Identification of small non-coding RNAs from mitochondria and chloroplasts

Small non-protein-coding RNAs (ncRNAs) have been identified in a wide spectrum of organisms ranging from bacteria to humans. In eukarya, systematic searches for ncRNAs have so far been restricted to the nuclear or cytosolic compartments of cells. Whether or not small stable non-coding RNA species also exist in cell organelles, in addition to tRNAs or ribosomal RNAs, is unknown. We have thus generated cDNA libraries from size-selected mammalian mitochondrial RNA and plant chloroplast RNA and searched for small ncRNA species in these two types of DNA-containing cell organelles. In total, we have identified 18 novel candidates for organellar ncRNAs in these two cellular compartments and confirmed expression of six of them by northern blot analysis or RNase A protection assays. Most candidate ncRNA genes map to intergenic regions of the organellar genomes. As found previously in bacteria, the presumptive ancestors of present-day chloroplasts and mitochondria, we also observed examples of antisense ncRNAs that potentially could target organelle-encoded mRNAs. The structural features of the identified ncRNAs as well as their possible cellular functions are discussed. The absence from our libraries of abundant small RNA species that are not encoded by the organellar genomes suggests that the import of RNAs into cell organelles is of very limited significance or does not occur at all

Entscheidungssammlung Staatsrecht - Grundrechte

Ziel der „Entscheidungssammlung Staatsrecht“ ist es, den Studierenden der Universität Würzburg zentrale Urteile und Beschlüsse des Bundesverfassungsgerichts (BVerfG) aus den Bereichen des Staatsorganisationsrechts, der Grundrechte sowie der Bezüge zum Völker- und Europarecht durch didaktisch aufbereitete Entscheidungsanalysen näher zu bringen. Dabei sollen neben den „Klassikern“ der Rechtsprechung auch aktuelle Judikate einbezogen werden. Die Fallsammlung richtet sich sowohl an Studierende der Anfangssemester als auch an Examenskandidaten, denen die schnelle Erfassung der Leitentscheidungen des BVerfG zum Staatsrecht ermöglicht werden soll. Das Projekt ist auf eine sukzessive Erweiterung angelegt. Es startet in dieser ersten Edition mit 18 Fällen aus dem Bereich der Grundrechte. In der juristischen Aus-bildung kommt den Grundrechten eine herausgehobene Bedeutung zu. Sie stehen nicht nur im Zentrum des „Grundkurs Öffentliches Recht II“, sondern strahlen in sämtliche Rechtsgebiete auch außerhalb des Öffentlichen Rechts aus. Bei der Entwicklung und Ausgestaltung der Grundrechtslehren nimmt die Rechtsprechung des BVerfG eine prägende Stellung ein. Die zweite Auflage erweitert die Entscheidungssammlung Staatsrecht um einige „Klassiker“ der Judikatur des BVerfG sowie wichtige neue Entscheidungen im Bereich der Grundrechte

Entscheidungssammlung Staatsrecht - Grundrechte

Ziel der „Entscheidungssammlung Staatsrecht“ ist es, den Studierenden der Universität Würzburg zentrale Urteile und Beschlüsse des Bundesverfassungsgerichts (BVerfG) aus den Bereichen des Staatsorganisationsrechts, der Grundrechte sowie der Bezüge zum Völker- und Europarecht durch didaktisch aufbereitete Entscheidungsanalysen näher zu bringen. Dabei sollen neben den „Klassikern“ der Rechtsprechung auch aktuelle Judikate einbezogen werden. Die Fallsammlung richtet sich sowohl an Studierende der Anfangssemester als auch an Examenskandidatinnen und -kandidaten, denen die schnelle Erfassung der Leitentscheidungen des BVerfG zum Staatsrecht ermöglicht werden soll. Das Projekt ist auf eine sukzessive Erweiterung angelegt. Es startet in dieser ersten Edition mit 18 Fällen aus dem Bereich der Grundrechte. In der juristischen Ausbildung kommt den Grundrechten eine herausgehobene Bedeutung zu. Sie stehen nicht nur im Zentrum des „Grundkurs Öffentliches Recht II“, sondern strahlen in sämtliche Rechtsgebiete auch außerhalb des Öffentlichen Rechts aus. Bei der Entwicklung und Ausgestaltung der Grundrechtslehren nimmt die Rechtsprechung des BVerfG eine prägende Stellung ein

What can we learn from single molecule trajectories?

Diffusing membrane constituents are constantly exposed to a variety of forces that influence their stochastic path. Single molecule experiments allow for resolving trajectories at extremely high spatial and temporal accuracy, thereby offering insights into en route interactions of the tracer. In this review we discuss approaches to derive information about the underlying processes, based on single molecule tracking experiments. In particular, we focus on a new versatile way to analyze single molecule diffusion in the absence of a full analytical treatment. The method is based on comprehensive comparison of an experimental data set against the hypothetical outcome of multiple experiments performed on the computer. Since Monte Carlo simulations can be easily and rapidly performed even on state-of-the-art PCs, our method provides a simple way for testing various - even complicated - diffusion models. We describe the new method in detail, and show the applicability on two specific examples: firstly, kinetic rate constants can be derived for the transient interaction of mobile membrane proteins; secondly, residence time and corral size can be extracted for confined diffusion

Reducing antipsychotic drugs in stable patients with chronic schizophrenia or schizoaffective disorder: a randomized controlled pilot trial

As the course of schizophrenic disorders is often chronic, treatment guidelines recommend continuous maintenance treatment to prevent relapses, but antipsychotic drugs can cause many side effects. It, therefore, seems reasonable to try to reduce doses in stable phases of the illness or even try to stop medication. We conducted a 26 weeks, randomized, rater blind, feasibility study to examine individualized antipsychotic dose reduction versus continuous maintenance treatment (Register Number: NCT02307396). We included chronic, adult patients with schizophrenia or schizoaffective disorder, who were treated with any antipsychotic drug except clozapine, who had not been hospitalized in the last 3 years and who were in symptomatic remission at baseline. The primary outcome was relapse of positive symptoms. Symptom severity, social functioning and side effects were also examined as secondary outcomes. 20 patients were randomized. Relapse rates in the two groups were not significantly different. No patient had to be hospitalized. One patient in the control group dropped out. The mean reduction of antipsychotic dose in the individualized dose-reduction group was 42%, however only one patient discontinued drug completely. There were no significant differences in efficacy or safety outcomes. This randomized trial provides evidence, that reduction of antipsychotic medication in chronic stable schizophrenic patients may be feasible. The results need to be confirmed in a larger trial with a longer follow-up period

Statistical analysis of 3D localisation microscopy images for quantification of membrane protein distributions in a platelet clot model.

We present the software platform 2CALM that allows for a comparative analysis of 3D localisation microscopy data representing protein distributions in two biological samples. The in-depth statistical analysis reveals differences between samples at the nanoscopic level using parameters such as cluster-density and -curvature. An automatic classification system combines multiplex and multi-level statistical approaches into one comprehensive parameter for similarity testing of the compared samples. We demonstrated the biological importance of 2CALM, comparing the protein distributions of CD41 and CD62p on activated platelets in a 3D artificial clot. Additionally, using 2CALM, we quantified the impact of the inflammatory cytokine interleukin-1β on platelet activation in clots. The platform is applicable to any other cell type and biological system and can provide new insights into biological and medical applications