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Long noncoding intronic RNAs are differentially expressed in primary and metastatic pancreatic cancer
<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is known by its aggressiveness and lack of effective therapeutic options. Thus, improvement in current knowledge of molecular changes associated with pancreatic cancer is urgently needed to explore novel venues of diagnostics and treatment of this dismal disease. While there is mounting evidence that long noncoding RNAs (lncRNAs) transcribed from intronic and intergenic regions of the human genome may play different roles in the regulation of gene expression in normal and cancer cells, their expression pattern and biological relevance in pancreatic cancer is currently unknown. In the present work we investigated the relative abundance of a collection of lncRNAs in patients' pancreatic tissue samples aiming at identifying gene expression profiles correlated to pancreatic cancer and metastasis.</p> <p>Methods</p> <p>Custom 3,355-element spotted cDNA microarray interrogating protein-coding genes and putative lncRNA were used to obtain expression profiles from 38 clinical samples of tumor and non-tumor pancreatic tissues. Bioinformatics analyses were performed to characterize structure and conservation of lncRNAs expressed in pancreatic tissues, as well as to identify expression signatures correlated to tissue histology. Strand-specific reverse transcription followed by PCR and qRT-PCR were employed to determine strandedness of lncRNAs and to validate microarray results, respectively.</p> <p>Results</p> <p>We show that subsets of intronic/intergenic lncRNAs are expressed across tumor and non-tumor pancreatic tissue samples. Enrichment of promoter-associated chromatin marks and over-representation of conserved DNA elements and stable secondary structure predictions suggest that these transcripts are generated from independent transcriptional units and that at least a fraction is under evolutionary selection, and thus potentially functional.</p> <p>Statistically significant expression signatures comprising protein-coding mRNAs and lncRNAs that correlate to PDAC or to pancreatic cancer metastasis were identified. Interestingly, <it>loci </it>harboring intronic lncRNAs differentially expressed in PDAC metastases were enriched in genes associated to the MAPK pathway. Orientation-specific RT-PCR documented that intronic transcripts are expressed in sense, antisense or both orientations relative to protein-coding mRNAs. Differential expression of a subset of intronic lncRNAs (<it>PPP3CB</it>, <it>MAP3K14 </it>and <it>DAPK1 loci</it>) in metastatic samples was confirmed by Real-Time PCR.</p> <p>Conclusion</p> <p>Our findings reveal sets of intronic lncRNAs expressed in pancreatic tissues whose abundance is correlated to PDAC or metastasis, thus pointing to the potential relevance of this class of transcripts in biological processes related to malignant transformation and metastasis in pancreatic cancer.</p
Análise clínico-epidemiológica de criptococose em indivíduos com hiv: uma revisão sistemática / Clinical-epidemiological analysis of cryptococosis and hiv coinfection: a systematic review
A criptococose assume caráter oportunista em pacientes vivendo com HIV-AIDS e imunossupressão avançada. A principal forma clínica é a meningoencefalite, responsável por 625.000 mortes anuais. Atualmente, a meningite criptocócica (MC) é a principal causa de meningite oportunista relacionada ao HIV no Brasil e na maioria dos países de baixa e média renda. Tem como objetivo estabelecer o perfil clínico-epidemiológico e os fatores determinantes da coinfecção entre a criptococose e pessoas vivendo com HIV. Trata-se de uma revisão sistemática de estudos publicados em periódicos científicos sobre: criptococose, HIV e AIDS. Buscou-se artigos publicados entre 2010 e 2020 em diferentes bases de dados. Foram selecionados 20 artigos que compuseram a amostra final. Observou-se como fatores clínicos e epidemiológicos associados à criptococose em pacientes com HIV: predominância de homens jovens, com contagem de células TCD4 <100 células/µL, não uso da terapia antirretroviral ou seu início tardio. É comprovada a importância do rastreio precoce da criptococose e da MC em pacientes com HIV, por meio de dosagens rotineiras de CrAg ainda em pacientes sem sintomas neurológicos. Assim, deve-se buscar esforços no sentido de priorizar a prevenção da criptococose e da MC em pacientes com HIV, por meio do amplo acesso a terapia antirretroviral, bem como da incorporação da dosagem do CrAg à rotina ambulatorial e hospitalar no atendimento aos pacientes infectados pelo HIV, fomentando a melhora dos dados epidemiológicos atuais.
Evaluación de la calidad del aceite de palma crudo comercializado en Bahía, Brasil
The characteristics of the quality of crude palm oil (CPO) and crude palm olein (CPOL) produced in the states of Bahia and Pará were investigated. Twelve oil samples were analyzed; 2 (CPO) were from Pará (produced industrially), while the other 10 were from Bahia (3 CPOs and 3 CPOLs produced industrially, while 1 CPOL and 3 CPOs were traditionally processed). The chemical analyses included the determination of fatty acid methyl esters (FAME), free fatty acids (FFA%), peroxide value (PV), induction time (IT), total carotenoids (TC) and total polar compounds (TPC). The major saturated fatty acids in these samples were palmitic (34.79-42.89 g 100 g–1) and stearic (4.49-5.84 g 100 g–1) acid, and the main unsaturated fatty acids were oleic (37.31-43.69 g 100 g–1) and linoleic (9.04- 12.74 g100 g–1) acid. All samples produced in Bahia exhibited higher FFA (6.77-13.49%) and TPC (13.71-19.50%) levels than permitted in the international quality standards, unlike the samples produced in Pará. TC, PV and IT ranged from 422.1 to 584.2 mg g–1, 1.32 to 3.7 meq O2 kg–1 oil and 1.72 to 4.66 h, respectively. PV, FFA and TPC were inversely correlated with TC and IT. The use of inappropriate oil extraction processes in Bahia is clearly becoming a food safety problem.Las características de calidad del aceite de palma crudo (CPO) y oleína de palma cruda (CPOL) producidos en los estados de Bahía y Pará fueron investigados. Se analizaron doce muestras de aceites; 2 (CPO) eran de Pará (producido industrialmente), mientras que las otras 10 procedían de Bahía (3 CPOs y 3 CPOLs producidos industrialmente, mientras que 1 CPOL y 3 CPOs fueron procesadas tradicionalmente). El análisis químico incluyó la determinación de ésteres metílicos de ácidos grasos (FAME), ácidos grasos libres (FFA%), índice de peróxido (PV), el tiempo de inducción (TI), los carotenoides totales (TC) y el total de compuestos polares (TPC). Los principales ácidos grasos saturados en estas muestras fueron palmítico (34,79 a 42,89 g 100 g–1) y esteárico (4.49 a 5.84 g 100 g–1), y los principales ácidos grasos insaturados fueron oleico (37.31-43.69 g 100 g–1) y linoleico (9,04-12,74 g 100 g–1). Todas las muestras producidas en Bahía muestran valores de FFA (6,77-13,49%) y TPC (13,71 a 19,50%), por encima de los niveles de los estándares internacionales de calidad, a diferencia de las muestras producidas en Pará. TC, PV y TPC oscilaron entre 422,1 a 584,2 mg g–1, 1,32 a 3,7 meq O2 kg–1 y 1,72 a 4,66 h, respectivamente. PV, FFA y TPC se correlacionan inversamente con TC y IT. El uso de procesos inadecuados de extracción de aceites en Bahía se está convirtiendo claramente en un problema de seguridad alimentaria
Doença Policística Hepática associada a Doença Policística Renal Autossômica Dominante: relato de caso - gravidade de doença hepática e revisão de literatura
A doença renal policística é uma doença de caráter genético hereditário, sendo um importante causa de doença renal crônica terminal com necessidade de Terapia de Substituição Renal (TSR). Além da clássica doença renal crônica a DRPAD pode apresentar várias manifestações extra-renais, entre elas, a doença cística hepática que acomete cerca de 90% dos pacientes. Infecções dos cistos hepáticos são complicações raras, porém graves. Neste artigo iremos apresentar um caso clínico com acometimento cístico hepático e renal maciço, além de uma breve revisão sobre complicações e possibilidades terapêuticas
A influência do tempo após o tratamento de sementes de soja sobre a sua geminação em Mineiros – Goiás / The influence of time after the treatment of soybean seeds on its twining in Mineiros – Goiás
A produção de soja tem aumentado a cada ano que se passa e ocupa um papel de destaque na economia brasileira. Porém, os produtores de soja possuem vários desafios para produzir de forma eficiente. Dentre estes desafios pode se destacar a questão do tratamento de semente que visa controlar pragas e patógenos que podem prejudicar a germinação e desenvolvimento da cultura no campo. Neste contexto, este trabalho teve por objetivo avaliar diferentes tempos após o tratamento de sementes de soja realizado com os produtos Power Seed New, Cruiser 350 FS e Apron RFC na dosagem de 100 ml de cada produto para cada 100 Kg de semente. Os tratamentos realizados consistiram na variação do tempo de plantio das sementes após receberem o tratamento com os produtos fitossanitários listados acima em 12, 24; 48, 72 horas e a testemunha que consistiu no plantio das sementes sem o tratamento com os produtos. Em cada tratamento avaliou se a altura de plantas, diâmetro de caule e comprimento de raízes após 15 dias do plantio. Com as variáveis avaliadas foi obtido a média, o erro padrão de cada uma e foram submetidas a Analise de Variância e posteriormente comparadas pelo teste Tukey a 5% pelo software SISVAR. Os dados obtidos revelaram que não existem efeitos negativos no desenvolvimento da cultura à medida que ocorre o aumento do tempo entre o tratamento de sementes e a realização do plantio das sementes tratadas. Dessa forma, esse trabalho permite desmitificar que à medida que o tempo passa após o tratamento de sementes o produtor perde a qualidade das suas sementes.
Perfil epidemiológico da Sífilis em gestantes no Maranhão no período de 2015 a 2018
A sífilis é uma Infecção Sexualmente Transmissível (IST) curável e exclusiva do ser humano, causada pela bactéria Treponema pallidum1. Quando a mulher adquire sífilis durante a gravidez, poderá haver infecção assintomática ou sintomática nos recém-nascidos. Mais de 50% das crianças infectadas são assintomáticas ao nascimento, com surgimento dos primeiros sintomas, geralmente, nos primeiros 3 meses de vida. Por isso, é muito importante a triagem sorológica da mãe na maternidade2. A sífilis em gestantes no Brasil e no Maranhão é assim um grave problema de saúde pública
Variant antigen diversity in Trypanosoma vivax is not driven by recombination.
African trypanosomes (Trypanosoma) are vector-borne haemoparasites that survive in the vertebrate bloodstream through antigenic variation of their Variant Surface Glycoprotein (VSG). Recombination, or rather segmented gene conversion, is fundamental in Trypanosoma brucei for both VSG gene switching and for generating antigenic diversity during infections. Trypanosoma vivax is a related, livestock pathogen whose VSG lack structures that facilitate gene conversion in T. brucei and mechanisms underlying its antigenic diversity are poorly understood. Here we show that species-wide VSG repertoire is broadly conserved across diverse T. vivax clinical strains and has limited antigenic repertoire. We use variant antigen profiling, coalescent approaches and experimental infections to show that recombination plays little role in diversifying T. vivax VSG sequences. These results have immediate consequences for both the current mechanistic model of antigenic variation in African trypanosomes and species differences in virulence and transmission, requiring reconsideration of the wider epidemiology of animal African trypanosomiasis
Desempenho agronômico de genótipos de couve-flor nas condições edafoclimáticas de Sinop
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