmas. No seu conjunto foi possível uma interrogação sobre as práticas vigentes nas creches e a criação de espaços de diálogo para a (re)construção do conhecimento e da ação. As educadoras, inspiradas pela formação, realizaram tarefas de experimentação da (in)formação partilhada, junto das crianças (e pais) nas creches, num processo cíclico de formação/ação. Procedemos a alguns reajustes ao plano inicialmente traçado, em função das necessidades e interesses das participantes. As educadoras revelaram entusiasmo e tiveram uma assiduidade total à formação

Nursing diagnostics in patients with arterial hypertension in primary care

RESUMO: Objetivo: Identificar diagnósticos de enfermagem (DEs) em portadores de hipertensão arterial atendidos na Unidade Básica de Saúde/UNIFAP. Metodologia: Estudo descritivo de abordagem quantitativa, realizado em uma unidade básica de saúde com portadores de Hipertensão Arterial Sistêmica cadastrados e acompanhados pelo programa de Doenças Crônicas do Ministério da Saúde, no período de janeiro à maio de 2017. Resultados: 25 hipertensos passaram por consulta de enfermagem, a maioria era do sexo feminino (56%), faixa etária que variava de 50 a 69 anos, média de idade 60,4 (±14) anos, casados (44%), não alfabetizados (40%) e de renda familiar de 1 a 2 salários mínimos (100%). Os diagnósticos de enfermagem mais frequentes foram : Risco de Função Cardiovascular  Prejudicada-100%; Estilo de Vida Sedentário-68%; Falta de Adesão-60%; Conhecimento deficiente-60% e Sobrepeso-48% Conclusão: A identificação dos diagnósticos de enfermagem, colabora para o avanço científico desta área e melhora o atendimento para o usuário hipertenso, pois promove um cuidado planejado, facilitando sua implementação e favorecendo a avaliação do mesmo, contribuindo para redução da morbimortalidade advinda de complicações da HAS, provenientes da falta de adesão pelos hipertensos na Atenção Primária.Objective: To identify nursing diagnostic (NDs) in patients with arterial hypertension treated at the Basic Health Unit / UNIFAP. Methodology: Descriptive study of a quantitative approach, performed in a basic health unit with patients with systemic arterial hypertension enrolled and monitored by the Chronic Diseases Program of the Ministry of Health, from January to May 2017.Resultados: Of the 25 hypertensive patients who underwent a nursing consultation, the majority were female (56%), ranging from 50 to 69 years, mean age 60.4 (± 14) years, married (44%) , Non-literate (40%) and family income of 1 to 2 minimum wages (100%). The most frequent nursing diagnostic were: Risk of Impaired Cardiovascular Function-100%; Sedentary Lifestyle-68%; Lack of adherence-60%; Deficiency of knowledge -60% and Overweight-48% Conclusion: The identification of nursing diagnostic contributes to the scientific progress of this area and improves care for the hypertensive user, since it promotes a planned care, facilitating its implementation and favoring the evaluation of the same , contributing to the reduction of morbidity and mortality due to the complications of  systemic arterial hypertension due to the lack of adherence by hypertensive patients in primary car

Associação entre letramento em saúde, ameaça pela COVID-19 e intenção vacinal de adolescentes brasileiros

Objetivo:&nbsp;investigar la influencia de la alfabetización en salud sobre la evaluación de la amenaza por COVID-19 y sobre la intención de los adolescentes brasileños de no vacunarse.&nbsp;Método:&nbsp;estudio transversal con 526 adolescentes brasileños entre 14 y 19 años. Se analizaron aspectos socioeconómicos, perfil epidemiológico, alfabetización en salud, amenaza a la salud por COVID-19 y la intención de no vacunarse mediante una relación bivariada y regresión lineal múltiple de respuesta de Poisson.&nbsp;Resultados:&nbsp;una elevada puntuación de alfabetización en salud (p=0,010), enfermedades cardiovasculares (p=0,006), menor nivel de renta (p=0,000) y vivir en la región norte (p=0,007) fueron factores que ayudaron a la sensación de mayor amenaza por COVID-19. La alfabetización en salud no influyó en la intención de no vacunarse (p=0,091), cuya prevalencia fue más baja entre los adolescentes del Sudeste en comparación con los del Norte (p=0,010), entre los que cursaban estudios superiores (p=0,049) y mayor nivel de renta (p=0,000).&nbsp;Conclusión:&nbsp;la alfabetización en salud influyó sobre la percepción de la amenaza de la enfermedad pero no en la intención de no vacunarse. La evaluación de la amenaza a la salud por COVID-19 y la prevalencia de la intención de no vacunarse fueron condicionadas por la región de residencia, nivel de renta y educación, acentuando la importancia de los determinantes sociales de la salud en este contexto.Objective:&nbsp;investigate the influence of health literacy on the assessment of COVID-19 threat to health and the intention not to be vaccinated among Brazilian adolescents.&nbsp;Method:&nbsp;cross-sectional study with 526 Brazilian adolescents aged 14 to 19 years. Socioeconomic aspects, health-disease profile, health literacy, health threat by COVID-19 and intention not to be vaccinated were analyzed by bivariate association and multiple linear regression with Poisson response. Results:&nbsp;higher health literacy score (p=0.010), cardiovascular disease (p=0.006), lower income (p=0.000), and living in the North region (p=0.007) were factors that contributed to feeling more threatened by COVID-19. Health literacy did not influence the intention not to be vaccinated (p=0.091), whose prevalence was lower among adolescents in the Southeast region when compared to those in the North region (p=0.010), among those who attended higher education (p=0,049) and those with higher income (p=0.000).&nbsp;Conclusion:&nbsp;health literacy influenced the perception of COVID-19 threat, but not the intention not to be vaccinated. Assessment of COVID-19 threat to health and prevalence of the intention not to be vaccinated were influenced by the region of residence, income, and education, which reinforces the importance of social determinants of health in this context.Objetivo:&nbsp;investigar a influência do letramento em saúde na avaliação da ameaça à saúde pela COVID-19 e sobre a intenção de não se vacinar de adolescentes brasileiros.&nbsp;Método:&nbsp;estudo transversal com 526 adolescentes brasileiros de 14 a 19 anos. Aspectos socioeconômicos, perfil saúde-doença, letramento em saúde, ameaça à saúde pela COVID-19 e intenção de não se vacinar foram analisados por associação bivariada e regressão linear múltipla com resposta Poisson.&nbsp;Resultados:&nbsp;maior pontuação de letramento em saúde (p=0,010), doença cardíaca (p=0,006), menor renda (p=0,000) e morar na região norte (p=0,007) foram fatores que contribuíram para o sentimento de maior ameaça pela COVID-19. O letramento em saúde não influenciou a intenção de não se vacinar (p=0,091), cuja prevalência foi menor entre os adolescentes do Sudeste quando comparados aos do Norte (p=0,010), entre os que cursavam o ensino superior (p=0,049) e entre aqueles com maior renda (p=0,000).&nbsp;Conclusão:&nbsp;letramento em saúde influenciou a percepção da ameaça da doença, mas não a intenção de não se vacinar. Avaliação da ameaça à saúde pela COVID-19 e a prevalência da intenção de não se vacinar foram influenciadas pela região de residência, renda e escolaridade, o que reforça a importância dos determinantes sociais da saúde nesse contexto

Integração da vigilância e atenção à saúde no tratamento da sífilis gestacional: análise dos indicadores do PQAVS e do Previne Brasil na Paraíba

Este artigo se baseia em um estudo feito com o objetivo de analisar indicadores sobre a testagem da sífilis na gestação no Programa de Qualificação das Ações de Vigilância em Saúde (PQAVS) e no Programa Previne Brasil no estado da Paraíba, e também de levantar aspectos do tratamento terapêutico para sífilis gestacional. Trata-se de uma pesquisa descritiva-exploratória, na qual foram sistematizados dados do indicador 11, testes por gestantes, do PQAVS e do indicador de desempenho da Atenção Primária à Saúde (APS), com base na proporção de gestantes que realizaram exames de sífilis e HIV durante o pré-natal em 2020; também foi feita a sistematização do webquestionário direcionado a profissionais da APS (médicos/enfermeiros) e autoaplicado sobre a atuação e tratamento terapêutico para sífilis gestacional. Dos 223 municípios da Paraíba, apenas 12% atingiram a meta do PQAVS e 39% a do Previne Brasil em 2020. Em relação ao webquestionário, houve a participação de 142 profissionais, dos quais 85% realizam o tratamento terapêutico preconizado pelo Ministério da Saúde para a APS. Desse modo, deve ser ressaltada a importância da ampliação da oferta de testes para sífilis, dos insumos para o tratamento adequado e da qualificação dos profissionais e da informação em saúde