Structural biologists, lets mind our colors

In structural biology, most figures of macromolecules are aimed at those well-versed in structure, requiring prior familiarity with scales and commonly used color schemes. Yet, as structural biology becomes democratized with the increasing pace of structure determination, the accessibility of structural data is paramount. Here, we identify three keys, and have written accompanying software plugins, for structural biologists to create figures truer to the hard-won data and clearer across different modes of color vision and to non-expert readers. Use perceptually uniform colormaps Consider readers with different modes of color vision Be explicit about scales and color usag

Structural biologists, lets mind our colors

In structural biology, most figures of macromolecules are aimed at those well-versed in structure, requiring prior familiarity with scales and commonly used color schemes. Yet, as structural biology becomes democratized with the increasing pace of structure determination, the accessibility of structural data is paramount. Here, we identify three keys, and have written accompanying software plugins, for structural biologists to create figures truer to the hard-won data and clearer across different modes of color vision and to non-expert readers. Use perceptually uniform colormaps Consider readers with different modes of color vision Be explicit about scales and color usag

Structural Characterization of Two CO Molecules Bound to the Nitrogenase Active Site

As an approach towards unraveling the nitrogenase mechanism, we have studied the binding of CO to the active site FeMo‐cofactor. CO is not only an inhibitor of nitrogenase, but it is also a substrate, undergoing reduction to hydrocarbons (Fischer‐Tropsch‐type chemistry). The C‐C bond forming capabilities of nitrogenase suggest that multiple CO, or CO‐derived ligands, bind to the active site. Herein, we report a crystal structure with two CO ligands coordinated to the FeMo‐cofactor of the molybdenum nitrogenase at 1.33 Å resolution. In addition to the previously observed bridging CO ligand between Fe2 and Fe6 of the FeMo‐cofactor, a new ligand binding mode is revealed through a second CO ligand coordinated terminally to Fe6. While the relevance of this state to nitrogenase‐catalyzed reactions remains to be established, it highlights the privileged role for Fe2 and Fe6 in ligand binding, with multiple coordination modes available depending on the ligand and reaction conditions

Polar cap arcs from the magnetosphere to the ionosphere: kinetic modelling and observations by Cluster and TIMED

On 1 April 2004 the GUVI imager onboard the TIMED spacecraft spots an isolated and elongated polar cap arc. About 20 min later, the Cluster satellites detect an isolated upflowing ion beam above the polar cap. Cluster observations show that the ions are accelerated upward by a quasi-stationary electric field. The field-aligned potential drop is estimated to about 700 V and the upflowing ions are accompanied by a tenuous population of isotropic protons with a temperature of about 500 eV. <br><br> The magnetic footpoints of the ion outflows observed by Cluster are situated in the prolongation of the polar cap arc observed by TIMED GUVI. The upflowing ion beam and the polar cap arc may be different signatures of the same phenomenon, as suggested by a recent statistical study of polar cap ion beams using Cluster data. <br><br> We use Cluster observations at high altitude as input to a quasi-stationary magnetosphere-ionosphere (MI) coupling model. Using a Knight-type current-voltage relationship and the current continuity at the topside ionosphere, the model computes the energy spectrum of precipitating electrons at the top of the ionosphere corresponding to the generator electric field observed by Cluster. The MI coupling model provides a field-aligned potential drop in agreement with Cluster observations of upflowing ions and a spatial scale of the polar cap arc consistent with the optical observations by TIMED. The computed energy spectrum of the precipitating electrons is used as input to the Trans4 ionospheric transport code. This 1-D model, based on Boltzmann's kinetic formalism, takes into account ionospheric processes such as photoionization and electron/proton precipitation, and computes the optical and UV emissions due to precipitating electrons. The emission rates provided by the Trans4 code are compared to the optical observations by TIMED. They are similar in size and intensity. Data and modelling results are consistent with the scenario of quasi-static acceleration of electrons that generate a polar cap arc as they precipitate in the ionosphere. The detailed observations of the acceleration region by Cluster and the large scale image of the polar cap arc provided by TIMED are two different features of the same phenomenon. Combined together, they bring new light on the configuration of the high-latitude magnetosphere during prolonged periods of Northward IMF. Possible implications of the modelling results for optical observations of polar cap arcs are also discussed

Origin of molecular oxygen in Comet 67P/Churyumov-Gerasimenko

Molecular oxygen has been detected in the coma of comet 67P/Churyumov-Gerasimenko with abundances in the 1-10% range by the ROSINA-DFMS instrument on board the Rosetta spacecraft. Here we find that the radiolysis of icy grains in low-density environments such as the presolar cloud may induce the production of large amounts of molecular oxygen. We also show that molecular oxygen can be efficiently trapped in clathrates formed in the protosolar nebula, and that its incorporation as crystalline ice is highly implausible because this would imply much larger abundances of Ar and N2 than those observed in the coma. Assuming that radiolysis has been the only O2 production mechanism at work, we conclude that the formation of comet 67P/Churyumov-Gerasimenko is possible in a dense and early protosolar nebula in the framework of two extreme scenarios: (1) agglomeration from pristine amorphous icy grains/particles formed in ISM and (2) agglomeration from clathrates that formed during the disk's cooling. The former scenario is found consistent with the strong correlation between O2 and H2O observed in 67P/C-G's coma while the latter scenario requires that clathrates formed from ISM icy grains that crystallized when entering the protosolar nebula.Comment: The Astrophysical Journal Letters, in pres

FAQs & IPOD : Implementación de Enseñanza Móvil

En la actualidad el dispositivo tecnológico móvil más utilizado por la población en el mundo y nuestro país es el teléfono celular. Estos, con el devenir de nuevas tecnologías, la miniaturización electrónica y otros elementos dan la posibilidad no sólo de establecer comunicaciones telefónicas sino que además nos permiten acceder a internet, escuchar música, ver videos, sacar fotografías y tantas otras cosas más. Sin dudas los mayores usuarios de este tipo de dispositivos; junto a los reproductores MP3, MP4 e IPOD; son los jóvenes y debemos tener en cuenta que involucran importantes implicancias educativas. El presente trabajo es un proyecto/experiencia de cátedra, implementado en las asignaturas de Técnicas Digitales de la carrera en Ingeniería Electrónica de la Universidad Tecnológica Nacional, Facultad Regional Paraná*. En este se describe el uso educativo de los reproductores MP4 e IPOD y su potencialidad para el desarrollo de actividades académicas y de formación. El uso de la tecnología en las aulas se está expandiendo aceleradamente, ofreciendo unas posibilidades pedagógicas impensables años atrás. Con las nuevas tecnologías, los estudiantes pueden explorar el mundo fuera de las cuatro paredes del aula, de su pupitre, el pizarrón y hasta del docente y de esta manera, entre muchas otras, lograr las competencias que su formación exige. En este contexto una de las herramientas utilizadas es el video educativo y la posibilidad de usarlo por parte de los alumnos siempre que cuenten con un acceso a internet para obtenerlo o visualizarlo y además tener la opción de bajarlo a un dispositivo móvil reproductor de MP4 permitiendo de esta manera una mayor libertad para reproducirlo en el momento y lugar que le sea más cómodo dentro de su propio calendario de actividades u otros que por sus características no disponen del acceso y el equipo correspondiente para acceder a la red.Eje: Tecnología informática aplicada en educaciónRed de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI

FAQs & IPOD : Implementación de Enseñanza Móvil

En la actualidad el dispositivo tecnológico móvil más utilizado por la población en el mundo y nuestro país es el teléfono celular. Estos, con el devenir de nuevas tecnologías, la miniaturización electrónica y otros elementos dan la posibilidad no sólo de establecer comunicaciones telefónicas sino que además nos permiten acceder a internet, escuchar música, ver videos, sacar fotografías y tantas otras cosas más. Sin dudas los mayores usuarios de este tipo de dispositivos; junto a los reproductores MP3, MP4 e IPOD; son los jóvenes y debemos tener en cuenta que involucran importantes implicancias educativas. El presente trabajo es un proyecto/experiencia de cátedra, implementado en las asignaturas de Técnicas Digitales de la carrera en Ingeniería Electrónica de la Universidad Tecnológica Nacional, Facultad Regional Paraná*. En este se describe el uso educativo de los reproductores MP4 e IPOD y su potencialidad para el desarrollo de actividades académicas y de formación. El uso de la tecnología en las aulas se está expandiendo aceleradamente, ofreciendo unas posibilidades pedagógicas impensables años atrás. Con las nuevas tecnologías, los estudiantes pueden explorar el mundo fuera de las cuatro paredes del aula, de su pupitre, el pizarrón y hasta del docente y de esta manera, entre muchas otras, lograr las competencias que su formación exige. En este contexto una de las herramientas utilizadas es el video educativo y la posibilidad de usarlo por parte de los alumnos siempre que cuenten con un acceso a internet para obtenerlo o visualizarlo y además tener la opción de bajarlo a un dispositivo móvil reproductor de MP4 permitiendo de esta manera una mayor libertad para reproducirlo en el momento y lugar que le sea más cómodo dentro de su propio calendario de actividades u otros que por sus características no disponen del acceso y el equipo correspondiente para acceder a la red.Eje: Tecnología informática aplicada en educaciónRed de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI

Faire l’Union. La refondation des parties de droite après les élections de 2002

Un nouveau parti de droite, pour le moment dénommé UMP, a été mis en place entre des deux tours de l'élection présidentielle. Cet article se donne pour objectif d'analyser les enjeux de cette transformation. La genèse de l'UMP permet de saisir dans quelle mesure un parti poli-tique peut être conçu comme la connexion d'un ensemble de systèmes de coopération organisés autour de postes à conquérir. En effet, l'impératif d'unification de la droite française est lié au décalage persistant existant entre les systèmes de coopération législatif et présidentiel. Mais les questions soulevées par cette fusion partisane (l'UMP inclut le RPR, DL et une majeure partie de l'UDF) montrent que cette vision ne peut suffire et que les partis ne sont pas seulement des systèmes de coopération mais aussi des systèmes de production. Dès lors, leurs logiques d'organisation internes pèsent sur ce travail de transformation du social en politique, de la plu-ralité en homogénéité. Dans le cas de l'UMP, il s'agit d'abord de mettre en commun des modes de fonctionnement, en particulier de définir la place et la légitimité accordées respectivement aux adhérents et aux élus, mais aussi d'organiser l'expression de la pluralité idéologique par la mise en place de courants

Dasabuvir and Ombitasvir/Paritaprevir/Ritonavir with or without Ribavirin in Patients with HIV-HCV Coinfection. Real Life Interim Analysis of an Italian Multicentre Compassionate Use Program

Background and Aims: An HCV cure is now possible in a large proportion of HIV-HCV patient. We present real life results of a compassionate use program promoted by SIMIT (Infectious and Tropical Diseases Italian Society) of Dasabuvir and Ombitasvir/Paritaprevir/Ritonavir ± Ribavirin for 12 weeks in 213 HIV-HCV genotype 1 patients. Data on efficacy and tolerability of this strategy in HIV patients have been reported until now only in 43 non cirrhotic HIV subjects