Diatoms synthesize sterols by inclusion of animal and fungal genes in the plant pathway

Diatoms are ubiquitous microalgae that have developed remarkable metabolic plasticity and gene diversification. Here we report the first elucidation of the complete biosynthesis of sterols in the lineage. The study has been carried out on the bloom-forming species Skeletonema marinoi and Cyclotella cryptica that synthesise an ensemble of sterols with chemotypes of animals (cholesterol and desmosterol), plants (dihydrobrassicasterol and 24-methylene cholesterol), algae (fucosterol) and marine invertebrates (clionasterol). In both species, sterols derive from mevalonate through cyclization of squalene to cycloartenol by cycloartenol synthase. The pathway anticipates synthesis of cholesterol by enzymes of the phytosterol route in plants, as recently reported in Solanaceae. Major divergences stem from reduction of Δ24(28) and Δ24(25) double bonds which, in diatoms, are apparently dependent on sterol reductases of fungi, algae and animals. Phylogenetic comparison revealed a good level of similarity between the sterol biosynthetic genes of S. marinoi and C. cryptica with those in the genomes of the other diatoms sequenced so far

Spatial behaviour of yellow-necked wood mouse Apodemus flavicollis in two sub-Mediterranean oak coppice stands

Strong mutual relationships exist between rodents and ecosystems. By modifying the structure and functioning of ecosystems, human activity can affect rodent behaviour and ecology. The yellow-necked mouse Apodemus flavicollis is widespread in Europe and its spatial ecology has been studied in various habitats, but studies are lacking for Mediterranean forests often altered by forest management practices. We investigated the spatial behaviour of A. flavicollis in a sub-Mediterranean deciduous oak forest of central Italy subject to forest management. We radio-tracked 27 individuals in two different coppice stands, i.e. a recently cut area and a high forest, differing in terms of species-specific habitat quality and rodent population density. We analysed the size of home ranges in relation to habitat type and sex. Our results revealed that home range and core area size did not differ between habitat types or sexes. The spatial behaviour of A. flavicollis thus did not appear to be influenced by population density and habitat quality. The lack of sex-related differences confirms the current knowledge on the species’ spatial ecology. Our findings provide the first useful information on the spatial behaviour of A. flavicollis in sub-Mediterranean deciduous oak forests, whose ecological processes may be markedly influenced by this key-species at several trophic levels.acceptedVersio

Anti-biofilm activity of an exopolysaccharide from a sponge-associated strain of Bacillus licheniformis

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Secondary metabolites ranging from furanone to exo-polysaccharides have been suggested to have anti-biofilm activity in various recent studies. Among these, <it>Escherichia coli </it>group II capsular polysaccharides were shown to inhibit biofilm formation of a wide range of organisms and more recently marine <it>Vibrio </it>sp. were found to secrete complex exopolysaccharides having the potential for broad-spectrum biofilm inhibition and disruption.</p> <p>Results</p> <p>In this study we report that a newly identified ca. 1800 kDa polysaccharide having simple monomeric units of α-D-galactopyranosyl-(1→2)-glycerol-phosphate exerts an anti-biofilm activity against a number of both pathogenic and non-pathogenic strains without bactericidal effects. This polysaccharide was extracted from a <it>Bacillus licheniformis </it>strain associated with the marine organism <it>Spongia officinalis</it>. The mechanism of action of this compound is most likely independent from quorum sensing, as its structure is unrelated to any of the so far known quorum sensing molecules. In our experiments we also found that treatment of abiotic surfaces with our polysaccharide reduced the initial adhesion and biofilm development of strains such as <it>Escherichia coli </it>PHL628 and <it>Pseudomonas fluorescens</it>.</p> <p>Conclusion</p> <p>The polysaccharide isolated from sponge-associated <it>B. licheniformis </it>has several features that provide a tool for better exploration of novel anti-biofilm compounds. Inhibiting biofilm formation of a wide range of bacteria without affecting their growth appears to represent a special feature of the polysaccharide described in this report. Further research on such surface-active compounds might help developing new classes of anti-biofilm molecules with broad spectrum activity and more in general will allow exploring of new functions for bacterial polysaccharides in the environment.</p

New bioactive hydrogenated linderazulene-derivatives from the gorgonian Echinogorgia complexa

[EN] Chemical analysis of the secondary metabolite pattern of the gorgonian Echinogorgia complexa, collected along South Indian coasts, showed the presence of two new tricyclic guaiane furanosesquiterpenes, iso-echinofuran (3) and 8,9-dihydro-linderazulene (4), co-occurring with the known echinofuran (5) and structurally related to the pigment linderazulene (1). The unprecedented molecules 3 and 4 were characterized by spectral methods, mainly by NMR techniques. Compounds 3¿5 displayed moderate activity in the mitochondrial respiratory chain inhibition assay.Manzo, E.; Ciavatta, ML.; López-Gresa, MP.; Gavagnin, M.; Villani, G.; Naik, CG.; Cimino, G. (2007). New bioactive hydrogenated linderazulene-derivatives from the gorgonian Echinogorgia complexa. Tetrahedron Letters. 48(14):2569-2571. https://doi.org/10.1016/j.tetlet.2007.02.020S25692571481

Effect of Cultivation Parameters on Fermentation and Hydrogen Production in the Phylum

The phylum is composed of a single class (), 4 orders (), 5 families (), and 13 genera. They have been isolated from extremely hot environments whose characteristics are reflected in the metabolic and phenotypic properties of the species. The metabolic versatility of members leads to a pool of high value-added products with application potentials in many industry fields. The low risk of contamination associated with their extreme culture conditions has made most species of the phylum attractive candidates in biotechnological processes. Almost all members of the phylum, especially those in the order , can produce bio-hydrogen from a variety of simple and complex sugars with yields close to the theoretical Thauer limit of 4 mol H/mol consumed glucose. Acetate, lactate, and L-alanine are the major organic end products. Thermotagae fermentation processes are influenced by various factors, such as hydrogen partial pressure, agitation, gas sparging, culture/headspace ratio, inoculum, pH, temperature, nitrogen sources, sulfur sources, inorganic compounds, metal ions, etc. Optimization of these parameters will help to fully unleash the biotechnological potentials of and promote their applications in industry. This article gives an overview of how these operational parameters could impact fermentation in terms of sugar consumption, hydrogen yields, and organic acids production

Sistema de monitorización basado en una red de sensores inalámbrica (WSN) implementada con software y hardware libre

La medición de variables agroclimáticas es indispensable para comprender un fenómeno o proceso particular. Mantener registros periódicos con una buena resolución espacial demanda una considerable inversión en equipamiento comercial, generalmente de acotada flexibilidad para adaptarse a diferentes escenarios. El rápido avance de tecnologías emergentes han permitido el acceso a numerosos componentes electrónicos compatibles con plataformas de hardware libre como Arduino, cuyas especificaciones y software para su programación son de libre disponibilidad para su uso y modificación. Sensores variados y la plataforma de desarrollo Arduino fueron usados para diseñar un sistema de monitorización basado en una red de sensores inalámbrica - mejor conocidas por sus siglas Wireless Sensor Network WSN - implementada íntegramente con hardware y software libre, con capacidades de almacenamiento y transmisión para su uso en proyectos relacionados con la agricultura y los recursos naturales. En el estudio actual se presentan resultados finales obtenidos en pruebas de laboratorio y campo donde se evaluaron sensores y componentes que dieron cuenta de su factibilidad en el desarrollo de una estación de monitorización.Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativ

Sistema de monitorización basado en una red de sensores inalámbrica (WSN) implementada con software y hardware libre

La medición de variables agroclimáticas es indispensable para comprender un fenómeno o proceso particular. Mantener registros periódicos con una buena resolución espacial demanda una considerable inversión en equipamiento comercial, generalmente de acotada flexibilidad para adaptarse a diferentes escenarios. El rápido avance de tecnologías emergentes han permitido el acceso a numerosos componentes electrónicos compatibles con plataformas de hardware libre como Arduino, cuyas especificaciones y software para su programación son de libre disponibilidad para su uso y modificación. Sensores variados y la plataforma de desarrollo Arduino fueron usados para diseñar un sistema de monitorización basado en una red de sensores inalámbrica - mejor conocidas por sus siglas Wireless Sensor Network WSN - implementada íntegramente con hardware y software libre, con capacidades de almacenamiento y transmisión para su uso en proyectos relacionados con la agricultura y los recursos naturales. En el estudio actual se presentan resultados finales obtenidos en pruebas de laboratorio y campo donde se evaluaron sensores y componentes que dieron cuenta de su factibilidad en el desarrollo de una estación de monitorización.Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativ

Desarrollo de una estación de medición agroclimática con hardware libre

La medición de variables agroclimáticas es indispensable para comprender un fenómeno o proceso particular. Mantener registros periódicos con una buena resolución espacial demanda una considerable inversión en equipamiento comercial, generalmente de acotada flexibilidad para adaptarse a diferentes escenarios. El rápido avance de tecnologías emergentes han permitido el acceso a numerosos componentes electrónicos compatibles con plataformas de hardware libre como Arduino, cuyas especificaciones y software para su programación son de libre disponibilidad para su uso y modificación. Sensores variados y la plataforma de desarrollo Arduino fueron usados para diseñar una estación de medición automática con capacidades de almacenamiento y transmisión para su uso en proyectos relacionados con la agricultura y los recursos naturales. En el estudio actual se presentan resultados preliminares obtenidos en pruebas de laboratorio y campo donde se evaluaron variados sensores y componentes que dieron cuenta de su factibilidad en el desarrollo de una estación de monitoreo agroclimática.Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativa (SADIO

Desarrollo de una estación de medición agroclimática con hardware libre

La medición de variables agroclimáticas es indispensable para comprender un fenómeno o proceso particular. Mantener registros periódicos con una buena resolución espacial demanda una considerable inversión en equipamiento comercial, generalmente de acotada flexibilidad para adaptarse a diferentes escenarios. El rápido avance de tecnologías emergentes han permitido el acceso a numerosos componentes electrónicos compatibles con plataformas de hardware libre como Arduino, cuyas especificaciones y software para su programación son de libre disponibilidad para su uso y modificación. Sensores variados y la plataforma de desarrollo Arduino fueron usados para diseñar una estación de medición automática con capacidades de almacenamiento y transmisión para su uso en proyectos relacionados con la agricultura y los recursos naturales. En el estudio actual se presentan resultados preliminares obtenidos en pruebas de laboratorio y campo donde se evaluaron variados sensores y componentes que dieron cuenta de su factibilidad en el desarrollo de una estación de monitoreo agroclimática.Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativa (SADIO