High-throughput characterization of the effect of sodium chloride and potassium chloride on 31 lactic acid bacteria and their co-cultures

Salt (NaCl) is associated with a risk of hypertension and the development of coronary heart disease, so its consumption should be limited. However, salt plays a key role in the quality and safety of food by controlling undesirable microorganisms. Since studies have focused primarily on the effect of salts on the overall counts of the lactic acid bacteria (LAB) group, we have not yet understood how salt stress individually affects the strains and the interactions between them. In this study, we characterized the effect of sodium chloride (NaCl) and potassium chloride (KCl) on the growth and acidification of 31 LAB strains. In addition, we evaluated the effect of salts on a total of 93 random pairwise strain combinations. Strains and co-cultures were tested at 3% NaCl, 5% NaCl, and 3% KCl on solid medium using an automated approach and image analysis. The results showed that the growth of LAB was significantly reduced by up to 68% at 5% NaCl (p < 0.0001). For the co-cultures, a reduction of up to 57% was observed at 5% NaCl (p < 0.0001). However, acidification was less affected by salt stress, whether for monocultures or co-cultures. Furthermore, KCl had a lesser impact on both growth and acidification compared to NaCl. Indeed, some strains showed a significant increase in growth at 3% KCl, such as Lactococcus lactis subsp. lactis 74310 (23%, p = 0.01). More importantly, co-cultures appeared to be more resilient and had more varied responses to salt stress than the monocultures, as several cases of suppression of the significant effect of salts on acidification and growth were detected. Our results highlight that while salts can modulate microbial interactions, these latter can also attenuate the effect of salts on LAB

Répression policière et violence de genre au Mexique : le cas de San Salvador Atenco

Ce mémoire porte sur la répression policière survenue à San Salvador Atenco, une communauté située dans l'État de Mexico, et les violences sexuelles exercées envers les femmes, dans le cadre de cette opération. Dans la nuit du 3 au 4 mai 2006, environ 4000 policiers (fédéraux, provinciaux, municipaux) interviennent pour mater une manifestation dirigée par un mouvement paysan, le Front des Peuples pour la Défense de la Terre (FPDT). Au cours de cette opération, les forces policières procèdent à des détentions massives illégales. Lors du transport des détenues entre la communauté et le pénitencier de Santiguito de Almoloya, on rapporte que la majorité des femmes auraient été soumises à des tortures sexuelles, allant de la violence verbale sexuellement dénigrante à des viols répétés. Depuis, ces crimes sont demeurés impunis. Malgré les engagements du gouvernement du Parti d'Action Nationale de lutter contre la violence de genre, les femmes qui ont entrepris de réclamer justice se heurtent invariablement à une mentalité discriminatoire qui caractérise toujours les instances autant politiques que judiciaires. Au moment où le Mexique entreprend sa démocratisation, comment expliquer que l'État puisse déployer une telle violence envers les femmes mexicaines? Les femmes militantes se sont-elles converties en une figure de dissidence? Ce mémoire a pour objectif de permettre une meilleure compréhension de la violence d'État envers les femmes et de l'impunité qui l'accompagne. Des chercheuses mexicaines expliquent que cette violence répond à un gouvernement patriarcal qui conçoit les femmes comme un butin de guerre. L'État s'en prend aux femmes pour symboliquement attaquer l'honneur des hommes et mener ainsi une guerre non déclarée contre les mouvements sociaux. Nous proposons de compléter cette vision en privilégiant un autre angle d'analyse. Dans le cadre d'une opération contre-insurrectionnelle, l'État mexicain exploite la torture sexuelle de façon ponctuelle comme un instrument de contrôle social, d'oppression et de terrorisme sexuel pour soumettre les femmes et les communautés auxquelles elles appartiennent. La violence structurelle qui caractérise le discours et les interventions des autorités politiques et judiciaires est délibérément utilisée, de façon plus indirecte et subtile, par l'État mexicain comme une stratégie terroriste pour décourager, dénigrer et terroriser les femmes afin de les ramener dans la sphère privée. Ce mémoire se veut une recherche qualitative. Il repose principalement sur des recherches féministes radicales anglo-saxonnes et mexicaines portant sur la violence envers les femmes et le sens à donner aux violences sexuelles. La recherche est complétée par des sources empiriques, en participant notamment au Forum itinérant Mujeres, Violencia e impunidad qui réunit des membres de la société civile et des chercheurs reliés à différentes institutions académiques mexicaines. Nous avons également mené des entrevues ouvertes auprès d'organisations de défense de droits humains, des avocates des femmes d'Atenco, des femmes qui furent vicitimes de violence à Atenco et des membres du FPDT. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Violence de genre, Terrorisme d'État, Terrorisme sexuel, Femmes mexicaines, Mouvements sociaux, Sexualisation de la torture, Violence structurelle patriarcale

Étude du microbiote de la sève d'érable et de son impact sur la qualité du sirop

Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2011-2012Récemment, les méthodes de récolte de la sève d'érable, mais aussi les méthodes d'analyses microbiologiques ont évolué. Les travaux présentés avaient pour objectif la caractérisation du microbiote acéricole par des méthodes moléculaires et la description de son impact quantitatif et qualitatif sur la qualité du sirop d'érable. Des analyses microbiologiques conventionnelles, physicochimiques et sensorielles ont été effectuées sur des échantillons de sève et de sirop provenant de sites québécois au cours de la période de récolte. De nouvelles méthodes moléculaires culture-indépendantes (profilage PCR communautaire, MARISA) ont permis de caractériser la structure et la composition du microbiote dans le temps et dans l'espace. Le site de production a été identifié comme étant le facteur le plus déterminant pour la composition alors que la période de récolte correspondait à un changement dans la structure des communautés microbiennes. Le séquençage de banques de clones et des essais qPCR spécifiques ont permis respectivement d'identifier et de quantifier les principales bactéries et levures de la sève d'érable. Puisque Pseudomonas fluorescens, Rahnella spp., Mrakia spp., Mrakiella spp. et Guehomyces pullulons ont été retrouvés à chaque site de production et qu'ils étaient aussi présents tout au long de la période de récolte, ces microorganismes sont considérés comme des membres stables du microbiote acéricole. Les analyses multivariées ont révélé des associations entre l'abondance relative de plusieurs contaminants et les propriétés de la sève et du sirop d'érable. Notamment des levures telles que Candida sake, Williopsis sp. et G. pullulons sont successivement associées à la quantité de glucose et de fructose dans la sève d'érable. En fin de saison, les bactéries du groupe P. fluorescens et les levures du genre Mrakia sont positivement associées aux flaveurs d'érable et de vanille. Ces résultats illustrent les deux facettes de l'impact de la communauté microbienne de la sève d'érable qui peut être associée positivement et négativement à la qualité de cette matière première et du produit fini, le sirop d'érable. Éventuellement, la compréhension de ces relations et de ses mécanismes permettra de développer des stratégies de modulation du microbiote et de gestion des systèmes de collecte

A study to determine how the professional staff at Home Treatment Service rank the appropriateness for nursing intervention according to patients' psychiatric diagnosis, physical health, and treatment by psychopharmaceuticals

Thesis (M.S.)--Boston UniversityPLEASE NOTE: Boston University Libraries did not receive an Authorization To Manage form for this thesis or dissertation. It is therefore not openly accessible, though it may be available by request. If you are the author or principal advisor of this work and would like to request open access for it, please contact us at [email protected]. Thank you.2031-01-0

La créativité, tout le monde sait ce que c'est !?!

Titre de l'écran-titre (visionné le 26 mai 2010)Également disponible en format papier

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Sequence data from Lake whitefish kidney tissue for both dwarf and normal forms from all five lake

Data from: Gene coexpression networks reveal key drivers of phenotypic divergence in lake whitefish

BACKGROUND: A functional understanding of processes involved in adaptive divergence is one of the awaiting opportunities afforded by high throughput transcriptomic technologies. Functional analysis of co-expressed genes has succeeded in the biomedical field in identifying key drivers of disease pathways. However, in ecology and evolutionary biology, functional interpretation of transcriptomic data is still limited. RESULTS: Here we used Weighted Gene Co-Expression Network Analysis (WGCNA) to identify modules of co-expressed genes in muscle and brain tissue of a lake whitefish backcross progeny. Modules were connected to gradients of known adaptive traits involved in the ecological speciation process between benthic and limnetic ecotypes. Key drivers, i.e. hub genes of functional modules related to reproduction, growth, and behavior were identified, and module preservation was assessed in natural populations. Using this approach, we identified modules of co-expressed genes involved in phenotypic divergence and their key drivers, and further identified a module part specifically rewired in the backcross progeny. CONCLUSIONS: Functional analysis of transcriptomic data can significantly contribute to the understanding of the mechanisms underlying ecological speciation. Our findings point to BMP and Calcium signaling as common pathways involved in coordinated evolution of trophic behavior, trophic morphology (gill rakers), and reproduction. Results also point to pathways implicating hemoglobins and constitutive stress response (HSP70) governing growth in lake whitefish

Evolutionary rescue by compensatory mutations is constrained by genomic and environmental backgrounds

Abstract Since deleterious mutations may be rescued by secondary mutations during evolution, compensatory evolution could identify genetic solutions leading to therapeutic targets. Here, we tested this hypothesis and examined whether these solutions would be universal or would need to be adapted to one's genetic and environmental makeups. We performed experimental evolutionary rescue in a yeast disease model for the Wiskott–Aldrich syndrome in two genetic backgrounds and carbon sources. We found that multiple aspects of the evolutionary rescue outcome depend on the genotype, the environment, or a combination thereof. Specifically, the compensatory mutation rate and type, the molecular rescue mechanism, the genetic target, and the associated fitness cost varied across contexts. The course of compensatory evolution is therefore highly contingent on the initial conditions in which the deleterious mutation occurs. In addition, these results reveal biologically favored therapeutic targets for the Wiskott–Aldrich syndrome, including the target of an unrelated clinically approved drug. Our results experimentally illustrate the importance of epistasis and environmental evolutionary constraints that shape the adaptive landscape and evolutionary rate of molecular networks