Functional upgrading in China’s export processing sector

Functional upgrading occurs when a firm acquires more sophisticated functions within an existing value chain. In this paper, we analyze if there is evidence of this type of upgrading in China’s export processing regime by investigating dynamics in the relative prevalence of Import & Assembly (IA) versus Pure Assembly (PA) processing trade over the period 2000-2013. Firms in both regimes provide similar manufacturing services to foreign companies, but IA firms also conduct the sophisticated tasks of quality control, searching, financing and storing imported materials. Consistent with a trend of functional upgrading, we show that the share of IA trade in total processing trade has increased rapidly during the period 2000-2006, both overall and within product categories. Furthermore, we find that this trend has gone hand in hand with improvements in a sector’s labor productivity and unit values. Against expectations, we find that this process has slowed down notably during the period 2006-2013.status: publishe

Polygenic adaptation and negative selection across traits, years and environments in a long-lived plant species (Pinus pinaster Ait., Pinaceae)

17 Pág.A decade of genetic association studies in multiple organisms suggests that most complex traits are polygenic; that is, they have a genetic architecture determined by numerous loci, each with small effect-size. Thus, determining the degree of polygenicity and its variation across traits, environments and time is crucial to understand the genetic basis of phenotypic variation. We applied multilocus approaches to estimate the degree of polygenicity of fitness-related traits in a long-lived plant (Pinus pinaster Ait., maritime pine) and to analyse this variation across environments and years. We evaluated five categories of fitness-related traits (survival, height, phenology, functional, and biotic-stress response) in a clonal common-garden network planted in contrasted environments (over 20,500 trees). Most of the analysed traits showed evidence of local adaptation based on Qst -Fst comparisons. We further observed a remarkably stable degree of polygenicity, averaging 6% (range of 0%-27%), across traits, environments and years. We detected evidence of negative selection, which could explain, at least partially, the high degree of polygenicity. Because polygenic adaptation can occur rapidly, our results suggest that current predictions on the capacity of natural forest tree populations to adapt to new environments should be revised, especially in the current context of climate change.This study was funded by the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness through projects RTA2010-00120-C02- 02 (CLONAPIN), CGL2011-30182- C02- 01 (AdapCon) and AGL2012-40151- C03- 02 (FENOPIN). The study was also supported by the “Initiative d’Excellence (IdEx) de l’Université de Bordeaux - Chaires d'installation 2015” (EcoGenPin) and the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme under grant agreement No 773383 (B4EST)Peer reviewe

Vulnerabilidad y adaptación de la zona costera colombiana al ascenso acelerado del nivel del mar

El país posee una variada y dinámica zona costera, que alcanza 3340 Km de extensión y que comprende dos litorales, el Caribe y el pacífico, y un territorio insular en el que se incluye el Archipiélago de San Andrés y Providencia. En su zona de costa y plataforma continental se encuentran importantes ecosistemas como manglares, praderas de fanerógamas y arrecifes coralinos, distribuidas por sus costas bajas y estuarinas, bahías, ensenadas y las costas arenosas y acantiladas. Tanto su línea de costa alta, como las planicies litorales bajas y ecosistemas costeros serán afectados por el actual cambio climático, y en especial, por el ascenso acelerado del nivel del mar. Los efectos del potencial ascenso del nivel marino fueron evaluados mediante indicadores geomorfológicos y morfo- dinámicos, con base en la caracterización física del litoral, la evaluación de su susceptibilidad y la proyección de los posibles cambios biofísicos que causará el incremento en un metro del nivel del mar en los próximos 100 años. De acuerdo con esta evaluación, en las costas colombianas es posible la inundación permanente de 4900 Km2 de costas bajas, el encharcamiento fuerte a total anegamiento de 5100 Km2 de áreas costeras moderadamente susceptibles, así como el encharcamiento de zonas aledañas y la profundización de los cuerpos de agua localizados en la zona litoral y la plataforma. Igualmente causará el incremento de la erosión en zonas especialmente sensibles, donde la actividad antrópica a reducido la capacidad de amortiguación de los sistemas litorales. Sistemas naturales como las playas y marismas serán los mas afectados por la erosión y la inundación litoral de acuerdo con esta evaluación. Se pudo establecer que los potenciales cambios biofísicos que afectarán el litoral colombiano por el cambio del nivel del mar harán que parte importante de la población, las actividades económicas y la infraestructura vital del país sean amenazadas por la inundación marina. La población que se encuentra en áreas bajo amenaza por inundación alcanza aproximadamente 1.4 millones de habitantes del litoral, población que esta dominantemente asentada en el sector urbano (85%). Para el litoral Caribe, sólo el 9% de las viviendas urbanas presentan alta vulnerabilidad a la inundación, porcentaje que llega al 46% en el sector rural. En el litoral Pacífico, el 48% de las viviendas del sector urbano y 87% del sector rural son altamente vulnerables, sin embargo, debido a las tradiciones culturales gran porcentaje de ellas están construidas sobre palafitos, costumbre que facilitará la adaptación. En cuanto a la vulnerabilidad social de los hogares en el litoral Caribe el 74% son moderadamente vulnerables, el 17% altamente vulnerables y el 9% son poco vulnerables. En el litoral Pacífico los hogares con alta vulnerabilidad social alcanzan el 13%, son moderadamente vulnerables el 62% y el restante 25% tiene baja vulnerabilidad. Respecto a las actividades económicas, se analizaron los principales sectores económicos asentados en el litoral Caribe, donde se concentra preferencialmente la infraestructura industrial y portuaria. El análisis de los elementos socioeconómicos permitió concluir que en el sector agropecuario, de las 1.533.290 Has de cultivos y pastos reportadas el 21% están expuestas a los diferentes grados de amenaza por inundación, de las cuales el 49% presentan alta vulnerabilidad y que está representada en cultivos de banano y palma africana principalmente. En el sector industrial, se encontró que el 75.3% (475 Has) del área ocupada por los establecimientos manufactureros en Barranquilla y el 99.7% (877 Has) en Cartagena son de alta vulnerabilidad. Para la infraestructura vial se considera que el 44.8% de la infraestructura vial terrestre tiene alta vulnerabilidad, el 5.2% vulnerabilidad moderada y el 22.7% es poco vulnerable. En las zonas insulares se analizó la vulnerabilidad de la isla de San Andrés, ubicada en el mar Caribe y que hace parte de un extenso archipiélago coralino de 52.2. km2. La isla de San Andrés cubre un área de 27 Km2, de los cuales el 17% sería inundado por un ascenso proyectado de 1 metro del nivel del mar, espacio que se localiza en las zonas norte y este de la isla. Las zonas mas afectadas por la inundación representan la mayor parte de la riqueza natural de la isla, y es también el sector donde se asienta la infraestructura turística y comercial. La alta vulnerabilidad de estas zonas es debida a la presencia de rellenos habilitados en la década de los años 50. Igualmente, la infraestructura de servicios públicos será afectada, en especial el alcantarillado, el abastecimiento de agua potable y la infraestructura vial, además del incremento de los actuales procesos de erosión. Se considera la implementación de medidas de adaptación tendientes a recuperar y fortalecer los mecanismos de resiliencia del litoral que faciliten la adaptación natural de las zonas costeras al ascenso del nivel del mar. Opciones adicionales como la preservación de humedales costeros, regulación de los usos y actividades en las zonas amenazadas por la inundación y la protección de zonas de interés socioeconómico vital complementan la estrategia de adaptación, consolidada en el marco del manejo integrado de zonas costeras que ha establecido el país para sus litorales

Parasitic copepods (Crustacea, Hexanauplia) on fishes from the lagoon flats of Palmyra Atoll, Central Pacific

We surveyed copepods parasitic on the fishes at Palmyra, a remote atoll in the Central Indo-Pacific faunal region. In total, we collected 849 individual fish, representing 44 species, from the intertidal lagoon flats at Palmyra and recovered 17 parasitic copepod species. The parasitic copepods were: Orbitacolax williamsi on Mulloidichthys flavolineatus; Anuretes serratus on Acanthurus xanthopterus; Caligus confusus on Carangoides ferdau, Carangoides orthogrammus, Caranx ignobilis, Caranx melampygus, and Caranx papuensis; Caligus kapuhili on Chaetodon auriga and Chaetodon lunula; Caligus laticaudus on Rhinecanthus aculeatus, Pseudobalistes flavimarginatus, M. flavolineatus, Upeneus taeniopterus, Chrysiptera glauca, and Epinephalus merra; Caligus mutabilis on Lutjanus fulvus and Lutjanus monostigma; Caligus randalli on C. ignobilis; Caligus sp. on L. fulvus; Caritus serratus on Chanos chanos; Lepeophtheirus lewisi on A. xanthopterus; Lepeophtheirus uluus on C. ignobilis; Dissonus similis on Arothron hispidus; Nemesis sp. on Carcharhinus melanopterus; Hatschekia longiabdominalis on A. hispidus; Hatschekia bicaudata on Chaetodon auriga and Chaetodon lunula; Kroyeria longicauda on C. melanopterus and Lernanthropus sp. on Kyphosus cinerascens. All copepod species reported here have been previously reported from the Indo-Pacific but represent new geographical records for Palmyra, demonstrating large-scale parasite dispersion strategies

Historical Isolation versus Recent Long-Distance Connections between Europe and Africa in Bifid Toadflaxes (Linaria sect. Versicolores)

Background: Due to its complex, dynamic and well-known paleogeography, the Mediterranean region provides an ideal framework to study the colonization history of plant lineages. The genus Linaria has its diversity centre in the Mediterranean region, both in Europe and Africa. The last land connection between both continental plates occurred during the Messinian Salinity Crisis, in the late Miocene (5.96 to 5.33 Ma). Methodology/Principal Findings: We analyzed the colonization history of Linaria sect. Versicolores (bifid toadflaxes), which includes c. 22 species distributed across the Mediterranean, including Europe and Africa. Two cpDNA regions (rpl32-trnL UAG and trnK-matK) were sequenced from 66 samples of Linaria. We conducted phylogenetic, dating, biogeographic and phylogeographic analyses to reconstruct colonization patterns in space and time. Four major clades were found: two of them exclusively contain Iberian samples, while the other two include northern African samples together with some European samples. The bifid toadflaxes have been split in African and European clades since the late Miocene, and most lineage and speciation differentiation occurred during the Pliocene and Quaternary. We have strongly inferred four events of post-Messinian colonization following long-distance dispersal from northern Africa to the Iberian Peninsula, Sicily and Greece. Conclusions/Significance: The current distribution of Linaria sect. Versicolores lineages is explained by both ancien

Molecular Evolution of Regulatory Genes in Spruces from Different Species and Continents: Heterogeneous Patterns of Linkage Disequilibrium and Selection but Correlated Recent Demographic Changes

Genes involved in transcription regulation may represent valuable targets in association genetics studies because of their key roles in plant development and potential selection at the molecular level. Selection and demographic signatures at the sequence level were investigated for five regulatory genes belonging to the knox-I family (KN1, KN2, KN3, KN4) and the HD-Zip III family (HB-3) in three Picea species affected by post-glacial recolonization in North America and Europe. To disentangle neutral and selective forces and estimate linkage disequilibrium (LD) on a gene basis, complete or nearly complete gene sequences were analysed. Nucleotide variation within species, haplotype structure, LD, and neutrality tests, in addition to coalescent simulations based on Tajima’s D and Fay and Wu’s H, were estimated. Nucleotide diversity was generally low in all species (average π = 0.002–0.003) and much heterogeneity was seen in LD and selection signatures among genes and species. Most of the genes harboured an excess of both rare and frequent alleles in the three species. Simulations showed that this excess was significantly higher than that expected under neutrality and a bottleneck during the Last Glacial Maximum followed by population expansion at the Pleistocene/Holocene boundary or shortly after best explains the correlated sequence patterns. These results indicate that despite recent large demographic changes in the three boreal species from two continents, species-specific selection signatures could still be detected from the analysis of nearly complete regulatory gene sequences. Such different signatures indicate differential subfunctionalization of gene family members in the three congeneric species